• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제14권1호
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• pp.74-80
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• 2004

Aspergillus fumigatus is one of the most common fungi in the human environment, both in-doors and out-doors. It is the main causative agent of invasive aspergillosis, a life-threatening mycosis among immunocompromised patients. The genome has been sequenced by an international consortium, including the Wellcome Trust Sanger Institute (U.K.) and The Institute for Genomic Research (TIGR, U.S.A.), and a ten times whole genome shotgun sequence assembly has been made publicly available. In this study, we identified tricarboxylic acid (TCA) cycle enzymes of A. fumigatus by comparative analysis with four other fungal species. The open reading frames showed high amino acid sequence similarity with the other fungal citric acid enzymes and well-conserved functional domains. All genes present in Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, Candida albicans, and Neurospora crassa were also found in A. fumigatus. In addition, we identified four A. fumigatus genes coding for enzymes in the glyoxylate shunt, which may be required for fungal virulence. The architecture of multi-gene encoded enzymes, such as isocitrate dehydrogenase, 2-ketoglutarate, succinyl-CoA synthetase, and succinate dehydrogenase was well conserved in A. fumigatus. Furthermore, our results show that genes of A. fumigatus can be detected reliably using GlimmerM.

• 대한약학회:학술대회논문집
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• 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.1
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• pp.130.3-131
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• 2003

The biological effects of NADPH-dependent isocitrate dehydrogenase (IDPc) inhibitor. DA-11004, was examined in obese zucker rats or streptozotocin-induced diabetic SD rats. Diabetes was induced by injection of streptozotocin (50mg/kg) dissolved in citrate buffer (pH 4.8) into the tail vein and induction of diabetes was confirmed by the measurement of the tail blood glucose level at 48h. DA-11004 (30mg/kg, po) was injected for successive 7days and significantly reduced the plasma glucose in streptozotocin-induced diabetic rats (P<0.05). (omitted)

• 대한약학회:학술대회논문집
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• 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.1
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• pp.132.2-133
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• 2003

The biological effects of NADPH-dependent isocitrate dehydrogenase (IDPc) inhibitor, DA-11004, was investigated in obese diabetic (ob/ ob) mice. DA-11004, metformin, and oxalomalate were daily injected (ip) for 8 weeks and after completing an 8-week period of experiment, mice were sacrificed at 1 hr after the last drugs treatment to collect their blood, liver, and adipose tissues(epididymal and retroperitoneal fat). (omitted)

• 대한약학회:학술대회논문집
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• 대한약학회 2003년도 Proceedings of the Convention of the Pharmaceutical Society of Korea Vol.1
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• pp.129.2-130
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• 2003

Recently. it has been known that NADPH-dependent isocitrate dehydrogenase (IDPc) involves in the obesity through production of NADPH, an important cofactor. DA-11004 is a synthetic potent IDPc inhibitor that $IC_{50}$ for IDPc is 1.49$\mu\textrm{M}$ (0.9$\mu$g/ml). The purpose of this study was to evaluate the effects of DA-11004 on the high fat high sucrose (HF)-induced obesity in C57BL/6 mice. (omitted)

• Journal of Plant Biology
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• 제25권2호
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• pp.73-81
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• 1982

The changes in activities of glyoxysomal and peroxisomal enzymes during the transition from fat degradation to photosynthesis were investigated with the cotyledns of rape (Brassica napus L.) seedlings. The development and disappearance of glyoxysomal enzyme (isocitrate lyase, EC 4.1.3.1; malate dehydrogenase, EC 1.1.1.37; catalase, EC 1.11.1.6) activities took place independently of light. It is concluded that the mobilization of storage fat is independent of photomorphogenesis. During early periods of development in the dark of light (days 1 through 3), the glyoxysomal enzyme activities were relatively high and the enzyme activities rose to a peak at 3rd day after sowing. Thereafter, the activities decreased gradually. While glyoxysomal enzyme activities were dropping, the peroxisomal enzyme (glycolate oxidase, EC 1.1.3.1) activities were increasing rapidly during the transition period in the light. Moreover, the changes of enzyme activities of the common microbody marker, catalase, indicated both functional patterns. The enzyme patterns in rape cotyledons indicate that the glyoxysomal function of microbodies is replaced by the peroxisomal function of these organelles during the transition from fat degradation to photosynthesis.

