An antagonistic bacterium, KJ1R5,, to Phytophthora capsici was obtained from root interior of a healthy pepper plant. To identify the bacterial antagonist, 16S rDNA sequence analysis, Biolog system, fatty acid methyl-esters (FAMEs), and physiological and biochemical characterization were conducted. The determined 165 rDNA sequence of KJ1R5, showed higher similarities to those of a group consisting of several Chryseobacterium strains with 95.2, 95.2, and 95,1% similarity to C. defluvii, Chryseobacterium sp. FR2, and C. scophthalmum, respectively, In addition, Halounella gailinarum, Bergeyella zoohelcum, and Riemerella anatipestifer are another group for KJ1R5, with 94.1, 89.7, and 87.2% similarities, respectively When identification of the antagonistic bacterium, KJ1R5, was conducted using BIOLOG system, the strain KJ1R5, was identified as Flavobacterium tirrenicum (similarity; 0.75%). Fatty acid profiles of the strain KJ1R5, were composed mainly of iso-17:0 w9c and iso-15:0 and identified as Chryseobacterium balustinum (similarity 0.524%). KJ1R5, was Gram-negative, regular short rods ranging from 0.8 $\mu\textrm{m}$ to 1.0 $\mu\textrm{m}$ and had no flagella. Phenotypic characterization of the antagonistic bacterium indicated that KJ1R5, were included in the genus Chreseobacterium, which belongs to the family Flavobacteriaceae. The strain was distinguished from these six existing species. These results indicated that strain might be placed as a new species in the genus Chryseobacterium.
In this biocontrol research, we evaluated disease suppressive effects of antagonistic bacterial strains ISE13 and KJ1R5 against Korean ginseng root rot caused by P. eaetorum. We also examined the effects of nutrient solution in the hydroponic culture system for Korean ginseng on biological activity of the bacterial strains. As results of dual culture tests of the bacterial strains on $V_{8}$ juice agar, the strain ISE13 showed antifungal activity against P. eaetorum and other plant pathogenic fungi, but the strain KJ1R5 did not. When their inhibitory effects against infection of P. eaetorum on the roots grown in either nutrient solution or water were tested, the strains ISE13 and KJ1R5 inhibited the disease severity of Korean ginseng roots only grown with water, compared to buffer-treated, inoculated controls. However, the nutrient solution used for hydroponic cultures of ginseng in pots caused higher levels of disease severity by the strains ISE13 and KJ1R5 from 418.8\%$ to 40.0\%$ and from 24.3\%$ to 45.0\%$, respectively. In this study, the bacterial strains ISE13 and KJ1R5 could be potentially biocontrol agents to suppress Korean ginseng root rot caused by P. eaetorum. However, more attention using nutrient solution in hydroponic cultures for Korean ginseng production should be applied in biocontrol of plant diseases using the antagonistic microorganisms.
사과 재배에 피해를 주고 있는 사과 겹무늬썩음병, 탄저병, 라이족토니아병을 복합적으로 방제하기 위한 기초연구로서 각 병원균에 대하여 우수한 길항력을 동시에 가지는 길항미생물을 선발하고 Streptomyces sp. S-1110으로 동정하였다. 분리된 길항미생물은 배양상등액으로 길항물질을 분비하였으며 우수한 열안정성과 pH 안정성을 가지는 특성이 있었으며 각 병원균에 대한 감수성이 조금씩 달라서 2 종 이상의 길항물질이 동시에 생산되어 길항작용을 하는 것으로 추정되었다. 또한 분리균이 생산하는 길항물질을 사과 과실에 직접접종된 사과 겹무늬썩음병과 탄저병의 방제를 위해 실험한 결과 높은 방제력을 보였다. 따라서 분리된 길항미생물은 사과 과수원 및 저장소에서 동시에 수종의 질병방제에 쓰일 수 있는 천연 복합방제제의 개발을 위한 기초 균주로의 가치가 높은 것으로 판단된다.
