Wood identification is regularly performed by observing the wood anatomy, such as colour, texture, fibre direction, and other characteristics. The manual process, however, could be time consuming, especially when identification work is required at high quantity. Considering this condition, a convolutional neural networks (CNN)-based program is applied to improve the image classification results. The research focuses on the algorithm accuracy and efficiency in dealing with the dataset limitations. For this, it is proposed to do the sample selection process or only take a small portion of the existing image. Still, it can be expected to represent the overall picture to maintain and improve the generalisation capabilities of the CNN method in the classification stages. The experiments yielded an incredible F1 score average up to 93.4% for medium sample area sizes (200 × 200 pixels) on each CNN architecture (VGG16, ResNet50, MobileNet, DenseNet121, and Xception based). Whereas DenseNet121-based architecture was found to be the best architecture in maintaining the generalisation of its model for each sample area size (100, 200, and 300 pixels). The experimental results showed that the proposed algorithm can be an accurate and reliable solution.
As a part of the Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP), we have developed a few algorithms for accurate identification of missing proteins, alternative splicing variants, single amino acid variants, and characterization of function unannotated proteins. We have found missing proteins, novel and known ASVs, and SAAVs using LC-MS/MS data from human brain and olfactory epithelial tissue, where we validated their existence using synthetic peptides. According to the neXtProt database, the number of missing proteins in chromosome 11 shows a decreasing pattern. The development of genomic and transcriptomic sequencing techniques make the number of protein variants in chromosome 11 tremendously increase. We developed a web solution named as SAAvpedia for identification and function annotation of SAAVs, and the SAAV information is automatically transformed into the neXtProt web page using REST API service. For the 73 uPE1 in chromosome 11, we have studied the function annotaion of CCDC90B (NX_Q9GZT6), SMAP (NX_O00193), and C11orf52 (NX_Q96A22).
LE, SON HAI;KANG, SHINSEONG;PHAM, TRIET MINH;LEE, KYUNGHOON
Journal of the Korean Society for Industrial and Applied Mathematics
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v.25
no.4
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pp.196-220
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2021
This study formulates a new geometric parameterization scheme to effectively address numerical analysis subject to the variation of the fiber radius of a square unit cell. In particular, the proposed mesh-morphing approach may lead to a parameterized weak form whose bilinear and linear forms are affine in the geometric parameter of interest, i.e. the fiber radius. As a result, we may certify the reduced basis analysis of a square unit cell model for any parameters in a predetermined parameter domain with a rigorous a posteriori error bound. To demonstrate the utility of the proposed geometric parameterization, we consider a two-dimensional, steady-state heat conduction analysis dependent on two parameters: a fiber radius and a thermal conductivity. For rapid yet rigorous a posteriori error evaluation, we estimate a lower bound of a coercivity constant via the min-θ method as well as the successive constraint method. Compared to the corresponding finite element analysis, the constructed reduced basis analysis may yield nearly the same solution at a computational speed about 29 times faster on average. In conclusion, the proposed geometric parameterization scheme is conducive for accurate yet efficient reduced basis analysis.
Fellah, M.;Draiche, Kada;Houar, Mohammed Sid Ahmed;Tounsi, Abdelouahed;Saeed, Tareq;Alhodaly, Mohammed Sh.;Benguediab, Mohamed
Structural Engineering and Mechanics
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v.69
no.3
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pp.335-345
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2019
In present study, a novel refined hyperbolic shear deformation theory is proposed for the buckling analysis of thick isotropic plates. The new displacement field is constructed with only two unknowns, as against three or more in other higher order shear deformation theories. However, the hyperbolic sine function is assigned according to the shearing stress distribution across the plate thickness, and satisfies the zero traction boundary conditions on the top and bottom surfaces of the plate without using any shear correction factors. The equations of motion associated with the present theory are obtained using the principle of virtual work. The analytical solution of the buckling of simply supported plates subjected to uniaxial and biaxial loading conditions was obtained using the Navier method. The critical buckling load results for thick isotropic square plates are compared with various available results in the literature given by other theories. From the present analysis, it can be concluded that the proposed theory is accurate and efficient in predicting the buckling response of isotropic plates.
Kim, Kangjoo;Lee, Jin-Won;Choi, Seung-Hyun;Kim, Seok-Hwi;Kim, Hyunkoo;Hamm, Se-Yeong;Kim, Rak-Hyeon
Journal of Soil and Groundwater Environment
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v.24
no.1
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pp.10-16
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2019
Alkalinity is an essential parameter for understanding geochemical processes and calculating partial pressure of $CO_2$, dissolved inorganic carbon, and mineral saturation indices. The Gran Titration Method (GTM) is one of the most accurate methods for measuring the alkalinity in water samples. However, this method has not been widely employed in measuring groundwater alkalinity in Korea, probably due to inadequate and insufficient understanding of the method. In this regard, this article was prepared to introduce GTM and related know-hows learned from the authors' experiences in measuring alkalinity. This paper also introduces a MS Excel-based alkalinity calculator as a handy tool for GTM.
