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An Orthologous Group Clustering Technique based on the Grid Computing

  • Oh, J.S.;Kim, T.K.;Kim, S.S.;Kwon, H.R.;Kim, Y.C.;Yoo, J.S.;Cho, W.S.
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
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    • pp.72-77
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    • 2005
  • Orthologs are genes having the same function across different species that specialize from a single gene in the last common ancestor of these species. Orthologous groups are useful in the genome annotation, studies on gene evolution, and comparative genomics. However, the construction of an orthologous group is difficult to automate and it takes so much time. It is also hard to guarantee the accuracy of the constructed orthologous groups. We propose a system to construct orthologous groups on many genomes automatically and rapidly. We utilize the grid computing to reduce the sequence alignment time, and we use clustering algorithm in the application of database to automate whole processes. We have generated orthologous groups for 20 complete prokaryotes genomes just in a day because of the grid computing. Furthermore, new genomes can be accommodated easily by the clustering algorithm and grid computing. We compared the generated orthologous groups with COGs (Clusters of orthologous Group of proteins) and KO (KEGG Ortholog). The comparison shows about 85 percent similarity compared with previous well-known orthologous databases.

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프랙탈-공간 다중화를 이용한 홀로그래픽 메모리 시스템의 누화해석 (Crosstalk Analysis of Holographic Memory System using Fractal - Space Multiplexing)

  • 김수길;홍선기
    • 조명전기설비학회논문지
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    • 제18권1호
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    • pp.44-51
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    • 2004
  • 움직이는 창(moving window; MW)을 이용한 프랙탈-공간 다중화 방법은 액정디스플레이(liquid crystal display; LCD) 상에서 수평, 수직방향으로 움직이는 창들을 통과한 기준빔으로 홀로그램을 다중화하는 방법이다. 그러나, 수직방향으로 인접한 MW사이에서 누화가 발생하여 고밀도의 정보저장 및 복원이 제한되고 있다. 따라서, 본 논문에서는 고밀도의 정보저장을 위해 렌즈의 초점거리, MW의 간격, 다중화되는 홀로그램의 개수에 의한 누화를 이론적으로 분석하고, 체적형 광굴절결정과 디스크형 광폴리머를 이용한 프랙탈-공간 다중화 실험 결과를 제시하였다.

SNS상의 비정형 빅데이터로부터 감성정보 추출 기법 (An Extraction Method of Sentiment Infromation from Unstructed Big Data on SNS)

  • 백봉현;하일규;안병철
    • 한국멀티미디어학회논문지
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    • 제17권6호
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    • pp.671-680
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    • 2014
  • Recently, with the remarkable increase of social network services, it is necessary to extract interesting information from lots of data about various individual opinions and preferences on SNS(Social Network Service). The sentiment information can be applied to various fields of society such as politics, public opinions, economics, personal services and entertainments. To extract sentiment information, it is necessary to use processing techniques that store a large amount of SNS data, extract meaningful data from them, and search the sentiment information. This paper proposes an efficient method to extract sentiment information from various unstructured big data on social networks using HDFS(Hadoop Distributed File System) platform and MapReduce functions. In experiments, the proposed method collects and stacks data steadily as the number of data is increased. When the proposed functions are applied to sentiment analysis, the system keeps load balancing and the analysis results are very close to the results of manual work.

칼라 지도 영상에서 도로 정보 추출 (Extraction of Road from Color Map Image)

  • 안창;최원혁;이상범
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제4권3호
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    • pp.871-879
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    • 1997
  • 지리 정보 시스템의 구축을 위한 기존의 수치 지도화 방법은 많은 비용과 시간이 소요되는 작업이므로 자동입력을 위한 도구의 필요성이 절실하다 지도의 특징을 살펴 보면, 몇 가지 특징적인 색을 이용하여 정보를 계층화시켜 작성되어 있으므로, 영상에서 색 정보를 분리하면, 여러 가지 정보를 효율적으로 추출할 수 있다. 본 논문에서는 칼라 지도 영상에서 도로 정보를 추출하는 알고리즘을 제안하였다. 스캐너로 입력된 칼라 지도영상을 색 계층별로 분리하고, 도로를 포함하고 있는 영상에서 모폴로지 연산의 하나인 조건적 볼림 연산을 병렬적으로 적용하는 알고리즘을 제안하였다. 제안된 복원 알고리즘을 이용하여 정보의 중첩으로 인한 도로의 훼손된 부분을 효율적으로 복원하였으며, 세선화와 벡터화를 통하여 도로의 정보를 표현하였다.

