Kwon, Soo Jeong;Roy, Swapan Kumar;Yoo, Jang-Hawan;Cho, Seong-Woo;Kim, Hag Hyun;Boo, Hee Ock;Woo, Sun-Hee
Proceedings of the Korean Society of Crop Science Conference
/
2017.06a
/
pp.123-123
/
2017
In spite of the potential medicinal significance and a wide range of pharmacologic properties of Platycodon grandiflorum, the molecular mechanism of its roots is still unknown. The present study was conducted to profile proteins from 3, 4 and 5 months aged diploid and tetraploid roots of Platycodon grandiflorum using high throughput proteome approach. Two-dimensional gels stained with CBB, a total of 68 differential expressed proteins were identified from the diploid root out of 767 protein spots using image analysis by Progenesis SameSpot software. Out of total differential expressed spots, 29 differential expressed protein spots (${\geq}2-fold$) were analyzed using LTQ-FTICR MS whereas a total of 24 protein spots were up-regulated and 5 protein spots were down-regulated. On the contrary, in the case of tetraploid root, a total of 86 differential expressed proteins were identified from tetraploid root out of 1033 protein spots of which a total of 39 differential expressed protein spots (${\geq}2-fold$) were analyzed using LTQ-FTICR MS whereas a total of 21 protein spots were up-regulated and a total of 18 protein spots were down-regulated. It was revealed that the identified proteins from the explants were mainly associated with the nucleotide binding, oxidoreductase activity, transferase activity. Taken together, the identified proteins may be helpful to identify key candidate proteins for genetic improvement of plants.
Jang, Sei-Heon;Hwang, Si Ae;Kim, Mijin;Yun, Sung-Hae;Kim, Moon-Sook;Karnik, Sadashiva S.;Lee, ChangWoo
Molecules and Cells
/
v.28
no.1
/
pp.25-30
/
2009
${\beta}$-Arrestins turn off G protein-mediated signals and initiate distinct G protein-independent signaling pathways. We previously demonstrated that angiotensin $AT_1$ receptorbound ${\beta}$-arrestin 1 is cleaved after $Phe^{388}$ upon angiotensin II stimulation. The mechanism and signaling pathway of angiotensin II-induced ${\beta}$-arrestin cleavage remain largely unknown. Here, we show that protein Tyr phosphatase activity is involved in the regulation of ${\beta}$-arrestin 1 cleavage. Tagging of green fluorescent protein (GFP) either to the N-terminus or C-terminus of ${\beta}$-arrestin 1 induced conformational changes and the cleavage of ${\beta}$-arrestin 1 without angiotensin $AT_1$ receptor activation. Orthovanadate and molybdate, inhibitors of protein Tyr phosphatase, attenuated the cleavage of C-terminal GFP-tagged ${\beta}$-arrestin 1 in vitro. The inhibitory effects of okadaic acid and pyrophosphate, which are inhibitors of protein Ser/Thr phosphatase, were less than those of protein Tyr phosphatase inhibitors. Cell-permeable pervanadate inhibited angiotensin II-induced cleavage of ${\beta}$-arrestin 1 in COS-1 cells. Our findings suggest that Tyr phosphorylation signaling is involved in the regulation of angiotensin II-induced ${\beta}$-arrestin cleavage.
Nitric oxide (NO) produced from endothelial cells plays a critical role in vascular physiology. The regulation of endothelial NO synthase (eNOS) involves various mechanisms including multiple Ser/Thr phosphorylations. Recently, eNOS-Ser617 was newly recognized to be phosphorylated in response to humoral factors including vascular endothelial growth factor. However, it remains unknown whether and how eNOS-Ser617 phosphorylation is stimulated by shear stress, the primary stimulus of endothelial NO production. This issue was explored in the present study using cultured bovine aortic endothelial cells (BAECs). Over-expression of a constitutively active protein kinase B(Akt) mutant in BAECs increased Ser617 phosphorylation while constitutively active protein kinase A mutant had no effect. When BAECs were subjected to an arterial level of laminar shear stress, eNOS-Ser617 phosphorylation was clearly increased in a time-dependent manner. Shear stress also stimulated Akt phosphorylation at Thr308, one of the key regulatory sites. The time courses of eNOS-Ser617 and Akt-Thr308 phosphorylations appeared to be very similar. These results suggested that eNOS-Ser617 phosphorylation, mediated by Akt, is a physiological response to the mechanical shear stress, involved in the regulation of NO production in endothelial cells.
