본 연구는 국내 주요 식물검역관리 대상 Phytophthora pinifolia를 대상으로 신속하고 정확한 병원균 종동정 및 검출을 위해 Ypt1 유전자 염기서열을 활용하여 제작된 종 특이적 분석용 분자마커와 다양한 PCR 기법을 활용하여 병원균들에 대한 다양한 검출기술의 표준화 및 최적 검출 시스템 구축을 통하여 실제 검역검역 현장에서 활용 가능한 병원균 존재여부의 신속, 정확한 판별기법을 개발하고자 수행하였다. Ypt1 영역의 염기서열을 기초로 선발된 종 특이적 primer는 1~10 pg의 검출민감도를 가지며 193 bp의 종 특이적 PCR 증폭산물을 형성시켰다. 또한 선발된 종 특이적 primer의 종 특이성을 확인하기 위하여 국내 식물검역대상에 포함된 Phytophthora속 종들과 주요 식물병원균들을 대상으로 conventional PCR과 real-time PCR을 수행한 결과 목표로 한 P. pinifolia DNA에서만 특이적 PCR 증폭산물을 확인할 수 있었다. 선발된 종 특이적 primer에 대한 PCR의 검출 민감도를 확인했을 때 conventional PCR의 검출민감도는 1~10 pg이었다.
Banik, Samudra Prosad;Pal, Swagata;Chowdhury, Sudeshna;Ghorai, Shakuntala;Khowala, Suman
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제21권4호
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pp.412-420
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2011
Secretion of cellobiase occurred in a brefeldin A (BFA) uninhibited manner in the filamentous fungus Termitomyces clypeatus. Fluorescence confocal microscopy revealed that application of the drug at a concentration of 50 ${\mu}g$/ml caused arrest of Spitzenkorper assembly at the hyphal tip. This resulted in greater than 30% inhibition of total protein secretion in the culture medium. However, the cellobiase titer increased by 17%, and an additional 13% was localized in the vacuolar fraction en route secretion. The secretory vacuoles formed in the presence of the drug were also found to be bigger (68 nm) than those in the control cultures (40 nm). The enzyme secreted in the presence and absence of BFA revealed a single activity band in both cases in native PAGE and had similar molecular masses (approx. 120 kDa) in SDS-PAGE. The BFA enzyme retained 72% of native glycosylation. It also exhibited a higher stability and retained 98% activity at $50^{\circ}C$, 93.3% activity at pH 9, 63.64% activity in the presence of 1M guanidium hydrochloride, and 50% activity at a glucose concentration of 10 mg/ml in comparison to 68% activity, 75% activity, 36% activity, and 19% activity for the control enzyme, respectively. The observations collectively aimed at the operation of an alternative secretory pathway, distinct from the target of brefeldin A, which bypassed the Golgi apparatus, but still was able to deliver the cargo to the vacuoles for secretion. This can be utilized in selectively enhancing the yield and stability of glycosidases for a successful industrial recipe.
벼의 키다리병(Bakanae disease)병원균 Gibberella fujikuroi Sawada는 그의 대사 산물로 Gibberellin 산류를 생산하고 있어 작물생장 조절작용이 있는 이 물질을 얻기 위하여는 우수한 균주를 알맞은 조건에서 배양하는 것이다. 이 시험은 우리나라의 야생균 가운데 Gibberellin 산류의 생산성이 우수한 균주를 분리 선발하기 위하여 먼저 평택, 예산, 당진 및 순천지역에서 키다리병에 걸려있는 볏모 뿌리를 수집하여 평택지역 4, 예산지역 7, 당진지역 7, 순천지역 5 균주를 각각 분리하여 형태학적으로 검토하여 동정하였다. 분리 선발된 각 균주와 대조근주(IAM-8048)에 대하여 일정한 배양 조건에서 Gibberellin 산류의 생산성을 배양액중 농도 측청과 볏모에 대한 배양액 추출물의 생산촉진 효과실험을 통하여 우수한 활성 균주 셋을 선정 Gibberella fujikuroi P-105, Y-14 및 T-58이라 각각 기호를 부쳤으며 그 가운데 P-105가 가장 우수하였다. 균주 Y-5, Y-7, T-54 및 S-152 등은 배양액중 Gibberellin 산류의 농도와 볏모에 대한 생장 촉진 효과가 낮거나 약간 억제적이었다. 배양 조건을 추구하기 위하여 조성과 함량이 다른 여섯가지 배양기에 대하여 비교 시험한 결과 Raulin-Thom 배양기 (glucose 16%, $NH_4NO_3$ 0.24%)에서 Gibberellin 산류의 생산이 가장 높았으며 그 밖에 다른것은 대략 Cross, Borrow, West, Stodola, Kurosawa 배양기의 순위로 생산성이 낮았다.
