The Gene Set network viewer (GSnet) visualizes the functional enrichment of a given gene set with a protein interaction network and is implemented as a plug-in for the Cytoscape platform. The functional enrichment of a given gene set is calculated using a hypergeometric test based on the Gene Ontology annotation. The protein interaction network is estimated using public data. Set operations allow a complex protein interaction network to be decomposed into a functionally-enriched module of interest. GSnet provides a new framework for gene set analysis by integrating a priori knowledge of a biological network with functional enrichment analysis.
Park, Jin-Oh;Park, Sang-Heon;Kim, Kyung-Soo;Park, Won-Joo;Kim, Jong-Hoon
Journal of the Computational Structural Engineering Institute of Korea
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v.33
no.2
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pp.113-119
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2020
The IoT-based sensor network is one of the methods that can be efficiently applied to maintain the facilities, such as bridges, at a low cost. In this study, based on LoRa LPWAN, one of the IoT communications, sensor board for cable tension monitoring, data acquisition board for constructing sensor network along with existing measurement sensors, are developed to create bridge structural health monitoring system. In addition, we designed and manufactured a smart sensor node for LoRa communication and established a sensor network for monitoring. Further, we constructed a test bed at the Yeonggwang Bridge to verify the performance of the system. The test bed verification results suggested that the LoRa LPWAN-based sensor network can be applied as one of the technologies for monitoring the bridge structure soundness; this is excellent in terms of data rate, accuracy, and economy.
Journal of the Korean Society for Nondestructive Testing
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v.23
no.1
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pp.45-52
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2003
A number of stress corrosion cracks in turbine rotor disk keyway in power plants have been found and the necessity has been raised to detect and evaluate the cracks prior to the catastrophic failure of turbine disk. By ultrasonic RF signal analysis and using a neural network based on bark-propagation algorithm, we tried to evaluate the location, size and orientation of cracks around keyway. Because RF signals received from each reflector have a number of peaks, they were processed to have a single peak for each reflector. Using the processed RF signals, scan data that contain the information on the position of transducer and the arrival time of reflected waves from each reflector were obtained. The time difference between each reflector and the position of transducer extracted from the scan data were then applied to the back-propagation neural network. As a result, the neural network was found useful to evaluate the location, size and orientation of cracks initiated from keyway.
Journal of the Institute of Electronics Engineers of Korea TC
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v.45
no.5
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pp.1-11
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2008
Wireless Sensor Networks is applied to improvement of life convenience or service like U-City as well as environment pollution, tunnel and structural health monitoring, storm, and earthquake diagnostic system. To increase the usability of sensor data and applicability, mobile devices and their facilities allow the applications of sensor networks to give mobile users and actuators the results of event detection at anytime and anywhere. In this paper, we present MUSNEMO(Multi-sensor centric Ubiquitous Smart sensor NEtwork using Mobile devices) developed system for providing more efficient and valuable information services with a variety of mobile devices and network camera integrated to WSN. Our system is performed based on IEEE 802.15.4 protocol stack. To validate system usability, we built sensor network environments where were equipped with five application sensors such magnetic, photodiode, microphone, motion and vibration. We also built and tested proposed MUSNEMO to provide a novel model for event detection systems with mobile framework.
Journal of Korean Institute of Industrial Engineers
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v.29
no.2
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pp.172-178
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2003
In the recent researches, a variety of ways for determining the locations of RBF centers have been proposed assuming that the number of RBF centers is known. But they have also many numerical drawbacks. We propose a new method to overcome such drawbacks. The strength of our method is to determine the locations and the number of RBF centers at the same time without any assumption about the number of RBF centers. The proposed method consists of two phases. The first phase is to determine the number and the locations of RBF centers using bi-section search method and enhanced k-medoids clustering which overcomes drawbacks of clustering algorithm. In the second phase, network weights are computed and the design of RBF network is completed. This new method is applied to several benchmark data sets. Benchmark results show that the proposed method is competitive with the previously reported approaches for center selection.
This is paper aims to evaluate allocation order of SRU using Analytic Network Process. For evaluation, in this paper, assess about person, ship and environment related risk by fuzzy logic and AHP(Analytic hierarchy Process). Also, quantity and quality operation efficiency assess by DEA (Data Envelopment Analysis) and Liquate scale. finally total weight calculate by ANP. At the result, Rescue Units of MP, YS RCC/RSC is order higher. Thus, it needs to have more rescue ships and rescue devices for relieving the risk in the future.
Journal of Institute of Control, Robotics and Systems
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v.7
no.4
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pp.326-333
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2001
This paper focuses on a method to connect mobile devices such as mobile robot. Automated Guided Vehicle (AGV) and Unmanned Container Transporter(UCT) to a fieldbus. In this paper, the IEEE 802.11 wireless LAN is used to extend a Profibus network for the mobile devices. In order to integrate these two networks, a gateway is developed using two threads and an internal buffer. Furthermore, a polling algorithm is applied at the gateway in order to satisfy real-time requirements on data communication, Finally, the performance measures such as data latency and throughput are experimentally evaluated on a wirelessly-extended Profibus network. The results shows the feasibility of the wireless extension of Profilbus for various mobile device.
Journal of the Korean Society of Marine Environment & Safety
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v.13
no.2
s.29
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pp.155-160
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2007
This paper aims to evaluation of order for allocation of rescue unit using Analytic Network Process. For evaluation, in this paper, assess about person, ship and environment related risk by fuzzy logic and AHP(Analytic hierarchy Process). Also, quantity and quality operation efficiency assess by DEA(Data Envelopment Analysis) and Liquate scale. finally total weight calculate by ANP. At the result, Rescue Units of MP, YS RCC/RSC is order higher. Thus, it needs to have more rescue ships and rescue devices for relieving the risk in the future.
The Journal of The Korea Institute of Intelligent Transport Systems
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v.1
no.1
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pp.17-21
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2002
There are many problems of interoperability between ITS system equipments since the protocol standard for a network center and a node has not defined. In this paper, we consider the use of the SNMP to solve the interoperability problem, and apply the SNMP in the case of a CCTV as an example. Also, we defined its corresponding MIBs and accomplished the interoperability test, where the method of controlling the CCTV is explained and the data transmitted on the network are shown in a hexadecimal format. Our results are expected to be helpful for a guideline or feasibility test as nationwide data to support the interoperability of ITS systems between a network center and nodes.
Currently, the radial basis function network (RBFN) and various other neural networks are employed to classify gases using chemical sensors arrays, and their performance is steadily improving. In particular, the identification performance of the RBFN algorithm is being improved by optimizing parameters such as the center, width, and weight, and improved algorithms such as the radial basis function network-stochastic gradient (RBFN-SG) and radial basis function network-normalized stochastic gradient (RBFN-NSG) have been announced. In this study, we optimized the number of centers, which is one of the parameters of the RBFN-NSG algorithm, and observed the change in the identification performance. For the experiment, repeated measurement data of 8 samples were used, and the elbow method was applied to determine the optimal number of centers for each sample of input data. The experiment was carried out in two cases(the only one center per sample and the optimal number of centers obtained by elbow method), and the experimental results were compared using the mean square error (MSE). From the results of the experiments, we observed that the case having an optimal number of centers, obtained using the elbow method, showed a better identification performance than that without any optimization.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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