Hepatitis B viral infection which affect about 10% of Korean population manifests asymptomatic carrier, chronic hepatitis and liver cirrhosis and even associates with hepatocellular carcinoma. Clinical manifestations induced by hepatitis B virus vary depending on the degree of immune response by cytotoxic T cells against viral epitope-presenting liver cells. Since hepatitis B virus presents high rate of mutaton that might change the presented epitope and eventually alter immune response, viral mutations, especially in promoters and enhancers, have an important implication in hepatic inflammation and viral replication. To identify mutations related to the hepatic inflammation, we investigated sequence variations of hepatitis B viral promotor regions in the presence or absence of symptoms in hepatitis B carriers. For this, sera from persistently hepatitis B virus-infected mother-child pairs were collected. After PCR amplifiation of all hepatitis B viral promoters (C promoter, S1 promoter, S2/S promoter, X promoter) using serum DNA from each pair, viral promotors were sequenced by automatic sequencer and then sequence data were analyzed by ClustalW. In most cases, the dominant type of maternal virus was transmitted to the child. However, in some children, some new host specific viral variants could be observed in Cp, S1p and S2/Sp. The mutations in C promoter did not seem to be vertically transmitted but arose in new host independently after the wild type had been transmitted. Enhancer I containing X promoter revealed high host specific variations as has been reported before. Two S promoters, S1p and S2/Sp, have shown some point mutations in children, but no deletion mutations were detected as in chronic hepatitis patients in whom deletion mutations are frequently found. In conclusion, the children with the vertically transmitted hepatitis B virus mostly retain the dominant type virus that had been transmitted. However, host specific variants tended to accumulate over time, possibly as clinical symptoms develop.
Shin, Ju Yeop;Kang, Sung Hoon;Ma, Hye Joon;Kwon, Ik Hwan;Yang, Seung Pil;Jung, Hyun Chul;Hong, Chung Ki;Kim, Kyeong Suk
Journal of the Korean Society for Nondestructive Testing
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v.36
no.1
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pp.18-26
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2016
The semiconductor industry is one of the key industries of Korea, which has continued growing at a steady annual growth rate. Important technology for the semiconductor industry is high integration of devices. This is to increase the memory capacity for unit area, of which key is photolithography. The photolithography refers to a technique for printing the shadow of light lit on the mask surface on to wafer, which is the most important process in a semiconductor manufacturing process. In this study, the width and step-height of wafers patterned through this process were measured to ensure uniformity. The widths and inter-plate heights of the specimens patterned using photolithography were measured using transmissive digital holography. A transmissive digital holographic interferometer was configured, and nine arbitrary points were set on the specimens as measured points. The measurement of each point was compared with the measurements performed using a commercial device called scanning electron microscope (SEM) and Alpha Step. Transmission digital holography requires a short measurement time, which is an advantage compared to other techniques. Furthermore, it uses magnification lenses, allowing the flexibility of changing between high and low magnifications. The test results confirmed that transmissive digital holography is a useful technique for measuring patterns printed using photolithography.
We studied the green synthesis and antibacterial activity of chitosan-silver (Ag) nanocomposite films for application in food packaging. Green synthesis of Ag nanoparticles (AgNPs) was achieved by a chemical reaction involving a mixture of chitosan-silver nitrate ($AgNO_3$) in an autoclave at 0.1 MPa, $121^{\circ}C$, for 15-120 s. The formation of AgNPs in chitosan was confirmed by both UV-Visible spectrophotometry and transmission electron microscopy (TEM) and the effects of chitosan-$AgNO_3$ concentration and reaction time on the synthesis of AgNPs in chitosan were examined. The resulting chitosan-Ag composite films were characterized by various analytical techniques and their antibacterial activity was evaluated based on the formation of halo zones around films, indicating inhibition of the growth of Escherichia coli. A fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy analysis showed that free amino groups in chitosan acted as effective reductants and AgNP stabilizers. The composite films exhibited enhanced antibacterial activity with increasing Ag content on the surface of as-prepared composite films.
