• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제18권9호
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• pp.1492-1495
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• 2008

Successful control of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, the causal agent of bacterial leaf streak, requires a specific and reliable diagnostic tool. A pathovar-specific PCR assay was developed for the rapid and accurate detection ofthe plant pathogenic bacterium Xanthomonas oryzae pv. oryzicola in diseased plant. Based on differences in a membrane fusion protein gene of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola and other microorganisms, which was generated from NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) and CMR (http://cmr.tigr.org/) BLAST searches, one pair of pathovar-specific primers, XOCMF/XOCMR, was synthesized. Primers XOCMF and XOCMR from a membrane fusion protein gene were used to amplity a 488-bp DNA fragment. The PCR product was only produced from 4 isolates of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola among 37 isolates of other pathovars and species of Xanthomonas, Pectobacterium, Pseudomonas, Burkholderia, Escherichia coli, and Fusarium oxysporum f.sp. dianthi. The results suggested that the assay detected the pathogen more rapidly and accurately than standard isolation methods.

• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 2004년도 Annual Meeting BioExibition International Symposium
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• pp.209-211
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• 2004

• 한국동물학회:학술대회논문집
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• 한국동물학회 1994년도 한국생물과학협회 학술발표대회
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• pp.248.2-248
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• 1994

• 유기물자원화
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• 제12권1호
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• pp.67-74
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• 2004

난지도 하수처리장내 슬러지로부터 페놀을 유일한 탄소 및 에너지원으로 이용하는 세균을 분리하여 그 특성을 조사하고 동정하였다. 본 세균은 그람 음성 구균으로 운동성을 가지며 페놀의 농도가 0.05%, 0.10%, 0.15%인 배지에서 성장을 보였으며, BBL Test를 실시한 결과 유사성을 가진 세균이 나타나지 않았다. 세균의 계통분류학적 분석을 위하여 세균의 염색체로부터 16s rDNA를 클로닝한 후 DNA 염기서열을 파악하고 이를 비교 및 분석한 결과 본 세균은 Proteobacteria의 Gamma (${\gamma}$) Subdivision에 속한 Xanthomonas Group의 Stenotrophomonas maltophilia strain과 99%의 유사성을 보이는 것으로 나타났다. 또한 Nitrogen-Fixing bacterium MAGDE3, Pseudomonas cissicola strain과는 98%의 상동성을, Stenotrophomonas sp. LMG 198, Xanthomonas cucurbitae과는 97%의 상동성을 보였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제6권4호
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• pp.265-269
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• 1996

An isolate of Streptomyces rochei synonym was found to produce antibiotics with narrow anti-microbial spectrum against Streptococcus and Xanthomonas sp. Among the antibiotic complex produced by the strain, the main active compound was isolated, and its physico-chemical properties and biological activities were investigated. Molecular weight of the compound was determined to be ${[M+H]}^+$ 797 (FAB-MS). UV, $^1H \;and\;^{13}C$ NMR, and IR spectra suggested that the compound is a kirromycin-like aurodox group antibiotic. However, the anti-microbial spectrum of the main compound was slightly different from that of kirromycin. In addition, it was newly found that kirromycin showed a selective anti-microbial activity against Streptococcus pyogenes and phytopathogenic Xanthomonas sp.

• The Plant Pathology Journal
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• 제38권5호
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• pp.490-502
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• 2022

Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) causes bacterial leaf blight (BLB) disease in rice (Oryza sativa L.) and it is among the most destructive pathogen responsible for severe yield losses. Potential bacterial biocontrol agents (BCAs) with plant growth promotion (PGP) abilities can be applied to better manage the BLB disease and increase crop yield, compared to current conventional practices. Thus, this study aimed to isolate, screen, and identify potential BCAs with PGP abilities. Isolation of the BCAs was performed from internal plant tissues and rhizosphere soil of healthy and Xoo-infected rice. A total of 18 bacterial strains were successfully screened for in vitro antagonistic ability against Xoo, siderophore production and PGP potentials. Among the bacterial strains, 3 endophytes, Bacillus sp. strain USML8, Bacillus sp. strain USML9, and Bacillus sp. strain USMR1 which were isolated from diseased plants harbored the BCA traits and significantly reduced leaf blight severity of rice. Simultaneously, the endophytic BCAs also possessed plant growth promoting traits and were able to enhance rice growth. Application of the selected endophytes (BCAs-PGP) at the early growth stage of rice exhibited potential in suppressing BLB disease and promoting rice growth.

• 미생물학회지
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• 제40권3호
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• pp.183-188
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• 2004

TNT 분해 세균 Stenotrophomonas sp. OK-5는 세 개의 다른 NAD(P)H-nitroreductase의 활성 fractions (NTR fractions I, II, III)을 갖고 있는 것으로 확인된 바 있다. 본 연구에서는 NTR fractions I, II, III에 대한 생리학적 특성과 분자생물학적 특성을 규명하고자 하였다. TNT에 대한 균주 OK-5의 NTR fractions I, II, 그리고 III의 활성은 억제 물질인 $\beta$-mercaptoethanol의 첨가 시에 효소의 활성 이 모두 억제되는 것으로 확인되었다. TNT와 그 유사 기질을 이용하여 균주 OK-5에서 분리된 NTR의 기질 특이성을 조사한 결과, nitrobenzene, 그리고 RDX에 대 해서는 비교적 활성 이 높게 나타났으나 2,6-DNT와 2,4-DNT에서는 낮은 활성을 나타내는 것으로 확인되었다. 균주 OK-5에서 정제된 NTR fraction I의 N-말단 아미노산 서 열은 $^1MSDLLNADAVVQLFRTARDS^20$로 분석되었고, Xanthomonas campestris의 NTR과 X. axonopodis의 NTR에서 각각 70%와 65%로 비교적 높은 유사성을 가지는 것으로 나타났다. 균주 OK-5의 NTR fraction I의 효소를 암호화하는 SmOK5nrI 유전자의 염기서열을 확인하고 분석된 유전자로부터 유추되는 아미노산 서열을 각각 비교한 결과 X. campestris의 NTR과 81%, X. axonopodis의 NTR과 75%,그리고 Streptomyces avermitilis의 NTR과 30%의 유사성이 있는 것으로 조사되었으나, Pseudomonas putida KT2440의 NTR (pnrB)과는 16%로 낮은 유사성이 있는 것으로 확인되었다.

