본 연구는 유산간균 및 유산구균으로부터 plasmid DNA를 신속하고 간편하게 분리하기 위한 방법에 관한 것이다. 세포벽 형성 억제 인자인 glycine을 0.5% 첨가한 TCM 배지에서 유산균을 배양하였고 plasmid DNA는 mutanolysin을 처리한 cells로부터 alkaline-detergent lysis 법으로 분리되었다. 유산간균은 효소 처리 때 mutanolysin의 농도를 30$\mu\textrm{g}$/$m\ell$로 하고 37$^{\circ}C$에서 5-10분간 반응되었을 때 plasmid DNA가 아주 잘 추출되었다. 유산구균의 경우는 그 최적 조건이 조금 달랐다. 본 방법은 L. casei, L. acidophilus, L. helveticus, S. lactis, S. faecalis, S. faecium과 S. cremoris 균주로부터 plasmid DNA를 신속하게 분리하는데 사용할 수 있었다. 본 방법을 이용하여 배양액 $1.5m\ell$로부터 분리된 plasmidsDNA가 gel상에서 쉽게 확인될 수 있었다.
Lactic acid bacteria (LAB) are widely used for various food fermentation. With the recent advances in modern biotechnology, a variety of bio-products with the high economic values have been produced using microorganisms. For molecular cloning and expression studies on the gene of interest, E. coli has been widely used mainly because vector systems are fully developed. Most plasmid vectors currently used for E, coli carry antibiotic-resistant markers. As it is generally believed that the antibiotic resistance markers are potentially transferred to other bacteria, application of the plasmid vectors carrying antibiotic resistance genes as selection markers should be avoided, especially for human consump-tion. By contrast, as LAB have some desirable traits such that the they are GRAS(generally recognized as safe), able to secrete gene products out of cell, and their low protease activities, they are regarded as an ideal organism for the genetic manipulation, including cloning and expression of homologous and heterologous genes. However, the vec-tor systems established for LAB are stil insufficient to over-produce gene products, stably, limiting the use of these organisms for industrial applications. For a past decade, the two popular plasmid vectors, pAM$\beta$1 of Streptococcus faecalis and pGK12 theB. subtilis-E. coli shuttle vector derived from pWV01 of Lactococcus lactis ssp. cremoris wg 2, were most widely used to construct efficient chimeric vectors to be stably maintained in many industrial strains of LAB. Currently, non-antibiotic markers such as nisin resistance($Nis^{r}$ ) are explored for selecting recombi-nant clone. In addition, a gene encoding S-layer protein, slp/A, on bacterial cell wall was successfully recombined with the proper LAB vectors LAB vectors for excretion of the heterologous gene product from LAB Many food-grade host vec-tor systems were successfully developed, which allowed stable integration of multiple plasmid copies in the vec-mosome of LAB. More recently, an integration vector system based on the site-specific integration apparatus of temperate lactococcal bacteriophage, containing the integrase gene(int) and phage attachment site(attP), was pub-lished. In conclusion, when various vector system, which are maintain stably and expressed strongly in LAB, are developed, lost of such food products as enzymes, pharmaceuticals, bioactive food ingredients for human consump-tion would be produced at a full scale in LAB.
Lee, Deog-Yong;Seo, Yeon-Soo;Kang, Sang-Gyun;Yoo, Han Sang
대한수의학회지
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제47권2호
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pp.157-162
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2007
Lactic acid bacteria (LAB) has been regarded as a useful microorganism and tried to manipulate plasmid DNA for increasing the usefulness. Although several methods have been developed to isolate plasmid DNA from Escherichia coli (E. coli), these methods were not sufficient to apply to LAB with exception of O'Sullivan's lysis method. So, we evaluated plasmid DNA extraction from LAB using general E. coli preparation methods and tried to improve the extraction yield and DNA purity by modifying O'Sullivan's alkaline lysis method. To improve the extraction yield, salt and carrier were added to precipitant and those were incubated at $-70{^{\circ}C}$. Only incubation at $-70{^{\circ}C}$ was the effective method of those modifications. Purity of plasmid DNA was improved by two times of each centrifugation and phenol/chloroform extraction. However, DNA was damaged by twice extraction with phenol/chloroform. Also, exclusion of ethidium bromide showed negative effect to purity. Additionally, it was recommended that improvement of the extraction yield may be due to centrifugation at high speed for more time and to dissolving complete DNA pellet before addition of 7.5 M ammonium acetate. Extraction using this modification produced higher quality of plasmid DNA.
From the extensive screening for small cryptic plasmid among about 23 lactic acid bacteria (LAB), 2.4 kb of cryptic plasmid was isolated from Lactobacillus farciminis strain KCTC 3681 and named as pLF24. The plasmid pLF24 was a circular molecule of 2,396 base-pairs in length with a G+C content of 38%. Two protein-coding sequences could be predicted. ORF1 and ORF2 showed homologies to plasmids of gram-positive bacteria. The replication protein coded by ORF2 and the plus origin, were similar to replication regions of other gram-positive bacteria as shown in plasmids such as pLH2, pLS141-1 and pLC2. The nucleotide sequence of pLF24 was deposited into Genbank data base with an accession number of EU429343. The newly isolated plasmid can be used for construction of shuttle vector in Lactobacillus bacteria.
