• 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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• 제7권6호
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• pp.614-629
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• 2001

21세기 지식기반 사회로의 정착화와 글로벌 인터넷화 추진으로 소프트웨어는 대형화 및 복잡화 되어가고 있으며, 그 수요는 폭주하는 실정이다. 이에, 표준화된 컴포넌트의 개발 및 유통을 통한 재사용의 활성화가 최근 산업계와 학계에서 중요한 이슈로 부각되는 실정이다. 현재, 컴포넌트의 재사용을 위하여 해외 컴포넌트 판매 마켓에서는 자사별 판매하는 제품의 특성에 따라 정보를 제공하고 있으나, 상이하게 정보를 정의하고 있으며, 그 정보의 수준이 미약하며, 표준화되지 않은 메타정보를 제공하고 있다. 즉, 국제표준 ISO 11179에 기반한 컴포넌트 데이타 레지스트리의 구축이 이루어지고 있지 않다. 국내에서는 2001년도에 공용 컴포넌트의 출시를 추진하고 있다. 따라서, 개발된 컴포넌트의 정보 공유와 유통을 위한 지원도구로서 표준화된 컴포넌트의 메타정보를 서비스 해주는 시스템이 필요하다. 본 논문은 컴포넌트 재사용 활성화의 일환으로 체계적인 정보공유와 정보유통을 위하여, 제품화된 공용 컴포넌트에 대한 표준화된 메타정보의 등록 및 관리를 제공해주는 ISO 11179 표준에 근거한 컴포넌트 유통환경의 도구로서, 컴포넌트 메타데이타 레지스트리(C_MDR) 시스템을 제시한다. 이를 위해, 컴포넌트에 대한 메타정보의 명세 플랫폼을 제시하고, 이 플랫폼에 따라 메타정보를 정의하고, 또한 타 시스템과의 정보의 호환성 증진을 위해 XML을 이용해 표현한다. 그리고 시스템 디자인을 위해 3계층 아키텍쳐 표현방식을 적용하여 단순하고 이해성 있는 시각화 모델링을 제공한다. 시스템 구현은 웹 상의 인터넷을 통해 컴포넌트 메타정보를 서비스를 할 수 있도록 시스템을 구축하며, ASP 개발언어와 PC용 RDMS 오라클을 사용한다. 이로서, 제품화된 컴포넌트j에 대한 유통 메타정보의 표준화를 기할 수 있고, 재사용을 위한 유통지원도구로서 지원이 가능할 것이다.

• 미생물학회지
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• 제30권1호
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• pp.8-14
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• 1992

Pseudomonas sp. DJ77로부터 extradiol dioxygenase 유전자(phnE)를 클로닝하고 염기배열을 결정하였다. 921 bp의 open reading frame (ORF) 이 존재하였고 개시코돈 앞에서 Shine-Dalgarno sequence를 발견하였다. phnE 유전자에서 만들어지는 PhnE 단백질은 분자량이 34,449 Da 인데 SDS-polycrylamide gel 전기영동에 의해 측정된 분자량과 일치하였다. PhnE는 NahH, XylE, DmpB 등과 아미노산 배열의 상동성의 약 50% 였다. DJ77에는 bphC와 같은 3형의 extradiol dioxygenase 유전자는 발견할 수 없었다. DJ77 과 JM101(pPE17)은 catechol, 3-methylcatechol, 4-methylcatechol, 2, 3-dihydroxybiphenyl 등의 기질을 meta-cleavage 하여 노란색 화합물을 생성할 수 있었다.

• 인문언어
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• 제5권
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• pp.93-106
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• 2003

Professor Daihyun Chung has recently presented an intriguing view of Ban-mal(non-honorific expressions) in Korean. He criticizes uses of Ban-mal, on the grounds that they presuppose the existence of hierarchical structures in human beings. Professor Chung also advocates ″a relational theory of Ban-mal″ according to which ascriptions of 'n-mal' should be relativized to the speaker-hearer relationship. He employs this view in showing that uses of Ban-mal indeed presuppose the existence of hierarchical structures in human beings I claim that Professor Chung has not shown the credibility of his relational theory of Ban-mal, and that this very view leads to an unintended and undesirable consequence. Moreover, 1 show that even if we assume that this view is true for the sake of an argument, he is not able to show that uses of Ban-mal indeed presuppose the existence of hierarchical structures. All he can show is rather that uses of 'Ban-mal'(a meta-linguistic expression) presuppose the existence of hierarchical structures. Finally, 1 conclude that what really presupposes the existence of hierarchical structures is the asymmetrical uses of Ban-mal and honorific expressions.

