• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제19권7호
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• pp.931-937
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• 2006

The full-length cDNA of the porcine SMPX gene was obtained by the rapid amplification of cDNA ends (RACE). The nucleotide sequences and the predicted protein sequences share high sequence identity with both human and mouse. The promoter of SMPX was sequenced and then analyzed to find the promoter binding sites. The reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) revealed that SMPX has a high level of expression in heart and skeletal muscle, a very low expression in lung and spleen and no expression in liver, kidney, fat and brain. Moreover, SMPX has a differential expression level in skeletal muscle, the expression in 65-day embryos being higher than other stages. The porcine SMPX was mapped to SSCXp24 by using a somatic cell hybrid panel (SCHP) and was found closely linked to SW1903 using the radiation hybrid panel IMpRH. An A/G single nucleotide polymorphism (PCR-RFLP) in the 3'-untranslated region (3'-UTR) was detected in eight breeds. The analysis of allele frequency distribution showed that introduced pig breeds (Duroc and Large White) have a higher frequency of allele A while in the Chinese indigenous pig breeds (Qingping pig, Lantang pig, YushanBlack pig, Large Black-White pig, Small Meishan) have a higher frequencies of allele G. The association analysis using an experimental population (188 pigs), which included two cross-bred groups and three pure-blood groups, suggested that the SNP genotype was associated with intramuscular fat content.

• 한국버섯학회지
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• 제16권1호
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• pp.16-21
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• 2018

생육이 빠르고 중형인 큰느타리버섯 품종을 육종하기 위하여 육종모본 $24{\times}46$과 KNR2539를 단교배하여 소규모 시험재배하여 생육소요일수(15.4일)와 수량(81.5 g/850 cc), 품질(7.5)을 기준으로 $17{\times}15$계통을 선발하였다. 선발된 계통을 '애린이6'라고 명명하고 대량재배로 큰느타리2호와 생육특성을 비교하였다. 병당수량은 '애린이6' 가 76.0 g으로 대조품종 61.4 g의 113% 수준이었다. 품질의 경우 '애린이6'는 6.8, '큰느타리2호'는 5.7로 나타났다. 생육소요일, 수량, 품질은, 독립 t test로 분석한 결과 통계적으로 유의성을 보였다. 갓의 명도(L)에 있어서 '애린이6'는 61.7로 대조품종의 58.3보다 높아서 밝은 색을 띄었다. 고유성에 있어서는 URP2와 URP11에서 대조품종과 신품종이 다형성을 보였고, 대치배양에서도 뚜렷한 대선이 관찰되었다.

• IMMUNE NETWORK
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• 제8권3호
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• pp.82-89
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• 2008

Background: Although a skin test is the primary option for detecting allergen-specific IgE in clinics, the serum IgE immunoassay is also important because it allows for the diagnosis of allergy without any accompanying adverse effect on the patient. However, the low detection limit of IgE levels by immunoassay may restrict the use of the method in some occasions, and improving its sensitivity would thus have a significant implication in allergy-immunology clinics. Methods: In this study, we attempted to detect specific serum IgE by using immuno-polymerase chain reaction (IPCR) which combines the antigen-antibody specificity of enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) with the amplification power of PCR. Results: Our results demonstrated that Blo t5-specific serum IgE can be detected by IPCR with a 100-fold higher sensitivity than ELISA, and cross-reactivity of serum IgE to other mite allergens is able to be analyzed by using only $0.3{\mu}l$ of serum sample. Use of real-time IPCR seemed to permit more convenient determination of specific serum IgE as well. Conclusion: We believe that IPCR can serve as a valuable tool in determining specific serum IgE, especially when the amount of serum sample is limited.

• 한국항공우주학회지
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• 제34권8호
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• pp.55-62
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• 2006

본 논문에서는 단일층 압전 작동기로 구동되는 곤충 모방 날갯짓 기구의 실험적 평가의 결과를 제시하였다. 변위 증폭기구의 연결막대 길이와 힌지 위치를 조절하여, 말벌류 곤충의 상향 날갯짓 끝에 발생하는 날개 겹침 (clap)을 모방할 수 있도록 하였다. 또한, 실제 곤충 날개의 단면이 지그-재그형인 것을 모방한 날개를 제작하여 부착하였다. 이 두 가지 추가적인 고안으로 인하여 본 날갯짓 기구는 이전 날개에 비하여 면적이 절반 밖에 되지 않음에도 불구하고 더 큰 양력을 발생할 수 있었다. 본 연구에서는 날개의 겹침, 지그-재그형 단면, 인가전압 파형이 양력 발생에 미치는 영향을 조사하였다. 최종적으로는 디지털 고속카메라를 이용하여, 개선된 날갯짓 기구가 상향 날갯짓과 하향 날갯짓에서 와류를 발생함을 확인하였다.

