• 제목/요약/키워드: Virus detection

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굴로부터 오염된 폴리오바이러스 및 노로바이러스의 검출 (Simplified Procedure for Detection of Poliovirus and Norovirus in Oysters)

  • 하숙희;우건조;곽효선;황인균;최원상
    • 한국식품과학회지
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    • 제37권6호
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    • pp.1018-1023
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    • 2005
  • 굴로부터 오염된 바이러스를 농축하고 검출하는 방법이 개발되었다. 바이러스를 인위적으로 굴 추출물에 접종시킨 후 polyethylene glycol(PEG)로 침전시키고 chloroform 또는 Freon으로 추출한 후 다시 PEG로 침전시켜 바이러스를 농축하였다. 각 단계별로 회수되는 폴리오바이러스의 량을 plaque assay를 이용하여 측정한 결과 처음 접종한 바이러스의 16.4-26.0%가 회수됨을 알 수 있었다. 검출을 위해서는 농축된 바이러스를 TRlzol로 추출한 후 바이러스의 RNA를 희석하거나 silica gel membrane을 이용하여 capture한 후 RT-PCR로 확인할 수 있었다. 그러나 상추와 햄버거에서 RT-PCR 방해물질을 효과적으로 제거하는 $QIAshredder^{TM}$ Homogenizer는 굴에 존재하는 방해물질을 제거하지 못하였다. 식품에 오염된 바이러스 농축을 위해 Freon이 일반적으로 사용되나 chloroform으로 대체가 가능하였다. 검출한계에 있어 굴 전체의 추출물을 사용하는 것과 소화기만을 분리하여 사용하는 경우 차이가 없으므로 RT-PCR 방해물질이 굴 전체조직에 고루 분산되어 있다고 판단된다. nested PCR은 이 방법의 효율을 높여주었다. 전체적으로 이 방법을 사용하면 굴로부터 오염된 노로바이러스의 검출이 가능하다고 판단된다.

Ultra-sensitive HBsAg IRMA 키트의 민감도 및 변이형 검출능 평가 (The Assessment of Ultrasensitive HBsAg kit's Sensitivity level and Performance in Detection of Mutant Forms)

  • 하동혁;민경선;노경운;김현주
    • 핵의학기술
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    • 제15권1호
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    • pp.121-125
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    • 2011
  • 배경 : B형간염표면항원(HBsAg)은 B형간염의 진단에 있어 가장 중요한 혈청학적 지표 중 하나이다. HBsAg 검사에 대한임상검사실의 수요에 맞추어 자동화 장비 및 검사법이 계속 개발되어 왔다. 본 연구는 국내에 보급된 RIAKEY, BNIBT, RIAKEY Ultra Sensitive HBsAg, ROCHE 키트의 민감도 및 변이형 검출능과 CLIA법의 CENTAUR 장비와 RIAKEY Ultra Sensitive HBsAg의 상관계수를 알아보고자 하였다. 방법 : WHO $1^{st}$ International Standard 1985(80/549), WHO $2^{nd}$ International Standard 2003 (00/588) 표준물질 2개를 이용하여 농도별 0.08, 0.04, 0.02, 0.01, 0.005 IU/ml 까지 계단희석을 시행하였으며, Subtype ad 9종, Subtype ay 변이시료 1종을 이용하여 RIAKEY, BNIBT, RIAKEY Ultra Sensitive HBsAg, ROCHE 키트를 이용하여 시행하였다. 그리고, 아형 검출에 사용된 변이시료 10종에 대한 IRMA법의 RIAKEY Ultra Sensitive HBsAg와 CLIA법의 CENTAUR 장비를 이용한 상관계수를 비교하였다. 결과 : 표준물질의 농도별 측정 시 WHO 0.01 PANEL 에서 Index 1.0 이상의 결과 값을 얻었으며, 그 결과 민감도는 0.01 IU/ml로 측정되었다. RIAKEY Ultra sensitve HBsAg 키트가 민감도측면에서 우수함을 알 수 있었다. RIAKEY Ultra sensitve HBsAg IRMA 키트에서는 adw2 9종과 ayw1 1종의 변이형 형태에 따라 모두 Index 1.0 이상으로 혈청중의 HBsAg을 100% 측정할수 있었다. RIAKEY Ultra sensitive HBsAg와 CLIA의 결과가 Y=1.0075 X + 1.2434, $R^2$=0.9982으로 우수한 상관성을 보였다. 결론 : 4세대인 IRMA법의 Ultra Sensitive HBsAg 키트로 혈청중의 HBsAg과 여러 가지 아형을 신속하고 정확히 측정하여 질병을 진단 할 수 있을 것으로 여겨진다.

