THOC1/Hpr1는 mRNA가 전사되는 동안 mRNP의 포장과 mRNA 방출에 관여하는 진화적으로 잘 보존된 THO 복합체의 한 소단위이다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe에서도 THOC1/Hpr1과 유사한 단백질을 암호화하는 유전자(sphpr1로 명명)를 찾아 그 특성을 조사하였다. 이배체 S. pombe 균주에 하나의 sphpr1 유전자만을 결실시킨 후 4분체 분석을 수행한 결과, 이 유전자는 생장에 필수적이었다. 티아민에 의해 발현이 조절되는 강력한 nmt1 프러모터를 이용하여 sphpr1를 과발현시키더라도 세포의 생장과 mRNA 방출에는 전혀 영향이 없었다. 하지만, sphpr1의 발현을 억제하면 생장이 억제되었으며 poly$(A)^+$ RNA가 핵 안에 축적되었다. 이와 같은 결과들은 sphpr1 유전자가 생장과 mRNA의 핵에서 세포질로의 방출에 관여하고 있음을 시사한다.
THOC7/Mft1는 mRNA가 전사되는 동안 mRNP의 포장과 mRNA 방출에 관여하는 진화적으로 잘 보존된 THO 복합체의 구성인자이다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe에서 THOC7/Mft1의 이종상동체(spThoc7)가 합성치사 돌연변이체 SLRsm1의 생장 결함을 부분적으로 상보하는 것으로 선별되었다. 이배체 S. pombe 균주에 하나의 spthoc7 유전자만을 결실시킨 후 4분체 분석을 수행한 결과, 이 유전자는 생장에 필수적이지 않았다. 하지만, ${\Delta}thoc7$ 결실돌연변이는 생장과 mRNA의 핵에서 세포질로의 방출에 약간의 결함을 보였다. 기능을 하는 spThoc7-GFP단백질은 주로 핵 안에 존재하였다. 이와 같은 결과들은 spThoc7도 mRNA 방출에 관여하고 있음을 시사한다.
mRNA의 핵에서 세포질로의 이동(mRNA export)에 관여하는 것으로 여겨지는 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 rsm1 유전자의 역할을 알아보기 위해 $kan^{r}$ 유전자를 이용하여 결실돌연변이주(deletion mutant)를 제조하였다. rsm1 유전자는 생장에 필수 유전자는 아니지만, rsm1 결실돌연변이주는 야생형에 비해 생장이 조금 늦고 mRNA export도 약간의 결함을 보였다. rsm1 유전자와 mRNA export의 중요 유전자와의 연관관계를 알아보기 위해, 이중돌연변이주(double mutants)를 제작하여 생장결함 정도와 mRNA export 결함 정도를 조사하였다. 조사한 유전자들 중에서 mex67 또는 npp106 돌연변이 유전자는 rsm1 결실돌연변이 유전자와 함께 존재하면 생장과mRNA export가 더욱 악화되었다. 반면, thp1 돌연변이 유전자는 rsm1 결실돌연변이 유전자와 함께 존재하면 오히려 생장과 mRNA export 정도를 야생형과 유사한 정도로 호전시켰다. 이와 같은 결과들은 rsm1 유전자가 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 중요한 역할을 담당하고 있음을 시사한다.
Kibum Park;Joo-Yeon Lim;Je-Hoon Kim;Jieun Lee;Songju Shin;Hee-Moon Park
Mycobiology
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제51권5호
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pp.372-378
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2023
Lkh1, a LAMMER kinase homolog in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe, acts as a negative regulator of filamentous growth and flocculation. It is also involved in the response to oxidative stress. The lkh1-deletion mutant displays slower cell growth, shorter cell size, and abnormal DNA content compared to the wild type. These phenotypes suggest that Lkh1 controls cell size and cell cycle progression. When we performed microarray analysis using the lkh1-deletion mutant, we found that only four of the up-regulated genes in the lkh1-deletion were associated with the cell cycle. Interestingly, all of these genes are regulated by the Mlu1 cell cycle box binding factor (MBF), which is a transcription complex responsible for regulating the expression of cell cycle genes during the G1/S phase. Transcription analyses of the MBF-dependent cell-cycle genes, including negative feedback regulators, confirmed the up-regulation of these genes by the deletion of lkh1. Pull-down assay confirmed the interaction between Lkh1 and Yox1, which is a negative feedback regulator of MBF. This result supports the involvement of LAMMER kinase in cell cycle regulation by modulating MBF activity. In vitro kinase assay and NetPhosK 2.0 analysis with the Yox1T40,41A mutant allele revealed that T40 and T41 residues are the phosphorylation sites mediated by Lkh1. These sites affect the G1/S cell cycle progression of fission yeast by modulating the activity of the MBF complex.
