• 제목/요약/키워드: interstrain polymorphism

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대식가시아메바(Acmthamoebapokphaga) 일곱 분리주간의 동위효소 profile과 Mitochondria DNA fingerprint의 다양성 (Interstrain polymorphisms of isoenzyme profiles and mitochondrial DNA fingerprints among seven strains assigned to Acanthamoeba polyphaga)

  • 공현희;박준형;정동일
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제33권4호
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    • pp.331-340
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    • 1995
  • 형태적으로 Aconthamoeba polyphaga로 동정긴 일곱 분리주의 동위효소 profile과 Mitochondria (Mt) DNAangerprint를 비교 분석하였다. 8가지 제한효소(B91 II. Sca I, Cla I, EcoR I, Xba I, Kpa I, Sal I. 및 Sst I)에 의한 Mt DNA fhlgerprint는 주간의 심한 다양성을 나타내었다. B가지 동위효소 (acid phosphatase, lactate dehydrogenase 및 glucose-6-phosphate dehydrogenase)는 주간의 심한 다양성을 나타내었으나 다른 3가지 동위효소(glucose phosphate isomerase, leucine aminopeptidase 및 malatedehydrogenase)는 비슷한 양상으로 나타났다 Ap 주의 동위효소 양상과 Mt DNA fmgerprint는 Jones 주와 동일하였다. Mt DNA fingerprinting은 대식가시아메바 주의 동정과 분리에 매우 유용함을 알았다. Aconthamoeba polvphasa의 우리말 학명을 대식가시아메바로 제안한다.

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카스텔란니가시아메바(Acanthamoeba castellanii) 한국 토양분리주 KA/S2의 생화학적 및 분자생물학적 특성 (Biochemical and molecular characterization of a strain KA/S2 of Acnnthamoebc castellanii isolated from Korean soil)

  • 정동일;공현희
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제34권1호
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    • pp.79-86
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    • 1996
  • 형태적으로 Aconaqmoebcusteuon리로 동정된 한국토양분리주 KA/S2의 일부 특성을 파악하여 A. castellanii로 알려진 4가지 reference 주(Castellani, Neff, fna 및 Chang주) 와 비교하였다 K4/s2주의 mitochondria(Mt) DNARFLP와 isoelectricforusing(IEF)로 분석한 동위효소 양상은 California 토양에서 분리된 Neff주의 그것과 동일하였으나 고 외의 주들 사이에는 심한 다양성이 과찰되었다. Chang주의 형태 및 전 단백질 양상은 다른 주에 비해 독특하였다. Aconamoeba app. 분리주의 동정 및 특성 파악에 Mt DNA RFLP 분석이 매우 유용할을 확인하였다. Aconamoebacasteunil의 우리말 학명을 카스텔라니가시아메바로 제안한다.

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High Prevalence of the China 1 Strain of Epstein-Barr Virus in Korea as Determined by Sequence Polymorphisms in the Carboxy-Terminal Tail of LMP1

  • Cho, Sung-Gyu;Lee, Won-Keun
    • Journal of Microbiology
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    • 제41권2호
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    • pp.129-136
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    • 2003
  • The Epstein-Barr virus (EBV)-encoded latent membrane protein 1 (LMPI) exhibits considerable sequence heterogeneity among EBV isolates. Seven distinct EBV strains have been defined based on sequence polymorphisms in the LMPI gene, which are designated China 1, China 2, China 3, Alaskan, Mediterranean, NC, and the B95-8 strains. In this study, we analyzed a 30-bp deletion and sequence variations in the carboxy-terminal region of the LMPl gene in 12 EBV isolates from spontaneous lym-phoblastoid cell lines derived from individuals with non-EBV associated cancers in Korea. Eleven of the 12 isolates showed a 30-bp deletion spanning LMPI amino acids 342 to 353, suggesting a high prevalence of the LMPI 30-bp deletion variant among EBV isolates in Korea. In addition, all 12 isolates had a 15-bp common deletion in the 33-bp repeat region and multiple base-pair changes relative to the prototype B95-8 EBV strain along with variations in the number of the 33-bp repeats. The bp changes at positions 168746, 168694, 168687, 168395, 168357, 168355, 168631, 168320, 168308, 168295, and 168225 were highly conserved among the isolates. Comparative analysis of sequence change patterns in the LMPI carboxy-terminal coding region identified nine 30-bp deletion variants as China 1, two deletion variants as a possible interstrain between the Alaskan and China 1 strains, and a single undeleted variant as a possible variant of the Alaskan strain. These results suggest the predominance of the China 1 EBV strain in the Korean population.