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방류용 수산종묘의 질병 관리에 대한 고찰 (Aquatic animal health management in stock enhancement)

  • 서장우;조미영;김진우;박경현;지보영;최동림;박명애;오명주
    • 한국어병학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.85-98
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    • 2010
  • 농림수산식품부와 국립수산과학원에서는 2009년도 방류 품종 (해면 품종 22종과 내수면 품종 11품종)을 대상으로 수산동물전염병의 감염 여부를 검사하였다. 총 12개 지방자치단체에 서 방류를 실시한 것으로 나타났으며, 이 중에서 경상남도, 전라남도, 제주도 및 충청남도는 해면 품종을 주로 방류하였으며, 경기도, 전라북도 및 충청북도는 내수면 품종을 많이 방류하는 것으로 나타났다. 검사품종중에서 해산품종으로는 전복이 24.5%로 가장 많았으며, 그 다음 해삼(15.2%), 넙치 (11.5%), 감성돔과 조피볼락(6.8%), 꽃게 (5.6%), 돌돔 (5.1%), 볼락 (4.6%), 붉은쏨뱅이 (4.5%)로 나타났다. 내수면 품종 중에서는 붕어가 19.4%로 가장 많았으며, 그 다음으로 뱀장어 (17.0%), 동자개 (12.3%), 다슬기 (12.0%), 메기 (8.4)의 순으로 검사 실적이 많았다. 총 33종의 품종을 대상으로 1,080회의 검사가 의뢰되었으며, 검사항목별로 2,066건의 검사를 실시한 결과 19건에서 red sea bream iridovirus (RSIV), koi herpesvirus (KHV) 또는 white spot syndrome virus (WSSV)와 같은 병원체가 검출되어 불합격 처리되었다.

담수관상어 5종에서의 iridoviruses 검출과 분포 분석 (Detection and distribution of iridoviruses in five freshwater ornamental fish species)

  • 정현도;류지효;정준범;김호열;전려진;조혜진;이준우
    • 한국어병학회지
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    • 제19권3호
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    • pp.197-206
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    • 2006
  • 2004~2005년까지 수입산 pearl gourami (Trichogaster leeri), dwarf gourami (Colisa lalia), silver gourami (Trichogaster microlepis), blue gourami (Trichogaster trichopterus sumatranus) 그리고 freshwater angelfish (Pterophyllum scalare) 등 5 어종을 대상으로 iridovirus 감염 실태를 PCR 방법을 사용하여 조사하였다. 채집한 56 samples 중 11 samples에서 PCR 양성 반응이 관찰되었고, pearl gourami에서 31.8% (7/22)로 가장 높은 감염 빈도를 나타내었다. 그 다음으로 dwarf gourami, blue gourami, silver gourami 순으로 나타났으며, freshwater angelfish에서는 iridovirus가 검출되지 않았다. 자연 감염된 관상어종의 비장으로부터 iridovirus의 핵산을 분리하여 검출한계 PCR 방법으로 viral DNA의 양을 비교하였으며, dwarf gourami에 비해 pearl gourami에서 더 많은 viral DNA가 검출되는 것을 확인하였다. 자연 감염이 확인된 pearl gourami groups는 실험실 환경에서 100% 폐사하였고, 폐사어 중 57% 이상이 PCR 양성 반응을 나타내었다. PstⅠfragment의 염기서열 비교에서 pearl gourami와 dwarf gourami에서 분리한 iridoviruses는 중국의 mandarinfish (Siniperca chuatsi)에서 분리된 infectious spleen and kidney necrosis virus (ISKNV)와 99% 이상의 매우 높은 상동성을 나타내었다.

