In this survey paper, we discuss biomedical ontologies and major text mining techniques applied to biomedicine and healthcare. Biomedical ontologies such as UMLS are currently being adopted in text mining approaches because they provide domain knowledge for text mining approaches. In addition, biomedical ontologies enable us to resolve many linguistic problems when text mining approaches handle biomedical literature. As the first example of text mining, document clustering is surveyed. Because a document set is normally multiple topic, text mining approaches use document clustering as a preprocessing step to group similar documents. Additionally, document clustering is able to inform the biomedical literature searches required for the practice of evidence-based medicine. We introduce Swanson's UnDiscovered Public Knowledge (UDPK) model to generate biomedical hypotheses from biomedical literature such as MEDLINE by discovering novel connections among logically-related biomedical concepts. Another important area of text mining is document classification. Document classification is a valuable tool for biomedical tasks that involve large amounts of text. We survey well-known classification techniques in biomedicine. As the last example of text mining in biomedicine and healthcare, we survey information extraction. Information extraction is the process of scanning text for information relevant to some interest, including extracting entities, relations, and events. We also address techniques and issues of evaluating text mining applications in biomedicine and healthcare.
Journal of the Korea Institute of Information and Communication Engineering
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v.21
no.5
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pp.951-959
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2017
In this paper, we design and implement an Android-based Hangul food menu recognition application that recognizes characters from images captured by a smart phone. Optical Character Recognition (OCR) technology is divided into preprocessing, recognition and post-processing. In the preprocessing process, the characters are extracted using Maximally Stable Extremal Regions (MSER). In recognition process, Tesseract-OCR, a free OCR engine, is used to recognize characters. In the post-processing process, the wrong result is corrected by using the dictionary DB for the food menu. In order to evaluate the performance of the proposed method, experiments were conducted to compare the recognition performance using the actual menu plate as the DB. The recognition rate measurement experiment with OCR Instantly Free, Text Scanner and Text Fairy, which is a character recognizing application in Google Play Store, was conducted. The experimental results show that the proposed method shows an average recognition rate of 14.1% higher than other techniques.
The Journal of the Convergence on Culture Technology
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v.8
no.5
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pp.489-495
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2022
It makes difference to LSTM D/L(Deep Learning) results for language model construction as the corpus preprocess changes. An LSTM model was trained with a famouse literaure poems(Ki Hyung-do's work) for training corpus in the study. You get the two wordvector sets for two corpus sets of the original text and eraised word ending text each once D/L training completed. It's been inspected of the similarity/analogy operation results, the positions of the wordvectors in 2D plane and the generated texts by the language models for the two different corpus sets. The suggested words by the silmilarity/analogy operations are changed for the corpus sets but they are related well considering the corpus characteristics as a literature work. The positions of the wordvectors are different for each corpus sets but the words sustained the basic meanings and the generated texts are different for each corpus sets also but they have the taste of the original style. It's supposed that the D/L language model can be a useful tool to enjoy the literature in object and in diverse with the analysis results shown in the study.
International journal of advanced smart convergence
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v.8
no.3
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pp.95-101
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2019
Recently, there have been many issues related to text recognition using Tesseract. One of these issues is that the text recognition accuracy is significantly lower for smaller fonts. Tesseract extracts text by creating an outline with direction in the image. By searching the Tesseract database, template matching with characters with similar feature points is used to select the character with the lowest error. Because of the poor text extraction, the recognition accuracy is lowerd. In this paper, we compared text recognition accuracy after applying various super-resolution methods to smaller text images and experimented with how the recognition accuracy varies for various image size. In order to recognize small Korean text images, we have used super-resolution algorithms based on deep learning models such as SRCNN, ESRCNN, DSRCNN, and DCSCN. The dataset for training and testing consisted of Korean-based scanned images. The images was resized from 0.5 times to 0.8 times with 12pt font size. The experiment was performed on x0.5 resized images, and the experimental result showed that DCSCN super-resolution is the most efficient method to reduce precision error rate by 7.8%, and reduce the recall error rate by 8.4%. The experimental results have demonstrated that the accuracy of text recognition for smaller Korean fonts can be improved by adding super-resolution methods to the OCR preprocessing module.