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인적 자원 소속성 분석을 위한 역할-수행자 이분 행렬 생성 알고리즘 (A Role-Performer Bipartite Matrix Generation Algorithm for Human Resource Affiliations)

  • 김학성
    • 디지털콘텐츠학회 논문지
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    • 제19권1호
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    • pp.149-155
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    • 2018
  • 본 논문에서는 BPM기반 인적 자원 소속성 분석을 위한 역할-수행자 이분 행렬 생성 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘은 정보제어넷 기반의 비즈니스 프로세스 모델로부터 역할-수행자 소속 관계를 추출하는 단계와 이로부터 역할-수행자 이분 행렬을 생성하는 단계로 구성된다. 결론적으로 생성된 행렬은 역할-수행자 소속성 네트워킹 지식을 발견하기 위한 데이터 구조로서 활용될 뿐 아니라 소셜 네트워크 분석 기법을 적용하여 BPM 기반 인적 자원 소속성 분석 결과를 도출할 수 있다.

사용자 검색 질의 단어의 순서 및 단어간의 인접 관계에 기반한 검색 기법의 구현 (Implementation of Search Method based on Sequence and Adjacency Relationship of User Query)

  • 소병철;정진우
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제21권6호
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    • pp.724-729
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    • 2011
  • 정보 검색은 다수 자료에서 사용자가 원하는 부분을 찾는 과정을 의미한다. 일반적으로 대규모 자료 집합의 관리를 위해서는 데이터베이스가 사용되는데 인터넷과 같은 복잡한 문서구조들이 공존하는 환경에서는 한 번에 사용자가 원하는 문서를 정확히 찾아내는 것이 어렵기 때문에, 문서에 순위를 부여하여 사용자에게 제시하는 방법이 일반적으로 많이 사용된다. 본 논문에서는 자료에 포함되어 있는 단어들을 단순히 검색하는 것 뿐만 아니라 단어들 간의 순서 및 인접성을 고려한 검색방법을 용어빈도-역문헌빈도 및 n-gram 기법을 응용하여 구현하였다. 그 결과 19,000개 이상의 다수 문서 집합에서 73%의 정확율로 보다 정확한 검색이 가능하게 되었다.

마이크로파를 이용한 소형어선용 선위측정방식 개발에 관한 연구 (On the Development of a Microwave Navigational Aid System Suitable for Small Fishing Boats)

  • 정세모;이상집
    • 한국항해학회지
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    • 제3권1호
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    • pp.47-77
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    • 1979
  • A microwave Navigational Aid system is suggested suitable for fishing boats too small to be equipped with Radar or Radio-Direction-Finder. The system proposed here is similar to that of Talking-Beacon developed in Japan, but the distinctive modification proposed is that an increase of sixteen times in peak transmitting power, thus an accompanying increase of coverage, is achieved with the same mean transmitting power as that of Japan without sacrificing the clearness of azimuth information, by adopting a pulse repetition modulation instead of pulse width modulation as in Japan system. An experimental land station transmitter of transmitting frequency of 9, 370MHz and of peak power of 35kw with a microwave beam of 1 degree in horizontal width and 7 degrees in vertical width rotating once every three minutes, and also an experimental receiver of 20-dB in sensitivity and of an assumed cost of 100 dollars, operated by a 12 volts battery source are made, and the sail test results are reported showing that a bearing infromation of an accuracy of within two degrees can be obtainable every three minutes at a distance of as far as 24 miles from the transmitter if the transmitter is located as high as 100 meters above sea-level.

