• 제목/요약/키워드: Vector shift

검색결과 131건 처리시간 0.023초

단백질 서열정렬 정확도 예측을 위한 새로운 방법 (A new method to predict the protein sequence alignment quality)

  • 이민호;정찬석;김동섭
    • Bioinformatics and Biosystems
    • /
    • 제1권1호
    • /
    • pp.82-87
    • /
    • 2006
  • 현재 가장 많이 사용되는 단백질 구조 예측 방법은 비교 모델링 (comparative modeling) 방법이다. 비교 모델링 방법에서의 정확도를 높이기 위해서는 alignment의 정확도 역시 매우 필수적으로 필요하다. 비교 모델링 과정 중의 fold-recognition 단계에서 alignment의 정확도에 의해 template을 고르는 방법은 단지 가장 비슷한 template을 선택하는 방법에 비해 주목을 받지 못하고 있다. 최근에는 두 가지의 alignment에 사이의 shift 정보를 바탕으로 한 shift score라는 수치가 alignment의 성능을 표현하기 위해서 개발되었다. 우리는 더 정확한 구조 예측의 첫걸음이 될 수 있는 shift score를 예측하는 방법을 개발하였다. Shift score를 예측하기 위해 support vector regression (SVR)이 사용되었다. 사전에 구축된 라이브러리 안의 길이가 n 인 template과 구조를 알고 싶은 query 단백질 사이의 alignment는 n+2 차원의 input 벡터로 변환된다. Structural alignment가 가장 좋은 alignment로 가정되었고 SVR은 query 단백질과 template 단백질의 structural alignment과 profile-profile alignment 사이의 shift score를 예측하도록 training 되었다. 예측 정확도는 Pearson 상관계수로 측정되었다. Training 된 SVR은 실제의 shift score와 예측된 shift score 사이에 0.80의 Pearson 상관계수를 갖는 정도로 예측하였다.

  • PDF

연속항공영상에서의 상대적 편이 추정에 관한 연구 (A study on the estimation of relative shift from aerial image sequences)

  • 황윤식;이쾌회
    • 대한전기학회:학술대회논문집
    • /
    • 대한전기학회 1991년도 하계학술대회 논문집
    • /
    • pp.825-828
    • /
    • 1991
  • This paper addresses estimation of the relative shift vector from aerial image sequences. We perform similarity function tests and decide the most appropriate similarity function for the visual navigation system using aerial images. Finally, we propose the maximum variance reference line selection method for reducing the estimation error of the shift vector.

  • PDF

불균일 이산 구속조건을 만족시키는 곡면 모델의 변형 방법 (A Method for Modifying a Surface Model with Nonuniform Scattered Constraint Points)

  • 김성환;송성재
    • 한국CDE학회논문집
    • /
    • 제12권1호
    • /
    • pp.58-73
    • /
    • 2007
  • This paper described a method for the construction of a surface through a set of nonuniform scattered points. When the shift vectors of some points as constraints on the original surface are given, those of the other points should be computed to make the new surface. To keep up the look-see and smoothness with the original surfaces, the proper relationship should be formulated between the shifts of the constraint points and those of the other points. Vector fields for 3 dimensional shift of a point on the surface are made based in the constraint shifts. Vector fields for 3 dimensional shift of a point on the surface are made based on the constraint shifts. Multilevel B-spline approximation technique was used to construct the vector field. The technique uses coarse-to-fine hierarchy of control lattices. The developed method was applied to shoe sole design system especially for grading. Using this system, a shoe sole can be modified effectively.

