• 제목/요약/키워드: dynamic binding

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Mobile IPv6 환경에서 동적 바인딩 갱신을 위한 라이프타임 할당 기법 (Lifetime Assignment Schemes for Dynamic Binding Update in Mobile IPv6)

  • 양순옥;송의성;길준민;김성석;황종선
    • 한국정보과학회논문지:정보통신
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    • 제31권1호
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    • pp.27-36
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    • 2004
  • 사용자의 이동성을 지원하는 Mobile IP 환경에서, 빈번한 바인딩 갱신 메시지의 발생은 상당한 부하를 초래할 수 있다. 따라서 이를 감소시키기 위한 알고리즘 개발이 필요하다. 이를 위해, 본 논문에서는 사용자의 이동성과 관련된 지역적 특성을 고려한 동적 바인딩 갱신을 위한 라이프타임 할당 기법을 제안한다. 각 이동 노드는 방문한 서브넷과 관련된 로그 정보를 이용하여 프로파일을 유지하고 있다. 즉, 방문한 서브넷별로 평균 상주시간을 기반으로 하여 적응적 라이프타임을 결정하여 다음 방문 시에 이 값을 바인딩 갱신의 라이프타임으로 사용한다. 또한 각 이동 노드가 동일한 서브넷을 방문하더라도 방문 시간대에 따라 평균 상주시간이 차이가 날 수 있다는 사실을 기반으로 하여, 동일한 서브넷에 대하여 방문 시각에 따라 별개의 라이프타임을 결정하는 알고리즘도 제안한다. 제안한 기법의 성능 향상을 보이기 위하여 기존 Mobile IPv6과 비교 실험을 수행하였으며, 이 과정에서 다음의 두 가지 인자를 주로 비교하였다: 바인딩 갱신 메시지의 수 및 바인딩 요청 메시지의 수. 실험 결과, 제안한 기법은 기존 Mobile IPv6에 비해 위 메시지의 수를 줄임으로써 상당한 통신비용 절감효과를 보여주었다.

Investigation of the Binding Site of CCR2 using 4-Azetidinyl-1-aryl-cyclohexane Derivatives: A Membrane Modeling and Molecular Dynamics Study

  • Kothandan, Gugan;Gadhe, Changdev G.;Cho, Seung Joo
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제34권11호
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    • pp.3429-3443
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    • 2013
  • Chemokine receptor (CCR2) is a G protein-coupled receptor that contains seven transmembrane helices. Recent pharmaceutical research has focused on the antagonism of CCR2 and candidate drugs are currently undergoing clinical studies for the treatment of diseases like arthritis, multiple sclerosis, and type 2 diabetes. In this study, we analyzed the time dependent behavior of CCR2 docked with a potent 4-azetidinyl-1-aryl-cyclohexane (4AAC) derivative using molecular dynamics simulations (MDS) for 20 nanoseconds (ns). Homology modeling of CCR2 was performed and the 4AAC derivative was docked into this binding site. The docked model of selected conformations was then utilized to study the dynamic behavior of the 4AAC enzyme complexes inside lipid membrane. MDS of CCR2-16b of 4AAC complexes allowed us to refine the system since binding of an inhibitor to a receptor is a dynamic process and identify stable structures and better binding modes. Structure activity relationships (SAR) for 4AAC derivatives were investigated and reasons for the activities were determined. Probable binding pose for some CCR2 antagonists were determined from the perspectives of binding site. Initial modeling showed that Tyr49, Trp98, Ser101, Glu291, and additional residues are crucial for 4AAC binding, but MDS analysis showed that Ser101 may not be vital. 4AAC moved away from Ser101 and the hydrogen bonding between 4AAC and Ser101 vanished. The results of this study provide useful information regarding the structure-based drug design of CCR2 antagonists and additionally suggest key residues for further study by mutagenesis.

Leucine Zipper as a Fine Tuner for the DNA Binding; Revisited with Molecular Dynamics Simulation of the Fos-Jun bZIP Complex

  • 최용훈;양철학;김현원;정선호
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제20권11호
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    • pp.1319-1322
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    • 1999
  • Leucine zipper dynamically tunes the degree of bifurcation of the DNA binding segments in the basic region of the Fos-Jun bZIP complex. Molecular dynamics simulation indicated that site-specific mutagenesis of conserved leucine residues inside the leucine zipper domain caused the change of dynamic behavior of the basic region, and efficient DNA binding occurs only within a certain range of distance between the two DNA binding segments in the basic region. Distribution of α-helices in the hinge region is also suggested to influence the bifurcation of the DNA binding segments.