• Genomics & Informatics
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• 제9권3호
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• pp.114-120
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• 2011

Chronic inflammation has been implicated as one of the important etiological factors in insulin resistance and type 2 diabetes mellitus (T2DM). To investigate the role of anti-inflammatory cytokines in the development of T2DM, we conducted a case-control study to assess the association between IL4/IL4R polymorphisms and disease risk. We firstly identified single nucleotide poly-morphisms (SNP) at IL4 and IL4RA loci by sequencing the loci in Korean participants. Case-control studies were conducted by genotyping the SNPs in 474 T2DM cases and 470 non-diabetic controls recruited from community-based cohorts. Replication of the associated signals was performed in 1,216 cases and 1,352 controls. We assessed effect of IL4 -IL4RA interaction on T2DM using logistic regression method. The functional relevance of the SNP associated with disease risk was determined using a reporter expression assay. We identified a strong association between the IL4 promoter variant rs2243250 and T2DM risk (OR=0.77; 95% CI, 0.67~0.88; p=$1.65{\times}10^{－4}$ in the meta-analysis). The reporter gene expression assay demonstrated that the presence of rs2243250 might affect the gene expression level with ~1.5-fold allele difference. Our findings contribute to the identification of IL4 as a T2D susceptibility locus, further supporting the role of anti-inflammatory cytokines in T2DM disease development.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제16권9호
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• pp.4077-4080
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• 2015

The chemokine receptor 4 (CXCR4) has been widely used in diagnosis and prognosis of colorectal cancer (CRC). However, there is no current consensus on the impact of CXCR4 on CRC patients. The purpose of this study was to evaluate the prognostic and clinicopathological importance of CXCR4 in CRC patients. Databases, such as PubMed, Cochrane library, CBM and EMBASE updated to 2014 were searched to include eligible articles. We analysed correlations between CXCR4 expression and clinicopathological features and overall survival (OS). A total of 1, 055 CRC patients from twelve studies were included in the study. The pooled odds ratios (ORs) which indicated CXCR4 expression was likely to be associated with TNM stage (OR=0.43, CI=0.34-0.55, P<0.00001), lymph node status (OR=2.23, CI=1.23-4.05, P=0.008) and vascular invasion (OR=2.21, CI=1.11-4.39, P=0.02). Poor overall survival of CRC cancer was found to be significantly related to CXCR4 overexpression (hazard ratio (HR) 1.36 CI=1.17-1.59, P<0.0001), whereas combined ORs revealed that CXCR4 expression had no correlation with gender or differentiation. Based on the published studies, CXCR4 overexpression in patients w ith CRC indicates poor survival outcome and clinicopathological factors.

• Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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• 제31권4호
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• pp.316-321
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• 2005

Ameloblastoma is the most common odontogenic tumor of the jawbones, but the origin of this tumor has been remained to be unproven. Cytokeratins (CKs) are specific intermediate filament of epithelial cells, and vimentin is expressed in mesenchymal cells. The immunohistochemical detection of different CKs and vimentin has made it easier to know the origin of tumor. Paraffin-embedded tissue sections from 15 ameloblastomas and 1 ameloblastic carcinoma were used for immunohistochemical evaluation of CK 7, 8, 13, 14, 19 and vimentin. Their expression is evaluated in different tumor cells, which are observed in different type of tumors. In the follicular and reticular subtype, central stellate cells of tumor nests expressed CK 8, 14, 19 and peripheral columnar cells expressed CK 14. CK 7, and 13 were not expressed. Vimentin was detected in fibrous stroma around tumor nest, not in tumor cells. The tumor cells of ameloblastic carcinoma expressed CK 7, 14 and 19, but CK 8 was more weakly stained than that in ameloblastoma. Central stellate cells and peripheral columnar cells of acanthomatous subtype showed same expression pattern with others. Meta plastic squamous cells expressed CK 8, 14, 19 and keratinizing squamous cells expressed CK 13, 19. CK 7 and vimentin were not detected in tumor cells and vimentin was expressed in fibrous stroma. Most of the tumor cells of ameloblastoma showed CK 14 and CK 19 and did not express CK 7 and vimentin. These findings were similar to the immunophenotype of dental lamina. And these results will be beneficial to differential diagnosis of odontogenic tumors and other kind of tumors arising at the oral cavity.

