Kim, Dockyu;Park, Min-Jung;Koh, Sung-Cheol;So, Jae-Seong;Kim, Eungbin
Journal of Microbiology
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v.40
no.1
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pp.86-89
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2002
Rhodococcus sp. strain T104, which is able to grow on either biphenyl or limonene, was found to utilize phenol as sole carbon and energy sources. Furthermore, T104 was positively identified to possess three separate pathways for the degradation of limonene, phenol, and biphenyl. The fact that biphenyl and limonene induced almost the same amount of catechol 1,2-dioxygenase activity indicates that limonene can induce both upper and lower pathways for biphenyl degradation by T104.
A gradient LC/MS system was constructed and applied for separation of biological samples. For example, a rapid and simple analytical method without pretreatment based on gradient ${\mu}LC/MS$ with a disposable microcolumn has been developed to determine B group vitamins in urine. Urine samples were directly injected to the disposable home-made microcolumn. The microcolumn can be emptied after being used for a series of urine samples, and repacked with fresh stationary phase. An overdose of vitamin pills were swallowed by healthy volunteers and the urine samples were taken 1,2,3,5, and 8 hours after swallowing. Vitamins immediately showed up in urine, hit the maximum, and disappeared swiftly. This technique is expected to have some application for clinical purposes.
Synthetic membrane processes are being increasingly integrated into existing reaction, isolation, and recovery schemes for the production of valuable biological molecules. In many cases they are replacing traditional unit processes. The properties of membrane systems which are most often exploited for both upstream and downstream processing and their permselectivity, high surface area per unit volume, are their potential for controlling the level of contact and/or mixing between two separate phases. Advances in both membrane materials and module design and operation have led to better control of concentration polarization and membrane fouling. After presenting some recent advances in membrane materials and fluid mechanics, we demonstrate how membranes have been integrated into cellular and enzymatic reaction schemes. This is followed by a review of established and emerging synergism between biological processes and synthetic membranes.
Proceedings of the Membrane Society of Korea Conference
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1992.10a
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pp.15-33
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1992
Synthetic membrane processes are being increasingly integrated into existing reaction, isolation, and recovery schemes for the production of valuable biological molecules. In many cases they are replacing traditional unit processes. The properties of membrane systems which are most often exploited for both upstream and downstream processing are their permselectivity, high surface area per unit volume, and their potential for controlling the level of contact and/or mixing between two separate phases. Advances in both membrane materials and module design and operation have led to better control of concentration polarization and membrane fouling. After presenting some recent advances in membrane materials and fluid mechanics, we demonstrate how membranes have been integrated into cellular and enzymatic reaction schemes. This is followed by a review of established and emerging membrane separation processes. Several examples are used to emphasize the synergism between biological processes and synthetic membranes.
Park, Ki-Young;Kim, Dockyu;Koh, Sung-Cheol;So, Jae-Seong;Kim, Jong-Sul;Kim, Eungbin
Journal of Microbiology
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v.42
no.2
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pp.160-162
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2004
Rhodococcus sp. strain T104 is able to utilize both limonene and biphenyl as growth substrates. Fur-thermore, T104 possesses separate pathways for the degradation of limonene and biphenyl. Previously, we found that a gene(s) involved in limonene degradation was also related to indigo-producing ability. To further corroborate this observation, we have cloned and sequenced a 8,842-bp genomic DNA region with four open reading frames, including one for indole oxygenase, which converts indole to indigo (a blue pigment). The reverse transcription PCR data demonstrated that the identified indole oxygenase gene is specifically induced by limonene, thereby implicating this gene in the degradation of limonene by T104.
The extraction and separation of isoflavones from Korean soybean were peformed by various mechanical and chemical extraction methods. They included solvent extraction, stirring, supersonification and sub/supercritical water extraction. From the experimental results of the variation of solvent extraction by change in composition, the increase in extraction of a specific compound by stirring or supersonic energy, and the application of supercritical fluid with superior solvating power over solvents, the sonification was the most desirable extraction method in extracting aglycone isoflavones, daidzein and genistein from Korean soybean.