Stability of five layer sandwich beams - a nonlinear hypothesis

  • Smyczynski, Mikolaj J.;Magnucka-Blandzi, Ewa
    • Steel and Composite Structures
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    • 제28권6호
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    • pp.671-679
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    • 2018
  • The paper is devoted to the stability analysis of a simply supported five layer sandwich beam. The beam consists of five layers: two metal faces, the metal foam core and two binding layers between faces and the core. The main goal is to elaborate a mathematical and numerical model of this beam. The beam is subjected to an axial compression. The nonlinear hypothesis of deformation of the cross section of the beam is formulated. Based on the Hamilton's principle the system of four stability equations is obtained. This system is approximately solved. Applying the Bubnov-Galerkin's method gives an ordinary differential equation of motion. The equation is then numerically processed. The equilibrium paths for a static and dynamic load are derived and the influence of the binding layers is considered. The main goal of the paper is an analytical description including the influence of binding layers on stability, especially on critical load, static and dynamic paths. Analytical solutions, in particular mathematical model are verified numerically and the results are compared with those obtained in experiments.

순환자원을 활용한 Cement Zero형 ECO 파일채움재의 성능평가 (Performance evaluation of cement-zero ECO pile-filling material utilizing recycled resource)

  • 송상훤;윤성진;이영원;음현미;문경주;고형우
    • 한국건축시공학회:학술대회논문집
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    • 한국건축시공학회 2013년도 추계 학술논문 발표대회
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    • pp.8-10
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    • 2013
  • Inorganic binding material was made by recycled resource and its applicability as pile-filling material was examined. The result was that the material had same liquidity with the liquidity of OPC and high reactivity with site soil. According to dynamic/static loading tests by site test-construction, the inorganic binding material met both design bearing capacity and settlement. Since the inorganic binding material showed same or better performance than OPC, the utilization possibility of the inorganic binding material made of recycled resource as pile-filling material was verified.

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Mechanisms of Macromolecular Interactions Mediated by Protein Intrinsic Disorder

  • Hong, Sunghyun;Choi, Sangmin;Kim, Ryeonghyeon;Koh, Junseock
    • Molecules and Cells
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    • 제43권11호
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    • pp.899-908
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    • 2020
  • Intrinsically disordered proteins or regions (IDPs or IDRs) are widespread in the eukaryotic proteome. Although lacking stable three-dimensional structures in the free forms, IDRs perform critical functions in various cellular processes. Accordingly, mutations and altered expression of IDRs are associated with many pathological conditions. Hence, it is of great importance to understand at the molecular level how IDRs interact with their binding partners. In particular, discovering the unique interaction features of IDRs originating from their dynamic nature may reveal uncharted regulatory mechanisms of specific biological processes. Here we discuss the mechanisms of the macromolecular interactions mediated by IDRs and present the relevant cellular processes including transcription, cell cycle progression, signaling, and nucleocytoplasmic transport. Of special interest is the multivalent binding nature of IDRs driving assembly of multicomponent macromolecular complexes. Integrating the previous theoretical and experimental investigations, we suggest that such IDR-driven multiprotein complexes can function as versatile allosteric switches to process diverse cellular signals. Finally, we discuss the future challenges and potential medical applications of the IDR research.

SOC 설계 자동화를 위한 동적인 하드웨어 할당 및 바인딩 알고리즘 (A Dynamic Hardware Allocation and Binding Algorithm for SOC Design Automation)

  • 엄경민;인치호
    • 한국ITS학회 논문지
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    • 제9권3호
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    • pp.85-93
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    • 2010
  • 본 논문에서는 SOC 설계 자동화를 위한 할당 및 바인딩을 동시에 수행하는 새로운 동적인 하드웨어 할당 및 바인딩 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘은 스케줄링의 결과를 입력으로 받아들이고, 각 기능 연산자에 연결된 레지스터 및 연결 구조가 최대한 공유하도록 제어스텝마다 연산과 기억 소자의 상호 연결 관계를 고려하여 기능 연산자, 연결 구조 및 레지스터를 동시에 할당 및 바인딩을 한다. 제안된 알고리즘은 각 시스템마다 비교 실험을 통하여 기존의 기능 연산자와 레지스터의 수를 미리 정했거나, 분리하여 수행한 방식들과 비교함으로서 제안된 알고리즘의 효용성을 보인다.

