Phospholipase D2 (PLD2) has been implicated in the tyrosine kinase-mediated signaling pathways, but the regulation events are yet to be identified. Herein, we demonstrate that pleckstrin homology (PH) domain of PLD2 (PLD2-PH) exerts an antitumorigenic effect via the suppression of PLD2 and focal adhesion kinase (FAK). The kinase domain of FAK interacts with PLD2-PH and induces tyrosine phosphorylation and activation of PLD2. Furthermore, PLD2 increased tyrosine phosphorylation of FAK. However, ectopic expression of the PLD2-PH competes for binding to FAK and reduces the interaction between PLD2 and FAK, thereby suppressing FAK-induced PLD activation and tyrosine phosphorylation of FAK. The PLD2-PH suppressed the migration and invasion of glioblastoma cells, as well as tumor formation in a xenograft mouse model. This study uncovers a novel role of PLD2-PH as a negative regulator of PLD2 and FAK.
Protein tyrosine kinases (PTKs) play a central role in the modulation of a wide variety of cellular events such as differentiation, proliferation and metabolism, and their unregulated activation can lead to various diseases including cancer and diabetes. PTKs represent a diverse family of proteins including both receptor tyrosine kinases (RTKs) and non-receptor tyrosine kinases (NRTKs). Due to the diversity and important cellular roles of PTKs, accurate classification methods are required to better understand and differentiate different PTKs. In addition, PTKs have become important targets for drugs, providing a further need to develop novel methods to accurately classify this set of important biological molecules. Here, we introduce a novel statistical model for the classification of PTKs that is based on their structural features. The approach allows for both the recognition of PTKs and the classification of RTKs into their subfamilies. This novel approach had an overall accuracy of 98.5% for the identification of PTKs, and 99.3% for the classification of RTKs.
It has been known that activation of tyrosine kinases is involved in signal transduction. Role of the tyrosine kinase in vascular smooth muscle contraction was examined in deoxycorticosterone acetate (DOCA)-salt hypertensive rats. Male Sprague-Dawley rats underwent uninephrectomy, one week after which they were subcutaneously implanted with DOCA (200 mg/kg) and supplied with 1% NaCl and 0.2% KCl drinking water for $4{\sim}6$ weeks. Control rats were treated the same except for that no DOCA was implanted. Helical strips of carotid arteries were mounted in organ baths for measurement of isometric force development. Genistein was used as a tyrosine kinase inhibitor. Concentration-response curves to 5-hydroxytryptamine (5-HT) shifted to the right by genistein in both DOCA-salt hypertensive and control rats. Although the sensitivity to genistein was similar between the two groups, the maximum force generation by 5-HT was less inhibited by genistein in arteries from DOCA-salt hypertensive rats than in those from controls. Genistein-induced relaxations were attenuated in arteries from DOCA-salt rats. Genistein affected the contraction to phorbol 12, 13-dibutyrate (PDBu) neither in DOCA-salt nor in control arteries. These observations suggest that tyrosine kinase is involved in 5-HT-induced vascular contraction, of which role is reduced in DOCA-salt hypertension.
Park, Hye-Jee;Park, Chang-Jin;Bae, Nahee;Han, Sang-Wook
The Plant Pathology Journal
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제32권3호
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pp.266-272
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2016
A bacterial tyrosine sulfotransferase, RaxST, is required for activation of rice XA21-mediated immunity, and it catalyzes sulfation of tyrosine residues of Omp1X and RaxX in Xanthomonas oryzae pv. oryzae, a causal agent of bacterial blight in rice. Although RaxST is biochemically well-characterized, biological functions of tyrosine sulfation have not been fully elucidated. We compared protein expression patterns between the wildtype and a raxST knockout mutant using shotgun proteomic analysis. Forty nine proteins displayed a more than 1.5-fold difference in their expression between the wildtype and the mutant strains. Clusters of orthologous groups analysis revealed that proteins involved in cell motility were most abundant, and phenotypic observation also showed that the twitching motility of the mutant was dramatically changed. These results indicate that tyrosine sulfation by RaxST is essential for Xoo movement, and they provide new insights into the biological roles of RaxST in cellular processes.
