• 제목/요약/키워드: mating-type distribution

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Phylogenetic Analysis of Phaeosphaeria Species Using Mating Type Genes and Distribution of Mating Types in Iran

  • Ghaderi, Fariba;Habibi, Azadeh;Sharifnabi, Bahram
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제38권2호
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    • pp.78-89
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    • 2022
  • Phaeosphaeria species are pathogenic on wheat, barley and a wide range of wild grasses. To analyze mating type loci of the Phaeosphaeria species and investigate mating type distribution in Iran, we sequenced mating type loci of 273 Phaeosphaeria isolates including 67 isolates obtained from symptomatic leaves and ears of wheat, barley, and wild grasses from two wheat growing region in Iran as well as 206 isolates from our collection from other regions in Iran which were isolated in our previous studies. Mating type genes phylogeny was successfully used to determine the species identity and relationships among isolates within the Phaeosphaeria spp. complex. In this study, we reported seven new host records for Phaeosphaeria species and the Phaeosphaeria avenaria f. sp. tritici 3 group was first reported from Iran in this study. Mating type distribution among Phaeosphaeria species was determined. Both mating types were present in all sampling regions from Iran. We observed skewed distribution of mating types in one region (Kohgiluyeh va Boyer-Ahmad) and equal distribution in the other region (Bushehr). However, when considering our entire dataset of 273 Iranian Phaeosphaeria isolates, the ratio of mating types was not deviated significantly from 1:1 suggesting possibilities for isolates of opposite mating type to interact and reproduce sexually, although the sexual cycle may infrequently occur in some regions especially when the climatic conditions are unfavorable for teleomorph development.

Diversity and distribution of mating types in Lentinula edodes and mating type preference in domesticated strains

  • Ha, Byeong-Suk;Ro, Hyeon-Su
    • 한국균학회소식:학술대회논문집
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    • 한국균학회 2018년도 춘계학술대회 및 임시총회
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    • pp.37-37
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    • 2018
  • Mating type of Lentinula edodes is determined by two unlinked genetic loci, A and B. To better understand mating behavior of L. edodes, we investigated variations in mating type genes in129 dikaryotic strains collected from East Asia. Through sequence analysis of A locus, we discovered that hypervariable region spanning N-term of HD2-intergenic region-N-term of HD1 could represent A mating type. Mating and hypervariable region analyses revealed 70 unique A mating types: 27 from 98 cultivated strains, 53 from 31 wild strains, and 10 commonly found. It was also revealed that only a few A mating type alleles such as A1, A4, A5, and A7 were prevalent in cultivated strains. Contrarily, A mating type in wild strains was highly diverse: 23 unique A alleles were discovered in small mountainous area in Korean peninsula, suggesting rapid evolution of A mating type in nature. The B locus was assessed by allelic variations in pheromone (PHB) and pheromone receptor (RCB) pairs which constituted subloci Ba and Bb. Sequence analyses and mating assay revealed 5 alleles of RCB1 with 9 associated PHBs in Ba sublocus and 3 alleles of RCB2 with 5 associated PHBs in Bb sublocus. Each RCB was primarily associated with two PHBs. Each PHB-RCB pair was always discovered as a distinct unit. This allowed us to propose 15 B mating types via combinations of five Ba and three Bb subloci. Further investigation on 129 strains confirmed that the B locus, unlike the A locus, was indeed restricted to 15 mating types. Thus, the total number of mating types became 1,050 in L. edodes through a combination of 70 A and 15 B. This number will further increase because of rapid diversification of A mating type. Our findings provide a comprehensive and practical knowledge on mating behaviors of L. edodes.

