• 제목/요약/키워드: Transaldolase

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고추 탄저병균의 포자 발아 단계 발현 유전자 동정 (Identification of Genes Expressed during Conidial Germination of the Pepper Anthracnose Pathogen, Colletotrichum acutatum)

  • 김정환;이종환;최우봉
    • 생명과학회지
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    • 제23권1호
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    • pp.8-14
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    • 2013
  • 고추 탄저병균의 포자 발아 단계에서 발현되는 유전자를 파악하기 위해 포자 발아단계cDNA library를 제작하고, 임의로 선택된 cDNA clone들에 대한 EST sequencing을 실시하였다. 총 983개 EST를 확보하여 contig assembly를 실시한 결과, 197개 contigs와 267개 singletons으로 조합되어, 최종적으로 464개의 유전자를 동정하였다. 464개 유전자 서열에서 유추한 아미노산 서열을 이용한 상동유전자 검색을 통해 절반의 유전자가 GenBank에 기존 등록된 유전자와 유의성 있는 유사성을 보였다. 가장 높은 빈도로 발현된 유전자는 elongation factor, histone protein, ATP synthease, 14-3-3 protein, clock controlled protein을 암호화하는 유전자들이었다. 그리고 고추 탄저병균의 세포 발달과정에 관여 하는것으로 추정되는 GTP-binding protein, MAP kinase, transaldolase, ABC transporter 유전자들도 검출되었다. 또한 고추탄저병균의 병원성에 영향을 미치는 것으로 파악되는 ATP citrate lyase, CAP20, manganese-superoxide dismutase 유전자들도 검출되어, EST sequencing 을 통한 세포 발달 단계 발현 유전자 탐색이 효과적임을 알 수 있었다.

Methylovorus sp. strain SS1 DSM 11726의 메탄올 대사와 세포외 다당류 생합성 (Metanol Metabolism and Extracellular Polysaccharide Biosynthesis in Methylovorus sp. strain SS1 DSM 11726)

  • 김재성;김시욱;김영민
    • 미생물학회지
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    • 제34권4호
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    • pp.207-211
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    • 1998
  • 메탄올을 이용하여 성장하는 Methylovorus sp. strain SS1은 formaldehyde의 산화를 위한 linear route의 주효소인 $NAD^+$-linked formaldehyde dehydrogenase 및 $NAD^+$-linked formate dehydrogenas와 cyclic route의 주효소인 hexulose-6-phosphate synthase, glucose-6-phosphate isomerae, glucose-6-phosphate dehydrogenase, 6-phosphogluconate dehydrogenase 등의 활성을 나타내었는데, cyclic route에 관여하는 효소의 활성이 상대적으로 더 높았다. 이 세균은 formaldehyde의 동화와 관련된 ribulose monophosphate 경로의 주효소와 Entner-Doudoroff 경로의 주효소 및 transaldolase 활성과 함께 세포외 다당류 합성과 관련된 phosphoglucomutase, UDP-glucose pyrophyosphorylase, mannose-6-phosphate isomerase의 활성도 나타내었다. 2.3 mM의 ammonium sulfate가 포함된 배지에서 성장한 세균은 7.6 mM의 ammonium sulfate가 포함된 배지에서 성장한 세균보다 더 많은 세포외 다당류를 생산하였지만 균체 수율은 낮았고, 6-phosphogluconate dehydrogenase와 phosphoglucomutase 및 UDP-glucose pyrophoshorylase의 활성은 높게 나타내었으나 6-phosphogluconate dehydratase/2-keto-3-deoxy-6-phosphogluconate aldolase의 활성은 낮았다.

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Analysis of Differential-expressed Proteins of Acidithiobacillus ferrooxidans Grown under Phosphate Starvation

  • He, Zhiguo;Zhong, Hui;Hu, Yuehua;Xiao, Shengmu;Liu, Jiarshe;Xu, Jin;Li, Guiyuen
    • BMB Reports
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    • 제38권5호
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    • pp.545-549
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    • 2005
  • Acidithiobacillus ferrooxidans is one of the most important bacterium used in bioleaching, and can utilize $Fe^{2+}$ or sulphide as energy source. Growth curves for Acidithiobacillus ferrooxidans under phosphate starvation and normal condition have been tested, showing lag, logarithmic, stationary and aging phases as seen in other bacteria. The logarithmic phases were from 10 to 32 hours for Acidithiobacillus ferrooxidans cultivated with normal cultivating condition and from 20 to 60 hrs for Acidithiobacillus ferrooxidans cultivated phosphate starvation. Differences of protein patterns of Acidithiobacillus ferrooxidans growing in case of normal or phosphate starvation were separately investigated after cultivation at $30^{\circ}C$ by the analysis of two-dimensional gel electrophoresis (2-DE), matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI)-Mass spectrometry. There were total 6 protein spots identified, which were Recombination protein recA, RNA helicase, AP2 domain-containing transcription factor, NADH dehydrogenase I chain D, Hyothetical protein PF1669, and Transaldolase STY3758. From the 6 identified protein spots, 3 proteins were found to be decreased in expression at the cultivating condition of phosphate starvation, while another three upregulated.