Histiocytic necrotizing lymphadenitis에서 HHV6과 EBV의 검출 (Detection of HHV6 and EBV in histiocytic necrotizing lymphadenitis)

  • 박경희;박성식;김지연;박수은
    • Clinical and Experimental Pediatrics
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    • 제51권9호
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    • pp.987-991
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    • 2008
  • 목 적 : Kikuchi-Fujimoto disease는 histiocytic necrotizing lymphadenitis라고도 불리는 질환으로 발열과 경부 림프절염을 특징으로 하며 자연 호전되는 경과를 보이는 질환이다. 원인에 대해서는 아직 잘 밝혀지지 않았다. 자연 호전되는 경과 등은 이 질환의 원인으로 바이러스 감염을 추측하게 되고, 고려되는 바이러스로는 대표적으로 EBV, HHV6, HHV8, CMV 등이 있다. 본 연구는 그 중에서 EBV, HHV6를 선택하여 HNL와의 연관성을 밝히고자 하였다. 방 법 : 1999년에서 2005년 사이 부산대학교 병원에서 조직검사에서 KFD으로 진단된 환자 51명을 대상으로 나이, 성별, 발열기간, 침범된 림프절 등에 대하여 의무기록지를 바탕으로 후향적으로 분석하였고 이들의 조직을 이용하여 EBV에 대한 ISH을 시행하고, HHV6에 대한 면역조직화학염색을 각각 시행하였다. 결 과 : 대상환자는 남자가 24명, 여자가 27명이었고 평균 연령은 25.9세였다. EBV에 대한 ISH에서 양성을 나타낸 환자는 51명 중에서 8명으로 15.7%였으며 HHV6에 대한 면역조직화학염색에서 양성을 나타낸 환자는 15명으로 29.4%였다. EBV의 경우 혈청검사(VCA IgG와 VCA IgM)가 같이 시행된 경우가 23명이었고 이중 한 명에서 EBV VCA IgM이 양성이면서 EBV ISH에서도 양성이었다. 결 론 : 본 연구는 HNL의 원인으로서 EBV와 HHV6의 역할을 증명하지 못하였으나, 드물게 HNL의 원인으로 바이러스 감염이 관여할 것으로 추측된다.

세가지 효소면역측정 시약을 이용한 C형 간염 바이러스 항체 검사의 비교 (Comparison of Three Third-Generation Anti-HCV Enzyme Immunoassay Tests)

  • 조희순;문진영;이채훈;김경동
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제15권1호
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    • pp.143-150
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    • 1998
  • 3세대 EIA를 이용한 anti-HCV 검사는 2세대 EIA에 비해 예민도와 특이도가 향상되었으나, 여전히 제조회사간에 서로 상이한 결과를 보이는 경우가 많았다. 저자들은 국산 3세대 anti-HCV 검사 시약인 LG HCD 3.0과 기존 영남대학교 의과대학 부속병원에서 사용하고 있는 Axsym HCV version 3.0, Cobas Core anti-HCV EIA와 비교하였다. Cobas 키트가 분별력과 민감도는 높았으나 상대적으로 위양성률이 높은 경향을 보였다. LG 키트는 희석 검체에서 1례를 제외하고는 1:160까지 양성을 보였으며, 다른 두 종의 anti-HCV 키트와 우수한 일치율을 보였으나, 다른 두 키트에 비해 비교적 분별력이 낮아 양성의 50%에서 S/C가 5이하의 값을 보였다. 위양성을 보인 검체의 S/C는 1에서 4사이이고, 위음성을 보인 1례에서는 0.91로 나타나 S/C가 0.8에서 4사이인 경우 면역블로팅검사로 확인할 필요가 있다고 생각되므로 검체의 양성율과 사용목적을 고려하여 시약을 선정하여야 할 것이다.

