• 환경생물
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• 제24권2호
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• pp.172-178
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• 2006

골재채취가 수층의 세균군집구조에 미치는 영향을 알아보기 위해 낙동강 중류, 골재채취가 이루어 지지 않은 수역인 구미대교와 장기간에 걸쳐 연속적으로 골재채취가 행해지는 지역인 성주군 소학리 (성주대교 인근)에서 $\alpha\;\beta\;\gamma-subclass$ proteobacteria, Cytophaga-Flavobacterium (CF) group 세균군과 황산염화원세균을 FISH법으로 정량분석하였다. 아울러 수온, pH, EC, 엽록소-$\alpha$ 양 등의 이화학적인 환경요인도 측정하였다. DAPI로 염색된 세균수로 측정한 총세균수의 경우, 두 정점간의 괄목할 만한 양적인 차이는 없었으나 그 시간차에 따른 변동이 골재채취 수역에서 더욱 심했다. 또한 높은 엽록소-$\alpha$ 양을 나타낸 골재채취 수역에서 검출한 CF group 세균군과 황산염환원세균이 총세균수에서 차지하는 비율이 비골재채취 수역에 비해 높았다. 이같은 결과는 저니질이 수층으로 재유입되었기 때문으로 판단된다. 그러나 본 연구에서 검출한 세균군이 총세균수에서 차지하는 비율을 합하면 그 비율은 골재채취 수역보다 비골재채취 수역에서 더 높았다. FISH법에 의한 세균의 검출가능성이 해당세균의 물질대사능과 연관이 있으므로 골재채취 수역에서의 낮은 세균 검출율은 골재채취가 세균의 물질순환에서의 역기능을 초래하고 이는 또한 연차적으로 그들의 먹이연쇄에 부정적인 영향을 미칠 가능성을 시사하는 것이다.

• 미생물학회지
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• 제45권2호
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• pp.133-139
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• 2009

비점오염원 관리를 위하여 영양염류 농축장치를 개발하였다. 이 장치는 저농도 상태인 영양염류를 고농도로 전환시키며, 이 과정에서 세균이 중요한 역할을 하고 있다. 세균은 장치 내 여재에 생물막을 형성하면서 영양염류를 농축하였다. 총인의 농축효율을 확인하기 위해 장치로 유입되는 하천수와, 유출되는 공극수, 여재에서 총인과 용존무기인, 총세균수를 측정하였고 농축과정에서 미생물 군집이 어떻게 달라지는가를 파악하기 위해 DGGE를 수행한 후 염기서열을 분석하였다. 총인의 경우 하천수에서는 0.12~0.35 mg/L로 농도가 낮았지만 농축 후 유출수에서는 0.45~0.86 mg/L, 여재에서는 40.91~242.71 mg/kg로 매우 높았다. 그러나 용존무기인은 농축이 일어나지 않았다. 총세균수 역시 하천수에서는 $0.3\sim2.3\times10^6$ cells/ml이었으나 농축 후 유출수와 여재에서 각각 $0.4\sim4.4\times10^6$ cells/ml, $0.8\sim1.9\times10^9$ cells/g로 높게 나타났으며, 총인의 농도 변화와 비슷한 패턴을 보여 총인의 농도와 세균수 간에 밀접한 관계가 있음을 확인하였다. 또한 세균의 군집은 하천수에서는 Clostridium 속이 주로 나타났으나 여재에서는 Aquabacterium 속이 우점하다가 천이가 일어나서 Clostridium 속과 Enterococcus 속이 출현하였다. 결론적으로, 영양염류 농축장치의 여재에서 부착세균의 생장으로 인하여 총인의 농축이 일어났음을 확인하였다. 따라서 이 농축장치는 총인을 고농도로 회수함으로써, 저농도로 다량 유입되는 비점오염원의 관리를 용이하게 할 수 있으며, 회수된 농축수는 수계에 추가적인 부하로 작용하지 않는 자연비료로서 활용할 수 있다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제12권1호
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• pp.55-62
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• 1997

