• 제목/요약/키워드: biochip

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Currents in Integrative Biochip Informatics

  • Kim, Ju-Han
    • 한국생물정보학회:학술대회논문집
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    • 한국생물정보시스템생물학회 2001년도 제2회 생물정보 워크샵 (DNA Chip Bioinformatics)
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    • pp.1-9
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    • 2001
  • scale genomic and postgenomic data means that many of the challenges in biomedical research are now challenges in computational sciences and information technology. The informatics revolutions both in clinical informatics and bioinformatics will change the current paradigm of biomedical sciences and practice of clinical medicine, including diagnostics, therapeutics, and prognostics. Postgenome informatics, powered by high throughput technologies and genomic-scale databases, is likely to transform our biomedical understanding forever much the same way that biochemistry did a generation ago. In this talk, 1 will describe how these technologies will in pact biomedical research and clinical care, emphasizing recent advances in biochip-based functional genomics. Basic data preprocessing with normalization and filtering, primary pattern analysis, and machine teaming algorithms will be presented. Issues of integrated biochip informatics technologies including multivariate data projection, gene-metabolic pathway mapping, automated biomolecular annotation, text mining of factual and literature databases, and integrated management of biomolecular databases will be discussed. Each step will be given with real examples from ongoing research activities in the context of clinical relevance. Issues of linking molecular genotype and clinical phenotype information will be discussed.

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섬유 기반의 다공성 윈도우를 가지는 박막 제작 및 공배양에의 활용 (Fabrication of a Polymeric Film with Nanofiber-based Porous Window and Its Application to Co-culture)

  • 정영훈;이종완;진송완
    • 한국기계가공학회지
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    • 제13권2호
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    • pp.21-27
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    • 2014
  • Recently, various biochip environments have been presented. In this study, a novel transparent film with porous membrane windows, which is an essential component in a co-cultured biochip environment, is fabricated using spin-coating, 3D printing, and electrospinning processes. In detail, a transparent polystyrene film was fabricated by means of the spin-coating process followed bywindow cutting, after which apolycaprolactone-chloroform solution was deposited along the window edge to introduce an adhesion layer between the PS film and the PCL nanofibers. Nanofibers were electrospun into the window region using a direct-write electrospinning method. Consequently, it was demonstrated that the fabricated window film could be used in a co-culture biochip environment.

바이오칩 분석 장비를 위한 광학 시스템 설계 (Optical system design for biochip analyzer)

  • 배수진;강욱;허영
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2003년도 하계학술대회 논문집 D
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    • pp.2809-2811
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    • 2003
  • Biochip-based diagnostic technology is an effective, time- and money-saving way of identifying Rifampin and Isoniazid resistant tuberculosis strains. In this paper, we suggest the optical system which is designed with the simple structure and has an appropriate specification for biochip analyzer including a CCD camera system. It consists of two parts with the same structure but opposite direction. each part is made by one lens, achromatic doublet and meniscus. We changed the working distance of the optical system and observed its characteristics.

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Scientometric journal mappings 기법을 통한 Biochip 분야의 Discipline 구조분석

  • 박각로;이우형;오해영;이명호
    • 한국경영과학회:학술대회논문집
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    • 한국경영과학회 2004년도 추계학술대회 및 정기총회
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    • pp.193-196
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    • 2004
  • 본 연구의 목적은 Biochip을 연구하는 학문분야의 지적구조를 분석하고 이를 선행연구에 의해 도출된 Co-word Map의 클러스터와 연계하는데 있다. 본 연구는 이러한 기술과 학문의 연계를 통해 정책입안자들과 R&D 기금관리자들의 의사결정을 지원해 주는 계량적이고 시각적인 근거를 제공하고자 한다.

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알츠하이머 질병 진단을 위한 혈액 바이오마커 검출용 바이오칩 센서 개발 (Development of Biochip Sensors for Blood Biomarkers Specific to Alzheimer's Disease Diagnostics)

  • 김수희;이상혁;이혜진
    • 공업화학
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    • 제28권4호
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    • pp.397-403
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    • 2017
  • 해마다 증가하는 알츠하이머 질병에 걸린 환자 수는 전체 노인 인구의 15%에 다다르고 있다. 인지장애를 유발하는 심각한 알츠하이머 질병을 조기에 진단하는 것은 중요한 일이지만 MRI, PET, 척수액 진단법과 같은 기존 진단법은 고비용뿐만 아니라 장시간의 진단으로 환자에게 부담을 줄 수 있다. 이러한 기존 알츠하이머 질병 진단법의 단점을 극복하기 위하여 소량의 환자 시료(예 : 혈액)만으로 신속하게 알츠하이머 질병을 조기에 진단할 수 있는 다양한 바이오센싱 기술을 개발하는 연구가 지속되고 있다. 본 미니총설에서는 알츠하이머 질병 진단에 유용하게 활용될 수 있는 혈액 바이오마커를 정성 및 정량적으로 검출할 수 있는 바이오칩 기반의 센서 기술과 이를 통한 조기진단 기술에 대해 간략하게 서술하고, 이와 관련한 최신 연구현황과 발전방향에 대해 논의하고자 한다.