We previously monitored nervous necrosis virus (NNV) in brain samples of artificially produced walleye Pollock (Gadus chalcogrammus) seedlings, with a low prevalence (1.8%, 1/55) but no clinical symptoms. Given that this virus is considered one of the most serious viral threats for almost all marine aquaculture fish species and characterized by both vertical and horizontal transmission, it would be interesting to monitor NNV in the fertilized eggs as well. We collected fertilized walleye pollock eggs from the farms located in Goseong during January to March, 2017. Approximately 50 mg of eggs were periodically taken from 4 each different batches, and 37 different pooled sample sets in total were made during sampling period. RNA was extracted from the eggs by using Trizol and cDNA was synthesized for RT-PCR for detecting NNV. Primers and PCR conditions are the same as previously described. As a result, NNV was not detected from any of the sample sets by one step PCR (0%, 0/37), suggesting NNV may not be a threat in walleye pollock aquaculture in Korea at present time. However, continuous monitoring for NNV should be conducted because introducing a new species into aquaculture industry involves potentials of disease outbreak and NNV is already known to cause outbreaks in gadoid fishes.
There has been proposed many simplification algorithms for effectively decreasing large-volumed polygonal surface data. These algorithms apply their own cost function for collapse to one of fundamental simplification unit, such as vertex, edge and triangle, and minimize the simplification error occurred in each simplification steps. Most of cost functions adopted in existing works use the error estimation method based on distance optimization. Unfortunately, it is hard to define the local characteristics of surface data using distance factor alone, which is basically scalar component. Therefore, the algorithms cannot preserve the characteristic features in surface areas with high curvature and, consequently, loss the detailed shape of original mesh in high simplification ratio. In this paper, we consider the vector component, such as surface orientation, as one of factors for cost function. The surface orientation is independent upon scalar component, distance value. This means that we can reconsider whether or not to preserve them as the amount of vector component, although they are elements with low scalar values. In addition, we develop a simplification algorithm based on half-edge collapse manner, which use the proposed cost function as the criterion for removing elements. In half-edge collapse, using one of endpoints in the edge represents a new vertex after collapse operation. The approach is memory efficient and effectively applicable to the rendering system requiring real-time transmission of large-volumed surface data.
실시간 멀티미디어 응용의 등장으로 멀티캐스트와 QoS(Quality of Service) 지원이 필수적인 망 서비스로 부각되고 있다. 이에, ATM 기반의 인터넷에서 IP 멀티캐스트의 효율적인 처리를 위하여 MARS(Multicast Address Resolution Server)가 제안되었고, 기존의 최선 서비스 기반의 인터넷에서 QoS(Quality of Service)를 지원하기 위하여 RSVP(Resource Reservation Protocol)가 제안되었다. 본 논문에서는 ATM 망에서 QoS가 지원되는 IP 멀티캐스트 서비스를 제공하기 위하여 MARS 구조에서 RSVP를 지원하는 두 가지 방안을 제안하고, 시뮬레이션을 통하여 그 성능을 분석하였다. 제안하는 두 가지 방법은 각각 'RSVP 전 홉 노드 방식'과 'MARS 서버 방식'이라 명명하였다. RSVP 전 홉 노드 방식은 송신원으로부터 ATM 망으로 진입하는 노드와 수신원을 향하여 ATM 망을 진출하는 노드 간에 각각 일대일 양방향 VC를 설정하여 멀티캐스트 그룹에 속하는 수신원들이 보내는 자원 예약 메시지를 ATM 망에서 전송하는 방안이다. MARS 서버 방식은 ATM 망을 진출하는 노드와 MARS 서버간에 MARS 제어 메시지 교환을 위해 존재하는 ATM VC를 사용하여 RSVP의 자원 예약 메시지를 전송하고, MARS 서버가 RSVP 자원 예약 메시지를 처리하도록 그 기능을 확장함으로써 ATM 망에서 필요로 하는 제어 VC 수를 절약할 수 있는 방안이다. 