A 16-residue polypeptide model with the sequence acetyl-YALSLAATLLKEAASL-OH was derived by rational de novo peptide design. The designed sequence consists of amino acid residues with high propensity to adopt an alpha helical conformation, and sequential order was arranged to produce an amphipathic surface. The designed sequence was chemically synthesized using a solid-phase method and the polypeptide was purified by reverse-phase liquid chromatography. Molecular mass analysis by electro-spray ionization mass spectroscopy confirmed the correct designed sequence. Structural characterization by circular dichroism spectroscopy demonstrated that the peptide adopts the expected alpha helical conformation in 50% acetonitrile solution. Liposome binding assay using Small Unilamellar Vesicle (SUV) showed a marked release of entrapped glucose by interaction between the lipid membrane and the tested peptide. The channel-forming activity of the peptide was revealed by a planar lipid bilayer experiment. An analysis of the conducting current at various applied potentials suggested that the peptide forms a cationic ion channel with an intrinsic conductance of 188 pS. These results demonstrate that a simple rational de novo design can be successfully employed to create short peptides with desired structures and functions.
The cell membrane, also known as the biological membrane, surrounds every living cell. The main components of cell membranes are lipids and therefore called as lipid membranes. These membranes are mainly made up of a two-dimensional lipid bilayer along with integral and peripheral proteins. The complex nature of lipid membranes makes it difficult to study and hence artificial lipid membranes are prepared which mimic the original lipid membranes. These artificial lipid membranes are prepared from phospholipid vesicles (liposomes). The liposomes are formed when self-forming phospholipid bilayer comes in contact with water. Liposomes can be unilamellar or multilamellar vesicles which comprises of phospholipids that can be produced naturally or synthetically. The phospholipids are non-toxic, biodegradable and are readily produced on a large scale. These liposomes are mostly used in the drug delivery systems. This paper offers comprehensive literature with insights on developing basic understanding of lipid membranes from its structure, organization, and phase behavior to its potential use in biomedical applications. The progress in the field of artificial membrane models considering methods of preparation of liposomes for mimicking lipid membranes, interactions between the lipid membranes, and characterizing techniques such as UV-visible, FTIR, Calorimetry and X-ray diffraction are explained in a concise manner.
The effects of lattice strain on the magnetic and the transport properties of La$_{0.8}$Sr$_{0.2}$MnO$_3$films grown on a LaAlO$_3$ (001) substrate and on a La$_{0.8}$Sr$_{0.2}$MnO$_3$ layer have been studied. It was observed that the metal-insulator and the ferromagnetic transitions turn out to be at higher temperatures for the film deposited on La$_{0.8}$Sr$_{0.2}$MnO$_3$ layer with respect to that on LaAlO$_3$. The dependence of Curie temperature on the bulk and the Jahn-Teller strains has also been determined. determined.
The effect of substrate micellization on the hydrolysis rate in the production of lysopho-sphatidylcholine (LPC) from phosphatidylcholine (PC) using hog pancreas phospholipase A2(PLA2) was studied. The optimal temperature and pH for the reactions in aqueous phase was found 42C and 7.2, respectively. For a given PC concentration, initial reaction rate was progressively increased with the addition of sodium deoxycholate (DOC), which could transform the bilayer of phospholipids into micellar structure.