We will investigate the bonding configurations of phenylalanine and tyrosine adsorbed on the Ge(100) surface using CLPES and DFT calculations. First, the C 1s, N 1s, and O 1s spectra obtained at 300 K revealed that both the amine and carboxyl groups of phenylalanine and tyrosine concurrently participated in adsorption on the Ge(100) surface without bond breaking using CLPES, depending on the extent of coverage. In the second place, we confirmed that the "O-H dissociated-N dative bonded structure" is the most stable structure implying kinetically favorable structure, and the "O-H dissociation bonded structure" is another stable structure manifesting thermodynamically advantageous structure using DFT calculations. This tendency turns up both phenylalanine and tyrosine, similarly. Furthermore, through the CLPES data and DFT calculation data, we discovered that the "O-H dissociated-N dative bonded structure" and the "O-H dissociation bonded structure" are preferred at 0.30 ML and 0.60 ML, respectively. Moreover, we found that the phenyl ring of phenylalanine is located in axial position to Ge(100) surface, but the phenyl ring of tyrosine is located in parallel to Ge(100) surface using DFT calculations.
Choi, Hye-Ryung;Kim, Won Kon;Kim, Eun Young;Jung, Hyeyun;Kim, Jeong-Hoon;Han, Baek-Soo;You, Kwan-Hee;Lee, Sang Chul;Bae, Kwang-Hee
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제22권7호
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pp.1029-1033
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2012
A number of evidence have been accumulated that the regulation of reversible tyrosine phosphorylation, which can be regulated by the combinatorial activity of protein tyrosine kinases (PTKs) and protein tyrosine phosphatases (PTPs), plays crucial roles in various biological processes including differentiation. There are a total of 107 PTP genes in the human genome, collectively referred to as the "PTPome." In this study, we performed PTP profiling analysis of the HIB-1B cell line, a brown preadipocyte cell line, during brown adipogenesis. Through RT-PCR and real-time PCR, several PTPs showing differential expression pattern during brown adipogenesis were identified. In the case of PTP-RE, it was shown to decrease significantly until 4 days after brown adipogenic differentiation, followed by a dramatic increase at 6 days. The overexpression of PTP-RE led to decreased brown adipogenic differentiation via reducing the tyrosine phosphorylation of the insulin receptor, indicating that PTP-RE functions as a negative regulator at the early stage of brown adipogenesis.
티로신 및 방향족 아미노산 유도체의 생물학적 합성에 이용되는 유용 효소인 tyrosine phenol-lyase(TPL) 활성을 평판배지에서 정량적으로 감지할 수 있는 기술을 개발하였다. 불투명 평판배지(turbid plate)의 제조과정은 먼저, 2 N염산과 DMSO로 조성된 공용매에 난용성 티로신을 400 mM 농도로 녹여서 배지에 가하고, 온도를 조절하여 니들형 티로신을 형성하도록 결정화를 유도하는 것이었다. 니들형 티로신은 일반적인 컬럼형에 비하여 약 $5{\sim}6$배 낮은 농도인 3.6g/L에서도 불투명 평판배지를 제조할 수 있었으며, 효소활성에 의하여 쉽게 분해되고, TPL활성의 고감도 고속탐색기술 개발에 적합하였다. 이 불투명 평판배지에 변이유발PCR법으로 제조한 TPL 라이브러리를 도말하고, 단일 콜로니 주변에서 형성되는 투명환의 크기와 실측한 TPL활성을 비교한 결과 직접적인 비례관계가 있음을 확인하였다. 따라서 난용성 물질의 미세입자를 평판배지에서 직접 발생시킨 후, 효소활성에 의한 투명환의 형성을 정량 관찰하는 본 연구의 방법은 신규 고활성 TPL의 분리 및 방향성 분자진화 등을 위한 고속탐색기술에 유용하게 사용될 수 있다.