Purpose: Type 1 diabetes mellitus (T1DM) is a chronic and immune-mediated disease, which is characterized by the progressive destruction of pancreatic beta cells. T1DM precipitates in genetically susceptible individuals through environmental factors. In this study, we aimed to evaluate the impact of autoimmunity and intestinal colonization of Candida albicans on the development of T1DM. Methods: Forty-two patients newly diagnosed with T1DM and 42 healthy subjects were included in this monocentric study. The basic and clinical characteristics of the patients were recorded. T1DM-, thyroid-, and celiac-associated antibodies were evaluated. Stool cultures for C. albicans were performed to assess whether or not gut integrity was impaired in patients with T1DM. Results: The evaluation of T1DM- and thyroid-associated antibodies showed that the prevalences of islet cell antibodies and antithyroperoxidase positivity were higher in the study patients than in the patients in the control group. Furthermore, the direct examination and culture of fresh stool samples revealed that 50% of the patients with T1DM and 23.8% of the control subjects had fungi (C. albicans). Conclusion: Through this study, we suggest that the presence of intestinal C. albicans colonization at the time of the diagnosis of T1DM may indicate impairment of normal intestinal microbiota. We also suggest that there may be a tendency of T1DM in patients with a high prevalence of intestinal C. albicans.
This study examined the antimicrobial, antioxidant, and tyrosinase inhibitory activities of bioactive compounds extracted from two starfish, Asterina pectinifera and Asterias amurensis, using solvent extraction after $Protamex^{TM}$ hydrolysis. Methanol and acetone fractions collected by stepwise extraction from specimens were subjected to silica gel column chromatography (SGCC) (200 mesh and 400 mesh), followed by high-performance liquid chromatography (HPLC). Two fractions (7:3 and 5:5 chloroform : methanol ratio, v/v) eluted using silica gel column chromatography from the two starfishes showed higher antimicrobial activity against Propionibacterium acnes and dermatophyte fungi (Epidermophyton floccosum, Microsporum audouinii, Trichophyton ferrugineum, Trichophyton mentagrophytes, and Trichophyton rubrum), antioxidant activity ($EDA_{50}$, mg/mL), and tyrosinase inhibitory activity compared to the other fractions. The final fractions obtained from Asterina pectinifera (RT 7.53, 8.93, and 10.48 min) and Asterias amurensis (RT 5.02 min) by SGCC (400 mesh) and HPLC from two SGCC fractions (200 mesh) showed 8.94 and 15.59 mg/mL antioxidant activity ($EDA_{50}$) and 46.89 and 40.19 % tyrosinase inhibitory activity, respectively. Extracts from starfishes are potential cosmetic basic material.
대전광역시 근교의 야산과 들판 등지에서 썩은 나뭇잎, 짚, 흙을 채취하여 각각을 배양한 다음 Congo red test에 의해 cellulase 활성을 보이는 균주를 선별하였다. Genomic DNA를 분리한 후 PCR을 수행하여 DNA sequence를 Gene Bank를 통해 분석한 결과 A. tubingensis로 밝혀졌다. 이것을 배양하여 상등액을 crude enzyme으로 사용하여 온도와 pH를 달리하면서 효소의 활성정도를 측정하였다. 대조균주로 A. oryzae KCTC 6291를 이용하였고, 본 연구를 통하여 분리한 균주인 A. tubingensis가 생산하는 cellulase는 A. oryzae의 cellulase에 비하여 각각 다른 온도와 pH에서 높은 안정성을 보여주었다. A. tubingensis는 각각의 온도에서 활성의 정도가 비슷했으며, 45$^{\circ}C$, 55$^{\circ}C$에서 높은 활성을 나타내고 있지만, 고르게 활성이 나타났다. 또한 pH 12.0에서 가장 높은 활성을 보여 주었고, pH 2.0, 3.0, 4.0에서는 양쪽 모두 거의 활성이 없었으며, 중성, 염기성에 대해서 활성에는 큰 변화가 없었다. 따라서, 분리 동정한 A. tubingensis는 온도와 pH에서 고르게 활성을 나타내므로 생균제로 활용할 수 있는 범위가 클 것으로 여겨진다.