SecA protein which has a pivotal role in the preprotein cranslocation across the inner membrane of Escherichia coli is a water-soluble protein with an unusual property of penetrating the membrane readily. An interesting and important question is what structural characteristics of SecA enables its ready penetration of lipid bilayer. The conformational properties of SecA in solution at 3$0^{\circ}C$, pH 7.5 were observed by hydrogen-tritium (HT) exchange, and denaturant-induced denaturation/renaturation and thermal unfolding. (omitted)
Kim, Soo-Hyun;Yim, Sung-Soo;Lee, Do-Joong;Kim, Ki-Su;Kim, Hyun-Mi;Kim, Ki-Bum;Sohn, Hyun-Chul
한국전기전자재료학회:학술대회논문집
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한국전기전자재료학회 2008년도 하계학술대회 논문집 Vol.9
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pp.239-240
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2008
As semiconductor devices are scaled down for better performance and more functionality, the Cu-based interconnects suffer from the increase of the resistivity of the Cu wires. The resistivity increase, which is attributed to the electron scattering from grain boundaries and interfaces, needs to be addressed in order to further scale down semiconductor devices [1]. The increase in the resistivity of the interconnect can be alleviated by increasing the grain size of electroplating (EP)-Cu or by modifying the Cu surface [1]. Another possible solution is to maximize the portion of the EP-Cu volume in the vias or damascene structures with the conformal diffusion barrier and seed layer by optimizing their deposition processes during Cu interconnect fabrication, which are currently ionized physical vapor deposition (IPVD)-based Ta/TaN bilayer and IPVD-Cu, respectively. The use of in-situ etching, during IPVD of the barrier or the seed layer, has been effective in enlarging the trench volume where the Cu is filled, resulting in improved reliability and performance of the Cu-based interconnect. However, the application of IPVD technology is expected to be limited eventually because of poor sidewall step coverage and the narrow top part of the damascene structures. Recently, Ru has been suggested as a diffusion barrier that is compatible with the direct plating of Cu [2-3]. A single-layer diffusion barrier for the direct plating of Cu is desirable to optimize the resistance of the Cu interconnects because it eliminates the Cu-seed layer. However, previous studies have shown that the Ru by itself is not a suitable diffusion barrier for Cu metallization [4-6]. Thus, the diffusion barrier performance of the Ru film should be improved in order for it to be successfully incorporated as a seed layer/barrier layer for the direct plating of Cu. The improvement of its barrier performance, by modifying the Ru microstructure from columnar to amorphous (by incorporating the N into Ru during PVD), has been previously reported [7]. Another approach for improving the barrier performance of the Ru film is to use Ru as a just seed layer and combine it with superior materials to function as a diffusion barrier against the Cu. A RulTaN bilayer prepared by PVD has recently been suggested as a seed layer/diffusion barrier for Cu. This bilayer was stable between the Cu and Si after annealing at $700^{\circ}C$ for I min [8]. Although these reports dealt with the possible applications of Ru for Cu metallization, cases where the Ru film was prepared by atomic layer deposition (ALD) have not been identified. These are important because of ALD's excellent conformality. In this study, a bilayer diffusion barrier of Ru/TaCN prepared by ALD was investigated. As the addition of the third element into the transition metal nitride disrupts the crystal lattice and leads to the formation of a stable ternary amorphous material, as indicated by Nicolet [9], ALD-TaCN is expected to improve the diffusion barrier performance of the ALD-Ru against Cu. Ru was deposited by a sequential supply of bis(ethylcyclopentadienyl)ruthenium [Ru$(EtCp)_2$] and $NH_3$plasma and TaCN by a sequential supply of $(NEt_2)_3Ta=Nbu^t$ (tert-butylimido-trisdiethylamido-tantalum, TBTDET) and $H_2$ plasma. Sheet resistance measurements, X-ray diffractometry (XRD), and Auger electron spectroscopy (AES) analysis showed that the bilayer diffusion barriers of ALD-Ru (12 nm)/ALD-TaCN (2 nm) and ALD-Ru (4nm)/ALD-TaCN (2 nm) prevented the Cu diffusion up to annealing temperatures of 600 and $550^{\circ}C$ for 30 min, respectively. This is found to be due to the excellent diffusion barrier performance of the ALD-TaCN film against the Cu, due to it having an amorphous structure. A 5-nm-thick ALD-TaCN film was even stable up to annealing at $650^{\circ}C$ between Cu and Si. Transmission electron microscopy (TEM) investigation combined with energy dispersive spectroscopy (EDS) analysis revealed that the ALD-Ru/ALD-TaCN diffusion barrier failed by the Cu diffusion through the bilayer into the Si substrate. This is due to the ALD-TaCN interlayer preventing the interfacial reaction between the Ru and Si.