Iris Recognition Based on a Shift-Invariant Wavelet Transform

  • Cho, Seongwon;Kim, Jaemin
    • International Journal of Fuzzy Logic and Intelligent Systems
    • /
    • 제4권3호
    • /
    • pp.322-326
    • /
    • 2004
  • This paper describes a new iris recognition method based on a shift-invariant wavelet sub-images. For the feature representation, we first preprocess an iris image for the compensation of the variation of the iris and for the easy implementation of the wavelet transform. Then, we decompose the preprocessed iris image into multiple subband images using a shift-invariant wavelet transform. For feature representation, we select a set of subband images, which have rich information for the classification of various iris patterns and robust to noises. In order to reduce the size of the feature vector, we quantize. each pixel of subband images using the Lloyd-Max quantization method Each feature element is represented by one of quantization levels, and a set of these feature element is the feature vector. When the quantization is very coarse, the quantized level does not have much information about the image pixel value. Therefore, we define a new similarity measure based on mutual information between two features. With this similarity measure, the size of the feature vector can be reduced without much degradation of performance. Experimentally, we show that the proposed method produced superb performance in iris recognition.

ON THE CYCLICTY OF ADJOINTS OF WEIGHTED SHIFTS

  • YOUSEFI, B.;TAGHAVI, M.
    • 호남수학학술지
    • /
    • 제26권2호
    • /
    • pp.147-153
    • /
    • 2004
  • We provide some sufficient conditions for the adjoint of a unilateral weighted shift operator on a Hilbert space to be cyclic.

  • PDF

Support Vector Regression에 기반한 전력 수요 예측 (Electricity Demand Forecasting based on Support Vector Regression)

  • 이형로;신현정
    • 산업공학
    • /
    • 제24권4호
    • /
    • pp.351-361
    • /
    • 2011
  • Forecasting of electricity demand have difficulty in adapting to abrupt weather changes along with a radical shift in major regional and global climates. This has lead to increasing attention to research on the immediate and accurate forecasting model. Technically, this implies that a model requires only a few input variables all of which are easily obtainable, and its predictive performance is comparable with other competing models. To meet the ends, this paper presents an energy demand forecasting model that uses the variable selection or extraction methods of data mining to select only relevant input variables, and employs support vector regression method for accurate prediction. Also, it proposes a novel performance measure for time-series prediction, shift index, followed by description on preprocessing procedure. A comparative evaluation of the proposed method with other representative data mining models such as an auto-regression model, an artificial neural network model, an ordinary support vector regression model was carried out for obtaining the forecast of monthly electricity demand from 2000 to 2008 based on data provided by Korea Energy Economics Institute. Among the models tested, the proposed method was shown promising results than others.

평균 이동 알고리즘 기반의 지지 벡터 영역 표현 방법 (Support Vector Data Description using Mean Shift Clustering)

  • 장형진;김표재;최정환;최진영
    • 대한전기학회:학술대회논문집
    • /
    • 대한전기학회 2007년도 심포지엄 논문집 정보 및 제어부문
    • /
    • pp.307-309
    • /
    • 2007
  • SVDD의 scale prob1em을 해결하기 위하여, 학습 데이터를 sub-groupings하여 group 단위로 SVDD를 통해 학습함으로써 학습 시간을 줄이는, K-means clustering을 이용한 SVDD 방범(KMSVDD)이 제안되었다. 하지만 KMSVDD는 K-means clustering 알고리즘의 본질상 최적의 K값을 정하기 힘들다는 문제와, 동일한 데이터를 학습할지라도 clustered group이 램덤하게 형성되기 때문에 매번 학습의 결과가 달라지는 문제점이 있었다. 또한 데이터의 분포 상태와 관계없이 무조건 타원(dlliptic) 형태의 K개의 cluster로 나누기 때문에 각각의 나눠진 cluster들은 데이터 분포에 대한 특징을 나타내기 힘들게 된다. 이러한 문제점을 해결하기 위하여 본 논문에서는 데이터 분포에서 mode를 먼저 찾은 후 이 mode를 기준으로 clustering하는 Mean Shift clustering 방법을 이용한 SVDD를 제안하고자 한다. 제안된 알고리즘은 KMSVDD와 비교해 데이터 학습 속도에서는 큰 차이가 없으면서도 데이터의 분포 상태를 고려한 형태로 clustering 한 sub-group을 학습하므로 학습의 정확도가 일정하게 되며, 각각의 cluster는 데이터 분표의 특징을 포함하는 효과가 있다. 또한 Mean Shift Kernel의 bandwidth의 결정은 K-Means의 K와는 달리 어느 정도 여유를 갖고 결정되어도 학습 결과에는 차이가 없다. 다양한 데이터들을 이용한 모의실험을 통하여 위의 내용들을 검증하도록 한다.

