• 제목/요약/키워드: feature subset selection

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Feature Selection via Embedded Learning Based on Tangent Space Alignment for Microarray Data

  • Ye, Xiucai;Sakurai, Tetsuya
    • Journal of Computing Science and Engineering
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    • 제11권4호
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    • pp.121-129
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    • 2017
  • Feature selection has been widely established as an efficient technique for microarray data analysis. Feature selection aims to search for the most important feature/gene subset of a given dataset according to its relevance to the current target. Unsupervised feature selection is considered to be challenging due to the lack of label information. In this paper, we propose a novel method for unsupervised feature selection, which incorporates embedded learning and $l_{2,1}-norm$ sparse regression into a framework to select genes in microarray data analysis. Local tangent space alignment is applied during embedded learning to preserve the local data structure. The $l_{2,1}-norm$ sparse regression acts as a constraint to aid in learning the gene weights correlatively, by which the proposed method optimizes for selecting the informative genes which better capture the interesting natural classes of samples. We provide an effective algorithm to solve the optimization problem in our method. Finally, to validate the efficacy of the proposed method, we evaluate the proposed method on real microarray gene expression datasets. The experimental results demonstrate that the proposed method obtains quite promising performance.

데이터마이닝을 이용한 심혈관질환 판별 모델 방법론 연구 (A study of methodology for identification models of cardiovascular diseases based on data mining)

  • 이범주
    • 문화기술의 융합
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    • 제8권4호
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    • pp.339-345
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    • 2022
  • 심혈관 질환은 전 세계적으로 주요 사망원인들 중 하나이다. 본 연구는 보다 우수한 심혈관질환 판별 모델을 생성하기 위한 방법에 대한 연구로써, 3가지 변수 선택법과 7가지 머신러닝 알고리즘을 바탕으로 사회인구학적 변수들을 이용하여 고혈압과 이상지질혈증 판별모델들을 생성하고, 생성된 모델들의 성능을 비교 평가한다. 본 연구의 결과에서는 두 가지 질병 모두에서, 전체변수 및 correlation-based feature subset selection 메소드 기반 모델들에서는 naive Bayes 모델이 다른 머신러닝을 이용한 모델들보다 다소 우수한 판별 성능이 있는 것으로 나타났고, wrapper 메소드 기반 변수 선택법에서는 logistic regression 모델이 다른 모든 모델보다 성능이 다소 우수한 것으로 나타났다. 본 연구의 결과는 원격의료 및 대중보건 분야에서 향후 한국인의 심혈관질환 판별 및 예측 모델 생성을 위한 참고자료로 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

AutoFe-Sel: A Meta-learning based methodology for Recommending Feature Subset Selection Algorithms

  • Irfan Khan;Xianchao Zhang;Ramesh Kumar Ayyasam;Rahman Ali
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
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    • 제17권7호
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    • pp.1773-1793
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    • 2023
  • Automated machine learning, often referred to as "AutoML," is the process of automating the time-consuming and iterative procedures that are associated with the building of machine learning models. There have been significant contributions in this area across a number of different stages of accomplishing a data-mining task, including model selection, hyper-parameter optimization, and preprocessing method selection. Among them, preprocessing method selection is a relatively new and fast growing research area. The current work is focused on the recommendation of preprocessing methods, i.e., feature subset selection (FSS) algorithms. One limitation in the existing studies regarding FSS algorithm recommendation is the use of a single learner for meta-modeling, which restricts its capabilities in the metamodeling. Moreover, the meta-modeling in the existing studies is typically based on a single group of data characterization measures (DCMs). Nonetheless, there are a number of complementary DCM groups, and their combination will allow them to leverage their diversity, resulting in improved meta-modeling. This study aims to address these limitations by proposing an architecture for preprocess method selection that uses ensemble learning for meta-modeling, namely AutoFE-Sel. To evaluate the proposed method, we performed an extensive experimental evaluation involving 8 FSS algorithms, 3 groups of DCMs, and 125 datasets. Results show that the proposed method achieves better performance compared to three baseline methods. The proposed architecture can also be easily extended to other preprocessing method selections, e.g., noise-filter selection and imbalance handling method selection.

