• 제목/요약/키워드: inter-species association

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천연활엽수림(天然闊葉樹林)에서의 수종간(樹種間) 상관관계(相關關係)와 공변이관계(共變異關係)의 분석(分析) (Analysis of Inter-Species Association and Covariation in a Natural Deciduous Forest)

  • 김지홍;권기현
    • 한국산림과학회지
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    • 제80권4호
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    • pp.360-368
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    • 1991
  • 신갈나무와 굴참나무가 우점종(優占種)인 활엽수림(闊葉樹林)에서 출현하는 37가지 목본식물(木本植物)에 대한 수종간(樹種間) 상관(相關)(association) 관계(關係)와 공변이(共變異)(covariation) 관계(關係)를 $X^2$ 검정(檢定)을 이용하여 분석(分析)하였다. 50개의 $20m{\times}20m$ 정방형(正方形) 표본구내(標本區內)에서 각 수종(樹種)의 출현(出現) 비출현(非出現)이 매개변수(媒介變數)가 되는 상관관계(相關關係)를 분석(分析)한 결과, 단풍나무는 고로쇠나무 및 음나무와 고도(高度)(${\alpha}$=0.01)의 정(正)의 상관관계(相關關係)를 갖고 있으나, 소나무와는 고도(高度)의 부(負)의 상관관계(相關關係)를 갖고 있었다. 졸참나무와 음나무, 참회나무와 노린재나무, 노린재나무와 다릅나무, 다릅나무와 산벚나무, 그리고 생강나무와 느릅나무는 상호 정(正)의 상관관계(相關關係)가 있는 것으로 나타났다. 각 수종(樹種)의 밀도(密度)와 흉고단면적(胸高斷面積)으로 비교된 공변이(共變異)의 분석(分析) 결과는 상관관계(相關關係)와 매우 부합되는 바가 많았다. 더우기 표본구(標本區)에 생존(生存)하는 수종(樹種)의 개체수(個體數)와 흉고단면적(胸高斷面積)이 매개변수(媒介變數)가 됨으로써 상관관계(相關關係)보다는 공변이관계(共變異關係)를 맺고있는 수종(樹種)들의 쌍(雙)이 많은 것으로 나타났다. 특히 천이(遷移)의 초기(初期) 혹은 중반단계(中盤段階) 수종(樹種)인 소나무는 대부분의 천이(遷移) 후기(後期) 수종(樹種) 혹은 극성상(極盛相) 수종(樹種)들과 부(負)의 공변이관계(共變異關係)가 있는 것으로 판단되었다. 이러한 생태학적(生態學的)인 정보(情報)들은 생태계(生態界) 분류(分類), 활엽수(闊葉樹) 혼효림(混淆林) 조성(造成), 그리고 미래목 선정등의 보육(保育)작업에 응용할 수 있을 것이다.

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Analysis of the Genetic Relationship among Mulberry (Morus spp.) Cultivars Using Inter-Simple Sequence Repeat (ISSR) Markers

  • Park, Eun-Ju;Kang, Min-Uk;Choi, Myoung-Seob;Sung, Gyoo-Byung;Nho, Si-Kab
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제41권2호
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    • pp.56-62
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    • 2020
  • Mulberry (Morus spp. family: Moraceae) has prime importance in the sericulture industry, and its foliage is the only natural feed of the silkworm Bombyx mori L. Traditional classification methods using morphological traits were largely unsuccessful in assessing the diversity and relationships among different mulberry species because of environmental influences on the traits of interest. For these reasons, it is difficult to differentiate between the varieties and cultivars of Morus spp. In the present study, inter-simple sequence repeat (ISSR) markers were used to investigate the genetic diversity of 48 mulberry samples genotyped using nine ISSR primers. The ISSR markers exhibited polymorphisms (53.2%) among mulberry genotypes. Furthermore, similarity coefficient estimated for these ISSR markers was found to vary between 0.67 and 0.99 for the combined pooled data. The phenogram drawn using the UPGMA cluster method based on combined pooled data of the ISSR markers divided the 48 mulberry genotypes into seven major groups. No genetic association was found in the collection area, and there was a mixed pattern between the mulberry lines. The hybridization between different mulberry species is highly likely to be homogenized due to natural hybridization.