  • PDF

Optimal SVM learning method based on adaptive sparse sampling and granularity shift factor

  • Wen, Hui;Jia, Dongshun;Liu, Zhiqiang;Xu, Hang;Hao, Guangtao
    • KSII Transactions on Internet and Information Systems (TIIS)
    • /
    • 제16권4호
    • /
    • pp.1110-1127
    • /
    • 2022
  • To improve the training efficiency and generalization performance of a support vector machine (SVM) in a large-scale set, an optimal SVM learning method based on adaptive sparse sampling and the granularity shift factor is presented. The proposed method combines sampling optimization with learner optimization. First, an adaptive sparse sampling method based on the potential function density clustering is designed to adaptively obtain sparse sampling samples, which can achieve a reduction in the training sample set and effectively approximate the spatial structure distribution of the original sample set. A granularity shift factor method is then constructed to optimize the SVM decision hyperplane, which fully considers the neighborhood information of each granularity region in the sparse sampling set. Experiments on an artificial dataset and three benchmark datasets show that the proposed method can achieve a relatively higher training efficiency, as well as ensure a good generalization performance of the learner. Finally, the effectiveness of the proposed method is verified.

WiBro 시스템을 위한 고속 LDPC 인코더 설계 (Fast Multi-Rate LDPC Encoder Architecture for WiBro System)

  • 김정기;발라카난;이문호
    • 대한전자공학회논문지TC
    • /
    • 제45권7호
    • /
    • pp.1-8
    • /
    • 2008
  • Low Density Parity Check codes(LDPC)는 최근 우수한 성능으로 통신 분야에서 채널 코딩의 중요한 블록으로 주목받고 있다. 그리하여 Wibro를 포함한 여러 표준에서 LDPC 부호를 채널 코딩으로 채택하고 있다. 이러한 LDPC 부호의 Encoder를 구현하는데 있어서의 약점은 기존의 이진 Matrix Vector Multiplier가 throughput의 감소의 원인이 되는 clock cycle이 많다는 것이다. 본 논문은 표준에서 사용되는 H 행렬이 Circulant Permutation Matrix(CPM)로 정의되어 있다는 점을 이용하여 인코더의 구현에 있어서 기존의 Matrix Vector Multiplier 대신에 cyclic shift register와 exclusive-OR을 사용하는 설계구조를 제안한다. 또한, 제안한 구조를 이용하여 WiBro에 포함되는 다양한 부호율에 적용가능한 인코더를 설계하였다. 제안된 WiBro LDPC의 인코더는 기존보다 적은 clock cycle을 가지므로 높은 throughput에 도달한다.

잡음과 스펙트럼 이동에 강인한 CNN 기반 라만 분광 알고리즘 (CNN based Raman Spectroscopy Algorithm That is Robust to Noise and Spectral Shift)

  • 박재현;유형근;이창식;장동의;박동조;남현우;박병황
    • 한국군사과학기술학회지
    • /
    • 제24권3호
    • /
    • pp.264-271
    • /
    • 2021
  • Raman spectroscopy is an equipment that is widely used for classifying chemicals in chemical defense operations. However, the classification performance of Raman spectrum may deteriorate due to dark current noise, background noise, spectral shift by vibration of equipment, spectral shift by pressure change, etc. In this paper, we compare the classification accuracy of various machine learning algorithms including k-nearest neighbor, decision tree, linear discriminant analysis, linear support vector machine, nonlinear support vector machine, and convolutional neural network under noisy and spectral shifted conditions. Experimental results show that convolutional neural network maintains a high classification accuracy of over 95 % despite noise and spectral shift. This implies that convolutional neural network can be an ideal classification algorithm in a real combat situation where there is a lot of noise and spectral shift.