주성분 분석 로딩 벡터 기반 비지도 변수 선택 기법 (Unsupervised Feature Selection Method Based on Principal Component Loading Vectors)

  • 박영준;김성범
    • 대한산업공학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.275-282
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    • 2014
  • One of the most widely used methods for dimensionality reduction is principal component analysis (PCA). However, the reduced dimensions from PCA do not provide a clear interpretation with respect to the original features because they are linear combinations of a large number of original features. This interpretation problem can be overcome by feature selection approaches that identifying the best subset of given features. In this study, we propose an unsupervised feature selection method based on the geometrical information of PCA loading vectors. Experimental results from a simulation study demonstrated the efficiency and usefulness of the proposed method.

Support vector machines with optimal instance selection: An application to bankruptcy prediction

  • Ahn Hyun-Chul;Kim Kyoung-Jae;Han In-Goo
    • 한국지능정보시스템학회:학술대회논문집
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    • 한국지능정보시스템학회 2006년도 춘계학술대회
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    • pp.167-175
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    • 2006
  • Building accurate corporate bankruptcy prediction models has been one of the most important research issues in finance. Recently, support vector machines (SVMs) are popularly applied to bankruptcy prediction because of its many strong points. However, in order to use SVM, a modeler should determine several factors by heuristics, which hinders from obtaining accurate prediction results by using SVM. As a result, some researchers have tried to optimize these factors, especially the feature subset and kernel parameters of SVM But, there have been no studies that have attempted to determine appropriate instance subset of SVM, although it may improve the performance by eliminating distorted cases. Thus in the study, we propose the simultaneous optimization of the instance selection as well as the parameters of a kernel function of SVM by using genetic algorithms (GAs). Experimental results show that our model outperforms not only conventional SVM, but also prior approaches for optimizing SVM.

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Identification of Chinese Event Types Based on Local Feature Selection and Explicit Positive & Negative Feature Combination

  • Tan, Hongye;Zhao, Tiejun;Wang, Haochang;Hong, Wan-Pyo
    • Journal of information and communication convergence engineering
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    • 제5권3호
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    • pp.233-238
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    • 2007
  • An approach to identify Chinese event types is proposed in this paper which combines a good feature selection policy and a Maximum Entropy (ME) model. The approach not only effectively alleviates the problem that classifier performs poorly on the small and difficult types, but improve overall performance. Experiments on the ACE2005 corpus show that performance is satisfying with the 83.5% macro - average F measure. The main characters and ideas of the approach are: (1) Optimal feature set is built for each type according to local feature selection, which fully ensures the performance of each type. (2) Positive and negative features are explicitly discriminated and combined by using one - sided metrics, which makes use of both features' advantages. (3) Wrapper methods are used to search new features and evaluate the various feature subsets to obtain the optimal feature subset.

생태계 모방 알고리즘 기반 특징 선택 방법의 성능 개선 방안 (Performance Improvement of Feature Selection Methods based on Bio-Inspired Algorithms)

  • 윤철민;양지훈
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제15B권4호
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    • pp.331-340
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    • 2008
  • 특징 선택은 기계 학습에서 분류의 성능을 높이기 위해 사용되는 방법이다. 여러 방법들이 개발되고 사용되어 오고 있으나, 전체 데이터에서 최적화된 특징 부분집합을 구성하는 문제는 여전히 어려운 문제로 남아있다. 생태계 모방 알고리즘은 생물체들의 행동 원리 등을 기반으로하여 만들어진 진화적 알고리즘으로, 최적화된 해를 찾는 문제에서 매우 유용하게 사용되는 방법이다. 특징 선택 문제에서도 생태계 모방 알고리즘을 이용한 해결방법들이 제시되어 오고 있으며, 이에 본 논문에서는 생태계 모방 알고리즘을 이용한 특징 선택 방법을 개선하는 방안을 제시한다. 이를 위해 잘 알려진 생태계 모방 알고리즘인 유전자 알고리즘(GA)과 파티클 집단 최적화 알고리즘(PSO)을 이용하여 데이터에서 가장분류 성능이 우수한 특징 부분집합을 만들어 내도록 하고, 최종적으로 개별 특징의 사전 중요도를 설정하여 생태계 모방 알고리즘을 개선하는 방법을 제안하였다. 이를 위해 개별 특징의 우수도를 구할 수 있는 mRMR이라는 방법을 이용하였다. 이렇게 설정한 사전 중요도를 이용하여 GA와 PSO의 진화 연산을 수정하였다. 데이터를 이용한 실험을 통하여 제안한 방법들의 성능을 검증하였다. GA와 PSO를 이용한 특징 선택 방법은 그 분류 정확도에 있어서 뛰어난 성능을 보여주었다. 그리고 최종적으로 제시한 사전 중요도를 이용해 개선된 방법은 그 진화 속도와 분류 정확도 면에서 기존의 GA와 PSO 방법보다 더 나아진 성능을 보여주는 것을 확인하였다.

