해양생물에는 육상생물자원에서는 존재하지 않는 다양한 화합물이 많이 존재하는데 이들 화합물은 새로운 치료제 및 대체 치료법을 개발하는데 유용하게 이용될 수 있다. 현재 해조류의 다양한 생리활성에 대한 연구가 진행되고 있으며 최근에는 여러 병원성 및 인체 감염균에 대한 항균효과를 나타내어 신약개발의 보고로 다양한 연구가 진행이 되고있다. 즉, 해조류는 천연물신약 또는 새로운 치료제 개발에 중요한 생물자원이다.
A strain producing a potent protease was isolated from turban shell. The strain was identified as Bacillus sp. S17110 based on phylogenetic analysis. The enzyme was purified from culture supernatant of Bacillus sp. S17110 to homogeneity by ammonium sulfate precipitation, SP-Sepharose, and DEAE-Sepharose anion exchange chromatography. Protease activity of the purified protein against casein was found to be stable at pH 7 to pH 10 and around $50^{\circ}C$. Approximately 70% of proteolytic activity of the enzyme was detected either in the presence of 100 mM SDS or Tween 20. The enzyme activity was enhanced in the presence of $Ca^{2+},\;Zn^{2+},\;Mg^{2+}$, but was inhibited by EDTA, indicating that it requires metal for its activity. The purified enzyme was found to be a monomeric protein with a molecular mass of 75 kDa, as estimated by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and gel filtration chromatography. The purified enzyme was analyzed through peptide fingerprint mass spectra generated from matrix-assisted laser desorption ionization-time-of-flight-mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) and a BLAST search, and identified as immune inhibitor A (inhA) deduced from nucleotide sequence of B. cereus G9241. Since InhA was identified as protease that cleave antibacterial proteins found in insect, inhA-like protease purified from Bacillus sp. S17110 might be pathogenic to sea invertebrates.
Kim, In-Woo;Markkandan, Kesavan;Lee, Joon Ha;Subramaniyam, Sathiyamoorthy;Yoo, Seungil;Park, Junhyung;Hwang, Jae Sam
Journal of Microbiology and Biotechnology
/
제26권11호
/
pp.1863-1870
/
2016
Antimicrobial peptides/proteins (AMPs) are present in all types of organisms, from microbes and plants to vertebrates and invertebrates such as insects. The grasshopper Oxya chinensis sinuosa is an insect species that is widely consumed around the world for its broad medicinal value. However, the lack of available genetic information for this species is an obstacle to understanding the full potential of its AMPs. Analysis of the O. chinensis sinuosa transcriptome and expression profile is essential for extending the available genetic information resources. In this study, we determined the whole-body transcriptome of O. chinensis sinuosa and analyzed the potential AMPs induced by bacterial immunization. A high-throughput RNA-Seq approach generated 94,348 contigs and 66,555 unigenes. Of these unigenes, 36,032 (54.14%) matched known proteins in the NCBI database in a BLAST search. Functional analysis demonstrated that 38,219 unigenes were clustered into 5,499 gene ontology terms. In addition, 26 cDNAs encoding novel AMPs were identified by an in silico approach using public databases. Our transcriptome dataset and AMP profile greatly improve our understanding of O. chinensis sinuosa genetics and provide a huge number of gene sequences for further study, including genes of known importance and genes of unknown function.
본 연구는 서해 중부 연안에 출현하는 쥐노래미 (Hexagrammos otakii)의 위내용물 분석을 통하여, 위내용물 조성과 성장 및 계절별 식성변화를 분석하였다. 쥐노래미의 전장 (total length, TL)은 5.6 cm에서 32.4 cm의 범위였다. 쥐노래미는 단각류 (amphipods), 새우류 (carid shrimps), 어류 (teleosts)를 주로 섭식하였고, 그 외 다양한 저서 갑각류와 무척추동물을 소량 섭식하였다. 새우류와 어류는 미성어 (immature)와 성어 (mature)의 위내용물에서 공통적으로 우점하였다. 단각류와 갯지렁이류 (polychaetes)는 그 다음으로 우점하였는데, 단각류는 작은 크기의 어류에서, 갯지렁이류는 큰 크기의 어류에서 그 비율이 더 높았다. DISTLM (distance-based linear modelling) 결과, 쥐노래미의 위내용물은 전장, 계절, 수온에 따라 유의하게 변하였지만, 성숙도와는 관련이 없었다.