정량분석을 통한 Eleutherococcus species의 HPLC 분석법 검증과 표준화 (Standardization of Eleutherococcus species and HPLC Method Validation for Quantitative Analysis)

  • 송미경;김미연;김호철
    • 대한본초학회지
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    • 제26권1호
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    • pp.103-110
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    • 2011
  • Objective : For the standardization and quality control of eleutheroside E in Eleutherococcus species, HPLC analysis was performed and eleutherosdie E content was compared in 23 kinds of Eleutherococcus species collected from Korea and China. Methods : The content of eleutheroside E in stem bark of Eleutherococcus species collected from Korea and China were analyzed by HPLC. 0.5% phosphoric acid and acetonitrile was used as mobile solvent. Validation of HPLC analysis method was confirmed by analyzing specificity, linearity, precision and accuracy following ICH guideline. Results : Content of eleutheroside E was determined to be 1.0-1.6% and 0.5-0.8% in Korean and Chinese E. senticosus, respectively. Content of eleutheroside E in E. sessiliflorus was 0.7-1.1% and 0.2-0.4% respectively in Korean and Chinese origin. All calibration curves showed good linear regression. The method showed good precision and accuracy with intra-day and inter-day variations of 0.880-3.442% (RSD) and 0.606-3.328% (RSD), respectively, and average recovery was of 0.141-1.363% (RSD), for the eleutheroside E analyzed. Conclusion : These results might be used to establish a criterion of eleutheroside E in Eleutherococcus species.

phytosociological studies of tridax procumbens: A case study of imo state university, owerri, imo state

  • Umeoka, N;Ogbonnaya, C.I.;Ohazurike, N.C.
    • 식품보건융합연구
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    • 제4권4호
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    • pp.26-30
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    • 2018
  • To have more insight into the nature of plant, plant scientists carry out phytosociological studies on such plant species. The phytosociological studies on Tridax procumbens. Linn was carried out at Imo State University, Owerri, Imo State between the months of July and September, 2018. Tridax procumbens Linn grows abundantly in the areas under tropical climate and supported by a sandy-loam soil. Morphological features showed a range of variations. Phytosociological investigation showed a Tridax- Mitracarpus-Digitaria plant community. Tridax procumbens was positively associated with Digitaria horizontalis, Mitracarpus scarber and Vernonia cinera. The Inter-relationship of T. Procumbens was thus determined. This study therefore is a contribution to the general ecology of the plant. Phytosociological studies helps plant scientist to have more knowledge into the nature of plant species. This study is a contribution to the general ecology of the plant Tridax procumbens. The study also shows that it has close association with mitracarpus Scarber and Digitaria horizontalis. More work should be carried out to find out if these plant species flower and produce seeds at the same time or not.

CO1 DNA 바코드 염기서열 기반 팽활(蟛螖) 신속 감별용 SCAR marker 개발 (Development of SCAR marker for the rapid assay of Paeng-hwal based on CO1 DNA barcode sequences)

  • 김욱진;노수민;최고야;장우종;문병철
    • 대한본초학회지
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    • 제39권2호
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    • pp.1-9
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    • 2024
  • Objectives : Paeng-hwal is described as an insect herbal medicine used for digestive diseases in the Dong-ui-bo-gam. The origin of this herbal medicine is limited to several small crabs, such as Helice tridens. These crab species cohabitat in the same environment and share similar morphological characteristics, making it very difficult to distinguish and collect the individual species for use in dietary supplements or herbal medicines. This study was conducted to develop a genetic identification tool for discriminating among these closely related small crab species. Methods : CO1 DNA barcode regions of 15 samples from 6 species of small crabs were analyzed to obtain the individual sequences. To identify the correct species, comparative analyses were carried out using the database of the NCBI GenBank and the NIBR. SCAR primers were designed to develop simple and rapid assay methods using inter-species specific sequences. Optimal SCAR assay conditions were established through gradient PCR, and the limit of detection (LOD) was determined. Results : Six species of small crabs (Helicana tridens, Macrophthalmus abbreviatus, Helicana tientsinensis, Helicana wuana, Chiromantes dehaani, and Hemigrapsus penicillatus), which are distributed as Paeng-hwal, were identified through CO1 sequences analysis. We also developed SCAR markers to distinguish between six small crabs at the species level. Furthermore, we established the optimal PCR assay methods and the LOD of each individual species. Conclusions : The rapid and simple SCAR-PCR assay methods were developed to identify the species and control the quality of herbal medicines for Paeng-hwal based on the genetic analyses of CO1 DNA barcodes.