Background: Inorganic arsenic is a human carcinogen that can target the liver, but its carcinogenic mechanisms are still unknown. Inorganic arsenic induces a spectrum of tumors including hepatocellular carcinoma in mice. Methods: Pregnant C3H mice were supplied with drinking water containing 50 ppm sodium arsenite during their pregnancy. The protein expression profile in the liver of 0.5-day-old. male offsprings exposed transplacentally to sodium arsenite was analyzed using protein 2D gel electrophoresis followed by mass spectrometry (MALDI-TOF). Results: Expression of proteins such as hydroxymethylglutaryl-CoA synthase mitochondrial precursor (HMG-CoA synthase), ${\beta}$-actin (cytoplasmic 1) and apolipoprotein A-IV precursor (Apo-AIV) were induced in mouse liver by sodium arsenite, while uricase (urate oxidase), guanine nucleotidebinding protein beta subunit 2-like 1 (RACK1) and fructose-bisphosphate aldolase B (Aldolase 2) were down-regulated. Summary: Expression of proteins that have been implicated in carcinogenesis, such as HMG-CoA, ${\beta}$-actin, and RACK1, was regulated in the liver of mice transplacentally exposed to inorganic arsenic.
Human genome projects have enabled whole genome mapping and improved our understanding of the genes in humans. However, many unknown genes remain to be functionally characterized. In this study, we characterized human chromosome 4 open reading frame 34 gene (hC4orf34). hC4orf34 was highly conserved from invertebrate to mammalian cells and ubiquitously expressed in the organs of mice, including the heart and brain. Interestingly, hC4orf34 is a novel ER-resident, type I transmembrane protein. Mutant analysis showed that the transmembrane domain (TMD) of hC4orf34 was involved in ER retention. Overall, our results indicate that hC4orf34 is an ER-resident type I transmembrane protein, and might play a role in ER functions including $Ca^{2+}$ homeostasis and ER stress.
Plant phytochromes, molecular light switches that regulate various aspects of plant growth and development, are known as autophosphorylating serine/threonine kinases. Although recent studies reveal that phytochrome autophosphorylation plays an important role in the regulation of phytochrome signaling through the control of phyA protein stability, the in vivo functional roles of phytochrome kinase activity in plant light signaling are largely unknown. Thus, it is necessary to investigate the detailed function of phytochrome as a protein kinase, which might include mapping of kinase domain on the phytochrome molecule, searching for substrates that could be phosphorylated by phyA, and in vivo functional analysis of the kinase activity with phytochrome mutants displaying reduced kinase activity. Our recent studies reveal that the kinase activity of phytochrome plays a positive role in plant light signaling. Therefore, we highlight the current knowledge about the functional roles of phytochrome kinase activity in the light signal transduction of plants, based on our recent results.
One of the cryptic plasmids from the oil degrading bacterium Klebsiella sp. KCL-2, the small plasmid pGD2, has been identified and characterized. This plasmid has a size of 3.6 kb with unknown functions. We constructed the recombinant plasmid pMGD2. The nucleotide sequences of the plasmid were determined and two open reading frames were detected. ORF1 encodes a replication initiator protein (RepA), which has a high degree of homology with the protein of ColE2 plasmid. The product encoded by ORF2 showed a high similarity with the transposase protein of IS5. IS5 is 1195 by long and contains an inverted terminal repetition of 16 bp with one mismatch. Stem-loop structures in the 5'untranslated region of the repA suggest that a putative gene, incA, is located in a complementary strand to the leader region of the repA mRNA.