The distribution characteristics of functional feeding groups and biological evaluation of water quality with benthic macroinvertebrates were investigated from 2013 to 2014 in the mountain streams of Jirisan National Park. Both quantitative and qualitative collection had been performed six times during study periods in twelve sites located at upstream, midstream and downstream of four valleys, Chilsungol, Baemsagol, Daesunggol and Piagol of freshwater ecosystem in Jirisan National Park. As results, the total collected benthic macroinvertebrates were 3 phyla, 4 classes, 11 orders, 37 families, 107 species and 4,028 individuals. In 2013, 3 phyla, 4 classes, 10 orders, 32 families, 89 species and 1,829 individuals were collected. And in 2014, 3 phyla, 4 classes, 9 orders, 31 families, 80 species and 2,199 individuals were identified. The total dominant species was Ecdyonurus kibumensis, and EPT groups occupied 80.39% of total species number. Biotic indices were also compared to site and to season. The dominant index (DI) was highest at the downstream of Baemsagol in the spring of 2013, and the evenness index (J') was highest at the downstream of Daesunggol in the summer of 2013. Both diversity index (H') and richness index (RI) were highest at the upstream of Baemsagol in the summer of 2014. The correlation between altitude above sea level and functional feeding groups of benthic macroinvertebrates was also researched in this study. As a result, the species number of shredders and predators have significantly increased according to the increase of the altitude of their habitat. On the other hand, individuals of gathering collectors have increased according to the increase of altitude. The biological water quality was evaluated and compared with several methods in this study, and we suggest that ESB and GPI are more appropriate than KSI and BMI to evaluate biological water quality of mountain stream water.
It is suggested that Urechis unicinctus is a filler feeder as like many tide and watery invertebrates which filtrate food materials by ciliary movement. However, the structure of the filter is not yet known in U. unicinctus, nor the filtering mechanism is not well understood. This study reveals ciliated epithelial cells in the foregut and the features of the cilia are good accord with that of known filtrating apparatus of other tide animals. This may implies that the foregut is in function of filtration and the food materials are filtrated by the ciliary movement. With the observation of the filtrating apparatus in the foregut, the intestine of U. unicinctus can be functionally compartmented into 3 parts. These are already known midgut and hindgut in function of digestion and respiration respectively, and the foregut in function of filtrating apparatus for foods. The filtrating apparatus of U. unicinctus is composed of the pseudostratified columnar epithelial cells with numerous cilia. The cilia are well differentiated kinocilia with the typical microtubule pattern, kinetosome and cilia roots. There are two kinds of striated cilia roots, the main root and the accessory root. The main root is extended perpendicularly from the cell surface to basement membrane and the short accessory root is branched with an acute angle of about $80^{\circ}$ from the main root at level of basal plate of the kinetosome. The spacial approaches of the main root with the large fused form of mitochondria is one of the characteristic features which might be in structural consideration an intimate association between energy source and energy mass consuming cell organelles.
Lepomis macrochirus from the family Centrarchidae, commonly known as Bluegill sunfish, is an introduced freshwater fish in Korea that thrives in lakes, ponds, reservoirs and rivers. Since its introduction into Korea in 1969, Lepomis macrochirus has rapidly dispersed out and increased in number almost all over the freshwater ecosystems in Korea. Consequently this species causes a severe ecological problem, threatening native fishes due to its omnivorous foraging behaviors upon fish juveniles and many freshwater invertebrates. To address population genetic structure of L. macrochirus, 74 fish samples from 10 populations were collected and compared for their mitochondrial D-loop control region. As the result we found that the genetic diversity of L. macrochirus is extremely low such as resulting only four haplotypes with a few nucleotide differences among them. Analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the source of population genetic variation is largely retained in the comparisons among individuals within populations, while it is relatively low with slight significance at the highest hierarchical group. This distribution pattern differs from what is expected when biogeography is under the influence of natural geographic barriers such as mountain ranges in Korea. Instead the result is accord with the influential role of random spreading events facilitated by local people for aquaculture and fishing, and subsequent dispersals since its single point of introduction into Korea.