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구내 재발성 아프타성 궤양 환자에서 타액내 바이러스 검출 및 단백질의 변화 (Detection of Viruses and Changes of Protein of Saliva in Patients with Recurrent Aphthous Ulcer)

  • 박상배;김병국;배정식
    • Journal of Oral Medicine and Pain
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    • 제24권2호
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    • pp.125-135
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    • 1999
  • This study was performed to discover the underlining influences of Herpes Simplex virus (HSV) and Varicella Zoster virus (VZV), to detect the changes of whole protein and mucin level and to observe protein profiles in the saliva when recurrent aphthous ulcer (RAU) was present. Unstimulated whole saliva was collected from 23 patients who for over three years had a clinical history of RAU, in a group of 10 women and 13 men, ranging from 11 to 72 years of age, and 20 healthy subjects, in a group of 8 women and 12 men, who did not have the symptoms nor a past history of RAU. Through the means of Polymerization Chain Reaction, genomic DNA from the HSV and VZV was purified from the saliva samples for identifying precisely the two types of viruses, and the level of whole protein and sialic acids in the saliva and the ratio of sialic acid to whole protein were measured, and SDS-polyacrylamide gel electrophoresis was performed. The results obtained were as follows ; 1. 39.13% of patients showed 224 bp bands of VZV DNA, those were appeared more in patients than in control group (p<0.01), but there was no significant difference between patients and control group in HSV DNA (p>0.05). 2. The concentration of whole protein in men patients was lower than in men control group (p<0.05), but there were no significant differences between patients and control in other groups (p>0.05). 3. The concentration of sialic acids from patients was lower than control group in all groups (p<0.05). 4. The concentration of sialic acids in proportion to that of whole protein was lower in patients than in control group (p<0.05), and in the two women groups (p<0.01), but no noticeable difference was found between the two men groups (p>0.05). 5. There were no consistent differences observed in the protein profiles of patients with control group except that certain protein bands near 50 kDa was lower in patients than in control group. These results suggest that viruses such as HSV and VZV and reduction of salivary whole protein and mucin levels are related to development of RAU.

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계절 인플루엔자 진단에서 신속항원검사의 유용성 (The Efficacy of Rapid Antigen Tests for Detection of Seasonal Influenza Virus)

  • 이준열;이솔;김한성;김광남
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제24권1호
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    • pp.31-36
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    • 2017
  • 목적: 본 연구에서는 인플루엔자 신속항원검사의 유용성을 확인해보고, 결과의 정확도에 영향을 주는 인자를 알아보고자 한다. 방법: 2011년 6월 1일부터 2016년 5월 31일까지 5년간 한림대학교 성심병원의 소아청소년과 외래와 응급실을 통해 내원한 인플루엔자 의사환자를 대상으로 하였다. 이들 중 입원하여 PCR검사를 같이 진행한 798검체의 검사 결과를 비교하였다. 결과: PCR검사를 표준으로 신속항원검사의 양성 일치율은 A형 인플루엔자에서 75.7%, B형 인플루엔자에서 60.0%였다. 발열 시작일로부터 4일 이내에 내원하여 검사를 진행한 경우 양성 일치율은 A형 인플루엔자 77.6%, B형 인플루엔자 73.2%였으나, 5일 이상 경과 후 검사를 진행한 경우 양성 일치율은 A형 인플루엔자 66.7%, B형 인플루엔자 21.4%였다. 결론: 신속항원검사의 민감도는 상대적으로 낮으므로, 인플루엔자 진단에 적용하기 위해서 증상 발현 후 5일 이내 빠르게 채취한 검체에서 상대적으로 높은 민감도 해석이 가능하다.

