Horticultural traits and genetic relationship were evaluated for 83 melon (Cucumis melo L.) cultivars. Survey of a total of 36 characteristics for seedling, leaf, stem, flower, fruit, and seed and subsequent multiple analysis of variance (MANOVA) were conducted. Principal component analysis (PCA) showed that 8 principle components including fruit weight, fruit length, fruit diameter, cotyledon length, seed diameter, and seed length accounted for 76.3% of the total variance. Cluster analysis of the 83 melon cultivars using average linkage method resulted in 5 clusters at coefficient of 0.7. Cluster I consisted of cultivars with high values for fruit-related traits, Cluster II for soluble solid content, and Cluster V for high ripening rate. Genotyping of the 83 cultivars was conducted using 15 expressed-sequence tagged-simple sequence repeat (EST-SSR) from the Cucurbit Genomics Initiative (ICuGI) database. Analysis of genetic relatedness by UPGMA resulted in 6 clusters. Mantel test indicated that correlation between morphological and genetic distance was very low (r = -0.11).
The Sporosarcina psychrophilia pyrB gene, which encodes aspartate transcarbamylase (ATcase), was cloned on Sau3AI restriction endonuclease fragment inserted into pUC19 plasmid vector, S. psychrophilia pyrB gene was expressed in Escherichia coli pyrB mutant for the complementation test. The sequence of 2,606 nucleotides including putative pyrB gene was determined. The region contained one full open reading frame (ORf) and two partial ORFs. The deduced amino acid sequence of the second ORF showed 59% identity with that of Bacillus caldolyticus ATCase. The first and third partial ORFs were closely related to the uracil permease (pyrP) and dihydroorotase (pyrC), respectively. Besides, potential terminator, antiterminator, and anti-antiterminator structures were found in the intergenic region between pyrP and pyrB. These results suggested that S. psychrophilia pyrimidine nucleotide biosynthesis genes are clustered as well as other Bacillus sp. Over-expressed product of pyrB encoding ATCase was purified and analyzed by the SDS-PAGE. The purified PyrB protein turned out to be molecular mass of 27 kDa and showed ATCase activity.
ErmSF is one of the Erm family proteins which catalyze S-adenosyl-$_L$-methionine dependent modification of a specific adenine residue (A2058, E. coli numbering) in bacterial 23S rRNA, thereby conferring resistance to clinically important macrolide, lincosamide and streptogramin B ($MLS_B$) antibiotics. $^{222}FXPXPXVXS^{230}$ (ErmSF numbering) sequence appears to be a consensus sequence among the Erm family. This sequence was supposed to be involved in direct interaction with the target adenine from the structural studies of Erm protein ErmC'. But in DNA methyltarnsferase M. Taq I, this interaction have been identified biochemically and from the complex structure with substrate. Arginine 223 and 227 in this sequence are not conserved among Erm proteins, but because of the basic nature of residues, it was expected to interact with RNA substrates. Two amino acid residues were replaced with Ala by site-directed mutagenesis. Two mutant proteins still maintained its activity in vivo and resistant to the antibiotic erythromycin. Compared to the wild-type ErmSF, R223A and R227A proteins retained about 50% and 88% of activity in vitro, respectively. Even though those arginine residues are not essential in the catalytic step, with their positive charge they may play an important role for RNA binding.
Kim, Byung-Soo;Jang, Jee-Sun;Kim, Sang-Cheol;Lim, Jo-Han
The Korean Journal of Applied Statistics
/
v.22
no.3
/
pp.617-626
/
2009
A series of recent papers reported that the inter-gene correlations in Affymetrix microarray data sets were strong and long-ranged, and the assumption of independence or weak dependence among gene expression signals which was often employed without justification was in conflict with actual data. Qui et al. (2005) indicated that applying the nonparametric empirical Bayes method in which test statistics were pooled across genes for performing the statistical inference resulted in the large variance of the number of differentially expressed genes. Qui et al. (2005) attributed this effect to strong and long-ranged inter-gene correlations. Klebanov and Yakovlev (2007) demonstrated that the inter-gene correlations provided a rich source of information rather than being a nuisance in the statistical analysis and they developed, by transforming the original gene expression sequence, a sequence of independent random variables which they referred to as a ${\delta}$-sequence. We note in this report using two cDNA microarray data sets experimented in this country that the strong and long-ranged inter-gene correlations were still valid in cDNA microarray data and also the ${\delta}$-sequence of independence could be derived from the cDNA microarray data. This note suggests that the inter-gene correlations be considered in the future analysis of the cDNA microarray data sets.