항원-항체 결합의 동시 검출을 위한 미세 유체 어레이 (Microfluidic Array for Simultaneous Detection of Antigen-antibody Bindings)

  • 배영민
    • 전자공학회논문지SC
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    • 제48권4호
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    • pp.102-107
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    • 2011
  • 본 연구에서는 복수의 항원-항체 결합 반응을 동시에 검출할 수 있는 미세유체역학 기반의 바이오칩을 설계하고 구현하였다. 본 연구의 바이오칩은 항원-항체 결합 반응이 이루어지는 반응기가 단일 채널에 직렬로 연결된 구조를 가지며, 각각의 반응기에는 항체가 고정화된 마이크로비드가 채워진다. 마이크로비드의 누출을 방지하기 위해서 마이크로채널에 위어 구조를 형성하였으며, 이를 위해서 gray-scale photolithography를 이용하였다. 항원-항체 결합 반응 검출 실험을 위해 3종의 항체를 선정하였으며, 각각의 항체를 avidn-biotin 반응을 통해 마이크로비드에 고정화하였다. 그리고, 형광물질이 표지된 항원을 마이크로채널에 연속적으로 주입하여 항원-항체 결합 반응을 유발하였으며, 10분 이내에 반응이 완료되는 것을 확인하였다. 또한, 항원에 따른 해당 반응기에서의 형광강도 증가를 검출함으로써, 미세유체 어레이의 구현 가능성을 확인하였다. 본 연구에서 제안한 미세유체 바이오칩은 면역 반응의 동시 검출을 위해 소요되는 시료의 양을 줄이고 반응 속도를 향상시킬 수 있을 것으로 사료된다.

FRET에 기반한 Open Sandwich Fluoroimmunoassay (Development of an Open Sandwich Fluoroimmunoassay Based on FRET)

  • ;이문권;성기훈;주재범;이은규
    • KSBB Journal
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    • 제22권6호
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    • pp.426-432
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    • 2007
  • QDs을 기반으로 하는 OsFIA는 매우 빠르고 간단히 수행될 수 있다. 또한 이 분석법은 고체상의 담체나 결합/잔류시약의 분리 등과 같은 여러 과정을 필요로 하지 않으며, 적은 양의 시약으로도 분석이 가능하다. 본 분석법은 높은 감도로 항원을 측정할 수 있으며, 일상적인 분석에도 쉽게 도입될 수 있을 것이다. 선형 범위 내에서 측정 가능한 receptor의 최소농도는 0.05 nM (2.65 ng/mL) 정도이다. 또한, 일반적으로 상용화된 항체를 가치고 수행이 가능하다. 이 OsFIA 분석법은 기존의 실험적 sandwich immunoassay의 효과적인 대안으로 제시된다.

마이크로 구조물 형성을 위한 핫 엠보싱용 플라스틱 스탬프 제작 (Fabrication of Hot Embossing Plastic Stamps for Microstructures)

  • 차남구;박창화;임현우;박진구;정준호;이응숙
    • 한국재료학회지
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    • 제15권9호
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    • pp.589-593
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    • 2005
  • Nanoimprinting lithography (NIL) is known as a suitable technique for fabricating nano and micro structures of high definition. Hot embossing is one of NIL techniques and can imprint on thin films and bulk polymers. Key issues of hot embossing are time and expense needed to produce a stamp withstanding a high temperature and pressure. Fabrication of a metal stamp such as an electroplated nickel is cost intensive and time consuming. A ceramic stamp made by silicon is easy to break when the pressure is applied. In this paper, a plastic stamp using a high temperature epoxy was fabricated and tested. The plastic stamp was relatively inexpensive, rapid to produce and durable enough to withstanding multiple hot embossing cycles. The merits of low viscosity epoxy solutions were a fast degassing and a rapid filling the microstructures. The hot embossing process with plastic stamp was performed on PMMA substrates. The hot embossing was conducted at 12.6 bar, $120^{\circ}C$ and 10 minutes. An imprinted PMMA wafer was almost same value of the plastic stamp after 10 times embossing. Entire fabrication process from silicon master to plastic stamp was completed within 12 hours.

실험 계획법을 이용한 점착방지막용 플라즈마 증착 공정변수의 최적화 연구 (Optimizing the Plasma Deposition Process Parameters of Antistiction Layers Using a DOE (Design of Experiment))

  • 차남구;박창화;조민수;박진구;정준호;이응숙
    • 한국재료학회지
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    • 제15권11호
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    • pp.705-710
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    • 2005
  • NIL (nanoimprint lithography) technique has demonstrated a high potential for wafer size definition of nanometer as well as micrometer size patterns. During the replication process by NIL, the stiction between the stamp and the polymer is one of major problems. This stiction problem is moi·e important in small sized patterns. An antistiction layer prevents this stiction ana insures a clean demolding process. In this paper, we were using a TCP (transfer coupled plasma) equipment and $C_4F_8$ as a precursor to make a Teflon-like antistiction layer. This antistiction layer was deposited on a 6 inch silicon wafer to have nanometer scale thicknesses. The thickness of deposited antistiction layer was measured by ellipsometry. To optimize the process factor such as table height (TH), substrate temperature (ST), working pressure (WP) and plasma power (PP), we were using a design of experimental (DOE) method. The table of full factorial arrays was set by the 4 factors and 2 levels. Using this table, experiments were organized to achieve 2 responses such as deposition rate and non-uniformity. It was investigated that the main effects and interaction effects between parameters. Deposition rate was in proportion to table height, working pressure and plasma power. Non-uniformity was in proportion to substrate temperature and working pressure. Using a response optimization, we were able to get the optimized deposition condition at desired deposition rate and an experimental deposition rate showed similar results.