This study was carried out to investigate the microbiological and chemical properties of natural water during storage. The water samples were taken at the time of purchase and the opened bottles and unopened bottles stored at the temperature of 4$^{\circ}C$, 18$^{\circ}C$, and 3$0^{\circ}C$. The bacterial content normally rose to 2.06$\times$102 CFU/$m\ell$ for the unopened bottles and 2.91$\times$102 CFU/$m\ell$ for the opened bottles after 2 weeks of storage, and 1.21$\times$102 CFU/$m\ell$ and 2.64$\times$102, respectively, after 24 weeks of storage. The number of viable cells of bacteria peaked more rapidly at the storage temperature of 3$0^{\circ}C$ than 18$^{\circ}C$. But the total samples were found to be negative for coliforms test during the study period. The average range of pH value was from 7.39 to 7.76. The results showed that the nitrates and chlorides satisfied the Korea Drinking Water Quality Standards during the storage period of 24 weeks. However, the undesirable changes of the taste and odor were detected within 2 weeks and 3 weeks, respectively.

• 한국식품조리과학회지
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• 제9권2호
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• pp.61-66
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• 1993

The object of this study was to investigate the effects of blanching and lactic acid bacterial inoculation on the quality of kimchi. The pHs of the group added Leuconostoc mesenteroides were rapidly decreased, and then kept almost steady states. However, the pHs of the groups added Bifidobacterium bifidum were gradually decreased. Blanching treatment reduced the number of viable cells. At the beginning of the fermentation, the total organic acid contents of the blanched groups were lower than those of the non-blanched groups, but later on they were higher. With fermentation, the contents of malic, citric and fumaric acid were decreased in the control group, but increased in the cultured groups and all blanched groups. The cutting forces of the blanched groups were higher than those of the non-blanched groups during the whole fermentation period. The inoculation of Leu. mesenteroides was effective on the preservation of ascorbic acid. Blanching and the inoculation of Leu. mesenteroides gave good effect on the sensory acceptability. The acceptability of the groups added Bifidobacterium bifidum was low in initial fermentation period, but increased during the late fermentation period.

• 한국축산식품학회지
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• 제44권1호
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• pp.119-131
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• 2024

BIOVITA 3 bacterial species (BIOVITA 3), a probiotic blend powder containing Clostridium butyricum IDCC 1301, Weizmannia coagulans IDCC 1201, and Bacillus subtilis IDCC 1101, has been used as a food ingredient for gut health. However, its efficacy in improving constipation has not been reported. Therefore, we aimed to investigate the functional effects of oral administration of BIOVITA 3 as well as its component strains alone (at 1.0×10⁹ CFU/day) in Sprague-Dawley (SD) rats with loperamide-induced constipation. The study included fecal analysis, gastrointestinal transit ratio, histopathological analysis, short chain fatty acids (SCFAs), and metagenome analysis. As results, the BIOVITA 3 group showed significant improvements in fecal number, water content, gastrointestinal transit ratio, and thickening of the mucosal layer. In the SCFAs analysis, all probiotic-treated groups showed an increase in total SCFAs compared to the loperamide-constipated group. Changes in microbial abundance and the diversity index of three groups (normal, constipated, and BIOVITA 3) were also defined. Of these, the BIOVITA 3 showed a significant improvement in loperamide-constipated SD-rats. This study suggests the possibility that BIOVITA 3 can be applied as an ingredient in functional foods to relieve constipation.

• 한국자원식물학회:학술대회논문집
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• 한국자원식물학회 2018년도 추계학술대회
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• pp.73-73
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• 2018

Bacterial leaf blight(BLB), caused by X. oryzae pv. oryzae(Xoo), is one of the most destructive diseases of rice due to its high epidemic potential. Understanding BLB resistance at a genetic level is important to further improve the rice breeding that provides one of the best approaches to control BLB disease. In the present investigation, a collection of 192 accessions was used in the genome-wide association study (GWAS) for BLB resistance loci against four Korean races of Xoo that were represented by the prevailing BLB isolates under Xoo differential system. A total of 192 accessions of rice germplasm were selected on the basis of the bioassay using four isolated races of Xoo such as K1, K2, K3 and K3a. The selected accessions was used to prepare 384-plex genotyping by sequencing (GBS) libraries and Illumina HiSeq 2000 paired- end read was used for GBS sequencing. GWAS was conducted using T ASSEL 5.0. The T ASSEL program uses a mixed linear model (MLM). T he results of the bioassay using a selected set of 192 accessions showed that a large number of accessions (93.75%) were resistant to K1 race, while the least number of accessions (34.37%) resisted K3a race. For races K2 and K3, the resistant germplasm proportion remained between 66.67 to 70.83%. T he genotypic data produced SNP matrix for a total of 293,379 SNPs. After imputation the missing data was removed, which exhibited 34,724 SNPs for association analysis. GWAS results showed strong signals of association at a threshold of [-log10(P-value)] more than5 (K1 and K2) and more than4 (K3 and K3a) for nine of the 39 SNPs, which are plausible candidate loci of resistance genes. T hese SNP loci were positioned on rice chromosome 2, 9, and 11 for K1 and K2 races, whereas on chromosome 4, 6, 11, and 12 for K3 and K3a races. The significant loci detected have also been illustrated, NBS-LRR type disease resistance protein, SNARE domain containing protein, Histone deacetylase 19, NADP-dependent oxidoreductase, and other expressed and unknown proteins. Our results provide a better understanding of the distribution of genetic variation of BLB resistance to Korean pathogen races and breeding of resistant rice.