In order to investigate what kind of response anaerobic bifidobacteria has on oxygen stress, five oxygen-tolerant bifidobacteria were isolated from human fecal samples. All were temporarily identified as Bifidobacterium longum through an analysis of carbohydrate utilization patterns and cellular fatty acid profiles. In the presence of oxygen, the lag phase became extended and the cell growth was suppressed. Bifidobacterial cell was able to remove dissolved oxygen in an early stage of growth and to overcome oxygen stress to a certain extent. The cell became long n size and showed a rough surface containing many nodes which were derived from abnormal or incomplete cell division. Cellular fatty acid profiled changed remarkably under a partially aerobic condition, so that the carbon chain of cellular fatty acid became short. All the dimethyl acetals originated from plasmalogen were reduced, any cyclopropane fatty acid, 9, 10-methyleneoctadecanoic acid ($C_{19:0}cyc9,10$), was increased remarkably. Oxygen stress induced a 5.5 kD protein in B. longum JI 1 of the oxygen-teolerant bifidobacteria, that was named Osp protein, and its N-terminal amino acid sequence was as follows: unknown amino acid-Thr-Gly-Val-Arg-Phe-Ser-Asp-Asp-Glu. Therefore, the oxygen-tolerant bifidobacteria seemed to defend against oxygen stress byincreasing the content of short fatty acid and cyclopropane fatty acid, and induction of an oxygen stress protein, but not the plasmalogen.
G protein-coupled receptor(GPCR) family is a cell membrane protein, and plays an important role in a signaling mechanism which transmits external signals through cell membranes into cells. Now, it is estimated that there may be about 800-1000 GPCRs in a human genome. But, GPCRs each are known to have various complex control mechanisms and very unique signaling mechanisms. GPCRs are involved in maintaining homeostasis of various human systems including an endocrine system or a neural system and thus, disorders in activity control of GPCRs are thought to be the major source of cardiovascular disorders, metabolic disorders, degenerative disorders, carcinogenesis and the like. As more than 60% of currently marketed therapeutic agents target GPCRs, the GPCR field has been actively explored in the pharmaceutical industry. Structural features, and class and subfamily of GPCRs are well known by function, and accordingly, the most fundamental work in studies identifying the previous GPCRs is to classify the GPCRs with given protein sequences. Studies for classifying previously identified GPCRs more easily with mathematical models have been mainly going on. Considering that secondary sequences of proteins, namely, secondary binding structures of amino acids constituting proteins are closely related to functions, the present paper does not place the focus on primary sequences of proteins as previously practiced, but instead, proposes a method to transform primary sequences into secondary structures and compare the secondary structures, and then detect an unknown GPCR assumed to have a same function in databases of previously identified GPCRs.
Adipocytes have been known to secrete a number of important proteins called adipokines with roles in energy metabolism, reproduction, cardiovascular function and immunity. In this study we have attempted to identify intensively secretory proteins from 3T3-L1 adipocytes. 3T3-L1 preadipocytes were differentiated into mature adipocytes and then the cells were left in serum-free medium. The supernatant was filtrated and dialyzed. Lyophilized secretome was fractionated by two different methods, 1-D SDS PAGE and RP-FPLC. The tryptic peptides from the gel slices and the FPLC fractions were analyzed by nanoLC/ESI-MS/MS. We identified a total of 303 identical proteins from two methods, 251 proteins from 1-D gel and 184 proteins from RP-FPLC. 86 of them were listed as a secretory protein Finally, we identified many known or unknown secreted proteins existed in the low level including adiponectin, angiotensinogen, bone morphogenetic protein-1 (BMP-1), macrophage migration inhibitory factor (MIF), insulin like growth factor-II (IGF-II), interleukin-6 (IL-6), follistatin-related protein-1, minecan, and resistin. The existence of some of secreted proteins has been confirmed in RNA level. This proteomic experiment is useful for the intensive screening of secretory proteins in many kinds of other cells.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.