20종의 아미노산 성분들에서의 염소 소독부산물 생성 특성을 조사한 결과, 단위 DOC당 THM 생성능은 Br 첨가 유무에 관계없이 tryptophan과 tyrosine에서 높게 나타났고 나머지 18종에서는 매우 낮은 생성능을 나타내었다. 단위 DOC당 HAA 생성능 조사결과, tryptophan, tyrosine, asparagine, aspartic acid 및 histidine에서 Br 첨가 유무에 관계없이 높은 생성능을 보였으며, asparagine, aspartic acid 및 histidine은 DCAA 생성능 조사결과, aspartic acid, histidine, asparagine, tyrosine 및 tryptophan에서 Br 첨가 유무에 관계없이 높은 생성능을 나타내었으며, aspartic acid는 660.2 ${\mu}$g/mg으로 나타나 다른 아미노산 성분들에 비해 월등히 높은 HAN 생성능을 나타내었으며, 반응성이 높은 6종의 아미노산 성분에서 생성되는 HAN 구성종의 대부분은 DCAN으로 나타났다. 단위 DOC당 chloral hydrate 와 chloropicrin의 생성능을 조사결과에서 chloral hydrate는 asparagine, aspartic acid, histidine, methionine, tryptophan 및 tyrosine에서 생성능이 높은 것으로 나타났고, chloropicrin의 경우는 20종의 아미노산에서 전체적으로 1${\mu}$g/mg 이하의 아주 낮은 생성능을 보였다. 아미노산의 작용기별 소독부산물 생성 특성은 THM의 경우 방향족(aromatic) 화합물인 tryptophan과 tyrosine에 반응성이 높았고, HAA는 aromatic, neutral, acidic, basic 순으로 반응성을 보였으며, HAN은 acidic, basic, neutral, aromatic 순으로 반응성을 나타내어 방향족 화합물보다 지방족 화합물이며 친수성인 물질에서 반응성이 더 높은 것으로 나타났다.
정자의 원형질막은 삼투압에 의해서 영향을 받는다고 보고되고 있다. 이중 세포막내 분자구조의 변화 특히 막지질 구조의 변화와 동반되는 이온채널의 변화 그리고 $Ca^{2+}$과 HCO$^{-}_{3}$의 유동성과도 밀접한 관련이 있는 것으로 보고되고 있다. 지금까지의 연구보고에 의하면, 정자의 첨체반웅 (acrosome reaction)이 일어날 경우 protein tyrosine phosphorylation이 증가되는데 이것은 cAMP, protein kinase A 둥을 통하여 작용되는 것으로 보고되고 있다. 막의 지질변화를 유도하는 물질로 일종의 sterol acceptor인 BSA가 알려져 있는 바, 실제로 BSA가 막지질 성분에 미치는 영향을 관찰한 결과 cholesterol이 유출되고 이온 둥의 유동성 변화가 일어나, 이 유동성 변화가 정자의 adenylyl cyclase를 활성화시켜 cAMP를 증가시키고, PKA가 활성화되어 결과적으로 protein tyrosine phosphorylation이 유도된다고 보는 것이다. 첨체반응과 protein tyrosine phosphorylation과는 밀접한 관계가 있는 것으로 사료되고 있다. 본 연구는 정자 원형질막에서 cholesterol이 유출되어 protein tyrosine phosphorylation이 유도될 때, BSA와 같은 sterol acceptor가 작용할 것이라는 전제하에, 고삼투압 하에서 탈수로 인해 원형질막이 위축되더라도 sterol acceptor가 존재한다면 막지질 성분의 구조적 변화가 억제될 수 있을 것이라는 가설을 설정하였다. 실험결과, 저온 및 고삼투압 하에서 정자운동은 감소되지만 원형질막의 구조적 변화는 없고, 삼투압에 대한 반응정도는 원형질막을 통한 수분이동과 세포공적 변화에 따라 비례적으로 일어난다고 하는 사실을 발견하였다. 이 결과는 정자보존에 있어서 저온변화에 영향을 미치는 여러 인자들 특히 protein tyrosine phosphorylation의 증가와 밀접한 관계가 있음을 시시해 준다. 또한 sterol acceptor로 알려진 BSA는 삼투압이 변화되더라도 역시 중요한 인자로 작용할 수 있음을 알 수 있었으며, 특히 고삼투압으로의 변화는 cAMP와 protein kinase A를 거치는 신호전달과정에 있어서 중요한 요인이라는 사실을 확인할 수 있었다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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