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토양세균 군집의 대사 다양성과 16S rDNA의 제한효소 지문분석에 의한 유전적 다양성의 비교 (Comparison of metabolic diversity by sole carbon source utilization and genetic diversity by restriction patterns of amplified 16S rDNA (ARDRA)in soil bacterial communities.)

  • 송인근;최영길;김유영;조홍범
    • 미생물학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.72-77
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    • 1999
  • BIOLOG GN microplate를 이용한 유일탄소원의 이용능 비교를 통한 대사적 유사성과 16S rDNA 의 PCR 증폭산물의 제한효소 지문 분석에 따른 유전적 유사성을 5종의 식생토양에 따른 토양미생물 군집을 대상으로 비교하였다. 16S rDNA를 증폭하여 제한효소 지문을 분석한 결과, 토양으로부터 직접 추출하여 증폭한 토양세균 군집의 16S rDNA의 유전적 유사도는 BIOLOG GN microplate를 이용한 대사적 구조와 일치하는 경향을 보았다. 그러나 배양된 종속영양세균 군집의 다양성과는 유전적 유사도가 매우 낮게 나타났다.

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토양 세균 군집의 유일탄소원 이용에 의한 지문분석 (Patterns of Utilizing Sole Carbon Source by Soil Microbes in a Forest Soil)

  • 송인근;최영길;안영범;신규철;조홍범
    • 미생물학회지
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    • 제35권1호
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    • pp.65-71
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    • 1999
  • BIOLOG GN microplate를 이용하여 6종의 식생 토양에 따른 토양미생물 군집의 유일탄소원 이용능을 비교 분석하였다. 전체적으로 축합물, 아미노산, 카르복실산 화합물을 잘 이용하였으나, amide의 경우 낮은 이용능을 보였다. 대응분석을 통해 6종류의 식생 토양에 따른 토양미생물 군집은 크게 삼림토양, 초지-경작지토양, 비식생 토양의 3가지 그룹의 대사적 다양성의 차이를 보이는 집단으로 분류되었다. 다차원 척도법 분석을 통해 신갈나무 삼림토양의 미생물 군집은 소나무와 떡갈나무 삼림토양의 미생물 군집과는 또 다른 그룹으로 분리되었다. 이러한 식생토양형에 다른 미생물 군집의 대사 다양성의 차이로 볼 때, 식생의천이에 따라 식생에 영향을 받는 미생물 군집의 대사 다양성 또한 식생의 천이에 대응하여 변화하고 있음을 확인하였다.

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바이칼호에서 분리한 빈영양성 세균과 저온성 세균의 탄소원 이용 특성 (Sole-Carbon-Source Utilization Patterns of Oligotrophic and Psychrotrophic Bacteria Isolated from Lake Baikal.)

  • 이건형;배명숙;박석환;송홍규;안태석
    • 미생물학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.248-253
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    • 2004
  • 2000년 9월부터 2002년 12월 사이에 바이칼호에서 분리된 빈영양성 세균 168균주와 저온성 세균 132균주를 대상으로 BIOLOG Microplate를 이용하여 탄소원의 이용특성을 조사하였다. 본 연구에 사용된 빈영양성 세균 중 oxidase 양성 (GN-NENT 그룹)의 86% (56균주)와 oxidase음성 (GN-ENT그룹)의 89% (92균주), 저온성 세균 중 oxidase 음성 (GN-ENT 그룹)의 82% (85균주)는 다앙한 탄소원 중에서 $\alpha$-D-glucose를 이용할 수 있었으며, 저온성 세균 중 oxidase 양성 (GN-NENT 그룹)의 93% (26 균주)는 bromosuccinic acid를 이용하였다. $\alpha$-D-lactose는 빈영양성 GN-ENT 그룹의 일부만이 이용하였으며 나머지 균주들은 전혀 이용하지 못하였다. BIOLOG Microplate를 이용하여 동정된 균들을 속별로 살펴보면, Pseudomonas속이 49균주로 가장 많았으며, 그 외에도 Salmonella 속, Serratia속, Buttiauxella 속, Pantoea 속, Yersinia 속, Brevundimonas 속, Hydrogenophaga 속, Photorhabdus 속, Sphingomonas 속, Xenorhabdus 속이 동정되었다.

