This study was conducted to investigate the characteristics of seed germination pattern by the prechilling and alternating temperature treatments to 16 species of native plant. The seed length, width and thickness ranged from 1.1 to 8.9 mm, from 0.7 to 7.5 mm and from 0.4 to 1.7 mm, respectively. In addition, the 1,000 grain weight of native plants ranged from 0.1 to 8.8g. Germination rate of Melandryum firmum R. and Saussurea pulchella F. with light condition, Capsella bursa-pastoris L. and Leonurus sibiricus L. with dark conditionin of non-treatment were the highest 69, 81,16 and 36%, respectively. Germination rate of Aster scaber T., Cirsium setidens N., Ligularia fischeri T., Plantago asiatica L., and Saussurea sp. of 5$^{\circ}C$ prechilling for 30 days were the highest 84, 29, 29, 57, 78 and 95% with light condition respectively, 30% but Cirsium nipponicum M. only with dark condition. Germination rate of Aralia elata S., Aster koraiensis N. and Synurus deltoides N. of alternating temperature with 8 hours at 3$0^{\circ}C$ and 16 hours at 15$^{\circ}C$ were the highest 2 and 57% with light condition and 52% with dark condition.
Low pathogenic avian influenza (LPAI; H9N2) and Newcastle disease (ND) are economically important poultry diseases in Korea. In this study, we investigated pathological features and virus distribution in the lymphoid tissues of chicks experimentally infected with H9N2 and/or ND virus. Six-weeks-old SPF chickens were divided into 4 groups, Control (C), H9N2 (E1), NDV (E2), and H9N2+NDV (E3). E1 group was challenged with 0.1 ml A/Kr/Ck/01310/01 (H9N2) $10^{5.6}$$EID_{50}$ intranasally, E2 group was challenged with 0.5 ml KJW (NDV) $10^{5.0}{\sim}10^{6.0}$$ELD_{50}$ intramuscularly, and E3 group was challenged with H9N2, followed 7 days later by NDV. In histopathological examination, E1 group showed depletion and necrosis in bursa of Fabricius, thymus, cecal tonsil, and spleen, whereas E2 and E3 groups were noted severe lymphocyte depletion and necrosis with destruction of lymphoid organs structures. In TUNEL assay, apoptotic bodies were detected in lymphoid organs of all experimental groups, which was most severe in E3 group. H9N2 and ND viruses were predominantly detected in cecal tonsil of E1, E2, and E3 groups by PCR and immunohistochemistry (ICH). In conclusion, co-infection of H9N2 with NDV caused severe pathologic lesions and apoptosis in lymphoid tissues compared to single infections.
Hong, Yeojin;Truong, Anh Duc;Lee, Janggeun;Lee, Kyungbaek;Kim, Geun-Bae;Heo, Kang-Nyeong;Lillehoj, Hyun S.;Hong, Yeong Ho
Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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v.32
no.7
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pp.1052-1061
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2019
Objective: This study was conducted to identify duck liver-expressed antimicrobial peptide 2 (LEAP-2) and demonstrate its antimicrobial activity against various pathogens. Methods: Tissue samples were collected from 6 to 8-week-old Pekin ducks (Anas platyrhynchos domesticus), total RNA was extracted, and cDNA was synthesized. To confirm the duck LEAP-2 transcript expression levels, quantitative real-time polymerase chain reaction was conducted. Two kinds of peptides (a linear peptide and a disulfide-type peptide) were synthesized to compare the antimicrobial activity. Then, antimicrobial activity assay and fluorescence microscopic analysis were conducted to demonstrate duck LEAP-2 bactericidal activity. Results: The duck LEAP-2 peptide sequence showed high identity with those of other avian species (>85%), as well as more than 55% of identity with mammalian sequences. LEAP-2 mRNA was highly expressed in the liver with duodenum next, and then followed by lung, spleen, bursa and jejunum and was the lowest in the muscle. Both of LEAP-2 peptides efficiently killed bacteria, although the disulfide-type LEAP-2 showed more powerful bactericidal activity. Also, gram-positive bacteria was more susceptible to duck LEAP-2 than gram-negative bacteria. Using microscopy, we confirmed that LEAP-2 peptides could kill bacteria by disrupting the bacterial cell envelope. Conclusion: Duck LEAP-2 showed its antimicrobial activity against both gram-positive and gram-negative bacteria. Disulfide bonds were important for the powerful killing effect by disrupting the bacterial cell envelope. Therefore, duck LEAP-2 can be used for effective antibiotics alternatives.