• 생명과학회지
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• 제24권8호
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• pp.887-894
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• 2014

유기염소계 난분해성 산업폐수처리에 효과적인 미생물제제 개발을 위하여 PCP (pentachlorophenol)와 TCE (trichloroethylene) 등과 같은 유기계 염소화합물이 오염되어있는 토양 및 산업폐수로부터 PCP 분해활성이 높은 GP5, GP19와 TCE 분해활성이 높은 GA6, GA15를 분리하였다. 이들 분리균주 GP5, GP19, GA6, GA15등은 Acetobactor sp., Pseudomonas sp., Arthrobacer sp., Xanthomonas sp.과 유사한 것으로 나타나 최종적으로 Acetobacter sp. GP5, Pseudomonas sp. GP19, Arthrobacer sp. GA6, Xanthomoas sp. GA15로 명명하였다. 유기염소계 산업폐수의 처리를 위한 복합미생물제제 OC17은 PCP와 TCE를 분해하는 4개의 분리 분리균주와 방향족화합물 분해균주인 Acinetobacter sp. KN11, Neisseria sp. GN13의 배양액을 혼합하여 제조하였다. 복합미생물제제 OC17은 $2.8{\times}10^9CFU/g$의 균체수를 갖고 있으며, 밀도는 $0.299g/cm^3$, 수분함량은 26.8%를 나타내었다. 복합미생물 제제 OC17은 PCP 500 mg/l가 포함되어있는 인공폐수를 이용한 실험에서 배양 65시간에 87%의 분해효율을 나타내었고, TCE (300 uM)의 분해효율은 배양 50시간에 90%의 분해효율을 나타내었다. 복합미생물제제 OC17을 이용한 유기 염소계 산업폐수의 처리효율 시험을 위한 연속배양 실험 에서 10일간 처리 하였을 때 91%의 COD 제거효율을 나타내었다.

• 한국수산과학회지
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• 제31권5호
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• pp.760-766
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• 1998

암모니아 산화 미생물을 부산근교 하수처리장의 오니와 양어장 여과막에서 분리 동정하여 이들의 암모니아 산화성을 실험하였다. 독립영양성 암모니아 산화세균으로는 Nitrosomonas sp.를 분리. 동정하였고 종속 영양성균으로는 2종의 Bacillus sp., 2종의 Acinetobacter sp., 그리 고 Xanthomonas sp., Ajcaligenes sp., Pseudomonas sp., 그리고 Sphingobacterium sp.등의 8종을 분리하였다. 분리균주들의 암모니아 산화성을 실험하기 위하여서는 mineral salt medium에 $NH_4Cl$ 10mg/$\ell$를 첨가한 배지에서 $28^{\circ}C$, 15일 배양한 결과 Nitrosomonas sp.는 배양4일째부터 균수가 증가하면서 암모니아 산화와 아질산생성이 시작되어 15일 배양후에는 약 2mg/$\ell$의 암모니아성질소의 감소가 일어났고 동시에 0.023$\~$0.036mg/$\ell$의 아질산성 질소가 생성되었다. Heterotrophs 8균주는 균주에 따라 다소 차이는 있었으나 배양 15일 동안 균의 증식은 거의 일어나지 않았고 오히려 약간 감소하는 경향을 나타내었다. 그리고 암모니아 산화성도 낮아 0.02$\~$0.64mg/$\ell$ 정도 감소하였고 아질산성 질소의 생성량은 0.01$\~$0.51 mg/$\ell$ 정도이었다. 그러나 heterotrophs 83주를 mineral salt medium에 $NH_4Cl$ 10mg$\ell$과 glucose 50 mg/$\ell$를 첨가시키면 균증식도 좋아지고 암모니아 산화성도 증가하여 15일 배양 후에는 암모니아성질소는 1.12$\~$3.85 mg/$\ell$ 정도 감소하였다. $NH_4Cl$ 50mg/$\ell$과 glucose 5 g/$\ell$ 로 조절된 배지에서는 암모니아 산화성이 더욱 좋아져 15일 배양 후에 약 1$\~$20mg/$\ell$의 암모니아성 질소가 감소하였다.

• 식물병연구
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• 제12권1호
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• pp.51-54
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• 2006

4종류의 식물 추출 오일(마늘, 생강, 계피, 레몬그라스)에 대한 실내 항균효과를 5종의 식물병원세균과 4종의 식물병원진균에 대해 조사하였다. 4종의 오일중 마늘오일과 계피오일의 항균효과가 우수하였다. 특히, 마늘오일은 식물병원세균인 Agrobacterium tumefaciens, Erwinia carotovora, Ralstonia solanacearum, Xanthomonas campestris와 식물병원진균인 Phytophthora infestans, Fusarium oxysporum, Collectotricum sp.에 대해 강한 항균력을 나타내었다. 그러나, Acidovorax avenae와 Pythium sp.에 대해서는 항균효과가 없었다. 마늘오일의 오이 흰가루병(Sphaerotheca fusca)과 토마토 흰가루병(Erysiphe cichoracearum)에 대한 포장 방제효과 실험결과 각각 70.0-74.6%와 71.2%의 방제가를 나타내었다.