• ALGAE
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• 제36권4호
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• pp.241-261
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• 2021

Amphidinium species are amongst the most abundant benthic dinoflagellates in marine intertidal sandy ecosystems. Some of them produce a variety of bioactive compounds that have both harmful effects and pharmaceutical potential. In this study, Amphidinium cells were isolated from intertidal sand collected from the East China Sea. The two strains established were subjected to detailed examination by light, and scanning and transmission electron microscopy. The vegetative cells had a minute, irregular, and triangular-shaped epicone deflected to the left, thus fitting the description of Amphidinium sensu stricto. These strains are distinguished from other Amphidinium species by combination characteristics: (1) longitudinal flagellum inserted in the lower third of the cell; (2) icicle-shaped scales, 276 ± 17 nm in length, on the cell body surface; (3) asymmetrical hypocone with the left side longer than the right; and (4) presence of immotile cells. Therefore, they are described here as Amphidinium stirisquamtum sp. nov. The molecular tree inferred from small subunit rRNA, large subunit rRNA, and internal transcribed spacer-5.8S sequences revealed that A. stirisquamtum is grouped together with the type species of Amphidinium, A. operculatum, in a fully supported clade, but is distantly related to other Amphidinium species bearing body scale. Live A.stirisquamtum cells greatly affected the survival of rotifers and brine shrimp, their primary grazers, making them more susceptible to predation by the higher tropic level consumers in the food web. This will increase the risk of introducing toxicity, and consequently, the bioaccumulation of toxins through marine food webs.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제50권4호
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• pp.488-500
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• 2022

Most fungal infections by opportunistic yeast pathogens such as Candida spp. are the major causes of morbidity and mortality in patients with lowered immune. Previous studies have reported that some strains of Candida secret secondary metabolites play an important role in the decreasing of immunity in the infected patient. In this study, 110 Candida spp. were isolated from different clinical specimens from Baghdad hospitals. Candida isolates were identified by conventional methods, they were processed for Candida speciation on CHROMagar. The results of identification were confirmed by internal transcribed spacer (ITS) sequencing. Phylogenetic trees were analyzed with reference strains deposited in GenBank. Antifungal susceptibility testing was evaluated by the disc diffusion method and performed as recommended by the Clinical and Laboratory Standard Institute (CLSI) M44-A document. Candida isolates investigated produce secondary metabolites gliotoxin with HPLC technique and quantification. Out of 110 Candida isolates, C. albicans (66.36%) was the most frequent isolate, followed by the isolates of C. tropicalis (10.9%) and C. glabrata (6.36%) respectively. Concerning the antifungal susceptibility test, Candida isolates showed a high level of susceptibility to Miconazole (70.9%), Itraconazole (68.2%), and Nystatine (64.5%). The ability of obtained isolates of Candida spp. to produce gliotoxin on RPMI medium was investigated, only 28 isolates had the ability to secret this toxin in culture filtrates. The highest concentrations were detected in C. albicans (1.048 ㎍/ml). Gliotoxin productivity of other Candida species was significantly lower. The retention time for gliotoxin was approximately 5.08 min.

• 한국터널지하공간학회 논문집
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• 제11권4호
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• pp.419-425
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• 2009

최근에 저토피 및 터널 갱구부에 반개착식 공법을 적용하여 구조적인 안전성과 자연친화성을 높인 사례가 증가하고 있다. 반개착식 공법은 저토피구판에시 원지반을 터널 천단아치에 해당하는 기초까지만 굴착하고 아치형 구조달을 설치하여 복토한 후에 터널하반을 굴착하여 기존 개착공법에서 발생되는 지반 과다절취에 따른 대절토 비탈면 발생과 굴착면 보강에 따른 고비용과 불안정성 증대 문제를 해결할 수 있는 공법이다. 본 논문에서는 저토피 구간에서 반개착식으로 굴착한 Braced Rib Arch의 거동에 대하여 연구하였다. 아치형구조물의 Rib Arch는 지간이 1.8 m인 아치형 강재를 간격재는 목재를 사용하였으며 1:10의 축척으로 4.0 m(폭)$\times$3.3 m(높이)$\times$4.0 m(연장)의 크기를 가진 대형토조에서 실험을 수행하였다. 모형실험결과 아치형 구조물에 작용하는 성토하중은 기존 개착터널에서 사용하는 하부구조물의 폭에 해당하는 상부토체의 크기보다 작은 것으로 나타났다.