유전자 알고리즘과 정보이론을 이용한 속성선택 (Feature Selection by Genetic Algorithm and Information Theory)

  • 조재훈;이대종;송창규;김용삼;전명근
    • 한국지능시스템학회논문지
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    • 제18권1호
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    • pp.94-99
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    • 2008
  • 속성선택 (Feature Selection)은 패턴분류 문제에서 분류기들의 성능을 향상시킬 수 있는 중요한 기법이다. 특히, 많은 속성들을 가지는 데이터의 분류문제에서 관련이 적은 데이터, 중복되거나 또는 노이즈 있는 데이터를 제거한 주요 속성부분집합을 선택하여 이용함으로써 분류기의 정확도를 향상시킬 수 있다. 본 논문에서는 유전자 알고리즘과 정보이론의 상호정보량을 이용하여 속성선택을 하는 기법을 제안하였다. 실험을 통하여 제안된 알고리즘이 패턴인식문제에서 다른 방법들보다 성능이 우수함을 보였다.

A Feature Selection-based Ensemble Method for Arrhythmia Classification

  • Namsrai, Erdenetuya;Munkhdalai, Tsendsuren;Li, Meijing;Shin, Jung-Hoon;Namsrai, Oyun-Erdene;Ryu, Keun Ho
    • Journal of Information Processing Systems
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    • 제9권1호
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    • pp.31-40
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    • 2013
  • In this paper, a novel method is proposed to build an ensemble of classifiers by using a feature selection schema. The feature selection schema identifies the best feature sets that affect the arrhythmia classification. Firstly, a number of feature subsets are extracted by applying the feature selection schema to the original dataset. Then classification models are built by using the each feature subset. Finally, we combine the classification models by adopting a voting approach to form a classification ensemble. The voting approach in our method involves both classification error rate and feature selection rate to calculate the score of the each classifier in the ensemble. In our method, the feature selection rate depends on the extracting order of the feature subsets. In the experiment, we applied our method to arrhythmia dataset and generated three top disjointed feature sets. We then built three classifiers based on the top-three feature subsets and formed the classifier ensemble by using the voting approach. Our method can improve the classification accuracy in high dimensional dataset. The performance of each classifier and the performance of their ensemble were higher than the performance of the classifier that was based on whole feature space of the dataset. The classification performance was improved and a more stable classification model could be constructed with the proposed approach.

GA-SVM Ensemble 모델에서의 accuracy와 diversity를 고려한 feature subset population 선택

  • 성기석;조성준
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
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    • 한국경영과학회/대한산업공학회 2005년도 춘계공동학술대회 발표논문
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    • pp.614-620
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    • 2005
  • Ensemble에서 feature selection은 각 classifier의 학습할 데이터의 변수를 다르게 하여 diversity를 높이며, 이것은 일반적인 성능향상을 가져온다. Feature selection을 할 때 쓰는 방법 중의 하나가 Genetic Algorithm (GA)이며, GA-SVM은 GA를 기본으로 한 wrapper based feature selection mechanism으로 response model과 keystroke dynamics identity verification model을 만들 때 좋은 성능을 보였다. 하지만 population 안의 후보들간의 diversity를 보장해주지 못한다는 단점 때문에 classifier들의 accuracy와 diversity의 균형을 맞추기 위한 heuristic parameter setting이 존재하며 이를 조정해야만 하였다. 우리는 GA-SVM 알고리즘을 바탕으로, population안 후보들의 fitness를 측정할 때 accuracy와 diversity 둘 다 고려하는 fitness function을 도입하여 추가적인 classifier 선택 작업을 제거하면서 성능을 유지시키는 방안을 연구하였으며 결과적으로 알고리즘의 복잡성을 줄이면서도 모델의 성능을 유지시켰다.

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