• 한국수산과학회지
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• 제29권2호
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• pp.256-261
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• 1996

본 연구는 우리나라의 대표적인 연어과 어류인 은연어, 무지개송어 및 그 잡종3배체의 부화자어에 있어서의 동위효소를 분석하여 부화후 초기의 유전적 특징과 유전현상을 규명하고 이를 토대로 이들 종 및 잡종의 식별을 위한 genetic marker를 찾아보고자 5개의 동위효소에 대한 분석을 실시하였다. 이들 중 PGI에서는 종간 차이를 나타내지 않은 반면에 LDH, MDH, IDH 및 PGM 등은 은연어와 무지개송어간에 종 특이적 pattern을 나타내었는데 이는 이들 어종간의 발생 초기에 종의 식별을 위한 유전적 marker로써 유용한 것으로 판단되며, 또한 잡종 및 잡종3배체의 genetic marker로서도 상기 네 가지의 동위효소는 유용한 것으로 나타났다.

• ALGAE
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• 제31권2호
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• pp.167-174
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• 2016

Biological response of cells to variable conditions should affect the expression level of certain genes. Quantification of these changes in target genes needs stable internal controls. Real-time quantitative polymerase chain reaction (PCR) has traditionally used reference or ‘housekeeping’ genes, that are considered to maintain equal expression in different conditions, to evaluate changes in target genes between samples and experimental conditions. Recent studies showed that some housekeeping genes may vary considerably in certain biological samples. This has not been evaluated in red algae. In order to identify the optimal internal controls for real-time PCR, we studied the expression of eleven commonly used housekeeping genes; elongation factor 1-alpha, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, β-actin, polyubiquitin, 30S ribosomal gene, 60S ribosomal gene, beta-tubulin, alpha-tubulin, translation initiation factor, ubiquitin-conjugating enzyme, and isocitrate dehydrogenase in different life-history stages of Bostrychia moritziana. Our results suggest that glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) and 30S ribosomal gene, have the most stable gene expression levels between the different life history stages (male, female, carposporophyte, and tetrasporophyte), while the other genes are not satisfactory as internal controls. These results suggest that the combinations of GAPDH and 30S would be useful as internal controls to assess expression level changes in genes that may control different physiological processes in this organism or that may change in different life history stages. These results may also be useful in other red algal systems.

• 생명과학회지
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• 제26권4호
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• pp.414-418
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• 2016

본 연구에서는 제주흑돼지와 랜드레이스 품종 사이에서 생산된 F₂ 교배 집단의 경제형질과 isocitrate dehydrogenase 3, beta subunit (IDH3B) 유전자의 유전적 다형성의 상관관계를 시험하였다. IDH3B 유전자의 프로모터 지역에서 304-bp 삽입/결실 돌연변이를 기준으로 전체 1,105 F₂들에 유전자형 분석에 이용하였다. 기초축군과 F₁, F₂에서 세 가지 유전자형(AA, AB, BB)이 모두 발견되었다. 통계적 상관 분석결과에서 도체중(CW), 세 지점(4-5번 흉추 사이, 11-12번 흉추 사이, 13번 흉추-1번 요추 사이)에서 측정한 등지방두께와 도체장(CL)의 수준은 유전자형애 따른 유의적인 차이를 나타내었지만(p<0.05), 육색(MC), 등심단면적(EMA)과 근내지방도(MARB)은 유의적인 차이를 나타내지 않았다(p>0.05). IDH3B 동형접합자 BB를 보유한 F₂ 돼지들은 도체중이 더 무겁고(80.790±0.725 kg), 도체장은 더 짧은(101.875±0.336 cm) 양상을 보였다(p<0.05). 또한, IDH3B 유전자형 BB인 개체들은 IDH3B AA나 AB 유전자형에 비해 4-5번 흉추 사이, 11-12번 흉추 사이에서 측정된 등지방두께도 더 두꺼운 수준을 나타내었다(p<0.05). 이상의 결과들은 IDH3B의 유전적 다양성이 제주흑돼지와 랜드레이스와 관련된 교배육종 체계의 산육능력 향상을 위한 유전적 분자 표지인자로 활용될 수 있음을 나타내었다.

