• 미생물학회지
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• 제35권1호
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• pp.41-46
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• 1999

수계에 분포하는 장바이러스를 검출하기 위해 민감도가 높고 검출시간이 빠른 PCR법을 이용하였다. 바이러스입자를 보다 순수하게 농축하기 위해 몇 가지 바이러스농축법을 비교조사하고 그것의 변형을 통하여 개선된 방법을 확립하였다. 비교한 농축방법중 흡탈착/Polyethyleneglycol(PEG) 침전법과 플록화/촉속원심분리법을 통해 10 PFU $ml^{-1}$ 까지 검출이 가능하여 다른 방법에 비해 효과적임이 판명되어Te. Sephadex resin을 이용한 부가적인 시료정제 과정을 통해 시료의 순도를 높일 수 있어검출한계를 10배정도 낮추었다. 서정된 검출법을 통해 한강수계에서 장바이러스의 분포를 조사한 결과 조사한 시료중 한강의 지천에서는 75%, 본류에서는 20%의 시료에서 바이러스가 검출되었다. 본 조사결과 흡탈착/PEG 침전법-PCR 검출기법이 수계의 바이러스 오염도를 간편하고 신속하게 검출하는데 매우 유용하였으며 국내 수계에도 바이러스 오염이 광범위함을 확인하였다.

• Food Science and Biotechnology
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• 제18권5호
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• pp.1150-1154
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• 2009

Low levels of virus contamination and naturally occurring reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) inhibitors restrain virus detection in oysters. A rapid and efficient oyster-processing procedure that can be used for sensitive virus detection in oysters was developed. Poliovirus type 1 Sabin strain was used to evaluate the efficacy of virus recovery. The procedure included (a) acid-adsorption and elution with buffers (0.25M glycine-0.14 M NaCl, pH 7.5; 0.25M threonine-0.14M NaCl, pH 7.5); (b) polyethylene glycol (PEG) precipitation; (c) resuspension in Tween 80/Tris solution and chloroform extraction; (d) the second PEG precipitation; (e) viral RNA extraction with TRIzol and isopropanol precipitation; and (f) RT-PCR combined with semi-nested PCR. The overall recovery of elution/concentration was 19.5% with poliovirus. The whole procedure usually takes 19 hr. The overall detection sensitivity was 4 RT-PCR units of genogroup I norovirus (NoV) and 6.4 RT-PCR units of genogroup II Nov/25 g of oysters initially seeded. The virus-detecting method developed in this study should facilitate the detection of low levels of NoV in oysters.