• 한국해양학회지:바다
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• 제22권1호
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• pp.31-44
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• 2017

Pfiesteria piscicida는 유독 종속영양 와편모조류로서, 크기가 작고 형태학적으로 유사한 Pfiesteria-like dinoflagellate (PLD) 종들로 인해, 광학 현미경 관찰만으로 정확하게 동정하는 것이 불가능하다. 따라서, 본 연구에서는 이러한 한계점을 극복하기 위해 EvaGreen 기반의 정량적 real-time PCR기법을 개발하였으며, 한국 근해에서 P. piscicida의 분포와 시화호에서 개체군 변동 조사를 통해 현장에서 유용성을 검증하였다. 이를 위해, internal transcribed spacer 1 (ITS 1) 영역을 대상으로 종 특이적 프라이머를 제작하였으며, P. piscicida와 진화적 유연관계에 있는 다양한 미세조류에 대해 PCR을 수행하여 프라이머의 특이성을 검증하였다. 개발된 프라이머를 real-time PCR 기법에 적용한 결과, P. piscicida의 세포수와 $C_T$값 간의 유의한 표준 곡선($r^2{\geq}0.999$)과 하나의 융해곡선 피크($88^{\circ}C$)가 관찰되었다. 이는 본 연구에서 개발된 기법이 대상생물인 P. piscicida를 정확하게 정성 및 정량분석이 가능함을 의미한다. 개발된 real-time PCR 기법의 현장적용 결과, 광학 현미경상에서는 탐지할 수 없었던 P. piscicida를 서해(김제, 목포)와 동해(강릉) 시료에서 검출하였다. 또한, 시화호 시료를 이용한 P. piscicida개체군 동태 조사에서 다른 정점에 비해 염분도가 상대적으로 낮았던(${\leq}15psu$), St. 1에서 2007년 6, 7, 8월에 세포밀도의 피크가 관찰되었다. 본 연구에서 개발된 EvaGreen 기반 real-time PCR 기법은 현장에서 P. piscicida를 탐지 및 정량 분석 하는데 성공하였으며, 이는 향후 이들 종에 대한 다양한 생태학적 연구에 활용될 것으로 사료된다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제27권12호
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• pp.2119-2128
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• 2017

Citrinin (CIT) is a toxic secondary metabolite produced by fungi belonging to the Penicillium, Aspergillus, and Monascus spp. This toxin has been detected in many agricultural products. In this study, a strain Y3 with the ability to eliminate CIT was screened and identified as Cryptococcus podzolicus, based on the sequence analysis of the internal transcribed spacer region. Neither uptake of CIT by cells nor adsorption by cell wall was involved in CIT elimination by Cryptococcus podzolicus Y3. The extracellular metabolites of Cryptococcus podzolicus Y3 stimulated by CIT or not showed no degradation for CIT. It indicated that CIT elimination was attributed to the degradation of intracellular enzyme(s). The degradation of CIT by C. podzolicus Y3 was dependent on the type of media, yeast concentration, temperature, pH, and initial concentration of CIT. Most of the CIT was degraded by C. podzolicus Y3 in NYDB medium at 42 h but not in PDB medium. The degradation rate of CIT was the highest (94%) when the concentration of C. podzolicus Y3 was $1{\times}10^8cells/ml$. The quantity of CIT degradation was highest at $28^{\circ}C$, and there was no degradation observed at 3$5^{\circ}C$. The study also showed that acidic condition (pH 4.0) was the most favorable for CIT degradation by C. podzolicus Y3. The degradation rate of CIT increased to 98% as the concentration of CIT was increased to $20{\mu}g/ml$. The toxicity of CIT degradation product(s) toward HEK293 was much lower than that of CIT.

• 대한기계학회논문집B
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• 제40권12호
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• pp.815-824
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• 2016

가압경수로에 장전되는 핵연료집합체는 연료 봉 다발과 지지격자 및 상하단 고정체로 구성되어 있다. 고온 고압의 냉각수는 원자로 하부로 유입되어 연료 봉 사이로 형성된 부수로를 따라 노심 상부로 흐른다. 경수로핵연료의 주요 열수력 성능인자는 정상운전시 압력강하 및 임계열속이며 사고시에는 급랭 시간이다. 한국원자력연구원에서는 경수로핵연료의 성능을 향상시키고 국산화를 위해 고성능 경수로핵연료, 이중냉각 핵연료 및 사고저항성 핵연료를 개발하였다. 경수로핵연료의 열수력 핵심기술을 개발하기 위해 압력강하 실험, 난류 유동혼합/열전달 실험, 임계열속 및 급랭 시험을 수행하였으며 전산유체역학 방법도 활용하였다. 더불어 사용후핵연료의 임시저장을 위한 건식저장 용기의 열유동에 대한 전산유체해석을 수행하였다. 한편, 경수로핵연료의 열수력 기반기술을 개발하고 실용화를 위해 대학 및 산업체와 협력연구도 진행하였다.