진화적으로 보존된 TREX 복합체의 구성요소인 Yra1/ALY는 hnRNP-유사 단백질의 REF (RNA와 방출인자 결합단백질) 계열에 속하는 단백질로서 전사, 핵 RNA의 안정성, mRNA의 핵에서 방출 등 여러 과정에 관여하는 것으로 알려져 있다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 게놈에는 2개의 REF 단백질을 암호화하고 있다. 이미 mRNA 방출인자로 알려진 Mlo3 이외에 THO 복합체의 구성인자로 예측되는 Tho4이 존재한다. 본 연구에서 tho4 (SPBC106.12c) 유전자의 결실이 생장과 mRNA의 방출에 영향을 주지 않는다는 것을 알았다. 그러나 tho4 유전자를 과발현시키면 생장이 늦어지고 $poly(A)^+$ RNA가 핵 안에 약간 축적되었다. ${\Delta}tho4$${\Delta}mlo3$와 ${\Delta}tho4$${\Delta}mex67$ 이 중 돌연변이는 어느 것도 추가적인 생장 결함을 보이지 않았다. 또한 Yeast two-hybrid와 공동침전(Co-immunoprecipitation) 분석에서 Tho4는 THO/TREX 복합체의 다른 구성인자들과 어떠한 상호작용도 보이지 않았다. 이와 같은 관찰결과들은 S. pombe의 Tho4 단백질이 기대와는 다르게THO/TREX 복합체의 구성인자가 아니며, mRNA 방출에도 직접 관여하지 않음을 의미한다.
Cop9 signalosome(CSN)은 최초 식물 발달 과정에서의 빛에 의한 전사 조절 과정에서의 억제 유전자로 처음 분리된 이후 이들이 다양한 진핵 생물 에서 매우 잘 보존되어 있음이 알려지게 되었다. 이들은 대부분 8개의 subunit으로 구성되며 26S proteasome lid와 eIF3와 구조적으로는 물론 기능적으로도 유사성을 보인다고 알려져 있다. 이들은 특히 Cullin-Ring ubiquitin ligases(CRL)의 구성 요소인 Cullin의 deneddylation을 매개하여 ubiquitin ligase의 활성을 조절한다고 알려져 있으며, 또한 세포 주기 및 checkpoint 조절에 관여한다고 보고되었다. 분열효모의 경우 CSN1 및 CSN2 결손 세포에서 S-phase로서의 진행이 지연됨이 관찰되었고 감마선 혹은 UV에 좀더 민감해지는 현상이 관찰되어 CSN이 checkpoint 조절에 관여한다는 것을 보여주었다. 곰팡이의 CSN 경우 구조적으로 더욱 상위 개체들의 그것과 더욱 유사한데, CSN이 생체 시계 리듬, 빛과 연관한 호르몬 생산, 곰팡이의 발달 과정 및 생식 주기를 조절함이 보고되었다. 또한 Aspergillus nidulans의 경우 상위개체에서 보여준 DNA 합성 및 손상, 세포 주기 조절에서의 기능이 알려지면서 CSN은 곰팡이 생활사에 필수적인 여러 과정들을 조절하는 중요한 인자임을 알 수 있다. 이로써 식물이나 포유동물 등에서 보고되었던 CSN의 주요 기능을 미생물에서도 대부분 공유하고 있음을 알 수 있고 이들이 CRL을 통한 주요 세포 활성 조절 연구에 좋은 툴로서 활용할 수 있음을 시사하고 있다.