• 한국환경생태학회지
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• 제31권5호
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• pp.444-454
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• 2017

세계 양서류 감소의 주요 요인으로 감염성 질병이 활발하게 연구되고 있으며, 야외 병원균 전파의 가능한 근원지로서 양서류 증양식장들이 언급되고 있으나, 국내에서 관련된 연구수행은 매우 미진한 상태이다. 본 연구에서는 인제, 괴산, 공주에 위치한 북방산개구리 증양식장의 내 외부에서 채집된 성체와 유생의 피부와 내부 장기들에서 확인되는 세균과 곰팡이 콜로니 수의 지역 간, 증양식장 내 외부 간 차이 여부를 파악하고, 나아가 유생으로부터 발견되는 세균의 종류를 16s rDNA 서열 비교를 통해 규명하고자 하였다. 연구결과, 성체의 경우 괴산에서 채집된 성체의 피부와 소화관으로부터 표집된 세균 콜로니 수와 피부와 간으로부터 표집된 곰팡이 콜로니 수가 인제에서 확인된 콜로니 수보다 의미 있게 많았으나 증양식장 내 외 간에는 두 지역 모두에서 어느 부위에서도 차이가 없었다. 유생의 경우 공주에서 채집된 유생의 내부로부터 표집된 곰팡이 콜로니 수가 인제에서 확인된 콜로니수보다 많은 경향을 보였다. 증양식장 내 외부의 비교 결과, 피부에서의 박테리아 수는 인제 증양식장 내부, 개체 내부에서의 박테리아 수는 공주 증양식장 외부에서 더 많은 콜로니 수가 확인되었다. 성체의 건강지수가 좋을수록 피부의 박테리아 콜로니 수와 피부와 심장의 곰팡이 콜로니 수가 적었으나, 유생에서는 관련성이 없었다. 유생으로부터 검출된 세균을 분류한 결과, 4개 문 내, 15개 속에 속하는 세균이 검출되었으나 증양식장 간 및 증양식장 내 외부 간 차이는 분명하지 않았다. 우리의 결과는 증양식장의 지역과 증양식장 내 외부 간의 서로 다른 조건들이 양서류에 있는 세균과 곰팡이의 군집크기 차이를 유발하며, 이것이 증양식 북방산개구리의 건강상태에 영향을 미칠 가능성이 있음을 보여준다. 더불어, 우리의 결과는 성공적인 양서류 증식장 운영과 증식장으로부터 질병의 가능한 야외전파를 막기 위하여, 증식장 내 효율적인 질병관리의 필요성이 높음을 시사한다.

• 한국치위생학회지
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• 제17권2호
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• pp.319-330
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• 2017