Agrobacterum tumefaciens-mediated transformation (ATMT) is becoming an effective system as an insertional mutagenesis tool in filamentous fungi. We developed and optimized ATMT for two Colletotrichum species, C. falcatum and C. acutatum, which are the causal agents of sugarcane red rot and pepper anthracnose, respectively. A. tumefaciens strain SK1044, carrying a hygromycin phosphotransferase gene (hph) and a green fluorescent protein (GFP) gene, was used to transform the conidia of these two Colletotrichum species. Transformation efficiency was correlated with co-cultivation time and bacterial cell concentration and was higher in C. falcatum than in C. acutatum. Southern blot analysis indicated that about 65% of the transformants had a single copy of the T-DNA in both C. falcatum and C. acutatum and that T-DNA integrated randomly in both fungal genomes. T-DNA insertions were identified in transformants through thermal asymmetrical interlaced PCR (TAIL-PCR) followed by sequencing. Our results suggested that ATMT can be used as a molecular tool to identify and characterize pathogenicity-related genes in these two economically important Colletotrichum species.
안구의 각막과 결막은 외계에 노출되어 있어서 손상을 받기 쉽고, 손상부위에 병균이 감염되면 염증이 유발되어 심한 시력장애를 초래하기도 하는데, 누액 속에 포함되어 있는 lysozyme은 이러한 병균에 대해 항균작용을 가지므로 평소에는 안구가 노출되어 있어도 각 결막염이 발생하지 않는다. 본 연구는 lysozyme의 항균효과를 조사하고자 각 결막염의 원인균 중 5가지를 선별하여 배양하였고, 그 배양액에 lysozyme을 농도별로 첨가하면서 생육저해 정도를 측정하였다. 그 결과, 배지 중의 lysozyme 농도가 증가할수록 공시균의 생육은 저해되었다. 1mM 농도의 lysozyme에 의해 Pseudomonas는 43%, Neisseria는 41%, KlebsielIa는 35%, Staphylococus는 22% 생육이 저해되었고, 그람음성균은 그람양성균인 Staphylococus보다 lysozyme에 대한 감수성이 약 1.5~2.0배 큰 것으로 나타났다. 그러나 lysozyme은 진균인 Fusarium의 생육에는 매우 미약한 저해양상을 나타내었다.
Park, Ro-Dong;Jo, Kyu-Jong;Jo, You-young;Jin, Yu-Lan;Kim, Kil-Yong;Shim, Jae-Han;Kim, yong-Wong
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제12권1호
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pp.84-88
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2002
The effect of chitosan on the growth of plant pathogenic fungi was investigated. Chitosan solubilized in acetic acid showed much higher and more consistent antifungal activity than that solubilized in HCl. The antifungal activity was not significantly affected within a DA (degree of deacetylation) range of $57.3-99.2\%$ tested. Water-soluble and low molecular weight chitosan ($57.3\%$ DA) against 6 plant pathogens showed that Monosporascus canonballus and Pythium irregulare were the most susceptible to the chitosan, while Fusarium oxysporum and F. graminearum were the most resistant. At a concentration of 2.5 mg/ml, the growth of pathogens was completely inhibited except for F. oxysporum. The $MIC_50$ values varied depending on both the DA of the chitosan and the plant pathogens. A chitosan with $57.3\%$ DA exhibited the lowest $MIC_50$ (ranging <0.1-1.8 mg/ml) and that with $84.7\%$ DA the highest $MIC_50$ (ranging <0.4-4.0 mg/ml) depending on the pathogen.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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