Potyvirus group에 속하는 것으로 알려진 마늘 모자이크 바이러스 (GMV)가 식물에서 병을 유도하는 메카니즘을 이해하기 위하여, 마늘에 존재하는 GMV에 대한 cDNA clone인 clone 29-6을 분리하였다. Northern blot 분석에 의해 이 바이러스의 genome size는 약 9 kb이고, 또한 clone 29-6은 GLV genome과 유사성이 없었으며, 마늘잎으로부터 분리된 $poly(A)^{+}$ RNA와 강하게 hybridization되었다. 이러한 사실은 이 cDNA clone이 마늘에 감염하여 모자이크 병반을 유도하는 GMV에 대한 cDNA clone 중의 하나인 것으로 생각되었다. Clone 29-6을 probe으로 사용하여 마늘 바이러스의 cDNA 은행을 탐색하여 이와 중첩되는 clone을 선별하여 염기서열을 결정한 결과 이들의 염기서열이 중첩부위에서 서로 일치하지 않았는데 이는 마늘은 여러 형태의 GMV에 의해 감염되어 있음을 암시한다.
생물체(生物體)가 가지고 있는 동위효소(同位酵素)는 그것을 지배(支配)하고 있는 유전자형(遺傳子型)에 의(依)해 여러가지 효소형(酵素型)을 나타낸다. 그러므로 소나무 clone 보존원(保存園)과 같이 접목법(接木法)에 의(依)해 영양번식(榮養繁殖)된 경우에는 만약 대목(臺木)이 접수(接穗)의 동위효소형(同位酵素型)에 직접적(直接的)인 영향(影響)을 미치지 않는다면 동위효소(同位酵素)를 이용(利用)하므로써 어떤 제한(制限)된 범위내(範圍內)에서는 감별(鑑別)이 가능(可能)할 것이다. 본(本) 연구(硏究)는 상기(上記) 가능성(可能性)을 확실(確實)히 알아내기 위하여 각(各) 개체(個體)마다 산지(産地)가 다른 소나무 수형목후보목(秀型木候補木)에서 접목법(接木法)에 의(依)해 조성(造成)된 clone 보존원(保存園)의 clone 중(中) 8개(個) clone의 48개(個) ramet에 대(對)한 과산화동위효소형(過酸化同位酵素型)을 조사연구(調査硏究)하였다. 8 clone 중 같은 효소형(酵素型)을 나다낸 것은 충북(忠北)3호(號)(CB-3)의 경기(京畿) 1호(號)(KK-l)였으나 이들도 평균활성도(平均活性度)에는 차이(差異)가 난다. 같은 clone 내(內)의 ramet 간(間) 효소형(酵素型)은 같이 나타나서 대목(臺木)이 접수(接穗)의 효소형(酵素型)에 직접적(直接的)인 영향(影響)을 마치지 않음을 보여 주었다. 48개(個) ramet 중 4개(個) ramet가 같은 clone 내(內)의 다른 ramet와는 그 효소형(酵素型)이 달랐다. 이상의 결과(結果) 소나무 접목(接木) clone을 과산화동위효소(過酸化同位酵素) 이용(利用) 감별(鑑別)할 수 있음을 시사(示唆)하였다.
기계 학습을 이용하여 의미가 유사한 코드 클론을 탐지하는 도구의 성능 평가에 빅클론벤치를 많이 활용한다. 하지만 빅클론벤치는 기계 학습에 최적화된 벤치마크가 아니기 때문에 그대로 기계 학습에 사용하면 잘못된 학습 데이터가 만들어질 수 있다. 본 연구에서는 빅클론벤치에서 제공하고 있는 코드 클론 데이터에서 누락된 타입-4 클론을 기계 학습을 이용하여 추가로 찾아 보완함으로써 빅클론벤치를 개선할 수 있음을 실험적으로 밝힌다. 트리 기반 컨볼루션 신경망을 이용한 기계 학습 모델을 사용해서 개선된 데이터를 학습했을 때, 기존의 데이터를 학습했을 때에 비해 기계 학습의 정확도 및 성능이 향상되었음을 확인하였다.
우수 이위체 clone을 선발하고 이를 FDR clone으로 육성하고자 본 실험 이 수행되었다. 1) 도입된 2X종자를 포장 및 온실에서 재배하여17 clone이 선발되었으며 이들의 특성이 조사되 고, 이들 Clone을 인공교배, 개방수분, 집단수분하여 그후대에서 18clone 이 선발되었다. 2) 선발된 clone들은 2n웅성과 2n자성배우자 형성에 대하여 조사되었다. 그중 D6-21만이 27∼30%의 2n웅성 배우자를 FDR에 의해 형성하였고. 다른 clone들은 2n웅성 배우자 형성율이 7% 미만이었다. 3) 자성 2n배우자를 생성하는 clone은 발견되지 않았다.