Pediococcus acidilactici strain M produced a bacteriocin which was proteinaceous, heat stable, and exhibited antimicrobial activity against lactic acid bacteria, variety of food spoilage and pathogenic bacteria. The antimicrobial activity was not caused by $H_2$$O_2$ and organic acid, and was remained between pHs of 4.0 to 9. Molecular weight of crude bacteriocin was approximately 2, 500. Phenotypic assignment after plasmid cruing experiment demonstrated that a 53.7 kilobase (kb) plasmid, designated as pSUC53, was responsible for the sucrose fermentation phenotype ($Suc^+$) and a 11.1 kb plasmid, designated as pBAC11, was associated with bacteriocin production phenotype ($Bac^+$). Neither of the two plasmids were linked to antibiotic resistance.
Three distinct plasmids, with approximate molecular weights of 1, 4.5, and 33 megadaltons, were found in Lactococcus lactis subsp. lactis (L. lactis) ML8. Slow acid-producing mutants of L. lactis ML8, isolated by plasmid curing with acriflavine treatment, lacked the 33-megadalton plasmids. The plasmid-cured mutant showed lactose-negative (Lac) characteristics and the alteration of extracellular proteinase pattern. The possible involvement of extracellular proteinase with the 33-megadalton plasmid is highlighted in this research.
The nucleotide sequence contains 2 open reading frames encoding a 45-amino-acid protein homologous to a transcriptional repressor protein CopG, and a 203-amino-acid protein homologous to a replication protein RepB. Putative countertranscribed RNA, a double-strand origin, and a single-strand origin were also identified. A shuttle vector, pUCL2.1, for various lactic acid bacteria (LAB) was constructed on the basis of the pCL2.1 replicon, into which an erythromycin-resistance gene as a marker and Escherichia coli ColE1 replication origin were inserted. pUCL2.1 was introduced into E. coli, Lc. lactis, Lactobacillus (Lb.) plantarum, Lb. paraplantarum, and Leuconostoc mesenteroides. The recombinant LAB maintained traits of transformed plasmid in the absence of selection pressure over 40 generations. Therefore, pUCL2.1 could be used as an E. coli/LAB shuttle vector, which is an essential to engineer recombinant LAB strains that are useful for food fermentations.
L. casei Y1T 9018은 자연적으로, 또는 mutagen처리하여 plasmid DNA 7가 curing 또는 deletion되었으며, 이러한 유천적 결함이 생긴 mutants는 다음과 같은 특성을 나타냈다. 1) 탄소원으로서 lactose가 주어졌을때 mutants의 유산 생성능이 현저히 저하되었다. 2) 탄소원으로서 glucose 맺 galactose 첨가시엔 유산 생성 정도가 정상균주와 큰 차이가 없였다. 3) 5 가시 항생제에 대한 내성 맺 lactose 이외의 당에 대한 발효능 시험 갤고파 정상과 차이가 없었다.
Chae, Han Seung;Lee, Jeong Min;Lee, Ju-Hoon;Lee, Pyung Cheon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제23권6호
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pp.837-842
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2013
A cryptic plasmid, pMBLR00, from Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides KCTC 3733 was isolated, characterized, and used for the construction of a cloning vector to engineer Leuconostoc species. pMBLR00 is a rolling circle replication plasmid, containing 3,370 base pairs. Sequence analysis revealed that pMBLR00 has 3 open reading frames: Cop (copy number control protein), Rep (replication protein), and Mob (mobilization protein). pMBLR00 replicates by rolling circle replication, which was confirmed by the presence of a conserved double-stranded origin and single-stranded DNA intermediates. An Escherichia coli-Leuconostoc shuttle vector, pMBLR02, was constructed and was able to replicate in Leuconostoc citreum 95. pMBLR02 could be a useful genetic tool for metabolic engineering and the genetic study of Leuconostoc species.
대구지역에서 수집한 50점의 김치 중에서 10점의 김치로부터 tetracycline내성 세균을 분리하였다. 이 균주들의 tetracycline에 대한 MIC는 25-100 mg/l 이상의 범위로 분포하였으며 다른 항생제에 대한 내성도 다양하였다. tet(M), tet(O)특이적 primer를 이용한 PCR에서 HJ9 한 균주에서만 tet(M)유전자가 검출되었으며, tet(M)은 플라스미드상에 존재하는 것으로 나타났다. HJ9 균주의 tet(M)부분 염기서열을 분석한 결과 기존에 보고된 Gram양성균의 tet(M)의 DNA 염기서열 및 아미노산 서열과 각각 90-99%, 94-100%의 높은 상동성을 보였다. 165 rRNA 염기서열을 분석한 결과 HJ9 균주는 Lactobacillus sakei로 동정되었다. 김치를 통하여서도 항생제 내성 유전자의 전파 확산이 가능할 것으로 생각된다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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