• 대한수의학회지
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• 제39권6호
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• pp.1151-1160
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• 1999

This study was conducted to detect the toxoplasma-specific DNA in peripheral blood collected from cats experimentally infected with Toxoplasma gondii (RH strain) and from domiciled cats by B1 gene-base polymerise chain reaction(PCR). The sensitivity of oligonucleotide primer, T-1 & T-2, designed from toxoplasma B1 gene amplification method was compared with parasite detection by mouse inoculation(MI). And also, latex agglutination test(LAT) and indirect fluorescent antibody test(IFAT) were conducted to detect the fluctuation of serum antibodies compared with the detection of toxoplasma by PCR and MI. Toxoplasma B1 gene PCR was shown consistently high sensitivity and the results obtained by PCR agreed completely with those from MI. All blood samples collected before infection with T gondii gave negative results by PCR and MI. Also, toxoplasma Bl gene PCR was not cross reaction with Neospora caninum DNA and normal cat leucocyte as controls. The toxoplasma-specific DNA was detected by PCR in blood of 5 cats experimentally infected with T gondii 6 days after infection and the detection of this specific-DNA was long lasted in blood for 64 days after infection. The detection of toxoplasma-specific DNA by PCR could be identified as few as 10 tachyzoites and the isolation of T gondii by MI could be isolated as few as 1 tachyzoite from tenfold serial dilution of T gondii with normal cat blood, respectively. In healthy domiciled cats, the toxoplasma-specific DNA and the parasite were detected and isolated in blood from 3 of 56(5.3%) cats by both PCR and MI, respectively. In the results of antibody test from the total 56 heads of healthy domiciled cats, the positive rates are 15(26.7%) by LAT and 19(33.9%) by IFAT. These results suggest that PCR detection of toxoplasma can be applied as a sensitive and specific diagnostic and research tool.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제20권10호
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• pp.1463-1470
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• 2010

E. coli has long been widely used as a host system for the manufacture of recombinant proteins intended for human therapeutic use. When considering the impurities to be eliminated during the downstream process, residual host cell DNA is a major safety concern. The presence of residual E. coli host cell DNA in the final products is typically determined using a conventional slot blot hybridization assay or total DNA Threshold assay. However, both the former and latter methods are time consuming, expensive, and relatively insensitive. This study thus attempted to develop a more sensitive real-time PCR assay for the specific detection of residual E. coli DNA. This novel method was then compared with the slot blot hybridization assay and total DNA Threshold assay in order to determine its effectiveness and overall capabilities. The novel approach involved the selection of a specific primer pair for amplification of the E. coli 16S rRNA gene in an effort to improve sensitivity, whereas the E. coli host cell DNA quantification took place through the use of SYBR Green I. The detection limit of the real-time PCR assay, under these optimized conditions, was calculated to be 0.042 pg genomic DNA, which was much higher than those of both the slot blot hybridization assay and total DNA Threshold assay, where the detection limits were 2.42 and 3.73 pg genomic DNA, respectively. Hence, the real-time PCR assay can be said to be more reproducible, more accurate, and more precise than either the slot blot hybridization assay or total DNA Threshold assay. The real-time PCR assay may thus be a promising new tool for the quantitative detection and clearance validation of residual E. coli host cell DNA during the manufacturingprocess for recombinant therapeutics.

• 정보처리학회논문지A
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• 제12A권6호
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• pp.531-538
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• 2005

고성능 VLSI 아날로그 정보처리시스템(AIPS)에서 고 이득 Op-Amp는 기본적 정보처리소자이다. 증폭기는 시스템 내 피드백루프에 사용시 안정도와 정확도를 얻기 위하여 고 이득이 요구된다. 1단의 증폭으로 이득이 충분하지 않을 경우 이득 부스팅 또는 추가적인 이득단이 필요하다. 본 논문에서 부 저항소자를 사용할 경우 이득이 개선되며 1단으로 고 이득을 손쉽게 얻을 수 있음을 보였다. 기존의 방법에 비교하여 본 연구에 제안된 방법은 전 출력 스윙, 적은 회로면적과 전력소비, 그리고 여러 구조의 증폭기에 적용가능 하다는 잇점을 지니고 있다. 부 저항소자는 Op-Amp에 사용될 경우 (+)와 (-) 차동출력 사이에 설치되어 증폭기 출력저항을 상쇄한다. 부 저항소자를 교차 연결된 CMOS 인버터의 형태로 구현할 경우 간단한 구조로서 40 dB 보다 더 큰 이득개선을 손쉽게 얻을 수 있음을 HSPICE 시뮬레이션을 통하여 확인하였다.

