Park, Cheol-Nam;Lee, Jung-Min;Lee, Dong-Ho;Kim, Beom-Seok
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제18권5호
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pp.880-884
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2008
A strain of Streptomyces sp. (M10) antagonistic to Botrytis cinerea was isolated from orchard soil obtained from Jeju Island, Korea. An antifungal substance (CN1) was purified from the culture extracts of the strain, and then identified as valinomycin through extensive spectroscopic analyses. Valinomycin showed potent in vitro antifungal activity against Botrytis cinerea and also in vivo control efficacy against Botrytis blight development in cucumber plants. Overall, the disease control efficacy of valinomycin was similar to that of vinclozolin, a commercial fungicide. This study provides the first report on the disease control efficacy of valinomycin against Botrytis blight.
CRAMP, a 37-amino acid cationic antimicrobial peptide was recently deduced from the cDNA cloned from mouse femoral marrow RNA. In order to investigate the structure-activity relationship and functional region of CRAMP, CRAMP and its 18-mer overlapping peptides were synthesized by the solid phase method. CRAMP showed broad spectrum antibacterial activity against both Gram-positive and Gram-negative bacterial strains (MIC: 3.125-6.25 μM) but had no hemolytic activity until 50 μM. CRAMP was found to have a potent anticancer activity (IC50: 12-23 μM) against two human small cell lung cancer cell lines. Furthermore, CRAMP was found to display faster bactericidal rate in B. subtilis rather than E. coli in the kinetics of bacterial killing. Among 18-meric overlapping fragment peptides, only CRAMP (16-33) displayed potent antibacterial activity (MIC: 12.5-50 μM) against several bacteria with no hemolytic activity. Circular dichroism (CD) spectra anal-ysis indicated that CRAMP and its analogues will form the amphipathic α-helical conformation in the cell membranes similar to other antimicrobial peptides, such as cecropins and magainins.
Pseudin is a naturally occurring 24 amino-acid-residue antimicrobial peptide derived from the skin of paradoxical frog Pseud's paradoxa. It shows potency against the bacteria and antibiotic-resistant bacteria strain, but has high cytotoxicity against mammalian cell. In our previous study, substitution of $Pro^{11}$ for Gly (Ps-P) increased bacterial cell selectivity but decreased the antibacterial activity of pseudin. In this study, we designed pseudin analogue, Ps-4K-P with increased cationicity up to +7 in Ps-P by substituting Glu14, Gln10, Gln24, and Leu18 with Lys. Ps-4K-P showed improved potent antibacterial activity with high bacterial cell selectivity. We determined the tertiary structure of Ps-4K-P in the presence of DPC micelles by NMR spectroscopy and it has a hinge structure at $Pro^{11}$ followed by three turn helices from $Pro^{11}$ to $Val^{23}$ at the C-terminus. Amphipathicity with increased cationicity as well as helix-hinge-helix structural motif provided by introduction of a Pro at position $Gly^{11}$ are the crucial factors which confer antibacterial activity with bacterial cell selectivity to Ps-4K-P.
Bacillus subtilis 028-1 균주는 청국장 발효에 사용하는 균주로 Staphylococcus sp. LS2 뿐만 아니라 여러 yeast 균주의 생장을 억제하는 항생물질을 생산하며, soybean meal 2%와 maltose와 같은 이당류를 1% 첨가하여 15~18시간 진탕 배양하였을 때 최대의 항생물질 생산을 보였으며 배지의 pH는 6.5 이하였다. 항생물질의 활성은 약염기성 조건에서 극대화되었으며, $100^{\circ}C$에서 20분간 가열하여도 활성은 크게 감소하지 않았고, 실온 보관 시 한 달 이상 효과가 지속되며 chymotrypsin과 papain 같은 단백질 분해효소 처리에 의해 서서히 활성이 줄어들었다. 투석에 의해 항생물질의 분자량을 측정한 결과 1,000에서 500 dalton 사이인 것으로 나타났으며 항미생물 효과는 있으나 fibrin 분해 능력이 없으므로 surfactin이 아닌 iturin 계열의 peptide성 항생물질로 보인다.
항생제의 오남용은 세균의 항생제 내성을 증가시켜 세균감염에 의한 질병 치료에 어려움을 초래한다. 본 연구에서는 동애등애유충으로부터 분리된 펩타이드의 신장에서의 폐렴간균 감염 억제 효능을 관찰하였다. 마우스는 비강을 통해 폐렴간균을 감염시키고 1일 후 펩타이드를 마우스에 근육 주사로 투여하였다. 10일 후 마우스를 희생하여 신장에서 세균 감염증을 조사하였다. 대조군에 비해 펩티드를 투여한 마우스의 신장에서 세균 감염증상, 몸무게의 감소가 유의하게 억제되었고 생존률이 농도 의존적으로 증가하는 것으로 나타났다. 이러한 결과들은 동애등애로부터 분리된 펩타이드가 폐렴 간균의 신장에서의 감염증상을 억제할 수 있음을 보여준다. 따라서 동애등애로부터 분리된 펩타이드는 효과적인 항생제 개발에서 가능성 높은 후보물질이 될 수 있을 것이다.