• 미생물학회지
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• 제32권1호
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• pp.40-46
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• 1994

Polychlorinaed biphenyls(PCBs) 와 biphenyl을 분해하는 Pseudomonas sp. DJ-12에서는 그 초기 분해과정에 pcb ABCD 유전자들이 관여하고 있음이 밝혀졌다. 그 중 pcbCD와 pcdD 유전자를 E. coli XL1-Blue에 클로닝하여 E. coli CU103 과 CU105 균주를 각각 제조하였다. E. coli CU103은 2,3-dehydroxybuphenyl dioxygenase(2,3-DHBP)와 meta-cleavage compound(MCP) hydrolase를 생성하여 2,3-dihydroxybiphenyl을 benzoate로 변환시켜 주었다. E. coli CU1 과 CU103 에서 pcbC 유전자의 산물인 2,3-DHBP dioxygense의 활성도는 Pseudomonas sp. DJ-12에서 보다 약 17배 높았으며, E. coli CU105에서 pcbD의 산물인 MCP hydrolase는 약 3배 더 높게 나타났다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제14권3호
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• pp.1937-1943
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• 2013

Altered expression or function of manganese superoxide dismutase (MnSOD) has been shown to be associated with cancer risk but assessment of gene polymorphisms has resulted in inconclusive data. Here a search of published data was made and 22 studies were recruited, covering 20,025 case and control subjects, for meta-analyses of the association of MnSOD polymorphisms with the risk of prostate, esophageal, and lung cancers. The data on 12 studies of prostate cancer (including 4,182 cases and 6,885 controls) showed a statistically significant association with the risk of development in co-dominant models and dominant models, but not in the recessive model. Subgroup analysis showed there was no statistically significant association of MnSOD polymorphisms with aggressive or nonaggressive prostate cancer in different genetic models. In addition, the data on four studies of esophageal cancer containing 620 cases and 909 controls showed a statistically significant association between MnSOD polymorphisms and risk in all comparison models. In contrast, the data on six studies of lung cancer with 3,375 cases and 4,050 controls showed that MnSOD polymorphisms were significantly associated with the decreased risk of lung cancer in the homozygote and dominant models, but not the heterozygote model. A subgroup analysis of the combination of MnSOD polymorphisms with tobacco smokers did not show any significant association with lung cancer risk, histological type, or clinical stage of lung cancer. The data from the current study indicated that the Ala allele MnSOD polymorphism is associated with increased risk of prostate and esophageal cancers, but with decreased risk of lung cancer. The underlying molecular mechanisms warrant further investigation.

• 한국통신학회논문지
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• 제31권8B호
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• pp.716-729
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• 2006

최근 대부분 기업들 환경에서의 정보 시스템들은 지역적으로 분산되어 있고 다양한 이종의 데이터 소스들로 구성되어 있다. 따라서 사용자가 의사 결정을 위해 정보를 얻는 것은 어렵다. 이러한 문제를 효율적으로 해결하기 위해 사용자에게 단일 인터페이스를 제공하고, 이기종 시스템들 간에 구축된 데이터베이스 시스템들은 각각 독립성을 유지하면서 하나의 인터페이스처럼 투명성을 제공할 필요성이 있다. 본 논문에서는 카테고리, 표준 온톨로지, 로케이션 온톨로지, 지식베이스로 구성된 XMDR을 제안한다. 표준 온톨로지는 데이터 표현에 사용되는 명칭, 속성, 관계성에 대한 이질적인 문제를 해결한다. 로케이션 온톨로지는 각 레거시 시스템을 연결하는 중간자(mediation)역할을 수행한다. 지식 베이스는 용어 공유를 위한 관계성을 정의한다. 적응적 검색은 로케이션 온톨로지에 의한 사이트 가중치의 반영과 지식 베이스의 다양한 형태의 지식 공유 및 통합을 통한 검색 시스템을 제안하고, 구조화되지 않은 지식들을 어떻게 공유할 것인가에 대한 개념적인 도메인 모델을 제시한다.

• 응용통계연구
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• 제26권2호
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• pp.307-319
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• 2013

마이크로어레이 실험의 특성상 표본의 수가 많지 않는 단점을 보완하고 분석 결과를 일반화하기 위하여 공개 저장소에 축적된 자료 중에 연구 목적이 동일한 여러 연구들을 통합하여 분석하려는 시도가 활발하다. 그러나 실험에서 사용한 플랫폼이 서로 다른 경우에는 유전자 관찰값의 분포가 달라지기 때문에 통합이 어렵고 최상의 통합 방법이 제시되어 있지 않다. 본 논문에서는 순위 기반 중위수, 분위수 이산화와 표준화를 각각 이용하여 변환한 자료값을 직접 합치거나 메타분석을 하여 연구 결과를 합치는 방법을 알아 보았다. 또한 GEO에서 다운받은 실제 자료들을 이용하여 네 가지 방법의 장단점과 효과를 비교하였고 서로 다른 연구 자료를 통합하는 것의 영향을 알아보았다.