Kocadal, Onur;Pepe, Murad;Akyurek, Nalan;Gunes, Zafer;Surer, Hatice;Aksahin, Ertugrul;Ogut, Betul;Aktekin, Cem Nuri
Clinics in Shoulder and Elbow
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v.22
no.2
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pp.79-86
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2019
Background: Increased oxidative stress and inflammation play a critical role in the etiopathogenesis of chronic tendinopathy. Melatonin is an endogenous molecule that exhibits antioxidant and anti-inflammatory activity. The aim of this study was to evaluate the biochemical and histopathological effects of exogenous melatonin administrations in supraspinatus overuse tendinopathy. Methods: Fifty rats were divided into the following four groups: cage activity, melatonin treatment, corticosteriod therapy, and control. Melatonin (10 mg/kg, intraperitoneal; twice a day) and triamcinolone (0.3 mg/kg, subacromial; weekly) were administered to the treatment groups after the overuse period. Biochemical and histopathological evaluations were performed on serum samples and biopsies obtained from rats. Plasma inducible nitric oxide synthase (iNOS), vascular endothelial growth factor (VEGF), total antioxidant status (TAS), total oxidant status (TOS), and oxidative stress index (OSI) levels were evaluated biochemically. Results: The TAS, TOS, OSI, iNOS, and VEGF values were significantly lower than the pre-treatment levels in rats receiving exogenous melatonin treatment (3 or 6 weeks) (p<0.05). TOS, iNOS, VEGF, and OSI values after 3 weeks of triamcinolone administration, and TOS, VEGF, and OSI levels after 6 weeks of triamcinolone application, were significantly lower than the pre-treatment levels (p<0.05). Conclusions: Exogenous melatonin application in overuse tendinopathy reduces oxidative stress and inflammation. Melatonin might be an alternative potential molecule to corticosteroids in the treatment of chronic tendinopathy.
This study was conducted to investigate the effect of initial pH, current density, and electrolysis time on process performance in terms of decolorization and chemical oxygen demand (COD) removal from disperse dyebath wastewater (DDW) by mono-polar parallel laboratory scale electrocoagulation (EC) process. COD reduction of 51.3% and decolorization of 92.8% were obtained with operating cost of 0.19 €/㎥ treated wastewater for Al-Al electrode pair, while 90.5% of decolorization and 49.2% of COD reduction were obtained with operating cost of 0.20 €/㎥ treated wastewater for an Fe-Fe electrode pair. The amount of sludge production were highly related to type of the electrode materials. At the optimum conditions, the amount of sludge produced were 0.18 kg/㎥ and 0.28 kg/㎥ for Al-Al and Fe-Fe electrode pairs, respectively. High decolorization can be explained by the hydrophobic nature of the disperse dye, while limited COD removal was observed due to the high dissolved organic matter of the DDW based on auxiliary chemicals. Energy, electrode, and chemical consumptions and sludge handling were considered as major cost items to find a cost-effective and sustainable solution for EC. The contribution of each cost items on operating cost were determined as 10.0%, 51.1%, 30.5% and 8.4% for Al-Al, and they were also determined as 9.0%, 38.0%, 40.5% and 12.5% for Fe-Fe, respectively. COD reduction and decolorization were fitted to first-order kinetic rule.
The bursa of Fabricius (BF) is a central humoral immune organ unique to birds. Four bursal peptides (BP-I, BP-II, BP-III, and BP-IV) have been isolated and identified from the BF. In this study, the immunoadjuvant activities of BPs I to IV were examined in mice immunized with H9N2 avian influenza virus (AIV) vaccine. The results suggested that BP-I effectively enhanced cell-mediated immune responses, increased the secretion of Th1 (interferon gamma)- and Th2 (interleukin-4)-type cytokines, and induced an improved cytotoxic T-lymphocyte (CTL) response to the H9N2 virus. BP-II mainly elevated specific antibody production, especially neutralizing antibodies, and increased Th1- and Th2-type cytokine secretion. BP-III had no significant effect on antibody production or cell-mediated immune responses compared to those in the control group. A strong immune response at both the humoral and cellular levels was induced by BP-IV. Furthermore, a virus challenge experiment followed by H&E staining revealed that BP-I and BP-II promoted removal of the virus and conferred protection in mouse lungs. BP-IV significantly reduced viral titers and histopathological changes and contributed to protection against H9N2 AIV challenge in mouse lungs. This study further elucidated the immunoadjuvant activities of BPs I to IV, providing a novel insight into immunoadjuvants for use in vaccine design.
Shanmugam, Sureshkumar;Park, Jae Hong;Cho, Sungbo;Kim, In Ho
Animal Bioscience
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v.35
no.8
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pp.1215-1222
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2022
Objective: A feeding trial was carried out to determine the effect of dietary inclusion of silymarin seed extract on growth performance, nutrient digestibility, excreta microbiota, excreta gas emission, blood profiles, and meat quality in broilers. Methods: A total of 1,088 one-day-old Ross 308 broiler chicks (mixed-sex) with an initial body weight of 42.34±0.82 g, were randomly allocated into 1 of 4 dietary treatments with 17 replicates of 16 chicks per cage and fed a basal diet supplemented with 0%, 0.02%, 0.04%, and 0.06% of silymarin. Results: The inclusion of silymarin supplementation linearly increased the body weight of broilers during days 7 to 21 and 1 to 35 days. On day 35, broilers fed a diet containing graded levels of silymarin supplementation linearly increased the nutrient digestibility of dry matter, gross energy, and nitrogen and cecal Lactobacillus counts (p = 0.038). While silymarin supplement linearly reduced the methyl mercaptans (p = 0.039) and acetic acid (p = 0.007) emission in broilers. No significant effects were observed on the blood profile. Relative weights of organs such as breast muscle, bursa of fabricius were increased (linear effect, p<0.05), water holding capacity was enhanced by increasing the silymarin level from 0% to 0.06%. A linear reduction (p>0.05) in drip loss from meat samples during days 1, 3, 5, and 7 by the addition of graded level of silymarin to the diet. Conclusion: An increasing level of silymarin supplementation to the diet of broiler would be beneficial to enhance growth performance, nutrient digestibility, excreta microflora, blood profile, and meat quality traits.