Chromatography has been method of choice for the separation complex biologi-cal mixtures fro analytical purpose, particularly for the last fifty years. Its use has recently been extended to preparative separation where the productivity relative to the amount of resin and sol-vent used is a matter of concern. To overcome the inherent thermodynamic inefficiency of batch chromatography, as exemplified by the partial temporal usage of the resin and dilution of the product with the solvent, chromatography has been continually modified by separation engineers. Column switching and recycling represnet some of the process modifications that have brought high productivity to chromatography. Recently, the simulated moving bed (SMB) method, which claims a high separation efficiency based on counter-current moving bed chromatography. has be-come the mainstay of preparative separation, especially in chiral separation. Accordingly, this pa-per reviews the current status of SMB along with several chromatographic modification, which may be helpful in routine laboratory and industrial chromatographic practices.
Various Saccharomyces cerevisiae strains were transformed with a 2 ${\mu}$-based multicopy expression plasmid, pYIGP, carrying Kluyveromyces marxianus inulinase gene under the control of GAPDH promoter. Among then two strains, SEY2102 and 2805, showed high levels of cell growth and inulinase expression, and were selected to study their fermentation properties on inulin. Jerusalem artichoke inulin was more effective for cell growth (10∼11 g-dry wt./L at 48 hr) and inulinase expression (1.0 units/mL with SEY2102/pYIGP and 2.5 units/mL with 2805/pYIGP) than other inulin sources such as dahlia and chicory. It was also found that maximal ethanol production of 9 g/L was obtained from Jerusalem artichoke inulin at the early stationary phase (around 30 hr), indicating that recombinant S. cerevisiae cells secreting exoinulinase could be used for the simultaneous saccharification of inulin and ethanol fermentation.
Fluidic conditions for the separation of phases were surveyed in a microfluidic aqueous two-phase extraction system. The infusion ratio between polyethylene glycol (PEG) and dextran solution defines the concentrations of each polymer in micro-channel, which determine the phase-separation. The appropriate ratio between PEG (M.W. 8000, 10%, w/v) and dextran T500 (M.W. 500000, 5%, w/v) in order to perform the separation of phases of both polymers was observed as changing the mixed ratio of both polymers. Based on the fluidic conditions, stable two-phase solutions were obtained within 4% to 8% and 3% to 1% of PEG and dextran, respectively. In addition, the characteristics of the two-phase were discussed. The separation technique studied in the paper can be applied for the implementation of a lab-on-a chip which can detect various biological entities such cells, bacterium, and virus in an integrated manner using built in a biosensor inside the chip.
Kim, Young-Bum;Park, Ji-Ho;Chang, Woo-Jin;Koo, Yoon-Mo;Kim, Eun-Ki;Kim, Jin-Hwan
Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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v.11
no.4
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pp.288-292
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2006
Through statistically designed experiments, lysis agents were optimized to effectively disrupt bacterial cells in a microfluidic device. Most surfactants caused the efficient lysis of Gram-positive microbes, but not of Gram-negative bacteria. A Plackett-Burman design was used to select the components that increase the efficiency of the lysis of the Gram-negative bacteria Escherichia coli. Using this experimental design, both lysozyme and benzalkonium chloride were shown to significantly increase the cell lysis efficiency, and ATP was extracted in proportion to the lysis efficiency. Benzalkonium chloride affected the cell membrane physically, while lysozyme destroyed the cell wall, and the amount of ATP extracted increased through the synergistic interaction of these two components. The two-factor response-surface design method was used to determine the optimum concentrations of lysozyme and benzalkonium chloride, which were found to be 202 and 99 ppm, respectively. The lysis effect was further verified by microscopic observations in the microchannels. These results indicate that Gram-negative cells can be lysed efficiently in a microfluidic device, thereby allowing the rapid detection of bacterial cells using a bioluminescence-based assay of the released ATP.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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