To investigate clonal variations of recombinant Chinese hamster ovary(rCHO) clones in response to culture pH and temperature, serum-free suspension cultures of two antibody-producing CHO clones(clones A and B), which were isolated from the same parental clone by the limiting dilution method, were performed in a bioreactor at pH values in the range of 6.8-7.6, and two different temperatures, $33^{\circ}C\;and\;37^{\circ}C$. In regard to cell growth, clone A and clone B displayed similar responses to temperature, although their degree of response differed. In contrast, clones A and B displayed different responses to temperature in regard to antibody production. In the case of clone A, no significant increase in maximum antibody concentration was achieved by lowering the culture temperature. The maximum antibody concentration obtained at $33^{\circ}C$(pH 7.4) and $37^{\circ}C$(pH 7.0) were $82.0{\pm}2.6$ and $73.2{\pm}4.1{\mu}g/ml$, respectively. On the other hand, in the case of clone B, an approximately 2.5-fold increase in maximum antibody concentration was achieved by lowering the culture temperature. The enhanced maximum antibody concentration of clone B at $33^{\circ}C$($132.6{\pm}14.9{\mu}g/ml$ at pH 7.2) was due to not only enhanced specific antibody productivity but also to prolonged culture longevity. At $33^{\circ}C$, the culture longevity of clone A also improved, but not as much as that of clone B. Taken together, CHO clones derived from the same parental clone displayed quite different responses to culture temperature and pH with regards antibody production, suggesting that environmental parameters such as temperature and pH should be optimized for each CHO clone.
표절을 쉽게 알아내기 위해, 프로그램 유사성 검사기(CloneChecker)를 만들었다. CloneChecker는 프로그램을 요약해서, 유사성을 계산하고, 비슷한 그룹들로 묶어 낸다. CloneChecker는 두 프로그램의 모든 부 구문트리(abstract syntax sub-tree)들을 서로 비교하므로 구문의 사소한 변화에 민감하지 않으며, 그럼에도 해쉬 함수를 이용하여 빠르게 수행된다. CloneChecker는 실제 강의에서 사용되었으며, C, Java, Scheme, nML로 짜여진 프로그램들에 대해 동작한다.
페디스토마 성충의 단백질을 정제하여 이를 항원으로 면역시킨 mouse의 spleen cell과 myeloma cell을 세포융합 시킨 결과 융합율은 56% 이었고. 3차 cloning한 후의 항체생산율은 89% 이였으며, 이들 융합세포로 부터 IgM을 생산하는 hybridoma clone과 IgG을 생산하는 hybridoma clone을 얻었다. IgM을 생산하는 hybridoma clone의 supernate는 antibody titer가 희석농도 1 : 64까지 양성이었고. IgG을 생산하는 hybridoma clone의 supernate는 1 : 256까지 양성이었다.
본 연구는 재래닭의 성장 관련 유용 유전자를 검색하기 위하여, 재래닭에서 발현되는 유전자와 코니쉬에서 발현되는 유전자를 subtraction하여 cDNA library를 구축하고, 염기서열을 밝혀서 재래닭 특이 유용 유전자를 검증하고자 하였다. cDNA library에서 얻은 clone들의 염기서열을 분석하여 나타난 결과를 5개의 clone을 비교 분석하였다. Clone NDS-1(618nt)은 비록 타 종과의 상동성은 낮으나(10%) 해당 과정에서 중요한 역할을 담당하는 triosephosphate isomerase이며, Clone NDS-6(651nt)는 자에서 해당 과정에 관여하는 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase로 여겨진다. 그러나 3가지 유전자(clone NDS-2, NDS-10, NDS-12)는 다른 유전자들과 비교하여 5.0%내외의 낮은 상동성을 보이고 고등 동물과 거의 유사성이 없으므로 재래닭 특이 성장 관련 유용 유전자일 가능성이 있다.
본 연구에서는 단일반응조에서 포기/비포기 시간에 따른 하수 내 유기물질 및 질소화합물을 변화양상을 살펴보고자 하였다. 실험 결과 C/N비 3 : 1, 포기/비포기 20/40 min 구간에서부터 90% 이상의 안정적인 유기물 및 질소 제거가 이루어짐을 알 수 있었다. 포기/비포기 구간의 비율을 길게 유지하는 것이 탈질에 더욱 효과적이었으며 이는 비포기 구간을 유지하는 동안 반응조 내 미생물의 군집변화에 기인하는 것으로 판단하였다. PCR-DGGE를 한 결과, 유기물 및 질소화합물의 산화에 관여하는 미생물로 Dysgonomonas mossii strain Melo40, Eubacterium sp. oral clone JN088, Uncultured bacterium clone SPESB2_718과 Bacterium enrichment culture clone LE이 관찰되었고 탈질에 관여하는 미생물은 Uncultured Acidobacteria bacterium clone AKYG487, Lactobacillus harbinensis strain FQ003, Erythrobacter litoralis strain Gi-3, Phytobacter diazotrophicus strain Ls8, Mycobacterium sp. enrichment culture clone GE10037biofNNA로 나타났다.
Domain analysis is the process of analyzing related software systems in a domain to find their common and variable parts. In the case of device drivers, they are highly suitable for domain analysis because device drivers of the same domain are implemented similarly for each device and each system that they support. Considering this characteristic, this paper introduces a new approach to the domain analysis of device drivers. Our method uses a code clone detection technique to extract similarity among device drivers of the same domain. To examine the applicability of our method, we investigated whole device drivers of a Linux source. Results showed that many reusable similar codes can be discerned by the code clone detection method. We also investigated if our method is applicable to other kernel sources. However, the results show that the code clone detection method is not useful for the domain analysis of all kernel sources. That is, the applicability of the code clone detection method to domain analysis is a peculiar feature of device drivers.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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