An, Tae Jin;Park, Myung Soo;Jeong, Jin Tae;Kim, Young Guk;Kim, Yong Il;Lee, Eun Song;Chang, Jae Ki
Korean Journal of Medicinal Crop Science
/
v.27
no.6
/
pp.404-411
/
2019
Background: In September 2017, wilting and rhizome rot symptoms were observed on Atractylodes macrocephala Koidz. in Jecheon-si and Eumseong-gun. This study was carried out to isolate hitherto unidentified pathogenic fungi from A. macrocephala and to test the pathogenicity of isolated fungi against Atractylodes spp. genus such as A. macrocephala, A. japonica, and their interspecific hybrids. Methods and Results: The diseased plants were washed with running tap water, and the boundary between the healthy area and the diseased area was cut while the pathogens were isolated by growing cultures from the diseased areas on Phytophthora semi-selective medium. The internal transcribed spacer (ITS) region of the isolates was used in this study for identification. Test plants were cultivated in the glasshouse at 20℃ - 30℃ for 4 months and then used for pathogenicity test. The pots with plants inoculated with mycelial plugs and zoospores were placed at 25℃ for 48 h in a dew chamber where relative humidity was above 95%, and then moved into the glasshouse at 20℃ - 30℃. The presence or absence of pathogenicity of the strains was determined by evaluating the symptom of plant wilting. The inoculation test was performed in three replicates with a non-treated control. Conclusions: On the basis of results of ITS sequence analysis, the strains isolated from the diseased plants was identified as Phytophthora sansomeana. Biological assay using test plants confirmed the pathogenicity of P. sansomeana against Atractylodes macrocephala. This is the first report of rhizome rot in A. macrocephala caused by P. sansomeana.
This study was performed to evaluate the bioequivalency between the Osmetone$^{TM}$ Tablet (Myeongmoon Pharm. Co., Ltd.) as a test formulation and the Relafen$^{TM}$ Tablet (Handok Pharm. Co., Ltd.) as a reference formulation. Twenty-four healthy male volunteers were administered the formulations by the randomized Latin square crossover design, and the plasma samples were determined by a high performance liquid chromatography (HPLC) with Ultra-Violet (UV) detector. AUC$_t$, C$_{max}$ and T$_{max}$ were obtained from the time-plasma concentration curves, and log-transformed AUC$_t$ and C$_{max}$ and log-untransformed T$_{max}$ values for two formulations were compared by statistical tests and analysis of variation. AUC$_t$ was determined to be 897.8${\pm}$431.1 ug.hr/ml for the reference formulation and 902.3${\pm}$408.4 ug.hr/ml for the test formulation. The mean values of C$_{max}$ for the reference and test formulations were 24.2${\pm}$8.9 and 24.0${\pm}$9.5 ug/ml, respectively. The AUC$_t$ and C$_{max}$ ratios of the reference Relafen$^{TM}$ Tablet to the test Osmetone$^{TM}$ Tablet were +5.01% and -0.83%, respectively, showing that the mean differences were satisfied the acceptance criteria within 20%. The results from analysis of variance for logtransformed AUC$_t$ and C$_{max}$ indicated that sequence effects between groups were not exerted and 90% confidence limits of the mean differences for AUC$_t$ and C$_{max}$ were located in ranges from log 0.80 to log 1.25, satisfying the acceptance criteria of the KFDA bioequivalence. The Osmetone$^{TM}$ Tablet as the test formulation was considered to be bioequivalant to the Relafen$^{TM}$ Tablet used as its reference formulation, based on AUC$_t$ and C$_{max}$ values.
The objective of the study was to evaluate the bioequivalency between the $Rozid^{TM}$ Tablet (Ilhwa Pharm. Co., Ltd.) as a test formulation and the $Rulid^{TM}$ Tablet (Handok Pharm. Co., Ltd) as a reference formulation. Twenty-four healthy male volunteers were administered the formulations by the randomized Latin square crossover design, and the plasma samples were determined by a high performance liquid chromatography (HPLC) with fluorescence detector. $AUC_t,\;C_{max}\;and\;T_{max}$ were obtained from the time-plasma concentration curves, and log-transformed $AUC_t\;and\;C_{max}$ and log-untransformed $T_{max}$ values for two formulations were compared by statistical tests and analysis of variation. $AUC_t$ was determined to be $63.30{\pm}25.57{\mu}g.hr/ml$ for the test formulation and $64.02{\pm}29.27mg.hr/ml$ for the reference formulation. The mean values of $C_{max}$ for the test and reference formulations were $5.07{\pm}2.14\;and\;5.53{\pm}2.60{\mu}g/ml$, respectively. The $AUC_t,\;and\;C_{max}$ ratios of the test $Rozid^{TM}$ Tablet to the reference $Rulid^{TM}$ Tablet were -1.12% and -8.32%, respectively, showing that the mean differences were satisfied the acceptance criteria within 20%. The results from analysis of variance for log-transformed $AUC_t,\;and\;C_{max}$ indicated that sequence effects between groups were not exerted and 90% confidence limits of the mean differences for $AUC_t,\;and\;C_{max}$ were located in ranges from log 0.80 and log 1.25, satisfying the acceptance criteria of the KFDA bioequivalence. The RozidTM Tablet as the test formulation was considered to be bioequivalent to the RulidTM Tablet used as its reference formulation, based on $AUC_t,\;and\;C_{max}$ values.