Dogan, Berkcan;Gumusoglu, Ece;Ulgen, Ege;Sezerman, Osman Ugur;Gunel, Tuba
Genomics & Informatics
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v.20
no.2
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pp.20.1-20.13
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2022
Recent studies have focused on the early detection of ovarian cancer (OC) using tumor materials by liquid biopsy. The mechanisms of microRNAs (miRNAs) to impact OC and signaling pathways are still unknown. This study aims to reliably perform functional analysis of previously validated circulating miRNAs' target genes by using pathfindR. Also, overall survival and pathological stage analyses were evaluated with miRNAs' target genes which are common in the The Cancer Genome Atlas and GTEx datasets. Our previous studies have validated three downregulated miRNAs (hsa-miR-885-5p, hsa-miR-1909-5p, and hsa-let7d-3p) having a diagnostic value in OC patients' sera, with high-throughput techniques. The predicted target genes of these miRNAs were retrieved from the miRDB database (v6.0). Active-subnetwork-oriented Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway enrichment analysis was conducted by pathfindR using the target genes. Enrichment of KEGG pathways assessed by the analysis of pathfindR indicated that 24 pathways were related to the target genes. Ubiquitin-mediated proteolysis, spliceosome and Notch signaling pathway were the top three pathways with the lowest p-values (p < 0.001). Ninety-three common genes were found to be differentially expressed (p < 0.05) in the datasets. No significant genes were found to be significant in the analysis of overall survival analyses, but 24 genes were found to be significant with pathological stages analysis (p < 0.05). The findings of our study provide in-silico evidence that validated circulating miRNAs' target genes and enriched pathways are related to OC and have potential roles in theranostics applications. Further experimental investigations are required to validate our results which will ultimately provide a new perspective for translational applications in OC management.
The present study investigated the effects of dietary supplementation of peanut shell extract on the growth performance and physiological properties of broiler chicks. Two diet energy levels (Positive and Negative) and four additives (0.0, 0.05, and 0.1% peanut shell extract and commercial antioxidant) were factorially arranged for eight treatments. The overall weight gain of the broilers was slightly improved at 0.05% for the antioxidant treatments regardless of the diet energy levels, but there was no statistical difference among the treatments (p > 0.05). The carcass characteristics of the broilers, such as cooking loss, crude protein content, antioxidant activity, and thiobarbituric acid reactive substances (TBARS) values, were improved by the feeding diets containing the 0.05% peanut shell extract. Furthermore, it was confirmed that the dietary supplementation of peanut shell extract did not have a negative effect on the immune responses of the broilers show by the lack of statistical differences in the liver and bursa Fabricious weight and cytokine level among the treatments. From the economic analysis, dietary supplementation of peanut shell extract significantly influenced the compensatory growth and food efficiency and, in turn, led to a decrease in the duration needed to reach 1.5 kg compared to the control. These results suggest the possibility that the peanut shell extract could be used as a functional feed additive by improving the growth performance and carcass characteristics with no detrimental effects on broilers.
Assie, Amr;Akbas, Seref D.;Kabeel, Abdallah M.;Abdelrahman, Alaa A.;Eltaher, Mohamed A.
Steel and Composite Structures
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v.43
no.1
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pp.79-90
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2022
In this study, the dynamic behavior of functionally graded layered deep beams with viscoelastic core is investigated including the porosity effect. The material properties of functionally graded layers are assumed to vary continuously through thickness direction according to the power-law function. To investigate porosity effect in functionally graded layers, three different distribution models are considered. The viscoelastically cored deep beam is exposed to harmonic sinusoidal load. The composite beam is modeled based on plane stress assumption. The dynamic equations of motion of the composite beam are derived based on the Hamilton principle. Within the framework of the finite element method (FEM), 2D twelve -node plane element is exploited to discretize the space domain. The discretized finite element model is solved using the Newmark average acceleration technique. The validity of the developed procedure is demonstrated by comparing the obtained results and good agreement is detected. Parametric studies are conducted to demonstrate the applicability of the developed methodology to study and analyze the dynamic response of viscoelastically cored porous functionally graded deep beams. Effects of viscoelastic parameter, porosity parameter, graduation index on the dynamic behavior of porous functionally graded deep beams with viscoelastic core are investigated and discussed. Material damping and porosity have a significant effect on the forced vibration response under harmonic excitation force. Increasing the material viscosity parameters results in decreasing the vibrational amplitudes and increasing the vibration time period due to increasing damping effect. Obtained results are supportive for the design and manufacturing of such type of composite beam structures.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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