광역 객체 컴퓨팅에서 통합(이름/속성) 기반의 동적 바인딩 서비스 모델의 실험분석 (The Experimental Analysis of Integrated (Name/Property) Dynamic Binding Service Model for Wide-Area Objects Computing)

  • 정창원;주수종
    • 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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    • 제33권10호
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    • pp.746-758
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    • 2006
  • 광역 환경에서 존재하는 수많은 서버객체들은 이름이나 속성에 의해, 다양한 중복된 성질을 갖는다. 이러한 같은 성질을 갖는 서버객체들인 중복객체들에게 서비스를 요청할 때, 기존의 네이밍이나 트레이딩 서비스는 중복된 서버객체들의 바인딩 서비스가 불가능하다. 따라서 우리는 광역 컴퓨팅 환경에서 중복객체의 선정 및 동적 바인딩 서비스를 위한 통합모델을 제시하였다. 본 모델은 중복된 객체들의 일치관리 기능뿐만 아니라 시스템들간의 부하 균형화를 유지하기 위해서 최소부하를 갖는 시스템상의 객체를 선정하는 동적 바인딩 서비스 기능을 제공한다. 이러한 목적에서 우리는 광역 컴퓨팅 환경에서 중복특성을 가진 서버객체들의 바인딩을 지원하기 위한 서비스 방안과 모델을 구축해 왔다. 본 논문에서는 구축된 모델에 대해 실험환경을 보이고, 연합 모델에서 클라이언트와 서버와의 바인딩 과정을 성능 평가하였고, 부하균형이 우리의 모델에 적용될 수 있는지 확인하기 위하여 주어진 조건을 이용하여 우리의 모델을 검증하였다. 또한 우리는 광역환경을 위한 도메인들간의 연합을 고려한 모델의 수행결과도 분석하였다. 이들 수행 결과를 통해 기존 네트워크의 물리적인 트리 구조상에서 검색 비용이 적음을 보였다.

융합 서비스의 진화를 위한 프로파일 기반 동적 서비스 바인딩 기술 (Profile-Based Dynamic Service Binding for Evolution of Converged Services)

  • 김길환;금창섭;배현주
    • 한국전자거래학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.27-46
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    • 2013
  • 융합 서비스를 빠른 시간 안에 시장에 제공하기 위해서는 외부 서비스와 자신의 핵심 역량을 융합하는 능력이 필요하며, 정보시스템 아키텍처는 이러한 서비스 융합을 효과적으로 지원해야 한다. 서비스 지향 아키텍처는 이러한 서비스 융합을 성공적으로 지원할 수 있는 정보시스템 아키텍처이다. 그러나 기존의 서비스 지향 아키텍처를 이용한 융합 서비스의 구현은 개별 서비스 진화가 융합 서비스의 진화로 반영되지 않는 단점이 있다. 본 논문에서는 서비스 지향 아키텍처의 맥락하에서 개별 서비스의 진화에 따른 융합 서비스의 자체적 진화를 지원하기 위한 프로파일 기반 동적 서비스 바인딩 기법의 도입을 제안하였다. 이를 위해 프로파일 기반 동적 서비스 바인딩 기술의 필요성을 제시하기 위해 스마트 운동 기구와 관련된 융합 서비스 시나리오를 제시하고 해당 기술이 구현해야 할 요구 사항을 도출하였다. 그리고 도출된 요구 사항을 만족시킬 수 있는 프로파일 기반 동적 서비스 바인딩 기술의 개념 및 구조를 제안하였다. 마지막으로 OSGi, Apache Camel, Apache CXF 등을 이용하여 프로파일 기반 동적 서비스 바인딩 기술의 프로토타입을 구현하여 제안된 기술에 대한 간략한 평가를 수행하였다.

홈 네트워크에서의 댁내외 기기들의 동적 바인딩 시스템 설계 및 구현 (Design and Implementation of Dynamic Binding System among the Devices Located in Inside and Outside of Home Networks)

  • 이재현;권경희
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제6권12호
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    • pp.169-176
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    • 2006
  • 홈 네트워크은 주택건축 시점에 건축물의 내장시스템을 중심으로 구축되기 때문에 건축 후 새롭게 구입한 기기와의 네트워크 호환성을 보장하지 못한다. 본 논문에서는 댁내의 기기를 통제하기 위해 댁내 외 기기와 효과적으로 연결할 수 있는 동적인 바인딩 시스템(Dynamic Binding System:DBS)을 제안한다. DBS는 WPAN(Wireless Personal Area Network)에서 동작하는 ZigBee 바인딩 기술을 기반으로 댁외 모바일 기기와 댁내 기기와의 연결을 시도하였다. 본 연구를 위한 시스템 구성으로는, 홈 서버에 프록시 서버와 location 서버가 위치하고 댁내의 기기들은 tinyOS 가 탑재된 telos보드로 구성하였으며, 모바일 기기는 에뮬레이터로 구현하였다. 댁내의 통신은 ZigBee에서 사용하는 IEEE 802.15.4 (2.4GHz)프로토콜을 이용하고, 그 외는 TCP/IP를 이용했다. DBS는 댁내 기기들이 주소형식에 상관없이 댁내 외 기기와 연결되는 것을 용이하게 하였다. 또한 흠 네트워크로 댁내 기기가 새로이 진입될 경우, 기기간 메시지교환을 통해 자동으로 인식될 수 있도록 하였다.

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