Hydrazinocurcumin (HC), a synthetic derivative of curcumin, has been reported to inhibit angiogenesis via unknown mechanisms. Understanding the molecular mechanisms of the drug's action is important for the development of improved compounds with better pharmacological properties. A genome-wide drug-induced haploinsufficiency screening of fission yeast gene deletion mutants has been applied to identify drug targets of HC. As a first step, the 50% inhibition concentration $(IC_{50})$ of HC was determined to be $2.2{\mu}M$. The initial screening of 4,158 mutants in 384-well plates using robotics was performed at concentrations of 2, 3, and $4{\mu}M$. A second screening was performed to detect sensitivity to HC on the plates. The first screening revealed 178 candidates, and the second screening resulted in 13 candidates, following the elimination of 165 false positives. Final filtering of the condition-dependent haploinsufficient genes gave eight target genes. Analysis of the specific targets of HC has shown that they are related to septum formation and the general transcription processes, which may be related to histone acetyltransferase. The target mutants showed 65% growth inhibition in response to HC compared with wild-type controls, as shown by liquid culture assay.
A cDNA coding alkaline phosphatase (AP) homologue was isolated from a cDNA library of Schizosaccharomyces pombe by colony hybridization. The nucleotide sequence of the cloned cDNA appeared to lack the N-terminal coding region. The genomic DNA encoding alkaline phosphatase homologue was isolated from S. pombe chromosomal DNA using PCR. The amplified DNA fragment was ligated into plasmid pRS315 to generate the recombinant plasmid pSW20. The DNA insert was subcloned as two smaller fragments for nucleotide sequencing. The sequence contains 2,789 by and encodes a protein of 532 amino acids with a molecular mass of 58,666 daltons. The S. pombe cells containing plasmid pSW20 showed much higher AP activity compared with the yeast cells with vector only This indicates that the cloned AP gene apparently encodes AP The predicted amino acid sequence of the S. pombe AP shares homology with those of other known APs.
RecA protein plans a central role in homologous recombination and DNA repair in Escherichia cofi (E. colD. The function 8nd structure of this protein are universal in prokarvotes and also conserved in eukaryotes such as yeast. The RecA-like protein with 74 lInDa in size has already been identified and purified from a fission yeast Schizosaccharomyces pombe (5. pommel (Lee, 19911. From this study it was revealed that the RecA-like protein of 5. pombe was highly inducible to various DNA damaging agents and inhibitors of nucleotide pool svnthesizins enzymes. The cellular level of the 5. pombe RecA-like protein wi,u markedly increased, upto 5- to 10-fold, by treatment with various DNA-damains agents including ultraviolet (UV) light, methyl methanesulfonate WS),4-nitroquinoline-1-oxide (4-NQO), and mitomycin-C (MMC), similar to E. cofi RecA protein. Interestingly, the protein level was also increased by inhibitors of nucleotide pool forming enzlwnes such as methotrexate (MTX) and hvdroxvurea (HU). The most effective doses for the inducibility of 4-NQO, MMS, W, MMC, MTX, and HU were 0.2 Ug/ml, 30 mM, 200 J/ma, 0.4 $\mus/ml,$ 1 Ug/ml, and 100 mM, respectively. The range of effective duration time for the inducibilitv of RecA-like protein was from 270 to 450 mins. These results suggest that the 5. pombe RecA-like protein also platys an imortant role in cellular responses to DNA damage as in E. coli system.
The pre-replication complex (pre-RC), including the core hexameric MCM2-7 complex, ensures that the eukaryotic genome is replicated only once per cell division cycle. In this study, we identified a rice $\underline{m}ini\underline{c}hromosome$$\underline{m}aintenance$ (MCM) homologue (OsMCM2) that functionally complemented fission yeast MCM2 (CDC19) mutants. We found OsMCM2 transcript expression in roots, leaves, and seeds, although expression levels differed slightly among the organs. Likewise, the OsMCM2 protein was ubiquitously expressed, but it was downregulated when nutritients were limiting, indicating that MCM2 expression (and therefore cell cycle progression) requires adequate nutrition. Yeast two-hybrid and GST pull-down assays demonstrated that OsMCM2 interacted with the COP9 signalosome 5 (CSN5). Taken as a whole, our results indicated that OsMCM2 functions as a subunit of the rice MCM complex and interacts with CSN5 during developmental regulation.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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