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우라나라 감자 역병균 A2 교배형 및 Metalaxyl 저항성균의 빈도 및 분포의 변화 (Changes in Frequencies and Distribution of A2 Mating Type and Metalaxyl-Resistant Isolates of Phytophthora infestans in Korea)

  • 고영진;정희정
    • 한국식물병리학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.92-98
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    • 1994
  • Phytophthora infestans populations collected from various geographical locations of Korea in 1991 and 1993 were analyzed for mating types and responses to metalaxyl. Both A1 and A2 mating type isolates were detected in 1991. The majority of the isolates were A2 mating type, but no A1 mating type was detected in 1993. About 40% of the isolates collected in 1991 were resistant to metalaxyl, and the distribution of metalaxyl-resistant isolates of P. infestans was strongly associated with their geographic origins in Korea. Metalaxyl-resistant isolates with EC50 values > 50$\mu\textrm{g}$/ml were collected from the northern provinces of Kangwon, Kyungbuk, and Chonbuk, but not from the southern provinces of Kyungnam, Chonnam, and Jeju in 1991. The drastic increase in the degree of quantitative resistance to metalaxyl was detected among the isolates from the southern provinces during 1991~1993. More than 50% of the isolates collected from the southern provinces of Kyungnam and Chonnam in 1993 had EC50 values >50$\mu\textrm{g}$/ml. The province of Kangwon had isolates with the greatest resistance to metalaxyl. this alpine areas might be the origin of metalaxyl-resistant isolates of P. infestans in Korea. The A2 genotype with metalaxyl resistance appears to be displacing the A1 genotype which is presently the predominant genotype in Korea.

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국내 고추역병균 Phytophthora capsici 집단의 교배형 분포 및 변화 (Distribution and Alteration of Mating Type of Phytophthora capsici Population from Red Pepper in Korea)

  • 송정영;유성준;김홍기
    • 한국균학회지
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    • 제30권2호
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    • pp.152-156
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    • 2002
  • 1995년부터 1998년 사이 국내에 분포하는 고추역병균 Phytophthora capsici 집단에 대해 A1과 A2 교배형의 발생분포 및 변화를 조사하였다. 전국의 75개 고추포장들로부터 분리된 973개 P. capsici 균주들의 A1 : A2 교배형 발생비는 573 : 400으로 나타났다. A1과 A2 교배형의 P. capsici 균주들은 조사를 실시한 모든 지방에서 발견되었다. 조사포장별로는 A1 또는 A2 교배형의 병원균들만이 분리된 포장들과 A1과 A2 교배형의 병원균들이 동시에 발생하는 포장들이 관찰되었으며, 각 단일 포장내 P. capsici 균주들의 A1 : A2 교배형 발생비율은 해마다 다양하게 나타났다. 한편, 동일 포장에서의 연차적인 교배형 발생비 추이를 조사한 결과 1995년과 1997년에 A2 교배형의 P. capsici만이 발생했던 공주포장에서는 1998년에 A1 교배형의 균주가 새롭게 발견되었다. 따라서 국내 고추 역병균 P. capsici 집단은 병발생 포장단위별로 다양한 A1 : A2 교배형 균주들의 발생비가 나타나고 있어 단일포장 내에서 유성생식이 이루어질 가능성이 높으며, 포장단위별 균주들 간에는 유전적인 차이가 다양하게 존재할 것으로 판단된다.

고양이와 개에서 분리한 Microsporum canis 의 교배형 (Mating Type of Microsporum canis Isolated from Cats and Dogs)

  • 이헌준;최원필
    • 대한수의학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.111-113
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    • 1988
  • To elucidate the distribution of mating type of Microsporum canis, originated from animals in Korea, a total of 272 strains of M. canis isolated from dogs and cats were mated with the tester strains of Nannizzia otae. Among 272 strains of M. canis examined, 217 strains(79.8%) were N. otae-, but none of strains showed+mating type. And 55 strains(20.0%) were reacted with neither N. otae+nor N. otae-.

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국내 고추 역병균의 병원성 분화 (The Race Differentiation of Phytophthora capsici in Korea)