Saccharomyces cerevisiae 표면 발현을 이용한 붉바리 신경괴사 바이러스 외피단백질의 생산 (Production of Red-spotted Grouper Nervous Necrosis Virus (RGNNV) Capsid Protein Using Saccharomyces cerevisiae Surface Display)

  • 박미례;서승석;황진익;김동균;박종범;정영재;이택견
    • 생명과학회지
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    • 제24권9호
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    • pp.995-1000
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    • 2014
  • 바이러스 분리 및 검출 측면에서의 해양바이러스 연구는 높은 빈도의 돌연변이와 유전적 다양성 때문에 한계가 있어 왔다. 현재 해양바이러스를 검출하기 위해 사용되고 있는 방법 중 ELISA를 기반으로 하는 혈청학적 방법이 가장 보편적이다. 혈청학적 방법은 항체의 질과 고도로 정제된 정확한 항원을 요구한다. 최근에 바이러스 외피단백질을 항원으로 이용하고자하는 새로운 실험시스템이 yeast surface display (YSD)를 사용하여 개발되었다. 이 연구에서는 붉바리 신경괴사 바이러스(RGNNV)의 외피단백질 유전자를 YSD와 HA-tagging 시스템을 이용하여 발현시키고 정제하였다. 2개의 RGNNV 외피단백질 유전자 조각(RGNNV1 및 RGNNV2)을 염기서열 데이터베이스에 기초하여 합성하였고, 효모 발현 벡터인 pCTCON로 클로닝하였다. 효모 strain EBY100에서의 RGNNV 외피단백질의 발현은 발현벡터에 의해 코드되는 C-말단의 c-myc tags를 인지하는 형광표지된 항체를 이용하여 flow cytometry로 검출되었다. 발현된 RGNNV 외피단백질은 ${\beta}$-mercaptoethanol 처리 후 Aga1과 Aga2 사이의 이황화결합 절단에 의해 효모표면으로부터 분리되었다. Anti-HA 항체를 사용한 Western blots을 수행하였을 때 각 RGNNV 외피단백질이 정해진 크기에서 검출되는 것이 확인되었다. 이러한 결과는 YSD와 HA-tagging 시스템이 재조합 RGNNV 외피단백질의 발현과 정제에 적용가능함을 나타낸다.

신종인플루엔자 폐렴환자에서 임상적 악화와 연관된 초기 전산화 단층촬영 소견 (Chest CT Parameters to Predict the Major Adverse Events in Acute Submassive Pulmonary Embolism)

  • 유승목;김원영;이충욱;손창환;서동우;이윤선;이재호;오범진;김원;임경수
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제69권2호
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    • pp.103-107
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    • 2010
  • Background: The aim of the present study was to evaluate whether findings on initial chest computed tomography (CT) of influenza pneumonia can help predict clinical outcome. Methods: We reviewed all adult patients admitted to the Emergency Department (ED) with a confirmed diagnosis of novel influenza A H1N1 virus (2009 H1N1) pneumonia, who underwent chest CT upon admission between Aug 26, 2009 and Jan 31, 2010. Radiologic findings were characterized by type and pattern of opacities and zonal distribution. Clinical outcome measures were intensive care unit (ICU) admission, mechanical ventilation, and inhospital death. Results: Of 59 patients diagnosed with 2009 H1N1 pneumonia, 41 (69.5%) underwent chest CT on admission into ED. Nine (22%) of these patients developed adverse clinical outcomes requiring the following treatments: 9 (22.0%) ICU admissions, 5 (12.2%) mechanical ventilation, and 3 (7.3%) inhospital deaths. Counting the number of patients with more than 4 involved lobes, the sensitivity, specificity, positive predictive value, and negative predictive value for detection of adverse clinical outcome were 67%, 84%, 55% and 80%, respectively. Conclusion: Extensive involvement of both lungs (over 4 lobes) is related to ICU admission, mechanical ventilation, and inhospital death. Initial chest CT may help predict an adverse clinical outcome of patients with 2009 H1N1 influenza pneumonia.