• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제9권2호
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• pp.184-190
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• 1999

The use of the polymerase chain reaction (PCR) method was described using two sets of primers based on the ceuN gene (JEJ 1 and JEJ 2) which encodes a protein involved in siderophore transport and 16S rRNA gene (pA and pB) for the sensitive and specific detection of enteropathogen Campylobacter jejuni. Six oligonucleotides were utilized in an amplification experiment and PCR products of predicted sizes were generated from whole cells and boiled cell lysates at the same intensity. Two sets of the primer pairs, JEJ and pAB, were specific enough for all C. jejuni strains tested for the direct use of whole cells without DNA extraction or lysis steps. In the PCR using the pAB primer pair, the detection limit, as determined by the ethidium bromide staining of the amplification products on agarose gels, was at the level of $10^1$ bacteria cells or less in both the pure culture and artificially inoculated milk and chicken enrichment samples, whereas the detection limit with the JEJ primer pair was relatively low, i.e. $10^3$ cells or more in the same PCR samples. The PCR method using either a primer JEJ or pAB was both repeatable and specific for the detection of C. jejuni in food. This method is simply completed within 4 h.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제17권1호
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• pp.56-62
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• 1989

유아 분변으로부터 장내 병원균인 Cl. perfringens ATCC 13124에 대하여 생육저해 작용을 가지는 낙산 생성균주 1D-1113을 분리하였다. 1D-113 균주는 Cl. butyricum으로 동정되었다. 임상적인 응용을 위하여 1D-113 균주의 포자형성과 포자의 성질을 조사하였다. SM배지에서 12시간 배양 후 포자를 형성하기 시작하여 36시간까지 포자를 형성하였으며, 이때 포자형성율은 95% 이상이었다. 또한 시판의 유포자성 낙산균과 유산균 정장제와 비교해 볼 때 제제화한 1D-113균주의 포자는 양호한 열내성, 보존성 및 내산성을 가지고 있었다.

• Journal of Animal Science and Technology
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• 제44권4호
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• pp.491-498
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• 2002

본 실험에서는 lactobacilli와 bifidobacteria에 의한 E. coli와 S. typhimurium에 대한 생육 억제능을 조사 하였다. 생육억제활성은 well disc assay와 turbidimetry method로 측정하여 비교하였다. 시험균주 10종 중에서 두 가지 방법 모두 평균적으로 높은 항균 활성을 나타낸 균주는 L. acidophilus La-5, L. acidophilus NCFM와 L. casei Lc-01인 것으로 나타났다. 선택된 3가지 유산균과 대표적 enteropathogen인 E. coli와 S. typhimurium을 각각의 혼합 배양하여 생균수를 측정한 결과 병원성균 생육억제는 생균수가 급격히 감소하는 배양 9시간 이후부터 나타났으며 30시간 혼합배양 후에는 병원성균의 생균수는 거의 존재하지 않았다. 실험결과 유산균의 항균활성은 pH 저하 만에 의한 것이 아니었고 유산균의 종류에 따라 생육억제활성에 차이가 있었다.

• Parasites, Hosts and Diseases
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• 제55권5호
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• pp.513-521
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• 2017

Infectious diarrhea is endemic in most developing countries. We aimed to investigate the protozoan, viral, and bacterial causes of acute diarrhea in Taif, Saudi Arabia. A cross-sectional prospective 1-year study was conducted on 163 diarrheal patients of various ages. Stool samples were collected, 1 per patient, and tested for 3 protozoa, 3 viruses, and 9 bacteria with the Luminex Gastrointestinal Pathogen Panel. Overall, 53.4% (87/163) of samples were positives (20.8% protozoa, 19.6% viruses, 2.8% bacteria, and 9.8% mixed). Rotavirus (19.6%), Giardia duodenalis (16.5%), and Cryptosporidium spp. (8.5%) were the mostly detected pathogens. Adenovirus 40/41 (4.2%), Salmonella (3%), Shiga toxin-producing Escherichia coli (3%), and Entamoeba histolytica (2.4%) were also detected. Norovirus GI/II, Vibrio cholerae, Yersinia enterocolitica, and Clostridium difficile toxin A/B were not detected in any patients. All pathogens were involved in coinfections except E. histolytica. Giardia (5.5%) and rotavirus (3%) were the most commonly detected in co-infections. Enterotoxigenic E. coli (2.4%), Campylobacter spp. (2.4%), E. coli 0157 (1.8%), and Shigella spp. (1.2%) were detected in patients only as co-infections. Infections were more in children 0-4 years, less in adults <40 years, and least >40 years, with statistically significant differences in risk across age groups observed with rotavirus (P<0.001), Giardia (P=0.006), and Cryptosporidium (P=0.036) infections. Lastly, infections were not significantly more in the spring. This report demonstrates the high burden of various enteropathogens in the setting. Further studies are needed to define the impact of these findings on the clinical course of the disease.