토양 우점능이 강한 생물학적 방제제 제조를 위해 경북지역 토양에서 길항균주를 분리하고 이들 중 Fusarium oxysporum, Phytophthora capsici 에 강력한 길항능을 보이는 Pseudomonas sp. 4059 를 선발, 동정하였다. Pseudomonas sp. 4059 의 시들음 병균 Fusarium oxysporum, 고추 역병균 Phytophthora capsici 에 대한 길항기작은 내열성 저분자의 항생물질과 철이온을 특이적으로 흡착하는 siderophore의 생산에 의한 것이다. Pseudomonas sp. 4059 는 항진균성 항생물질 Phenazine 생산 유전자를 소유하며 Salkowski test에 양성인 옥신류 생산도 한다는 것을 확인하였다. Pseudomonas sp. 4059 는 bioochemical tests, API test, MicroLogTM system을 통해 Pseudomonas fluorescens (biotype A)으로 98% 상동성을 보였으므로 이를 Pseudomonas fluorescens (biotype A) 4059 로 명명하였다. 선발된 길항균 Pseudomonas fluorescens (biotype A) 4059는 고추를 기주식물로 하였을 때 고추역병균인 Phytophthora capsici가 원인이 되는 고추역병을 in vivo 상에서도 충분히 억제할 수 있는 생물방제능을 나타내었다.
온실 토양으로부터 주요 작물 병원균의 생육을 억제하는 길항곰팡이를 분리, 동정하였고, 그 균이 분비하는 향균물질을 분리하여 활성을 petriplate assay로 검정했다. 길항균의 foot cell, 분생포자 및 MY20 배지상의 균사 등 형태학적 특징에 근거하여 이 균을 Aspergillus terreus로 동정하였다. A. terreus의 배양여액을 chloroform으로 추출하고, 그 추출물을 column chromatography와 thin layer chromatography로 향균물질을 순수분리하였으며, 화학구조는 butyrolactone I이었다. 이 물질의 주요 작물병원균에 대한 $ED_{50}$은 Botrytis cinerea, Phytophthora capsici. Pythium ultimum, Rhizoctonia solani, 그리고 Fusarium oxysporum에 각각 9.7, 42.6, 23.3, 13.7, 102.7 ppm으로 나타났다.
Han, Joon-Hee;Shim, Hongsik;Shin, Jong-Hwan;Kim, Kyoung Su
The Plant Pathology Journal
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제31권2호
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pp.165-175
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2015
Anthracnose is a fungal disease caused by Colletotrichum species that is detrimental to numerous plant species. Anthracnose control with fungicides has both human health and environmental safety implications. Despite increasing public concerns, fungicide use will continue in the absence of viable alternatives. There have been relatively less efforts to search antagonistic bacteria from mudflats harboring microbial diversity. A total of 420 bacterial strains were isolated from mudflats near the western sea of South Korea. Five bacterial strains, LB01, LB14, HM03, HM17, and LB15, were characterized as having antifungal properties in the presence of C. acutatum and C. gloeosporioides. The three Bacillus atrophaeus strains, LB14, HM03, and HM17, produced large quantities of chitinase and protease enzymes, whereas the B. amyloliquefaciens strain LB01 produced protease and cellulase enzymes. Two important antagonistic traits, siderophore production and solubilization of insoluble phosphate, were observed in the three B. atrophaeus strains. Analyses of disease suppression revealed that LB14 was most effective for suppressing the incidence of anthracnose symptoms on pepper fruits. LB14 produced antagonistic compounds and suppressed conidial germination of C. acutatum and C. gloeosporioides. The results from the present study will provide a basis for developing a reliable alternative to fungicides for anthracnose control.