천남성(天南星) 유전자 감별을 위한 DNA 바코드 분석 및 Marker Nucleotide 발굴 (Identification of Marker Nucleotides for the Molecular Authentication of Arisaematis Rhizoma Based on the DNA Barcode Sequences)

  • 김욱진;이영미;지윤의;강영민;최고야;김호경;문병철
    • 대한본초학회지
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    • 제29권6호
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    • pp.35-43
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    • 2014
  • Objectives : Official Arisaematis Rhizoma is described only three species, Arisaema amurnse, Arisaema erubescens, and Arisaema heterophyllum, in national Pharmacopoeia. However, other Arisaema species, Arisaema ringens, Arisaema takesimense and Arisaema serratum, also have been distributed as an inauthentic Arisaematis Rhizoma in the herbal market. To develop a reliable molecular authentication method for Arisaematis Rhizoma in species level, we analyzed DNA barcode regions using six Arisaema species. Methods : Thirty-eight samples of six Arisaema plants species (A. amurense, A. amurense f. serratum, A. heterophyllum, A. takesimense, and A. serratum) were collected from different habitate and nucleotide sequences of DNA barcode regions (rDNA-ITS, matK, and rbcL gene) were analyzed after PCR amplification. The species-specific sequences and phylogenetic relations were estimated using entire sequences of three DNA barcodes based on the analysis of ClastalW and UPGMA, respectively. Results : The comparative analysis of DNA barcode sequences were revealed inter-species specific nucleotides to distinguish the medicinal plant of Arisaema Rhizoma in species levels excluding between A. amurense and its subspecies (A. amurense f. serratum) and A. takesimense and A. serratum, respectively. However, we obtained sequence differences enough to discriminate authentic and inauthentic Arisaematis Rhizoma. Therefore, we suggest that these SNP type molecular genetic markers were an reliable method avaliable to identify official herbal medicines. Conclusions : These marker nucleotides could be useful to identify the official herbal medicines by providing definitive information that can identify original medicinal plant and distinguish from inauthentic adulterants and substitutes.

한반도 도서지역의 식물사회네트워크 분석 (Analysis of Plants Social Network on Island Area in the Korean Peninsula)

  • 이상철;강현미;박석곤
    • 한국환경생태학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.127-142
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    • 2024
  • 본 연구는 난온대림에 속한 도서지역에서 조사한 대량의 식생 데이터로 식물사회네트워크 분석을 통해 식물군락의 수종간 상호관계를 파악하고자 했다. 상록활엽수 성숙림에 출현하는 교목성 후박나무·구실잣밤나무·생달나무·광나무, 관목성 돈나무·자금우, 덩굴성 마삭줄·멀꿀이 서로 강한 양성결합(+)을 보였다. 이 수종들은 낙엽활엽수종과는 음성결합(-)하거나 친소관계가 없었는데 이는 입지환경 차이가 크기 때문이다. 식물사회네트워크 소시오그램에서 4개의 그룹으로 묶어 상록활엽수종인 그룹I과 낙활엽수종인 그룹II의 수종간에는 중심성과 연결성이 높게 나타났다. 소시오그램의 수종(노드) 배치와 연결정도(그룹화)는 DCA분석와 같이 환경요인과 식물군집의 특성을 간접적으로 추정 가능한 것으로 분석됐다. 식물사회네트워크상 중심성과 영향력이 큰 수종은 마삭줄·사스레피나무·생강나무·때죽나무 등이었다. 이 수종은 생태적 지위의 범위가 넓은 일반종이면서 숲틈과 훼손지 등에 흔히 출현하는 기회종의 특성과 생존전략을 갖는 것으로 보인다. 이 수종들이 식물군집의 종간 상호작용과 군집의 구조와 기능 변화에 그 역할이 클 것이다. 하지만 실제 식물사회에서 어떤 상호작용을 통해 식물군집 변화에 영향을 미치는지는 장기적인 연구와 심도 있는 논의가 필요하다.

참나무 천연림(天然林)의 임분(林分) 구조(構造)에 대한 해석(解析) (The Interpretation for Stand Structure in Natural Oak Forests)