Rao, Zhili;Kim, So Young;Li, Xiaotong;Kim, Da Som;Kim, Yong Ju;Park, Jung Hee
Molecules and Cells
/
제43권9호
/
pp.784-792
/
2020
Arginine kinase (AK), a bioenergy-related enzyme, is distributed widely in invertebrates. The role of highly conserved histidines in AKs is still unascertained. In this study, the highly conserved histidine 284 (H284) in AK of Daphnia magna (DmAK) was replaced with alanine to elucidate the role of H284. We examined the alteration of catalytic activity and structural changes of H284A in DmAK. The catalytic activity of H284A was reduced dramatically compared to that in wild type (WT). Thus the crystal structure of H284A displayed several structural changes, including the alteration of D324, a hydrogen-bonding network around H284, and the disruption of π-stacking between the imidazole group of the H284 residue and the adenine ring of ATP. These findings suggest that such alterations might affect a conformational change of the specific loop consisting of G310-V322 at the antiparallel β-sheet region. Thus, we speculated that the H284 residue might play an important role in the conformational change of the specific loop when ATP binds to the substrate-binding site of DmAK.
Vibrio harveyi, one of the major causal agent of vibriosis, affects a diverse range of marine vertebrates and invertebrates over a wide geographical area. The aims of this study were to investigate the characteristics of extracellular products (ECPs) from an isolate of the pathogenic non‐luminous V. harveyi and the luminous V. harveyi. And ECPs of V. harveyi were examined the pathogenicity to the black rockfish, Sebastes schlegeli, and histopathological traits of internal organs injected by ECPs. Four strains of V. harveyi cultures produced ECPs showing various enzymatic activites (caseinase, gelatinase, phospholipase, lipase, haemolysin). The ECPs showed strong cytotoxicity on macrophages of black rockfish, Sebastes schlegeli and olive flounder, Paralichthys olivaceus. Especially, the virulence of ECPs from the isolate of V. harveyi FR 2 was higher in the intraperitoneally injected black rockfish. Also, the ECPs of V. harveyi FR 2 caused the expansion of sinusoids in the liver, the activation of ellipsoid in the spleen and the sloughing of the epidermal cell in the intestine. It was suggested that the ECPs from V. harveyi play an important role in the pathogenicity process of the V. harveyi.
Fipronil, the phenylpyrazole insecticide, is effective and used in various fields. Especially, fipronil was reliable because it was known to be specific on invertebrate animals than vertebrate animals including mammals. However, fipronil had potential risks that affect vertebrate animals as it blocks the gamma-aminobutyric acid (GABA) receptors that also exists in vertebrates as well as invertebrates. Therefore, it was necessary that harmful effects of fipronil on vertebrates are clarified. For this purpose, the zebrafish (Danio rerio) were used on behalf of vertebrate animals in present study. The zebrafish were exposed to 5 ㎍/L, 25 ㎍/L, and 50 ㎍/L of fipronil during 12, 24 and 72 hours. To closely observe toxic process, 12 hours and 24 hours of additional time point were set in the exposure test. Nuclear magnetic resonance (NMR)-based metabolomics is an approach to detect metabolic changes in organism resulted from external stimuli. In this study, NMR-based metabolomics showed the metabolic changes in zebrafish caused by fipronil exposure. Metabolic analysis revealed that fipronil interfered with energy metabolism and decreased the antioxidant ability in zebrafish. Antioxidant ability decline was remarkable at high exposure concentration. In addition, metabolic analysis results over time suggested that reactions for alleviating the excessive nerve excitation occurred in zebrafish after fipronil exposure. Through this study, it was elucidated that the adverse effects of fipronil on vertebrate animals are evident. The risk of fipronil on vertebrates can be no longer ignored. Moreover, this study has a meaning of practically necessary research for organism by examining the effects of fipronil at low concentrations existed in real environment.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.