• 대한환경공학회지
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• 제30권2호
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• pp.155-160
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• 2008

본 연구에서는 다단계 전기화학적 반응기를 이용하여 환원제의 투입, 전극의 종류, 수리학적 체류시간(HRT : Hydraulic Retention Time) 및 전류밀도 변화에 따른 질산성질소의 제거효율을 살펴보았다. 실험결과, 환원제 투입은 질산성질소 제거효율을 증가시켰으며 에너지투입량은 감소시켰다. 전극종류를 변화시켰을 경우, 질산성질소 제거효율 및 전류효율의 차이는 거의 없었으나 Zn 환원제의 회수를 위해 B-type(1단 : Pt-Zn, 2단 : Pt-Zn, 3단 : Pt-Zn, 4단 : Pt-Zn)을 선정하였다. 수리학적 체류시간 변화실험에서는 수리학적 체류시간과 무관하게 동일전류밀도를 공급한 실험과 수리학적 체류시간 변화에 따른 전류밀도 변화 실험 즉, 단위부피당 동일 전류량 공급 실험을 진행하였다. 실험 결과, 수리학적 체류시간과 전류밀도 변화에 의해 농도분극현상과 적용전류량의 부족현상이 발생하게 된다. 즉 수리학적 체류시간이 감소할수록 농도분극현상은 감소하지만 단위 부피당 적용전류량이 부족하게 된다. 따라서 수리학적 체류시간과 전류밀도 실험을 통해 적절한 운전조건을 도출할 수 있으며, 내부 스페이서의 설치로 확산을 증가시킬 경우 질소제거효율 및 에너지효율이 증가될 수 있을 것으로 예상된다.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제58권12호
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• pp.472-477
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• 2015

Purpose: Adherence to treatment with inhaled corticosteroids (ICS) is a critical determinant of asthma control. The objective of this study was to assess factors that determine adherence to ICS therapy in children with asthma. Methods: Fifty-eight children with asthma, aged 5 to 16 years, used ICS with or without a spacer for 3 months. Adherence rates as measured from questionnaires and canisters, asthma symptom scores, and inhalation technique scores were assessed every 30 days. The degree of supervision by caregivers was assessed at day 30. Results: Adherence rates measured using canisters were lower at day 60 than at day 30 (P=0.044) and did not change thereafter ($74.4%{\pm}17.4%$ at day 30, $66.5%{\pm}18.4%$ at day 60, and $67.4%{\pm}22.2%$ at day 90). Adherence rates at days 60 and 90 and during the total study period were significantly different when measured by using questionnaires versus canisters (P<0.001, P=0.022, and P =0.001, respectively). In the comparison of adherence rates repeatedly measured at days 30, 60, and 90 and adherence rates during the total study period among the 3 groups, adherence rates in the high-degree supervision group were significantly higher than those in the low-degree supervision group ($82.0{\pm}16.0$ vs. $66.1{\pm}14.5$, $75.4{\pm}14.4$ vs. $56.2{\pm}18.4$, $75.0{\pm}18.3$ vs. $55.0{\pm}19.7$ [P=0.027]; $77.9{\pm}12.2$ vs. $59.1{\pm}11.4$ [P=0.021]) after adjustment for sex and age. Conclusion: The level of caregiver supervision is an important factor affecting adherence to ICS therapy in children with asthma. Therefore, a high degree of supervision may be required to increase adherence to ICS therapy in children with asthma.

• 한국균학회지
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• 제28권2호
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• pp.112-117
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• 2000

야생에 서식하고 있는 번데기 및 성충에 감염된 기주의 자실체로부터 동충하초속균 3속 14균주를 분리하였고, RFLP에 의한 유전정보를 이용하여 ITS 영역에 대한 유연관계를 분석하였다. 수집된 각 균주의 rDNA ITS I과 II 부위를 primer ITS 1과 ITS 4를 사용하여 PCR에 의해 증폭한 결과 증폭된 산물은 500 bp크기로 잘 보존되어 종간 또는 속간 서로 구분되지 않았다. 따라서 증폭산물을 7종의 제한효소로 절단하여 밴드상을 관찰한 결과 수집된 Paecilomyces tenuipes 4균주와 Beauveria bassiana 2균주, JB3 균주를 제외한 Cordyceps militaris 6균주는 각각 동일 종으로 분류되었다. 한편 C. scarabaeicola 균주는 7종의 제한효소에서 모두 B. bassiana의 밴드와 일치하여 C. scarabaeicola의 불완전세대는 B. bassiana로 간주되었다. 제한 효소 중에 Paecilomyces속과 Cordyceps 속간 구분에 용이한 제한효소는 CfoI, HpaII이었으며, 그중 CfoI는 Paecilomyces, Cordyceps, Beauveria속간 구분에 용이하였다. UPGMA 분석결과 P. tenuipes, C. militaris, C. scarabaeicola와 B. bassiana, JB4 균주 등 4개의 군으로 그룹화되었으며, 그룹간에는 100% 유의수준을 나타냈다. 따라서 rDNA-RFLP 분석에서 속간 유연관계는 적었으나 종간 유연관계는 가까운 결과를 얻었다.