참담치 hemocyte에 존재하는 항균 펩타이드를 역상 HPLC column을 사용하여 분리 및 정제하였다. 정제된 펩타이드는 matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrophotometer (MALDI-TOF/MS) 분석을 통해 분자량이 3330.549 Da이며, edman 분해법을 통해 14개의 N-말단 아미노산 서열을 확보하였다. 분석한 N-말단 서열은 M. californianus의 sperm-specific protein Phi-1과 protamine-like PL-III protein과 각각 93%와 87%의 유사도를 나타냈으며, M. edulis의 sperm-specific protein Phi-1과 87% 일치함을 확인하였다. 또한 open-reading frame (ORF)은 306 bp의 길이에 101개의 아미노산을 코딩하고 있음을 밝혔으며, 이는 M. californianus의 sperm-specific protein Phi-1와 93.5% 유사하였다. 분자량과 아미노산 서열에 근거하여 31개 아미노산으로 구성된 펩타이드를 합성하였으며 이는 그람 양성균인 B. subtilis, S. mutans, S. aureus와 그람 음성균인 E. coli, K. pneumoniae, P. mirabilis, P. aeruginosa 그리고 진균류인 C. albicans에 항균 활성을 보였다. 합성한 펩타이드는 항생제 내성균주인 S. aureus CCARM 0203와 S. aureus CCARM 0204에 항균 활성을 보였다. 합성 항균 펩타이드는 넙치 혈장에 대한 용혈현상은 없었고, 세포독성을 확인한 결과 HUVEC cell line에 전혀 독성을 보이지 않았다. 본 연구결과, 참담치의 혈구로부터 분리 및 정제한 sperm-specific protein 유래 항균 펩타이드는 다양한 균주에 항균 활성을 보였고 낮은 세포독성을 가졌으며, 이러한 특성은 본 실험에서 분리한 항균 펩타이드가 항생제 대체재로서 개발 가능성을 제시하고 있다.
The bactenecin is an antibacterial peptide with an intramolecular disulfide bond. We recently found that homodimeric bactenecin exhibits more potent antibacterial activity than the monomeric form and retains its activity at physiological conditions. Here we assess the difference in the modes of antibiotic action of homodimeric and monomeric bactenecins. Both monomeric and dimeric bactenecins almost completely killed both Staphylococcus aureus and E. coli within 10-30 min at concentrations of $8-16\;{\mu}M$. However, exposure to liposomes elicited an increase in the fluorescence quantum yield from a tryptophan-containing monomeric analog, while the homodimeric analog showed a significant reduction in fluorescence intensity. Moreover, unlike the monomer, the homodimer displayed apparent membrane-lytic activity enabling release of various sized dyes from liposomes, and rapidly and fully depolarized the S. aureus membrane. Together, our results suggest that homodimeric bactenecin forms pores in the bacterial membrane, while monomeric one penetrates through the membrane to target intracellular molecules/organelles.
Plectasin, the first defensin extracted from a fungus (the saprophytic ascomycete Pseudoplectania nigrella), is attractive as a prospective antimicrobial agent. The purpose of this study was to establish a bacterium-based production system and evaluate the antimicrobial activity of the resulting plectasin. A gene encoding plectasin, with the codon preference of Escherichia coli, was optimized based on its amino acid sequence, synthesized using genesplicing with overlap extension PCR, and inserted into the expression vector pGEX-4T-1. The fusion protein was expressed in the soluble fraction of E. coli and purified using glutathione Stransferase affinity chromatography. Plectasin was cleaved from the fusion protein with thrombin and purified by ultrafiltration. The purified plectasin showed strong, concentrationdependent antimicrobial activity against gram-positive bacteria, including antibiotic-resistant bacteria, especially penicillin-resistant Enterococcus faecium. This antimicrobial activity was equal to chemically synthesized plectasin and was maintained over a wide range of pH and temperatures. This soluble recombinant expression system in E. coli is effective for producing plectasin at a relatively lower cost, and higher purity and efficiency than prior systems, and might provide a foundation for developing a large-scale production system. Overall, plectasin shows potential as a novel, high-performance, and safe antibiotic for the treatment of refractory diseases caused by drug-resistant bacterial strains.
In order to clone the peptide synthetase gene form Lysobacter lactamgenus IFO 14,288, the gene fragments were amplified using primers for the adenylation domain and the thionylation domain of the peptide synthetase genes in other organisms by polymerase chain reaction (PCR). The resulting 0.5-kb fragment was cloned in a pGEM-T vector, and the nucleotide sequences were determined. Six different PCR products were obtained; three were identified to be a part of L-$\alpha$-aminoadipyl-L-cysteinyl-D-valine (ACV) synthetase and three to be other peptide synthetases. Using each of the two different classes of PCR products as mixed probes, a cosmid library of L. lactamgenus chromosomal DNA constructed in a pHC79 vector was screened by an in situ hybridization procedure, and one positive clone was selected which was bound by peptide synthetase gene fragments as well as ACV synthetase gene fragments. The partial sequence analysis formt he obtained pPTS-5 cosmid showed th presence of more than two open reading frames. These were for two putative membrane transporters, which were homologous with several integral membrane proteins including the ABC transporter ATP-binding protein of E. coli (YbjZ) and the metal ion uptake protein of Bacillus subtilis (YvrN). A 45% homology was also found between the two transporter proteins at the carboxy terminus. Through a hydropathy analysis and transmembrane analysis. 4-5 transmembrane domains were found in these two proteins. When the genes were expressed in Escherichia coli, the gene products inhibited the hose cell growth, probably due to the disturbance of the membrane transport system.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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