시뮬레이션을 통하여, MARS 서버 방식은 ATM 제어 VC의 수를 절약할 수 있을 뿐 아니라 경우에 따라 RSVP 자원 예약 메시지 전달 지연을 줄일 수도 있음을 볼 수 있었다. 그러나, MARS 클러스터 내에 동시에 존재하는 RSVP 흐름이 많을 때에는 MARS 서버 방식의 경우 MARS 서버에서의 병목 현상으로 인해 성능이 저하될 수 있다.Abstract Emerging real time multimedia applications require multicast service with a QoS(Quality of Service) support. An overlay service architecture MARS(Multicast Address Resolution Server) is proposed to support IP multicast over an ATM network, and a resource reservation protocol RSVP is proposed to provide QoS support in the Internet which is originally based upon best effort service only. In this paper, we propose two schemes to support IP multicast service with QoS support over ATM networks: 'RSVP Previous Hop Node(RPHN) scheme' and 'MARS server based scheme'. In RPHN scheme, the RSVP reservation messages are transported via one-to-one ATM control VC from the egress nodes to the ingress nodes of the the multicast flow set up between each pair of nodes. The RSVP message processing occurs at the ingress nodes of the multicast flow. Whereas, in the MARS server based scheme, the RSVP reservation messages are transported via the MARS control VCs between the egress nodes and the MARS server. The RSVP message processing burden is imposed at MARS server in this scheme. For MARS server based scheme, no additional ATM VC is required for RSVP reservation message transmission, while the processing burden at the MARS server is high. Simulation results show that the MARS server based scheme, may accomplish RSVP reservation message delivery with smaller delay as well as saving of the number of ATM VCs. When the number of simultaneous RSVP flows in the MARS cluster is large, however, MARS based scheme may suffer performance degradation since MARS server becomes a performance bottleneck.
In this paper, we propose a practical TCP friendly rate control scheme that considers the minimum channel bandwidth of the network when transporting SVC (scalable video coding) video over IP netowrks such as Internet. RTP and RTCP is mainly designed for use with UDP (User Datagram Protocol) for real-time video transport over the Internet. TCP-friendly rate control was proposed to satisfy the demands of multimedia applications while being reasonably fair when competing for bandwidth with conventional TCP applications. However the rate control model of the conventional TCP-friendly rate control scheme does not consider the minimum channel bandwidth of the network. Thus the estimated channel bandwidth by the conventional rate control model might be quite different from the real channel bandwidth when the packet loss ratio of the network is very large. In this paper, we propose a modified TCP-friendly rate control scheme that considers the minimum channel bandwidth of the network. Based on the modified TCP-friendly rate control, we assign the minimum channel bandwidth to the base layer bitstream of SVC video, and remaining available bandwidth is allocated to the enhancement layer of SVC video for the TCP friendly scalable video transmission. It is shown by simulations that the modified TCP-friendly rate control scheme can be effectively used for a wider range of controlled bit rates depending on the packet loss ratio than the conventional TCP-friendly control scheme. Furthermore, the effectiveness of the proposed scheme in terms of objective video quality is proved by comparing PSNR performance with the conventional scheme.