• 대한수의학회지
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• 제44권4호
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• pp.551-559
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• 2004

Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) causes various clinical signs in human and animals, and has been indicated as a global enteropathogen with zoonotic importance. In this study, the feces of healthy pigs were collected from the slaughtered pigs of Daejon abattoir during the period from December 2001 to October 2002. Of 326 specimens, 13 STEC were confirmed by culture, PCR and colony hybridization. The isolates were further studied for toxin types, pathogenic factors, plasmid profiles, and antimicrobial resistance to characterize the genetic and toxigenic properties. In PCR, all of 13 isolates were evident to have shiga toxin gene (stx). Of 13 isolates stx1 gene was detected in 4 and stx2 gene in 9. The genes of eaeA, hlyA and rfbE were not present in any isolates. In colony hybridization using shiga toxin common primer (STXc), 2 to 9 per 100 colonies subcultured from 13 isolates showed the positive reaction. In the examination for plasmid profiles of the isolates, one to eleven plasmids with varying sizes of 1.0 Kb to 100 Kb were detected, and the 13 STEC could be classified into four groups by the plasmid patterns. The antimicrobial resistance patterns of the isolates were comparably corresponded with the plasmid profile patterns.

• Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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• 제9권1호
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• pp.1-13
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• 2006

목 적: 소아의 급성 위장관염은 매우 흔하고 입원율이 높은 중요한 질환이다. 본 연구에서는 지역 사회에서 소아의 급성 위장관염을 일으키는 대표적인 바이러스 및 세균을 대상으로 1년간 발생 경향에 대한 최근 자료를 제시하고자 하였다. 방 법: 서울대학교 보라매병원 소아과에 3일 이내의 급성 설사를 주소로 내원한 15세 미만의 소아를 대상으로 임상 검사 및 대변 검사를 시행하였다. 입원 소아는 2003년 4월부터 2004년 3월까지 1년간, 외래 소아는 2003년 4월부터 7월까지 단일 외래를 방문한 환아들에 국한하여 연구하였다. 방문 2일 이내에 대변 검체를 얻었으며 바이러스성 원인균 검사로는 로타바이러스, 장 아데노바이러스 항원 검출법을, 세균성 원인균 검사로는 Salmonella, Shigella, Vibrio, Campylobacter 균종 및 Yersinia enterocolitica 대해 배양검사를 시행하였고 병원성 E.coli (ETEC, EHEC, EPEC) 검출을 위해서는 PCR 법을 이용하였다. 입원 환아들은 전해질 검사를 포함한 혈액 검사를 같이 시행받았다. 결 과: 전체 입원 환아는 130명, 외래 환아는 28명이 대상에 포함되었으며, 6세 미만의 환아가 각각 94.6% (123명), 92.8% (26명)로 대부분을 차지하였다. 모두 단일 원인균이 분리되었으며 그 중 로타바이러스가 가장 흔한 원인균으로 입원 환아의 42.3% (55명)에서, 외래 환아의 29.6% (8명)에서 검출되었다. 대변 배양 검사에서는 비장티푸스성 살모넬라균이 입원 환아의 3.9% (4명), 외래 환아의 3.6% (1명)에서 배양되었다. 병원성 대장균은 입원 환아의 2.1% (2명/97명), 외래 환아의 25.0% (3명/12명)에서 분리되었으며 EPEC (4명), ETEC (1명) 순이었고 EHEC는 분리되지 않았다. 이외에 장 아데노바이러스와 Campylobacter, Yersinia, Shigella 균종은 한 예도 없었다. 결 론: 로타바이러스는 국내 지역 사회 병원에서 소아기 위장관염으로 입원하게 되는 가장 흔한 원인균이며 세균성 장염의 원인균으로는 비장티푸스성 살모넬라와 병원성 대장균, 특히 EPEC와 ETEC가 중요하다. Campylobacter 균종은 급성 설사로 입원하게 되는 환아에서는 흔하게 분리되지 않는 것으로 보여지나 외래 환아를 다수 포함한 대단위의 연구가 더 필요하리라 생각된다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제29권4호
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• pp.287-293
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• 2002