여러 작물 재배지 토양에서 각종 근권미생물을 분리하여 이들 분리미생물 중 수박 만할병균인 Fusarium oxysporum f. sp. niveum(KCCM34741)에 길항하는 미생물인 YJ-19, YJ-45, YJ-3 등 12 균주를 분리하였다. 길항미생물들은 MS agar 배지 실험 및 미생물제제 첨가 상토 실험에서 모두 참박의 발아율을 향상시켰으며, 이들 중 분리주 YJ-3 균주는 참박의 발아율과 초기생육에 가장 큰 영향을 주는 미생물로 선별되었다. YJ-3 균주를 제제화하여 참박 재배 기간별로 식물체 생육실험을 행한 결과 대조구인 일반 상토 및 시판 미생물혼합 상토 보다 각각 46%와 13%정도 생육을 촉진하는 것으로 나타났다. 분리주 YJ-3 균주는 간균의 gram 양성균으로서 Bacillus sp.로 동정되었다. Bacillus sp. YJ-3은 수박 만할병균인 F. oxysporum f. sp. niveum에 대해 강한 억제효과를 나타내었고, 그외 수박 병원균인 Alternaria cucumerina, Botrytis cinerea, Colletotrichum orbiculare, Didymella bryoniae, Rhazoctonia solani 등에서도 우수한 길항력을 나타내어 본 Bacillus sp. YJ-3 균주는 수박 만할병균에 길항하는 동시에 참박의 생육을 촉진하는 미생물로 확인되었다.
BACKGROUND: Some microorganisms extant in nature have ability to suppress various plant pathogens, and also can promote plant growth. Thus microorganisms are such great source of antimicrobial agents to develop antagonistic microorganism production and eco-friendly crop management. We isolated the microorganisms in various eco-friendly formulations. The suppressive abilities against plant pathogens have been characterized in vitro level. METHODS AND RESULTS: The indigenous microorganisms have been isolated from Cooked rice, Black sugar, Rice Bran, and Red clay using dilution plating method. Population of bacteria and fungi were above 107 in the all formulations. We isolated and pure cultured the microorganisms based on morphological characteristics. Three major plant pathogens (Fusarium oxysporum, Rhizoctonia solani, Phytophthora capsici) have been used to select antagonistic microorganisms. Total 20 bacteria and 9 fungi showed the pathogen growth suppression ability in vitro condition. The selected microorganisms were identified by ITS sequence similarity. CONCLUSION: All tested eco-friendly formulations contained high-density of the microorganisms. Among the isolated microorganisms, Bacillus spp. and Streptomyces spp. showed the most effective antifungal activity against the plant pathogens such as F. oxysporum, R. solani, and P. capsici. Among the selected fungi Trichoderma sp. demonstrated antifungal activity. Our results suggest that the currently adapted eco-friendly formulations might useful for sustain agricultural system.
채소 등 작물의 부패균인 Erwinia carotovora subsp. carotovora의 생육을 억제하는 길항세균을 경작지 표토층으로부터 분리하고 배양조건에 따른 억제력변화를 조사하고, 길항관련 유전자의 소재를 확인하였다. 분리균들중 가장 우수한 억제력을 갖는 S4, S14, S65 균주를 최종 선발하고 Pseudomonas 근연종으로 동정하였다. 523 배지를 사용하여 배양조건에 따른 억제력 변화를 조사한 결과 배지초기 pH를 7-8로 조정하여 $30^{\circ}C$에서 3일간 배양하였을 때 가장 높은 억제력을 보였고, 배지성분중 탄소원으로 mannitol과 sorbitol, 무기염으로 CaCl2를 첨가했을 때 효과적이었으나 질소원에 대한 감수성은 낮았다.
Podosphaera fusca에 의한 멜론 흰가루병은 우리나라에서 멜론의 심각한 식물병 중의 하나이다. 본 연구에서는 선발한 길항세균의 다양한 식물병원균에 대한 균사 생육 억제 및 메론 흰가루병 방제에 대한 효과를 평가하였다. 16S rDNA 및 gyrA 유전자의 염기서열을 바탕으로 선발한 길항세균 Bacillus sp. M09, M70 및 M99-1을 동정한 결과 B. velezensis로 동정되었다. B. velezensis M09, M70 및 M99-1는 다양한 식물병원균에 47~69%의 균사생육 억제 효과를 보였을뿐만 아니라 흰가루병균의 발생을 현저히 감소시켰다. 본 연구에서 선발한 3균주는 멜론 흰가루병뿐만 아니라 다양한 식물병에 대한 잠재적인 생물방제제로 활용될 수 있을 것으로 생각되었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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