Background: Biogenic fabrication of silver nanoparticles from naturally occurring biomaterials provides an alternative, eco-friendly and cost-effective means of obtaining nanoparticles. It is a favourite pursuit of all scientists and has gained popularity because it prevents the environment from pollution. Our main objective to take up this project is to fabricate silver nanoparticles from lichen, Usnea longissima and explore their properties. In the present study, we report a benign method of biosynthesis of silver nanoparticles from aqueous-ethanolic extract of Usnea longissima and their characterization by ultraviolet-visible (UV-vis), Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy, transmission electron microscopy (TEM) and scanning electron microscopy (SEM) analyses. Silver nanoparticles thus obtained were tested for antimicrobial activity against gram positive bacteria and gram negative bacteria. Results: Formation of silver nanoparticles was confirmed by the appearance of an absorption band at 400 nm in the UV-vis spectrum of the colloidal solution containing both the nanoparticles and U. longissima extract. Poly(ethylene glycol) coated silver nanoparticles showed additional absorption peaks at 424 and 450 nm. FTIR spectrum showed the involvement of amines, usnic acids, phenols, aldehydes and ketones in the reduction of silver ions to silver nanoparticles. Morphological studies showed three types of nanoparticles with an abundance of spherical shaped silver nanoparticles of 9.40-11.23 nm. Their average hydrodynamic diameter is 437.1 nm. Results of in vitro antibacterial activity of silver nanoparticles against Staphylococcus aureus, Streptococcus mutans, Streptococcus pyrogenes, Streptococcus viridans, Corynebacterium xerosis, Corynebacterium diphtheriae (gram positive bacteria) and Escherichia coli, Klebsiella pneuomoniae and Pseudomonas aeruginosa (gram negative bacteria) showed that it was effective against tested bacterial strains. However, S. mutans, C. diphtheriae and P. aeruginosa were resistant to silver nanoparticles. Conclusion: Lichens are rarely exploited for the fabrication of silver nanoparticles. In the present work the lichen acts as reducing as well as capping agent. They can therefore, be used to synthesize metal nanoparticles and their size may be controlled by monitoring the concentration of extract and metal ions. Since they are antibacterial they may be used for the treatment of bacterial infections in man and animal. They can also be used in purification of water, in soaps and medicine. Their sustained release may be achieved by coating them with a suitable polymer. Silver nanoparticles fabricated from edible U. longissima are free from toxic chemicals and therefore they can be safely used in medicine and medical devices. These silver nanoparticles were stable for weeks therefore they can be stored for longer duration of time without decomposition.
Kim, Jun-Sang;Kim, Chang-Hyeon;Lee, Won-Joo;Jeon, Chang-Ho
Journal of the Korea Society of Computer and Information
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v.19
no.11
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pp.9-15
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2014
In this paper, We propose a block reallocation algorithm for reducing network traffic in Hadoop cluster. The scheduler of Hadoop cluster receives a job from users. And the job is divided into multiple tasks assigned to nodes. At this time, the scheduler allocates the task to the node that satisfied data locality. If a task is assigned to the node that does not have the data(block) to be processed, the task is processed after the data transmission from another node. There is difference of workload among nodes because blocks in cluster have different access frequency. Therefore, the proposed algorithm relocates blocks according to the task allocation pattern of Hadoop scheduler. Eventually, workload of nodes are leveled, and the case of the task processing in a node that does not have the block to be processing is reduced. Thus, the network traffic of the cluster is also reduced. We evaluate the proposed block reallocation algorithm by a simulation. The simulation result shows maximum 23.3% reduction of network consumption than default delay scheduling for jobs processing.
This paper is about a physical layer frame security technique using OFB-style encryption/decryption with AES algorithms on Gigabit Ethernet network. We propose a data security technique at the physical layer that performs OFB-style encryption/decryption with AES algorithm with strong security strength when sending and receiving data over Gigabit Ethernet network. Generally, when operating Gigabit Ethernet network, there is no security features, but data security is required, additional devices that apply this technique can be installed to perform security functions. In the case of data transmission over Gigabit Ethernet network, the Ethernet frames conform to IEEE 802.3 specification, which includes several fields to ensure proper reception of data at the receiving node in addition to the data field. When encrypting, only the data field should be encrypted and transmitted in real time. In this paper, we show that only the data field of the IEEE802.3 frame is encrypted and transmitted on the sending node, and only the data field is decrypted to show the plain text on the receiving node, which shows that the encryption/decryption is carried out correctly. Therefore, additional installation of devices that apply this technique can increase the reliability of the system when security for data is required in Ethernet network operating without security features.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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