Objectives: The purpose of this study was to compare SYBR Green qPCR, TaqMan, and bacterial selective medium cultures for accurate quantitative analysis of oral microorganisms. Methods: The SYBR Green method is widely used to analyze the total amount of oral microorganisms in oral saliva. However, in this study, MTR-PCR method based on TaqMan method was performed using newly developed primers and probes. In addition, it was designed to confirm the detection agreement of bacteria among bacteria detection method. Results: As a result of MRT-PCR and SYBR Green qPCR analysis, more than 40 times (0.9-362.9 times) bacterium was detected by MRT-PCR. In addition, more bacteria were detected in saliva in the order of MRT-PCR, SYBR Green qPCR, and bacterium culture, and the results of MRB-PCR and SYBR Green qPCR showed the highest agreement. The agreement between the three methods for detecting P. intermedia was similar between 71.4 and 88.6%, but the agreement between MRT-PCR and SYBR Green qPCR was 80% for S. mutans. Among them, the number of total bacteria, P. intermedia and S. mutans bacteria in saliva was higher than that of SYBR Green qPCR method, and bacterium culture method by MRT-PCR method. P. intermedia and S. mutans in saliva were detected by MRT-PCR and MRT-PCR in 88.6% of cases, followed by the SYBR Green qPCR method (80.0%). Conclusions: The SYBR Green qPCR method is the same molecular biology method, but it can not analyze the germs at the same time. Bacterial culturing takes a lot of time if there is no selective culture medium. Therefore, the MRT-PCR method using newly developed primers and probes is considered to be the best method.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2001년도 추계학술발표대회
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• pp.918-922
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• 2001

In a previous study, we have isolated a number of lactobacilli from Korean women, and one of them (KLB46) was identified as Lactobacillus crispatus by 16S rRNA gene sequencing. For the ecological treatment of bacterial vaginosis (BV) cell suspension of L. crispatus KLB46 was instillated into BV patients. L. crispatus KLB46 was found to persist for several days in cell suspension with no nutrients. In this study, in order to assess the influence of starvation on physiological activity, we compared the viability and culturability of KLB46 following suspension in various buffer solutions. A pair of in situ fluorescent dye was used to assess viability (i.e. membrane integrity) and the culturability was examined by plate count assay. A rapid epifluorescence staining method using the LIVE/DEAD Bacterial Viability Kit $(BacLight^{TM})$ was applied to estimate both viable and total counts of bacteria in cell suspension. $BacLight^{TM}$ is composed of two nucleic acid-binding stains ($SYTO\;9^{TM}$ and propidium iodide). $SYTO\;9^{TM}$ penetrates all bacterial membranes and stains the cells green while propidium iodide only penetrates cells with damaged membranes, therefore the combination of the two stains produces red fluorescing cells. Optimal staining conditions for $BacLight^{TM}$ were found to be with 0.0835M $SYTO\;9^{TM}$ and 0.05M propidium iodide for 15 min incubation at room temperature in dark. When cells were microscopically examined during 140 hours of starvation, the culturability decreased markedly while the viability remained relatively constant, which suggests that large fraction of KLB46 cells became viable but non-culturable (VBNC) upon starvation.

• 한국수산과학회지
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• 제8권4호
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• pp.217-221
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• 1975

1975년 5월부터 10월까지 자리돔의 식품위생학적인 안전성을 검토하기 위하여 자리돔의 서식해수, 어획직후의 자리돔, 시판자리돔, 자리물회 및 자리무침 회의 일반세포수, coliform group MPN 및 parahaemolyticus의 유무를 조사한 결과를 요약하면 다음과 같다, 1) 서식해수의 일반세균수는 평균 $1.7\times10^2/ml$ 정도였고 coliform group MPN은 4/ml이하였다. 2) 어획직후의 자리돔은 일반세균수가 평균 $3.2\times10^3/g$였고 coliform group MPN은 300g이하였다. 3) 시판되고 있는 자리돔의 일반세균수는 8월 중순경에는 평균 $1.1\times10^6/g$ 9월중순경에는 $2.2\times10^6/g$ 였다. 4) 자리무침회 및 자리물회의 일반세균수는 각각 $1.1\times10^7/g,\;4.9\times10^5/g\~1.7\times10^7/g$였다. 5) 자리무침회와 자리물회에서는 V.purahamolyticus 균이 검출 되지 않았으나 서식해수와 자리돔에서는 V. parahaemolyticus 균이 검출 되었는데 식중독을 일으킬수 있는 균량은 아니였다. 5) 자리돔 및 각종 자리돔회의 일반세균수, coliform group MPN 및 V. parahaemolyticus는 8월과 9월에 오염도가 가장 높았다. 본 연구의 지도와 많은 조언을 주신 부산수산대학 식품공학료 최위경, 이강호, 이응호, 박사들과 실험을 도와 준 제주대거 이창환, 박철우, 이진영 제군에게 감사를 드리는 바이다.