병독성 대장균 (K88ac)의 pilin gene을 분리하여 이를 당근에 도입한 후 이의 발현을 유도하여 자돈 설사병 예방 및 치료를 위한 당근경구백신 개발을 목적으로 하였다. 형질전환을 통해 494 세포주를 확립하였고, western분석을 통하여 0.1~4 $\mu\textrm{g}$/g의 pilin 단백질 발현을 확인하였으며 백신식물 생산에 적합한 세포주 2종 (M1-17, Y14-1)을 선발하여 포장생산 및 임상실험에 적용하였다. 쥐를 대상으로 당근 경구 투여시 병원균 항체 생성 여부와 면역 유도를 위한 최적 농도 지표를 파악하기 위하여 1주 간격으로 형질전환 당근 1g, 3g, 5g을 경구투여 한 결과 백신 당근 3g 투여시 10$\mu\textrm{g}$의 재조합 pilin 백신을 경구 투여한 것에 비해 다소 높은 항체 생성을 나타냈으며 3g의 분량이 쥐 면역 유도를 위한 적정량으로 확인하였다. 자돈에 대한 백신당근 경구 투여시 자돈 설사병 보호 효과를 정량적으로 구명하기 위하여 분석한 자돈의 일당 증체량은 형질전환 당근 투여시 평균 60g 이상 더 높은 증체량을 보였으며, 질병방제 효과를 구명하기 위하여 장독성 병원균을 인위 접종한 결과 대조구에서만 fecal score 3의 심각한 설사를 확인하였다. 본 연구를 통해 개발된 당근백신은 효율적 투여방법 등에 대한 후속 실험을 통하여 산업적 이용 가능성이 탐색될 예정이다.

• 한국동물위생학회지
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• 제42권2호
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• pp.93-112
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• 2019

Calf diarrhea is a common disease in young claves and is still a major cause of productivity and economic loss in livestock farms. Fecal samples from Korean native cattle (n=100) with diarrhea from 64 farms in Gwangju area, Korea from september 2017 to December 2018 were examined for shedding of important protozoan parasitic, viral and bacterial pathogens using culture, rapid test kit and PCR methods. Of 57 (89.1%) of the 64 Korean native cattle farms examined had samples infected with at least one of the investigated pathogens. Among 100 fecal samples, 88 samples were positive for at least one the twelve pathogens and 51 samples were simultaneously positive for two or more pathogens by culture and PCR assay. Bovine group A rotavirus (BRV) was the most common pathogen, found in 43/100 (43.0%) samples on 32/64 (50.0%) farms. Subsequently, kobuvirus (30.0%), pathogenic E. coli (29.0%), bovine parvovirus (17.0%), Giardia spp. (13.0%), Eimeria spp. (10.0%), Clostridium perfringens type A (8.0%), bovine torovirus (8.0%), bovine viral diarrhea virus (6.0%), bovine coronavirus (5.0%), bovine norovirus (2.0%) and Cryptosporidium spp. (2.0%) were detected. Nebovirus, kırklareli virus, bovine adenovirus, Salmonella spp. and intestinal parasites were not detected. Of the 72 calves sampled in this age group, 64 (88.9%) samples were positive for at least one enteropathogen. BRV was identified in 34/72 (47.2%) samples from 27/48 (56.3%) farms. Subsequently, pathogenic E. coli (30.6%), kobuvirus (29.2%), BPaV (22.2%), Giardia spp. (15.3%), Eimeria spp. (9.7%), BVDV (6.9%), Cl. perfringens type A (6.9%), BCoV (4.6%) and Cryptosporidium spp. (2.8%) were detected in fecal samples. A total of ninety-six strains of E. coli were isolated from one hundred fecal samples collected from Korean native cattle with diarrhea. The presence of stx1, stx2, eaeA, LT, STa, STb, ehxA, saa, F4, F5(K99), F6, F17, F18 and F41 genes in the isolates was investigated by PCR. Out of ninety-six E. coli isolates screened for specific genes, 30 strains E. coli were identified to harbor shiga toxin-producing E. coli (STEC) 7 (7.3%), enterohemorrhagic E. coli (EHEC) 8 (8.3%), enteropathogenic E. coli (EPEC) 6 (6.3%), enterotoxigenic E. coli (ETEC) 2 (2.1%) and STEC/ETEC hybrid 7 (7.3%). This study provides epidemiological estimates of the prevalence of Korean native cattle's enteropathogens in Gwangju area, Korea, which would be used for cattle farmers and veterinarians to select appropriate therapeutic method.