Purpose: This study examined the suitability of using text network analysis (TNA) methodology for topic analysis of academic papers related to nursing. Methods: TNA background theories, software programs, and research processes have been described in this paper. Additionally, the research methodology that applied TNA to the topic analysis of the academic nursing papers was analyzed. Results: As background theories for the study, we explained information theory, word co-occurrence analysis, graph theory, network theory, and social network analysis. The TNA procedure was described as follows: 1) collection of academic articles, 2) text extraction, 3) preprocessing, 4) generation of word co-occurrence matrices, 5) social network analysis, and 6) interpretation and discussion. Conclusion: TNA using author-keywords has several advantages. It can utilize recognized terms such as MeSH headings or terms chosen by professionals, and it saves time and effort. Additionally, the study emphasizes the necessity of developing a sophisticated research design that explores nursing research trends in a multidimensional method by applying TNA methodology.
We present a fast algorithm for Korean text extraction and segmentation from subway signboards using smart phone sensors in order to minimize computational time and memory usage. The algorithm can be used as preprocessing steps for optical character recognition (OCR): binarization, text location, and segmentation. An image of a signboard captured by smart phone camera while holding smart phone by an arbitrary angle is rotated by the detected angle, as if the image was taken by holding a smart phone horizontally. Binarization is only performed once on the subset of connected components instead of the whole image area, resulting in a large reduction in computational time. Text location is guided by user's marker-line placed over the region of interest in binarized image via smart phone touch screen. Then, text segmentation utilizes the data of connected components received in the binarization step, and cuts the string into individual images for designated characters. The resulting data could be used as OCR input, hence solving the most difficult part of OCR on text area included in natural scene images. The experimental results showed that the binarization algorithm of our method is 3.5 and 3.7 times faster than Niblack and Sauvola adaptive-thresholding algorithms, respectively. In addition, our method achieved better quality than other methods.
The Journal of The Korea Institute of Intelligent Transport Systems
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v.3
no.2
s.5
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pp.19-28
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2004
This paper shows how to compensate the skew from the traffic sign included in the natural image and extract the text. The research deals with the Process related to the array image. Ail the process comprises four steps. In the first fart we Perform the preprocessing and Canny edge extraction for the edge in the natural image. In the second pan we perform preprocessing and postprocessing for Hough Transform in order to extract the skewed angle. In the third part we remove the noise images and the complex lines, and then extract the candidate region using the features of the text. In the last part after performing the local binarization in the extracted candidate region, we demonstrate the text extraction by using the differences of the features which appeared between the tett and the non-text in order to select the unnecessary non-text. After carrying out an experiment with the natural image of 100 Pieces that includes the traffic sign. The research indicates a 82.54 percent extraction of the text and a 79.69 percent accuracy of the extraction, and this improved more accurate text extraction in comparison with the existing works such as the method using RLS(Run Length Smoothing) or Fourier Transform. Also this research shows a 94.5 percent extraction in respect of the extraction on the skewed angle. That improved a 26 percent, compared with the way used only Hough Transform. The research is applied to giving the information of the location regarding the walking aid system for the blind or the operation of a driverless vehicle
Researching in text detection and segmentation has been done for a long period in the OCR area. However, there is some other area that the text detection and segmentation from images can be very useful. In this report, we first propose the design of a mobile translator system which helps non-native speakers to understand the foreign language using ubiquitous mobile network and camera mobile phones. The main focus of the paper will be the algorithm in detecting and segmenting texts embedded in the natural scenes from taken images. The image, which is captured by a camera mobile phone, is transmitted to a translator server. It is initially passed through some preprocessing processes to smooth the image as well as suppress noises. A threshold is applied to binarize the image. Afterward, an edge detection algorithm and connected component analysis are performed on the filtered image to find edges and segment the components in the image. Finally, the pre-defined layout relation constraints are utilized in order to decide which components likely to be texts in the image. A preliminary experiment was done and the system yielded a recognition rate of 94.44% on a set of 36 various natural scene images that contain texts.
Hai, Nguyen Cao Truong;Kim, Kyung-Im;Park, Hyuk-Ro
Journal of Information Processing Systems
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v.5
no.1
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pp.5-10
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2009
Text data has always accounted for a major portion of the world's information. As the volume of information increases exponentially, the portion of text data also increases significantly. Text classification is therefore still an important area of research. LDA is an updated, probabilistic model which has been used in many applications in many other fields. As regards text data, LDA also has many applications, which has been applied various enhancements. However, it seems that no applications take care of the input for LDA. In this paper, we suggest a way to map the input space to a reduced space, which may avoid the unreliability, ambiguity and redundancy of individual terms as descriptors. The purpose of this paper is to show that LDA can be perfectly performed in a "clean and clear" space. Experiments are conducted on 20 News Groups data sets. The results show that the proposed method can boost the classification results when the appropriate choice of rank of the reduced space is determined.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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