  • 이상준;박용주;김흥태;김병섭
    • 식물병연구
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    • 제16권2호
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    • pp.153-157
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    • 2010
  • 본 연구는 고추 역병균의 교배형 분포와 병원성 분화를 구명하기 위하여 수행하였다. 2005년부터 2007년까지 고추 역병에 감염된 식물로부터 총 143균주를 분리하였고 분리된 균주의 교배형을 조사하였다. 2005년 분리된 20균주 중 A1 교배형이 75%, A2 교배형이 25%인 것으로 조사되었다. 2006년 분리된 총 91균주 중 A1 교배형이 49.0%이고 A2 교배형이 42.9%로 나타났으며 교배가 되지 않는 S형(sterile type)이 3.3%로 분리되었다. 2007년 분리된 균주는 2006년과 비슷한 양상을 나타내었다. 전체 143균주의 교배형은 A1 56.6%, A2 39.2%, S형 4.2%로 조사되었다. 50종 고추에 교배형이 다른 대표적인 3균주를 접종하여 병원성 반응이 다른 13개의 고추를 선발하여 고추 역병균 병원성 분화 조사를 위한 판별품종군을 만들었다. 고추역병 판별품종군을 이용하여 병원성 여부를 조사한 결과 11종의 서로 다른 병원성 반응을 나타내는 것으로 조사되었다. 이를 통해 국내에 최소 11개의 고추 역병균 레이스가 존재한다는 것을 확인할 수 있었다.

The Uneven Distribution of Mating Type Genes in Natural and Cultivated Truffle Orchards Contributes to the Fructification of Tuber indicum

  • Li, Qiang;Fu, Yu;Sun, Qun;Sourzat, Pierre;Yang, Mei;Liu, Chengyi;Tan, Hao;Ye, Lei;Zou, Jie;Wu, Chenguang;Zhang, Bo;Li, Xiaolin
    • Mycobiology
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    • 제46권1호
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    • pp.64-71
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    • 2018
  • The aim of this study was to investigate the pattern of distribution of mating type (MAT) genes of Tuber indicum in ectomycorhizosphere soils from natural T. indicum-producing areas and cultivated truffle orchards and ascocarp samples from different regions. Quantitative real-time PCR and multiplex PCR were used to weight the copy numbers of MAT1-1-1 and MAT1-2-1 in natural truffle soils and cultivated orchard soils. The effect of limestone on the pattern of truffle MAT genes and the correlation between soil properties and the proportion of MAT genes were also assessed. These results indicated that an uneven and nonrandom distribution of MAT genes was common in truffle-producing areas, cultivated truffle orchards, and ascocarps gleba. The competition between the two mating type genes and the expansion of unbalanced distribution was found to be closely related to truffle fructification. Limestone treatments failed to alter the proportion of the two mating type genes in the soil. The content of available phosphorus in soil was significantly correlated with the value of MAT1-1-1/MAT1-2-1 in cultivated and natural ectomycorhizosphere soils. The application of real-time quantitative PCR can provide reference for monitoring the dynamic changes of mating type genes in soil. This study investigates the distributional pattern of T. indicum MAT genes in the ectomycorhizosphere soil and ascocarp gleba from different regions, which may provide a foundation for the cultivation of T. indicum.

국내 고추역병균 Phytophthora capsici 집단의 교배형 분포 특성에 따른 Metalaxyl 감수성 (Metalaxyl Sensitivity Related with Distribution Feature of Mating Type of Phytophthora capsici Population from Red Pepper in Korea)

  • 송정영;유성준;이윤수;김병섭;김홍기
    • 한국균학회지
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    • 제31권2호
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    • pp.98-102
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    • 2003
  • 1995년부터 1998년까지 75곳의 국내 고추포장들로부터 수집된 433개의 고추역병균 Phytophthora capsici 집단의 교배형 분포 특성에 따른 metalaxyl 감수성을 분석하였다. Metalaxyl $2{\mu}g/ml$ 농도에서 P. capsici 집단의 평균 균사생장 저해율은 68.2%였으며, 저항성균의 발생율은 평균 28.6%였다. 포장단위별로 metalaxyl에 대한 반응을 조사한 결과 A1형 또는 A2형 단일 교배형만 출현한 포장들의 균주들은 서로 비슷한 수준의 감수성을 나타냈으며, 대부분 포장단위별로 약제 감수성이나 저항성 중의 하나로 구분됐다. 그러나 교배형이 혼재하여 분포하는 각 포장단위별 균주들간의 약제에 대한 반응은 단일교배형 포장균주들에 비해 매우 다양했으며, 포장별로 저항성균의 발생비율도 다양했다. 이러한 결과들은 국내에 분포하는 고추역병균 P. capsici 집단의 metalaxyl 약제에 대한 다양한 감수성이 각 포장단위별 A1 : A2교배형 발생비와 매우 밀접한 관계가 있다는 것을 의미한다.