Lee, Han-Young;Min, Byung-Jun;Kim, Mun-Hee;Seo, Dong-Sun;Hur, Wong
The Transactions of the Korea Information Processing Society
/
v.3
no.2
/
pp.339-347
/
1996
object-oriented programming is used to develop next-generation telecommu- nications services running on the distributed processing environment. In order to test these services efficiently at the system-level during not only in the development phase but also in the operation phase, we define an embedded monitor service within the infrastructure to monitor the operation of the distributed programs, and describe a system-level test mechanism based on the monitor service. By separating the function of monitor server which monitors operations of objects and collects monitored data and that of tester which makes analysis and decides the sequence of test events, the invasive effect of monitoring can be minimized. At the same time, accurate diagnosis on the system can be achieve by exploiting the test mechanism. The mechanism, as a core component for the implementation of real-time fault-tol-erant systems, is applicable to general-purpose distributeded systems as well.
Ultra-high-performance concrete (UHPC) has attracted increasing attention in prefabricated steel-concrete composite beams as achieving the onsite construction time savings and structural performance improvement. The inferior replacement and removal efficiency of conventional prefabricated steel-UHPC composite beams (PSUCBs) has thwarted its sustainable applications because of the widely used welded-connectors. Single embedded nut bolted shear connectors (SENBs) have recently introduced as an attempt to enhance demountability of PSUCBs. An in-depth exploration of the mechanical behavior of SENBs in UHPC is necessary to evidence feasibilities of corresponding PSUCBs. However, existing research has been limited to SENB arrangement impacts and lacked considerations on SENB geometric configuration counterparts. To this end, this paper performed twenty push-out tests and theoretical analyses on the shear performance and design recommendation of SENBs. Key test parameters comprised the diameter and grade of SENBs, degree and sequence of pretension, concrete casting method and connector type. Test results indicated that both diameters and grades of bolts exerted remarkable impacts on the SENB shear performance with respect to the shear and frictional responses. Also, there was limited influence of the bolt preload degrees on the shear capacity and ductility of SENBs, but non-negligible contributions to their corresponding frictional resistance and initial shear stiffness. Moreover, inverse pretension sequences or monolithic cast slabs presented slight improvements in the ultimate shear and slip capacity. Finally, design-oriented models with higher accuracy were introduced for predictions of the ultimate shear resistance and load-slip relationship of SENBs in PSUCBs.
In Korea, all domestic made test systems for detecting antibodies in HIV-1 contain the antigens from human immunodeficiency type 1 (HIV-1) subtype B. However, because HIV-1 subtype O is significantly different in amino acid sequences from all other subtypes of HIV-1, there has been a need for developing a test for detecting antibodies in subtype O. For this purpose, the entire nucleotide sequence corresponding to the extracellular domain of the transmembrane glycoprotein of HIV-1 subtype O was synthesized with consideration of Escherichia coli condon usage. Various regions of the extracellular domain were cloned into E. coli expression vectors and tested for levels of protein production. The nucleotide sequence, named ECTM, that can encode a 129 amino acid-long peptide, was found to be expressed at a high level in E. coli. The protein of approximately 17 kDa specifically reacted with sera from individuals infected with HIV-1 subtype O. The ECTM protein was purified to near homogeneity by the CM-T gel chromatography, using concentrated, denatured inclusion bodies. In Western blot analysis, the purified viral antigen reacted with sera from individuals infected with subtype O more efficiently than subtype B. The enzyme linked immunoabsorbent assay (ELISA) system was developed using the subtype O viral protein and compared with the commercially available kit lacking the antigens from subtype O. The ELISA kit containing the subtype O antigen ECTM alone efficiently reacted with sera from individuals infected with subtype O. The subtype O antigen-containing kit produced a positive absorbence even when sera were diluted 512-fold, suggesting a high sensitivity. The commercially available kit also reacted with subtype O sera, but produced a negative result at a dilution of 8-fold. Our results suggest that the currently available kit may not be able to efficiently detect subtype O sera and that the viral protein developed in this study may be added to the current system to maximize the detection of sera from individuals infected with subtype O.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.