• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권12호
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• pp.2019-2029
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• 2016

Zinc finger proteins are among the most extensively applied metalloproteins in the field of biotechnology owing to their unique structural and functional aspects as transcriptional and translational regulators. The classical zinc fingers are the largest family of zinc proteins and they provide critical roles in physiological systems from prokaryotes to eukaryotes. Two cysteine and two histidine residues ($Cys_2His_2$) coordinate to the zinc ion for the structural functions to generate a ${\beta}{\beta}{\alpha}$ fold, and this secondary structure supports specific interactions with their binding partners, including DNA, RNA, lipids, proteins, and small molecules. In this account, the structural similarity and differences of well-known $Cys_2His_2$-type zinc fingers such as zinc interaction factor 268 (ZIF268), transcription factor IIIA (TFIIIA), GAGA, and Ros will be explained. These proteins perform their specific roles in species from archaea to eukaryotes and they show significant structural similarity; however, their aligned amino acids present low sequence homology. These zinc finger proteins have different numbers of domains for their structural roles to maintain biological progress through transcriptional regulations from exogenous stresses. The superimposed structures of these finger domains provide interesting details when these fingers are applied to specific gene binding and editing. The structural information in this study will aid in the selection of unique types of zinc finger applications in vivo and in vitro approaches, because biophysical backgrounds including complex structures and binding affinities aid in the protein design area.

• 한국자동차공학회논문집
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• 제23권2호
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• pp.199-207
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• 2015

Solid materials of ammonia sources with SCR have been considered for the application of lean NOx reduction in automobile industry, to overcome complex problems of liquid urea based SCR. These solid materials produce ammonia gas directly with proper heating and can be packaged by compact size, because of high volumetric ammonia density. Among ammonium salts and metal ammine chlorides, calcium ammine chloride was focused on this paper due to low decomposition temperature. In order to make calcium ammine chloride in lab-scale, simple reactor and glove box was designed and built with ammonium gas tank, regulator, and sensors. Basic test conditions of charging ammonia gas to anhydrous calcium chloride are chosen from equilibrium vapor pressure by Van't Hoff plot based on thermodynamic properties of materials. Synthetic method of calcium ammine chloride were studied for different durations, temperatures, and pressures with proper ammonia gas charged, as a respect of ammonia gas adsorption rate(%) from simple weight calculations which were confirmed by IC. Also, lab-made calcium ammine chloride were analyzed by TGA and DSC to clarify decomposition step in the equations of chemical reaction. To understand material characteristics for lab-made calcium ammine chloride, DA, XRD and FT-IR analysis were performed with published data of literature. From analytical results, water content in lab-made calcium ammine chloride can be discovered and new test procedures of water removal were proposed.

• 공업화학
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• 제31권5호
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• pp.475-480
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• 2020

Lactic acid와 키토산을 Cu(II) 이온과 반응시켜 합성한 착물을 사용하여 유기인 유사 독성물질인 DFP (Diisopropyl fluorophosphate) 분해반응에 적용하였다. Cu(II)-lactic acid 착물의 경우 homogeneous 상태에서 분해반응 반감기가 37. 1 min으로 분해성능이 우수하였다. 1 kDa 저분자량 수용성 키토산으로 합성한 Cu(II)-LMWS chitosan 착물은 결정화 후에는 용해도가 낮아 heterogeneous 한 상태에서 분해반응이 진행되었으며 그 반감기는 32.9 h이었다. 이 결과는 기존에 연구된 18 kDa 키토산 Cu(II)착물의 분해반응속도보다 약 16배 정도 증가된 것이다. Cu(II)-LMWS chitosan 착물을 결정화하지 않고 homogeneous한 상태로 진행한 분해반응에서는 반감기가 8.75 h로 용해도에 따라 약 4배의 차이를 확인할 수 있었다.