We have fabricated silver nanowire (AgNW) films as a stretchable and transparent electrode on polydimethylsiloxane (PDMS) substrates using a spray coater. Inherently, they show poor surface roughness and stretchability. To tackle it, we have employed a conductive polymer, poly (3,4-ethylenedioxythiophene) : Poly(styrene sulfonate) (PEDOT : PSS). PEDTO : PSS solution is mixed with AgNWs or spin-coated on the AgNW film. Compared with AgNW film only, PEDOT : PSS film only, and polymer-mixed AgNW films, the AgNW/polymer bilayer films exhibit much better surface roughness and stretchability. It is found that spray-coating of AgNWs on uncured PDMS and spin-coating of PEDOT : PSS solution on the AgNW films enhance the surface roughness of electrodes. Such a bilayer structure also provides a stable resistance under tensile strain due to the fact that each layer acts as a detour route for carriers. With this structure, we have obtained the peak-to-peak roughness ($R_{pv}$) as low as 76.8nm and a moderate increase of sheet resistance (from $10{\Omega}/{\Box}$ under 0% strain to $30{\Omega}/{\Box}$ under 40% strain).
Irradiation of the metal nanoparticles causes local plasmon resonance in a specific wavelength band, which can improve the absorption and scattering properties of a structure. Since noble metal nanoparticles have better resonance effects than those of other metals, it is easy to identify plasmonic reactions and this is advantageous to find the optical tendency. Compared to having a particle gap or randomly arranged particle structures, densely and evenly packed structures can exhibit more uniform optical properties. Using the uniform properties, the structure can be applied to optical filtering applications. Therefore, in this paper, validation tests about metal nanoparticles and thin film structures are conducted for more accurate analysis. The optical properties of monolayer and bilayer noble metal nanoparticle structures with different diameters, packed in a uniform array, are investigated and their optical trends are analyzed. In addition, a thin film structure under identical conditions as metal nanoparticle structure is evaluated to confirm the improved optical characteristics.
The dependence on nickel oxide thickness and a ferromagnetic layer thickness in unidirectional and isotropic exchange-coupled NiO/NiFe(Fe) bilayer films was investigated by magnetic force microscopy to better understand the relation between magnetic domain structure and exchange biasing at microscopic length scales. As the NiO thickness increased, the domain structure of unidirectional biased films formed smaller and more complex in-plane domains. By contrast, for the isotropically coupled films, large domains generally formed with increasing NiO thickness including a cross type domain with out-of plane magnetization orientation. The density of the cross domain is proportional to exchange biasing field, and the fact that the domain mainly originated from the strongest exchange coupled region was confirmed by imaging in an applied external field during a magnetization cycle.
Membrane proteins in highly oriented lipid bilayer samples are useful for membrane protein structure determination. We used in the past planar lipid bilayers which were aligned and supported on the glass slide. These samples were mechanically aligned in a magnetic field. However, these stacks of glass slides with planar lipid bilayers are not well suited for use with a commercial solid-state NMR probe with a round coil. Therefore, a homebuilt solid-state NMR probe was built and used with a stack of thin glass plates wherein the RF coil was wrapped directly around the flat square sample. Recently, we began to use magnetically aligned bicelles that are suitable for the structure determination of membrane proteins by solid-state NMR spectroscopy without any effort to build a flat square coil probe. These bicelle samples are well suited for use with a commercial solidstate NMR probe with a round coil, are very easy to prepare and are very stable, so that they can be kept for more than a year. In this paper, we present the solid-state NMR spectra of optimized and magnetically oriented bicelle samples of membrane proteins.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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