• 제목/요약/키워드: gene csgA

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S. typhimurium과 S. enteritidis 균주의 Thin Aggregative Fimbriae 유전자 csgA, csgB 분석 (Analysis of Thin Aggregative Fimbriae Genes csgA, csgB of S. typhimurium and S. enteritidis Strains)

  • 나훈택;정맹식;김홍선;김수영
    • 한국자연치유학회지
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    • 제7권1호
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    • pp.20-25
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    • 2018
  • 본 연구의 목적은 Salmonella 표준균주 4(ATCC 3종, KCTC 1종)와 분리균주 2종 모두 6종을 대상으로 Thin aggregative fimbriae(박층 응집 섬모)에 해당하는 유전자 csgA와 csgB 를 각각 비교하여 아미노산 돌연변이와 염기서열 돌연변이를 유전자 서열분석법으로 관찰하는 것이었다. 균주들의 유전자 서열을 분석한 후에 분석한 결과는 비교적 적은 아미노산 돌연변이가 관찰되었다. Salmonella csgA 유전자에서는 Ser20→Gly(AGT→GGT), csgB 유전자에서는 Asp25→Ala(GAT→GCT)와 Lys66→Thr(AAA→ACA)으로 각각 아미노산 돌연변이와 뉴클레오티드 서열(nucleotide sequence) 돌연변이가 관찰되었다. Salmonella 6종의 균주에서 S. typhimurium - TH 균주에서 높은 비율인 2개의 아미노산 돌연변이가 관찰되었으며, 반면에 S. typhimurium ATCC 13311 균주와 S. typhimurium KCTC 1925 균주에서는 nucleotide sequence 변이가 관찰되지 않았다. 이상의 결과로 볼 때에 아미노산 돌연변이 탐색연구에 S. typhimurium - TH 균주의 csgA & csgB 유전자는 유전자서열 연구에 유용하다고 판단한다.

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생물막형성 장내세균의 Curli 및 Cellulose 세포외 바탕질 분석 (Biofilm Forming Ability and Production of Curli and Cellulose in Clinical Isolates of Enterobacteriaceae)

  • 최예환;이희우;김성민;이제철;이유철;설성용;조동택;김정민
    • 미생물학회지
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    • 제47권4호
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    • pp.335-341
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    • 2011
  • 본 연구에서는 병원 감염의 주요 원인균으로 생물막 관련 감염증에서 흔히 분리되고 있는 Citrobacter, Enterobacter 및 Serratia 등의 임상분리 장내세균 22주를 대상으로 생물막 형성능을 조사하고, 생물막의 세포외 바탕질의 구성 성분을 알아보기 위하여 Congo-red 한천배지상의 집락 형상과 calcofluor 염색을 시행하였다. 또한 curli 생성 오페론인 csgBA(C) 유전자의 유무 확인과 csgA 유전자의 염기서열을 규명하였다. $37^{\circ}C$에서 24시간 배양 후 생물막 형성능 분석에서는 2주의 S. marcescens를 제외한 나머지 20주는 모두 생물막 형성능이 있는 것으로, $28^{\circ}C$에서 48시간 배양 후 분석에서는 22주 모두 생물막 형성능이 있는 것으로 확인되었다. Congo-red 한천배지에서의 균집락 형상을 조사한 결과 균속에 따라서 균 집락의 표현형상이 다르게 나타났으며, 동일 균속내에서도 균 집락의 표현형상과 색 농도의 차이가 관찰되어 세포외 바탕질의 주요 성분 및 생성량의 차이가 있음을 시사하였다. 1주의 C. freundii와 4주의 E. cloacae에서 csgBA(C) 유전자 양성을 나타내었다. 염기서열 분석결과, E. cloacae의 csgA는 E. coli의 csgA와 80.9%, E. sakazakii의 csgA와 75.7%, 그리고 C. freundii의 csgA와 67.8%의 상동성이 있는 것으로 나타났다. E. cloacae의 경우 Congo-red 염색의 결과와 curli 유전자 검색 결과가 일치하였을 뿐만 아니라, csgA 유전자를 보유하지 않은 균주의 생물막 형성능이 csgA 유전자를 보유한 균주에 비해 현저하게 낮은 것으로 나타나, curli가 E. cloacae의 생물막 세포외 바탕질 구성성분의 주요 요소일 것으로 추정되었다.

Myxococcus xanthus socD500에 의한 포자 형성 및 CsgA신호에 특이적 유전자의 발현에 관한 연구 (Myxococcus xanthus socD500 mutation causes Sporulation and Induction of two C-signal Specific Genes)