  • 김지홍;이돈구;김진수;이경준;현정오;황재우;권기원
    • 한국산림과학회지
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    • 제82권3호
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    • pp.235-245
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    • 1993
  • 경기도(京畿道) 광주군(廣州郡)과 전라남도(全羅南道) 광양군(光陽郡)에 위치한 서울대학교(大學校) 연습림(演習林)에서 참나무류(類)가 주종을 이루고 있는 천여(天然) 활엽수림(闊葉樹林)의 구성적(構成的)인 특정을 중심으로 임분(林分) 구조(構造)를 파악하여 보다 효율적으로 경영하기 위한 기초 생태학적(生態學的) 그리고 조림학적(造林學的) 정보를 알아보기 위하여 본 연구를 수행하였다. 표본 조사 방법은 흉고직경(胸高直徑) 6cm 이상의 목본(木本) 식생(植生)에 대하여 점사분법(點四分法)을 이용하였고, 광주군의 산림에는 152개의 표본점을, 광양군 산림에는 187개의 표본점을 설정하였다. 두 지역의 조사 임분에 대하여 1) 중요치(重要値) 산출에 의한 수종(樹種) 구성(構成) 상태(狀態), 2) 주요 구성 수종별 단위 면적당 임목수, 3) 두 지역 산림의 수종(樹種) 다양성(多樣性), 그리고 4) $X^2$ 검정(檢定)에 의한 참나무류 6수종에 대한 종간(種間) 상관관계(相關關係)를 비교 분석하였다. 참나무류의 상대우점도는 경기도 광주군에서 88%정도이고, 전남 광양지역에서는 50%정도로서, 두 지역에서 굴참나무와 신갈나무가 공통적으로 높은 우점도를 나타내고 있었다. 굴참나무는 광주지역에서 낮은 분포를 보이고, 상수리나무, 떡갈나무, 갈참나무는 광양에서 거의 출현하지 않았다. 참나무군집의 종다양성과 균재도는 광주에서 각각 0.82와 0.61인 반면, 광양지역은 각각 1.09와 0.73를 나타낸 것으로 보아서, 광주지역은 인간의 간섭을 더 많이 받은 지역으로 여겨지며, 광양지역은 서어나무, 단풍나무, 고로쇠나무 등이 많이 침입하여 종다양성이 증가하고 천이가 상대적으로 더 진전되고 있었다.

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Genetic identification of Sinomenium acutum based on chloroplast gene ndhF sequences

  • Ryuk, Jin Ah;Lee, Hye Won;Ko, Byoung Seob
    • 대한본초학회지
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    • 제28권5호
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    • pp.1-6
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    • 2013
  • Objectives : This study was conducted to identify the original Sinomini Caulis et Rhizoma plant among Stephania tetrandra, Cocculus trilobus, and Aristolochiae fangchi to develop the genetic marker for Sinomini Caulis et Rhizoma. Methods : Sinomenium acutum was identified by the classification and identification committee of the National Center for Standardization of Herbal Medicines. The chloroplast ndhF gene was amplified. We performed sequences alignment analysis of Sinomenium acutum, Stephania tetrandra, C. trilobus, and A. fangchi using BioEdit program. The SFR markers designed were consisted of SF01, SR04, and SR05 primers. Results : Many variations of Sinomeni Caulis et Rhizoma are currently commercialized as herbal medicine. We compared the base sequences of the ndhF intergenic space of chloroplast DNA with Sinomenium acutum, Stephania tetrandra, C. trilobus, and A. fangchi. According to the results, it showed that the nucleotide variations were seen in 30 genes of four species. Phylogenetic analysis revealed that 4 species were classified into five groups based on an inter-group divergence in nucleotide sequence of 9%. We developed SFR marker nucleotides enough to authenticate respective species and confirmed its application on the band size at 419 base pair. These sequence differences at corresponding positions were available genetic markers to identity the Sinomeni Caulis et Rhizoma. Conclusions : Base on these results, the ndhF region was effective in distinguishing Sinomini Caulis et Rhizoma The SFR genetic marker was useful for identifying Sinomini Caulis et Rhizoma with other species.

두타산 일대 천연림에서 요인분석에 의한 산림유형 분류 (The Classification of Forest Types by Factor Analysis in Natural Forests of Dutasan)

  • 정상훈;김지홍
    • 농업생명과학연구
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    • 제46권4호
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    • pp.21-30
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    • 2012
  • 본 연구는 요인분석을 통해 수종간의 관계 및 수종 구성에 영향을 미치는 요인 등을 파악하고, 군집분석을 이용하여 두타산 일대 천연림을 대상으로 산림유형을 분류하기 위해 수행되었다. 상관관계분석을 통해 주요 수종들의 상호관계를 나타내었고, 요인분석을 통해 수종구성에 영향을 미치는 세 가지 요인을 알아보았으며 요인점수를 바탕으로 군집분석을 실시하여 산림유형을 분류하였다. 마지막으로 분산분석을 실시하여 군집분석의 결과를 평가하였다. 수종간 상관관계분석 결과와 요인분석 결과는 밀접한 관련이 있는 것으로 나타났으며, 수종 구성에 미치는 첫 번째 요인은 산림천이과정에 의한 소나무의 쇠퇴현상이었다. 두 번째 요인과 세 번째 요인은 각각 계곡의 생육환경과 산복의 생육환경이었다. 두타산 일대 산림의 수종구성에 영향을 미치는 3가지 요인을 바탕으로 군집분석을 실시하여 산림유형을 분류하였고 분산분석을 통해 분류 결과를 검증한 결과, 총 4가지의 산림유형(신갈나무-고로쇠나무-물푸레나무군집, 신갈나무군집, 신갈나무-피나무군집, 소나무군집)으로 분류되었다.