• 한국가금학회지
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• 제13권1호
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• pp.31-40
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• 1986

정상적인 산란계와 란소 기능을 정지시킨 비산란계의 에너지 대사를 비교한 결과는 다음과 같다. 1. 절식시 열생산량(FHP)은 산란계 109.7Kcal/kg$^{0.75}$ , 비산란계 87.4 Kcal/kg$^{0.75}$ 이며 전자의 FHP가 약 25.5% 높았다. 2. 유지를 위한 ME요구량(MEm)에 있어서 산란계 149Kcal/kg$^{0.75}$ 에 대하여 비산란계는 135Kcal/kg$^{0.75}$ 이며 산란계가 10% 높았다. 이는 유지시라 하드라도 란생산을 계속하는 이상체내에서의 산란을 위해 대사작용이 계속되기 때문으로 생각된다. 3. 생산을 위한 ME의 정미이용효율(NAME)은 산란계 77%, 비산란계 83%이었다. 이 경우 체에너지 축적이 마이너스였던 산란계의 NAME은 주로 란생산을 위한 ME 이용효율이며 또 산란이 중지된 비산란계의 NAME은 증체를 위한 이용효율에 해당된다고 생각된다. 4. 산란계와 비산란계에 있어서 각각 체중과 체에너지 축적의 회귀식으로 구한 체중 1g 증감할때의 에너지치는 산란계 3.54Kcal, 비산란계5.04Kcal 가 된다. 즉, 산란계는 비산란계에 비하여 약 70%의 에너지가를 나타내어 이들은 체에너지가 란생산을 위해 이용되는 경우의 이용효율을 나타내는 것이라 생각된다. 5. 혈청중 T$_3$ 및 T$_4$ 측정결과 T$_4$농도는 유의차가 없는데 비하여 T$_3$ 농도는 산란계가 비산란계에 비하여 유의적으로 높았다. 6. 간추출액중 에너지 대사에 관여하는 효소, ATP citrate lyase, fructose diphosphate aldolase, isocitrate dehydrogenase 및 glutamic pyruvic transaminase활성을 측정한 결과 간추출액 1mg 1분간당 분해기질을 기준으로 할 때 측정한 4개 효소활성은 산란계가 비산란계에 비하여 유의적으로 증가한다. 그러나 간 1당 1분간 분해 기질을 기준으로 할 때 ICD와 APT citrate lyase만이 산란계의 활성이 현저히 증가하였다.

• 대한약리학회지
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• 제21권1호
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• pp.12-26
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• 1985

흰쥐 뇌 미토콘드리아에 의한 $O^{-}_{2}{\cdot}$ 의 생성과 이 radical의 유해작용 및 그 작용기전을 알아보기 위하여 본실험을 수행하였다. Succinate와 antimycin존재하에서 미토콘드리아는 $O^{-}_{2}{\cdot}$을 생성하였으며 이는 SOD-inhibitable NBT환원으로 확인되었다. 동일 조건에서 $H_2O_2$는 일차생성물인 $O^{-}_{2}{\cdot}$의 dismutation으로 생성됨을 알수 있었다. 상기조건에서 미토콘드리아의 막지질이 파괴되었고 반응액에 첨가된 isocitrate dehydrogenase와 적혈구에 각각 불활성화와 용혈이 초래되었다. 이같은 작용은 $Fe^{++}$이 있을때만 관찰 되었다. 그리고 독작용은 superoxide dismutase 혹은 castalase에 의해서 억제되었다. 또한 methional을 첨가하였을 때 ethylene이 생성되었으며 그 생성은 $Fe^{++}$에 의하여 현저히 증가하였다. Ethylene 생성 역시 상기 효소에 의하여 억제되었다. 따라서 미토콘드리아에서 발생된 $O^{-}_{2}{\cdot}$은 거대분자 및 세포에 독성을 나타낼수 있으며 이같은 작용은 $Fe^{++}$의 촉매작용에 의한 $O^{-}_{2}{\cdot}$와 $H_2O_2$의 상호작용으로 발생되는 $OH{\cdot}$ 에 의한것으로 추측되었다. 이상의 결과는 미토콘드리아가 유독성 산소 radical을 발생하므로 조직손상을 시킬 수 있다는 가능성을 시사하는 증거라고 생각되었다.