• 대한본초학회지
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• 제37권5호
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• pp.9-16
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• 2022

Objectives : The purpose of this study is to report that applying the genetic discrimination method to Pinelliae Tuber is suitable as a countermeasure for the limitations of morphological identification announced publicly in the Ministry of Food and Drug Safety(MFDS). Methods : Randomly selected fifty samples in Pinelliae Tuber imported from China were used for morphological and genetic identification. The morphological identification was applied method announced publicly by the MFDS. The traits of morphological identification were classified as Pinellia ternata, P. tripartita, Pinellia pedatisecta, and Typhonium flagelliforme, according to the formation of tuberous root and tuber morphology. The genetic identifications were conducted by Sequence Characterized Amplified Region(SCAR) marker and DNA barcoding analysis for cross-validation, respectively. SCAR marker was verified according to the presence or absence of amplicon through PCR amplification using species-specific primers. DNA barcoding analysis used sequence information of the matK region. Results : As a result of the morphological identification, 27 out of 50 samples were identified as original species 'P. ternata' of genuine 'Pinelliae Tuber', and 23 were identified as adulterant species 'P. pedatisecta'. Unlike this, the genetic identification was identified as the original species 'P. ternata' in all 50 samples in the SCAR marker and matK regional sequence analysis. Conclusions : Pinelliae Tuber of morphological mutant that can not be classified by morphological identification is imported from China. The SCAR marker would be used as accurate and efficient assays for species identification of the morphological mutant.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제36권4호
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• pp.289-297
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• 2021

본 연구에서 multiplex PCR과 real-time PCR을 이용하여 창난젓의 원료를 감별할 수 있는 새로운 판별법을 개발하였다. 명태와 가이양의 종 특이 프라이머를 디자인하고, 명태와 가이양의 genomic DNA를 template로 single PCR과 multiplex PCR을 실시하였다. PCR을 실시한 결과, single PCR에서 명태(297 bp)와 가이양(132 bp)에 해당하는 PCR 밴드를 확인하였으며 교차 반응이 일어나지 않는 것을 확인하였다. Multiplex PCR에서 명태와 가이양 사이에 교차반응 없이 증폭이 일어나는 것을 확인하였다. Real-time PCR 결과, 명태 종 판별 프라이머에서 명태의 Ct 평균값은 20.765±0.691, 가이양 시료에서 Ct 평균값은 35.719±1.828이었으며, 가이양 종 판별 프라이머에서 명태 시료의 Ct 평균값은 35.996±1.423, 가이양 시료의 Ct 평균값은 20.096±0.793으로 프라이머의 효율성, 특이성 및 교차 반응성에서 유의한 차이가 나타났다. 이러한 결과를 바탕으로 시중에서 판매되는 7개 제품을 multiplex PCR 및 real-time PCR로 확인하였으며, 모든 시료에서 유효한 결과를 확인하였다. 본 연구에서 제작된 명태와 가이양에 대한 종 특이적 프라이머는 가공된 젓갈 시료의 원료의 판별 가능하며, 이러한 결과는 식품안전관리에 기여할 수 있을 것으로 기대된다.

• Journal of Plant Biotechnology
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• 제41권1호
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• pp.56-63
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• 2014

무의 가공용 품종의 가공 수율이 현재 약 70%로 버리는 부분이 많아 뿌리의 형태가 가공에 유리하도록 상부와 하부의 굵기가 유사한 품종을 육성코자 하였으며 웅성불임을 이용하여 채종함으로 종자의 순도도 높이고자 본 연구를 실시하였다. 가공용 품종은 특히 순도가 높아야 하므로 계통 육성 과정에서 순계로 고정되었는지 여부를 확인하기 위해 표현형 뿐 아니라 분자표지를 활용하여 증식된 종자의 순도를 검정하였다. 우수 품종 육성을 위해 A친은 ('관동여름' ${\times}$ '계룡봄무')의 후대에서 위황병에 저항성이며 추대성이 늦고 고온기 재배에서 근비대성이 타 계통보다 양호한 담록수 계통을 고정하였고, B친은 ('태상왕' ${\times}$ '서울봄무')의 후대에서 위황병, 근류병에 저항성이며 잎색은 진한 녹색으로 청수색이 강하고 근비대성, 육질치밀성인 계통을 선발 고정하였다. 화분친(C친)은 개체선발법으로 세대를 진전하였으며 분리세대 순도검정을 위해 각 세대별로 종자 48점을 ACMP-490, cnu-316 프라이머를 이용하여 분석한 결과 분리 1 세대 ACMP-490은 64.6%, cnu-316은 66.7%의 고정율을 보였으며, 분리 2세대 ACMP-490은 68.8%, cnu-316은 70.8%의 고정율을 보였고, 분리 3 세대 ACMP-490은 93.8%, cnu-316은 100%의 고정율을 나타냈으며, 분리 4 세대 ACMP-490은 93.8%, cnu-316은 100%의 고정율을 보였고, 분리 5 세대 ACMP-490은 95.8%, cnu-316은 100%의 고정율을 보였고, 분리 6세대 ACMP-490은 100%, cnu-316은 100%의 고정율을 보여 원원종을 확보하였다. 고정이 확인된 계통을 이용하여 조합을 작성한 결과 뿌리의 형태가 가공에 적합하고 순도가 우수하여 이를 'YR 오래(YR ORE)'로 2011년에 품종보호 출원하여 2013년 신품종으로 등록 되었다(품종보호 제 4550호, 2013.06.10.).