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국내 B-ISDN 환경에서 UNI 기본 호/연결 메시지의 선택사양에 관한 연구 (The Study on Optional Infromation Elements of Q.2931 in Korea)

  • 김석배;최강일
    • 한국정보처리학회논문지
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    • 제4권4호
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    • pp.1089-1099
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    • 1997
  • ITU-T에서 현재 정의하고 있는 B-ISDN 신호분야의 신호능력집합 2.1은 점대점 기본호 / 연결 제어절차를 설명하고 있는 Q.2931 을 핵심으로 구성된다. 국내에서도 B-ISDN 분야에서는 1차 목표망의 범주를 정의하였으며, 연구가 한창 진행중에 있다. Q.2931 프로토콜은 여러가지 망구성요소들에게 적용되어야 하지만 사용자에게 서비스를 제공/ 하는 관점에서는 다말장치와 망장치들사이에 일관성이 제공되어야 한다. 그러나, 이 프로토콜의 대부분이 선택사양으로 명시되있어 특징 장치에서 이 프로토콜을 적용하고자 하는 경우에 어려움이 있으며, 특히 망기능을 수용하는 장치에서는 여러가지 사항들이 미리 고려되어야 한다. 본 논문에서는 Q.2931 프로토콜에서 선택사양의 정보요소들을 고찰하고 ,국내 ISDN 망의 범주내에서 정보요소의 성격을 재정의하였으며, 특별히 망의 기능을 갖는 장치들이 제공해야하는 최소한의 공통기능들을 제시하였다.

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BIM을 도입한 맞춤형 인테리어 설계 업무프로세스 분석 (Analysis of Business Process for Customizing Interior Design Introducing BIM)

  • 박세영;김경훈;김주형;김재준
    • 한국BIM학회 논문집
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    • 제2권1호
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    • pp.18-26
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    • 2012
  • 2000년대 초반까지의 주택공급 정책은 국민들이 살 수 있는 최소한의 주거공간을 확보한다는 의미를 가지고 있어 질보다는 양에 충실한다는 정책이었으며, 인간 생활의 다양성을 고려하지 않은 획일적인 배치의 대규모 아파트를 대량 생산하는 결과를 초래하게 되었다. 이후 경제 성장과 더불어 국민 의식이 높아지고, 생활주기의 변화와 함께 주거수준도 크게 향상되면서 인간 생활의 다양성을 고려하지 않은 획일적 설계에 대한 불만은 더욱 높아지게 되었으며, 이에 따라 거주자의 라이프 스타일을 고려한 맞춤형 설계가 나타나게 되었다. 그러나 고객의 요구사항에 따라 발생되는 다양한 정보를 관리해야 하는 맞춤형 설계에서는 참여자들간의 의사소통, 대량의 자재정보처리, 자재원가관리 등에 대한 현장관계자들의 업무량이 증가된다. 따라서 본 연구에서는 정보관리를 효율적으로 수행할 수 있는 BIM기술을 적용시켜 맞춤형 설계에서 발생될 수 있는 다양한 문제점들을 저감시키고자 하며, 이를 위해 공사참여자들의 업무프로세스를 설계하고자 한다.

과학교육 연구자료의 정보 전산화 체제(II) -서울대학교 대학원 과학교육과의 학위 눈문 분석- (Data base system for the information on science education research and development: (II) Analysis of master's theses and doctoral dissertations from the Department of Science Education, Seoul National University)

  • 이원식;박승재;김영수
    • 한국과학교육학회지
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    • 제11권2호
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    • pp.143-159
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    • 1991
  • The purpose of this study is to develop a data base system for the infromation on research and development of science education. As a part of this development, an analysis of master's theses and doctoral dissertations from the Department of Science Education, Seoul National University was done, and using authors' classification system for the research and development materials of science education, those theses were classified. From the analysis and classification, the following conclusion was drawn: 1) The Department of Science Education, Seoul National University had produced 468 masters of education for about 30 years. Among them, only 107 theses were on the science education and the other 361 theses on the pure science. This means that department has not taken root as a department of science education. If it does not carry out its own purpose of establishment, it will not be able to justify its existence any longer 2) As compared to the increased number of students applying for the doctoral program, the number of faculty is very few in the field of science education. Without more supplement of the faculty member majored science education, there will be increased conflict and disorder among faculty and students. 3) The proportion of the theses on science education to those on science vanes greatly by the major of the department. This is the mirror of the faculty attitude to and recognition of science education and the faculty composition. 4) The classification of master theses and doctoral dissertations on science education showed that most of them focused on the secondary school science education and were survey studies. But recently it is noticeable that the theme of the study became diversified and has kept in step with the international research trends.

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