• 대한화학회지
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• 제33권5호
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• pp.510-515
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• 1989

테트라에틸렌펜타아민과 포름알데히드의 주형축합반응으로부터 새로운 펜타아자 거대두고리 리간드인 1,3,6,9,12-펜타아자비시클로[10,2,1]펜타데칸(D)의 니켈(II) 및 구리(II) 착화합물 $[Ni(D)]^{2+},\;[Cu(d)]6{2+}\;그리고\;[Cu(D)Cl]^+$를 합성하였다. 거대두고리 리간드인 D에는 한 개의 이미다졸리딘 고리가 있다. $[Ni(D)]^{2+}와 [Cu(D)]^{2+}$는 5-5-5-6 킬레이트고리 배열로 된 평면사각형 구조를 이루며, 5-배위 착이온인 $[Cu(D)Cl]^+$의 구조는 그의 전자스펙트럼으로 볼 때 사각피라미드일 것으로 보인다. 이들 니켈(II) 및 구리(II) 착화합물의 합성과 확인 그리고 분광학적인 특성과 화학적인 특성이 논의된다.

• 대한화학회지
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• 제32권6호
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• pp.528-535
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• 1988

이성분 혼합용매 속에서 $[Mo_2O_3(Ox)_2(OxH)_2(NCS)_2]$의 산소고리화 반응에 대한 속도론적 연구는 분광광도법으로 수행되었다. 이 때 온도는 $20^{\circ}C$ 에서 $40^{\circ}C$, 압력은 1bar에서 1500 bar로 변화시켰다. 관찰된 속도 상수는 수소이온 농도의 증가에 따라 증가하고 티오시안이온 농도의 증가에 따라서는 감소한다. 공용매의 유전상수가 증가할수록 더욱 안정한 중간체가 형성된다. 관찰된 속도상수는 $k_{obs}^{-1} = k^{-1} (1 + K^{-1}[H_2O]^{-1})로 주어진다. 모든 활성화파라미터는 양의 값이다. [Mo_2O_3(Ox)_2(OxH)_2(NCS)_2]$의 산소고리화 반응은 Id 메카니즘에 의해 진행된다.

• Bulletin of the Korean Chemical Society
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• 제28권8호
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• pp.1249-1255
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• 2007

We have investigated the photophysical properties of dansyl-N-methylaminobenzoic acid (DABAH) as a ligand and its lanthanide (Ln3+)-cored complexes (Ln3+-(DABA)3(terpy)) in order to determine the main energy transfer pathway for sensitized near infrared emission of Ln3+ ions (Ln3+ = Nd3+ and Er3+) in Ln3+- (DABA)3(terpy). The fluorescence spectrum of DABAH shows a large Stokes shift with increasing solvent polarity. This large Stokes shift might be due to the formation of a twisted intramolecular charge transfer (TICT) state, as demonstrated by the large dipole moment in the excited state. It is in good agreement with the result that the phosphorescence even in the Gd3+-cored complex based on the DABAH ligand was not observed, maybe due to the highly forbidden character of the S1 → T1 transition in the DABAH ligand. A short decay component (ca. 1 ns) was observed in Er3+-(DABA)3(terpy) whereas the fluorescence lifetimes of DABAH and its Gd3+-(DABA)3(terpy) are observed about ~10 ns. The short component could be originated from the energy transfer process between the ligand and the Ln3+ ion. Based on the fluorescence of DABAH its Ln3+- (DABA)3(terpy), the sensitization of Ln3+ luminescence in the Ln3+-(DABA)3(terpy) takes place by the energy transfer via the TICT state of DABAH in the excited singlet state rather than via the excited triplet state.

• 대한화학회지
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• 제30권1호
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• pp.76-83
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• 1986

카르복실기를 갖는 리간드들과 옥소바나듐(IV) 사이에 형성되는 착화합물 ($VO(picn)_2$, $VO(htmq)_2$, $VO(quin)_2$ 및 $VO(pyra)_2{\cdot}2H_2O)$들을 합성하여 그들의 IR 및 자기적 특성을 조사하였다. 이들의 자화율 값과 V=O결합의 신축진동수 값으로부터 $VO(picn)_2$ 및 $VO(htmq)_2$착화합물에 있어 강한 분자간 상호작용이 존재하는 것으로 추정하였다. IR데이타를 근거로 할 때 4개의 옥소바나듐(IV) 착물들에 있어 카르복실기는 모두 한자리 배위자로서 작용함을 알 수 있었다. 자유리간드와 옥소바나듐 착물의 IR스펙트럼을 비교 검토하므로서 중심원자와 리간드주게원자들로 구성되는 배위권에서의 기본 진동 형태를 분류하고 착물 형성 후 나타난 새로운 IR흡수띠들을 분류한 진동 형태와 대응시켰다.