The current SBAS service does not provide a method to integrate multiple SBAS corrections. This paper proposes a positioning method to effectively integrate multiple SBAS and multiple GNSS. In the method, the final position is obtained by the weighted sum of the positions obtained from the combination of GNSS and SBAS. Since each position is independently computed and combined using flexible weights, it has a simple structure that can easily cope with various environments. In order to verify the operation and performance of the proposed method, raw measurements of GNSS and SBAS were collected using commercial receivers. The experiments using real signals show that the combined use of two SBAS corrections was more accurate by 0.05~0.4m(2dRMS) than using only one SBAS correction. To improve the position accuracy, this paper considered the integration of multi-GNSS and multi-SBAS, which was not found in other existing studies. The proposed method is expected to be a core technology for designing multi-GNSS navigation receivers considering multi-SBAS corrections. The importance of the method will be increased as KPS and KASS also available in near future.
A sub-channel solver, named ${\underline{S}}teady$ and ${\underline{T}}ransient$${\underline{A}}nalyzer$ for ${\underline{R}}eactor$${\underline{T}}hermal$ hydraulics (START), has been developed using the homogenous model for two-phase conditions of light water reactors. The code is developed as a fast and accurate TH-solver for coupled and multi-physics calculations. START has been validated against the NUPEC PWR Sub-channel and Bundle Test (PSBT) database. Tests like single-channel quality and void-fraction for steady state, outlet fluid temperature for steady state, rod-bundle quality and void-fraction for both steady state and transient conditions have been analyzed and compared with experimental values. Results reveal a good accuracy of solution for both steady state and transient scenarios. Axially different values for turbulent mixing coefficient are used based on different grid-spacer types. This provides better results as compared to using a single value of turbulent mixing coefficient. Code-to-code evaluation of PSBT results by the START code compares well with other industrial codes. The START code has been parallelized with the OpenMP algorithm and its numerical performance is evaluated with a large whole PWR core. Scaling study of START shows a good parallel performance.
The purpose of this study is to classify the concentration of HbA1c (glycosylated hemoglobin), which is an indicator in the management of accurate blood glucose level in diabetic patients, using a non-invasive optical property measurement method. To measure the optical properties of HbA1c, the optical source uses LEDs and laser diodes of 400 nm in the visible region and 1450 nm in the nearinfrared region using thermopile to detect the Raman scattering intensity. An HbA1c control solution was used. As a result, the optical properties of 5% (normal) and 9% (abnormal) HbA1c control solutions showed specificity in which the output values were reversed at 850 nm and 950 nm, respectively. This property was applied to distinguish between normal and abnormal values in diabetes. In addition, considering tissue penetration depths for non-invasive measurements, two wavelengths were determined to be effective in distinguishing the concentrations of HbA1c control solutions at 5%, 7%, and 9%.
In the present investigation, thermal buckling and free vibration characteristics of functionally graded (FG) Timoshenko nanobeams subjected to nonlinear thermal loading are carried out by presenting a Navier type solution. The thermal load is assumed to be nonlinear distribution through the thickness of FG nanobeam. Thermo-mechanical properties of FG nanobeam are supposed to vary smoothly and continuously throughout the thickness based on power-law model and the material properties are assumed to be temperature-dependent. Eringen's nonlocal elasticity theory is exploited to describe the size dependency of nanobeam. Using Hamilton's principle, the nonlocal equations of motion together with corresponding boundary conditions based on Timoshenko beam theory are obtained for the thermal buckling and vibration analysis of graded nanobeams including size effect. Moreover, in following a parametric study is accompanied to examine the effects of the several parameters such as nonlocal parameter, thermal effect, power law index and aspect ratio on the critical buckling temperatures and natural frequencies of the size-dependent FG nanobeams in detail. According to the numerical results, it is revealed that the proposed modeling can provide accurate frequency results of the FG nanobeams as compared some cases in the literature. Also, it is found that the small scale effects and nonlinear thermal loading have a significant effect on thermal stability and vibration characteristics of FG nanobeams.
UV Psc is a typical RS CVn type system undergoing dynamic chromosphere activity. We performed photometric observations of the system in 2015 and secured new BVR light curves showing well-defined photometric waves. In this paper, we analyzed the light curves using Wilson-Devinney binary code and investigated the orbital period of the system. The combination of our light curve synthesis with the spectroscopic solution developed by previous investigators yielded the absolute parameters as: $M_1=1.104{\pm}0.042M_{\odot}$, $R_1=1.165{\pm}0.025R_{\odot}$, and $L_1=1.361{\pm} 0.041L_{\odot}$ for the primary star, and $M_2=0.809{\pm}0.082M_{\odot}$, $R_2=0.858{\pm}0.018R_{\odot}$, and $L_2=0.339 {\pm}0.010L_{\odot}$ for the secondary star. The eclipse timing diagram for accurate CCD and photoelectric timings showed that the orbital period may vary either in a downward parabolic manner or a quasi-sinusoidal pattern. If the latter is adopted as a probable pattern for the period change, a more plausible account for the cyclic variation may be the light time effect caused by a circumbinary object rather than an Applegate-mechanism occurring via variable surface magnetic field strengths.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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