강원지역 감자 역병균 Phytophthora infestans의 교배형 및 약제저항성 변화 (Changes of Mating Type Distribution and Fungicide-resistance of Phytophthora infestans Collected from Gangwon Province)

  • 박경훈;류경열;윤종철;정규식;김점순;권민;김병섭;차병진
    • 식물병연구
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    • 제16권3호
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    • pp.274-278
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    • 2010
  • 강원지역의 감자포장에서 2006년과 2007년에 역병균을 분리하여, 교배형, metalaxyl과 dimethomorph 반응을 조사하였다. 각 지역에서 분리한 역병균의 교배형을 조사한 결과, 2006년 분리된 조사 균주는 155 균주 중 A1형이 58.7%, A2형이 41.3%로 확인 되었으며, 2007년 분리된 균주에서 A2 교배형은 6.7%로 발생 비율이 매우 낮았다. metalaxyl에 대한 반응성은 2006년 133균주에서 저항성 균주가 73.75%, 중도 저항성 균주가 18.8%, 감수성 균주가 7.5%로 나타났으며, 2007년 조사한 101 균주 중에서 저항성이 56.4%, 중도저항성 균이 4%, 감수성 균이 36.6%로 분리되었다. 강원도의 대부분 지역에서 A2 교배형 발생과 metalaxyl에 저항성을 갖는 균주를 확인할 수 있었는데, 이러한 결과는 병원균이 지속적으로 기주 및 환경요인에 따라 변화되고 있음을 의미한다. Dimethomorph 약제 반응 조사결과 MIC 값은 0.6미만, 06~1.0, 1.0이상인 세 개의 그룹으로 분류 되었으며, 2006년에는 $1.0\;{\mu}g/ml$이상인 균주는 56.3%이었으나 2007년에는 $1.0\;{\mu}g/ml$이상인 균주가 4%였다. $EC_{50}$ 값은 2007년에 조사한 균주들의 평균값이 $0.12\;{\mu}g/ml$로 2006년 평균값 $0.37\;{\mu}g/ml$ 보다 감소하였다. 감자 역병균들의 MIC 값과 $EC_{50}$ 값을 고려한 결과, 2007년에 조사한 병원균의 약제 반응정도가 2006년에 분리한 균주보다 감소하는 것으로 확인되었다.

대구지방 소아 및 토양에서 분리한 Microsporum gypseum의 교배형에 대한 연구 (Study on Mating Type of Microsporum gypseum Isolated from Children Patients and Soils in Taegu Area)

  • 노병의;방용준
    • 대한의생명과학회지
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    • 제2권1호
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    • pp.109-114
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    • 1996
  • Microsporum gypseum complex의 교배형 및 감염원을 조사하기 위하여 대구에 거주하는 소아에서 분리한 M.gypseum 17주와 환자주변의 초등학교 운동장, 화단 및 어린이 놀이터의 토양에서 분리한 60주를 표준균주 A.gypsea 및 A.incurvata와 교배 실험을 실시하였다. 소아에서 분리된 M.gypseum 17주의 성별 완전형의 분포는 남아에서 A.incurvata가 14주 이었고, A.gypsea는 3주이었다. 여아에서는A.incurvata만 4주 분리되었다. 병형별 분리빈도는 Tinea facial가 A.gypsea 2주, A.incurvata 10주로 다른 부위보다 많이 분리되었다. 교배형의 분포는 환자에서 분리한 17주중 A.gypsea는 3주중 "+"형 2주, "-"형이 1주이었고, A.incuwata는 "+"형이 6주, "-"형이 8주이었다. 토양에서 분리한 60주의 교배형의 분포는 A.gypsea는 31주중 "+"형 16주, "-"형이 15주이었고, A.incurvata는 "+"형이 15주, "-"형이 14주이었고 특히 소아에서 많이 분리된 A.incurvata가 어린이 놀이터에서 많이 분리된 것을 보면 소아의 M.gypsen 감염은 놀이터와 관련성이 있을 것으로 사료된다. 분리된 A.incurvata가 어린이 놀이터에서 많이 분리된 것을 보면 소아의 M.gypsen 감염은 놀이터와 관련성이 있을 것으로 사료된다.

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