  • 이병욱
    • 생명과학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.184-190
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    • 2003
  • 군집을 이루어 생활을 하는 세균류의 하나인 M. xanthus의 csgA 유전자는 세포 표면 단백질을 암호화하는데 이 단백질은 M. xanthus의 자실체 및 포자 형성을 수반하는 발생 (development)에 필수적이다. csgA 돌연변이들은 정상적인 성장을 보이지만, 발생 과정에서 자실체 및 포자 형성이 불가능하다. 또한, CsgA 세포간 기인한 신호 전달체계에 의해서 유발되는 CsgA 특이적 유전자들의 발현이 없거나 감소한다. socD500돌연변이는, csgA 돌연변이체로부터 자실체 혹은 포자 형성을 회복하게 해주는 2차 돌연변이 중의 하나로서, csgA 돌연변이체의 포자 형성을 회복하도록 한다. socD500에 의한 포자 형성은 영양원의 고갈 및 자실체의 형성이 없이도, 단순히 성장 온도를 $32^{\circ}C$에서 $15^{\circ}C$로 낮추는 것이 의해서 이루어진다. 이런 과정을 거쳐 형성된 포자의 구조를 전자현미경으로 관찰한 결과 정상 포자와는 다르게 단지 얇은 여러 겹의 막들이 존재하였다. 또한 socD500 돌연변이체에서 10개의 CsgA 특이적 유전자들의 발현율을 측정한 결과, 자실체 형성을 수반하는 정상적인 발생시에만 발현하는 ΩDK4506 및 ΩDK4406 유전자들이 $15^{\circ}C$에서 높게 발현되는 것으로 나타났다. 이 결과는 socD500은 CsgA에 특이적인 신호 전달체계에 관련된 일부 유전자들의 발현을 조절하는 역할에 관련되었다는 것을 알 수가 있었다.

Association Between C1019T Polymorphism in the Connexin 37 Gene and Helicobacter Pylori Infection in Patients with Gastric Cancer

  • Jing, Yuan-Ming;Guo, Su-Xia;Zhang, Xiao-Ping;Sun, Ai-Jing;Tao, Feng;Qian, Hai-Xin
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제13권5호
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    • pp.2363-2367
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    • 2012
  • Objective: To investigate the association between the connexin 37 C1019T polymorphism and Helicobacter pylori infection in patients with gastric cancer. Methods: 388 patients with gastric cancer (GC), 204 with chronic superficial gastritis (CSG) were studied. H. pylori was detected by gastric mucosal biopsies biopsy dyeing method. Connexin 37 gene polymorphism 1019 site genotypes were determined by gene sequencing technology. Genotypes and alleles frequencies were compared. Results: (1) Connexin37 gene 1019 site distribution frequency (CC type, TC type, TT type) in the CSG group was 18.1%, 45.1% and 36.8%; in the stomach cancer group it was 35.1%, 45.9% and 19.%, conforming to the Hardy-Weinberg euilibrium. (2) In comparison with CSG group, the frequency of Connexin37 C allele was higher in the gastric cancer group (58.0% vs 40.7%, OR = 2.01, 95%CI = 1.58-2.57, P < 0.01). The prevalence of gastric cancer risk was significantly increased in the carriers of C allele (CC+TC) than in TT homozygote (OR = 2.47, 5%CI = 1.68- 3.610. (3) Gastric cancer patients complicated with Hp infection 211 cases, gastric cancer group of the male patients with HP positive patients with 187 cases, 40 cases of female patients with negative patients, 24 cases were HP positive, negative in 137 cases, control group male patients, 28 cases were Hp positive, negative in 95 patients, female patients with Hp positive 6 cases, 75 cases were negative. On hierarchical analysis, the male group OR value was 15.9 (95%CI to 9.22-27.3), and the female OR was 2.19 (95%CI 0.88-5.59), indicating a greater contribution in males (P <0.01). After elimination of gender effects, positive HP and gastric cancer were closely related (OR 8.82, 95% CI: 5.45-14.3). (4) The distribution frequency of C allele in patients with Hp infection was much higher than that in Hp negative cases in the GC group (64.5% vs 47.0%, OR = 2.05, 95%CI = 1.54-2.74, P < 0.01). Compared with TT homozygotes, (CC+TC) genotype prevalence of gastric cancer risk increased significantly (OR = 2.96, 5%CI = 1.76-2.99 ). Conclusion: The T allele in the connexin37 gene might not only be associated with gastric cancer but also with H. pylori infection.

Saccharomyces cerevisiae deletion mutant의 세라마이드 생합성 (Biosynthesis of ceramide by deletion mutant of Saccharomyces cerevisiae)

  • 김세경;노용호;윤현식
    • KSBB Journal
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    • 제24권1호
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    • pp.25-29
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    • 2009
  • Saccharomyces cerevisiae의 deletion mutant를 이용하여 ydc1, ypc1, scs7, sur1, csg2, ipt1, Icb4, Icb5, dpll의 deletion이 세라마이드의 생산에 미치는 영향을 고찰하였다. 세라마이드는 ELSD가 연결된 HPLC를 통하여 분석하였으며 ${\triangle}$ydc1 mutant의 세라마이드 생산량이 6 mg ceramide/g cell로 최대량을 나타내었으며 ${\triangle}$sur1 mutant, ${\triangle}$lcb5 mutant, ${\triangle}$dpll mutant의 경우 control로 사용한 BY4742와 비슷한 세라마이드 생산량을 나타내었고, 그 외 ${\triangle}$ypc1 mutant, ${\triangle}$scs7 mutant, ${\triangle}$csg2 mutant, ${\triangle}$ipt1 mutant, ${\triangle}$lcb4 mutant는 BY4742보다 낮은 세라마이드 생산량을 나타내었다.