• 대한화학회지
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• 제34권3호
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• pp.232-238
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• 1990

Zn의 생화학적 역할을 연구하기 위하여, 간단한 모델시스템을 설정하였다. 즉, Zn가 리간드인 $OH_2나 NH_3$와 배위결합을 이루거나 carboxypeptidase A (CPA)의 기질에 해당하는 펩티드의 O=C-와 배위결합을 할 때, 그 기하학적 구조 및 net atomic charge의 변화를 조사하였다. Double Zeta basis set를 사용한 ab initio HF-SCF 계산에 의하면, Zn는 이들 리간드의 O-H, N-H, O=C-를 매우 polar하게 만든다. 특히, 펩티드의 탄소는 친전자성이 매우 증가하여, nucleophile의 공격을 용이하게 받을 수 있을 것으로 예측되었다. 또한, CPA에서 Zn 주위에 있는 리간드의 분자배위 상태를 조사하기 위하여, CPA+glycyltyrosine complex에 관한 molecular mechanics방법을 적용하였다. 이 결과를 X-ray 결과와 비교하였을 때, Zn는 4배위 결합 이외에 물분자도 관여할 것으로 예측된다.

• 대한화학회지
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• 제43권3호
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• pp.307-314
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• 1999

대장균의 RNase P의 RNA 성분인 M1 RNA는 대장균 rnpB 유전자의 주요한 일차전사물인 선구-M1 RNA로부터 3'가공으로 생성된다. 이 가공 활성을 가지고 있는 효소 분획을 부분 정제하고 그 특성을 조사하였다. 이 활성 분획을 높은 염농도에 노출시키면 가공 활성이 불활성화하는 것으로 보아, 가공효소는 여러 효소로 이루어진 효소 복합체인 것으로 추정된다. 이 효소 분획은 화학적 핵산 가수분해효소인 납(II) 이온으로 처리하면 효소 활성을 잃지만, 효소 분획 자체에서 추출한 RNA를 가하면 효소 활성을 되찾는다. 이 결과는 효소 활성에는 RNA 분자가 필요하다는 것을 시사한다. 부분 정제한 효소로 형성되는 절단자리들의 분석 결과도, 3'가공과정이 여러 효소에 의하여 일어나고, 적어도 두 가지 다른 경로로 일어난다는 것을 암시한다.

• 대한화학회지
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• 제36권1호
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• pp.81-86
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• 1992

M(S-S,ph)(N-N,H) (M = Ni(II), Pd(II), Pt(II); (S-S,ph) = 1,2-diphenylethylenedithiolate; (N-N,H)=1,10-phenanthroline) 착물의 친전자성 및 친핵성 리간드 반응을 조사하였다. norbornadiene과의 반응성은 중심금속의 역결합의 정도에 의존하며 2,5-dithia-3,4-diphenyl-tricyclo[4,4,1,0]-undeca-3,8-diene을 생성하였다. methyl iodide와의 반응은 (N-N,H) 리간드의 이탈 능력에 지배되며 메틸화된 $M(S-S,ph)_2$ 착물을 생성하였다. 이 반응의 주생성무리은 열 분해에 의해 얻어진 ${\alpha},{\alpha}{\prime}$,-bismethylthiostibene $(CH_3S-SCH_3,ph)$의 구조로부터 M(S-S,CN)(N-N,H)((S-S,CN) = 1,2-dicyanoethylenedithiolate)의 새로운 혼합 리간드 착물을 합성하였다.