Erwinia carotovora subsp. carotovora에 의한 흰색꽃양배추 세균성 무름병 (Bacterial Soft Rot of Cauliflower by Erwinia carotovora subsp. carotovora)

  • 박덕환;류경렬;김점순;임춘근
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권4호
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    • pp.364-366
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    • 1998
  • Bacterial soft rot was occurrenced on stems of cauliflower at a trial field of Alpine Agricultural Experiment Station, Kangwon-Do, Korea. the symptoms began as a small water-soaked lesion, which enlarged rapidly in diameter. The tissue within the affected region became slimy, disintegrating into a mushy mass of disorganized cells. The causal organism was isolated from the diseases lesions and was identified as Erwinia carotovora subsp. carotovora based on the morphological, physiological and chemical characteristics , and on the results of the Biolog program (Biolog Inc., U. S. A.). E. carotovora subsp. carotovora is the first described bacterium which causes bacterial soft rot on cauliflower in Korea.

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Linkage Between Biodegradation of Polycyclic Aromatic Hydrocarbons and Phospholipid Profiles in Soil Isolates

  • Nam, Kyoung-Phile;Moon, Hee-Sun;Kim, Jae-Young;Kukor, Jerome-J.
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제12권1호
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    • pp.77-83
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    • 2002
  • A bacterial consortium capable of utilizing a variety of polycyclic aromatic hydrocarbons has been isolated from a former manufactured gas plant site. The consortium consisted of four members including Arthrobacter sp., Burkholderia sp., Ochrobacterium sp., and Alcaligenes sp., which were identified and characterized by the patterns of fatty acid methyl esters (FAME analysis) and carbon source utilization (BIOLOG system). With the individual members, the biodegradation characteristics of aromatic hydrocarbons depending on different growth substrates were determined. FAME analyses demonstrated that microbial fatty acid profiles changed to significant extents in response to different carbon sources, and hence, such shift profiles may be informative to characterize the biodegradation potential of a bacterium or microbial community.

Erwinia carotovora subsp. carotora에 의한 고추냉이(와사비) 세균성 무름병 (Bacterial Soft Rot of Wasabi by Erwinia carotovora subsp. coarotovora)

  • 박덕환;서상태;최준근;임춘근
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권5호
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    • pp.555-557
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    • 1998
  • Occurrence of soft rots was observed on wasabi (Wasabia japonica Matsum) grown in Chuncheon and Pyengchang Kangwon province, Korea. The symptoms appeared on the wasabi root, which became mushy and black. This eventually resulted in wilting and death of the aboveground parts of the wasabi. The causal organism was isolated from the infected lesions and was identified as Erwinia carotovora subsp. carotovora based on the morphological, physiological and biochemical characteristics, and on the results of the Biolog program (Biolog Inc., U. S. A.). E. carotovora subsp. carotovora is the first described bacterium which causes bacterial soft rot on wasabi in Korea.

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Erwinia carotovora subsp. carotovora에 의한 고추 세균성 무름병 (Bacterial Soft Rot of Pepper Caused by Erwinia carotovora subsp. carotovora)

  • 박덕환;김영숙;허성기;명인식;임춘근
    • 한국식물병리학회지
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    • 제14권6호
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    • pp.738-740
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    • 1998
  • Bacterial soft rot was occurred on fruit of pepper that was grown in Chunceon, Kangwon province, Korea. The symptoms began as a small hole at 5 mm diameter, which made injury by a tobacco bud worm (Heliothis assulta). The affected fruit became soft and produced offensive odor. The causal organism was isolated from the diseased fruit and was identified as Erwinia carotovora subsp. carotovora based on the morphological, physiological and biochemical characteristics, and on the results of the Biolog program (Biolog Inc., U. S. A.). E. carotovora subsp. carotovora is the first described bacterium which causes bacterial soft rot on pepper in Korea.

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Identification of Leuconostoc strains isolated from kimchi using carbon -source utilization patterns

  • Lee, Jung Sook;Chun, Chang Ouk;Kim, Sam Bong;Park, Bong Keun;Lee, Hun Joo;Ahn, Jong Seog;Mheen, Tae Ick
    • Journal of Microbiology
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    • 제35권1호
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    • pp.10-14
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    • 1997
  • The database of metabolic fingerprints generated using the GIolog system of lactic acid bacteria isolated from kimchi, described by Lee et al. (8), was used for the identification of 75 Leuconostoc isolates. The test strains were isoalted using a selective isolation medium specific for the genus Leuconostoc and examined for their ability to oxidize carbon sources using the Biolog system. The results show that the 75 test strains were identified to the known Leuconostoce clusters. It is suggested that the Biolog system can be applied for rapid identification of lactic acid bacteria isolated from kimchi.

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