• Genomics & Informatics
• /
• 제20권4호
• /
• pp.41.1-41.9
• /
• 2022

The pathogen Gallibacterium anatis has caused heavy economic losses for commercial poultry farms around the world. However, despite its importance, the functions of its hypothetical proteins (HPs) have been poorly characterized. The present study analyzed the functions and structures of HPs obtained from Gallibacterium anatis (NCTC11413) using various bioinformatics tools. Initially, all the functions of HPs were predicted using the VICMpred tool, and the physicochemical properties of the identified virulence proteins were then analyzed using Expasy's ProtParam server. A virulence protein (WP_013745346.1) that can act as a potential drug target was further analyzed for its secondary structure, followed by homology modeling and three-dimensional (3D) structure determination using the Swiss-Model and Phyre2 servers. The quality assessment and validation of the 3D model were conducted using ERRAT, Verify3D, and PROCHECK programs. The functional and phylogenetic analysis was conducted using ProFunc, STRING, KEGG servers, and MEGA software. The bioinformatics analysis revealed 201 HPs related to cellular processes (n = 119), metabolism (n = 61), virulence (n = 11), and information/storage molecules (n = 10). Among the virulence proteins, three were detected as drug targets and six as vaccine targets. The characterized virulence protein WP_013745346.1 is proven to be stable, a drug target, and an enzyme related to the citrate cycle in the present pathogen. This enzyme was also found to facilitate other metabolic pathways, the biosynthesis of secondary metabolites, and the biosynthesis of amino acids.

• 한국정보과학회논문지:소프트웨어및응용
• /
• 제31권10호
• /
• pp.1320-1331
• /
• 2004

동영상 어댑테이션 시스템은 네트워크 제약, 클라이언트 제약 등을 만족하면서, 동영상의 품질이 최대가 되도록 동영상을 변환해 주는 시스템을 말한다. 본 논문에서는 정적으로 중간 동영상과 품질측정에 관한 정보를 생성해두는 준-동적 어댑테이션 시스템을 제안한다. 중간 동영상은 원본 동영상의 해상도를 반으로 줄여가며 생성되어, 서버에 저장된다. 품질 측정에 관한 정보는 프레임 율 별 부드러운 정도의 수치와, 픽셀 당 비트 량 별 선명한 정도의 수치에 대한 테이블을 정적으로 생성해 둔 것이다. 이런 중간 결과물들은 클라이언트에서의 서비스 품질을 고려하며 동적으로 동영상을 변환 할 때 가능한 빠르게 동영상 변환이 수행될 수 있도록 해준다. 실험 결과 제안된 어댑테이션 시스템은 기존의 동적 어댑테이션 시스템에 비해 약 30배정도 빠르게 어댑테이션을 수행하는 반면, 약 2%정도의 품질 저하가 있었고 중간동영상을 저장하기 위한 추가적인 서버공간이 필요하다는 것을 확인 할 수 있었다.

• The Plant Pathology Journal
• /
• 제36권6호
• /
• pp.618-627
• /
• 2020

Although limited progress have been made about pathogen system of Hibiscus rosa-sinensis and Hibiscus latent Fort Pierce virus (HLFPV), interaction between plant host and pathogen remain largely unknown, which led to deficiency of effective measures to control disease of hibiscus plants caused by HLFPV. In this study, infection of HLFPV in Hibiscus rosa-sinensis was firstly confirmed for the first time by traditional electron microscopy, modern reverse transcription polymerase chain reaction and RNA-seq methods in China (HLFPV-Ch). Sequence properties analyzing suggested that the full-length sequences (6,465 nt) of HLFPV-Ch had a high sequence identity and a similar genomic structure with other tobamoviruses. It includes a 5'-terminal untranslated region (UTR), followed by four open reading frames encoding for a 128.5-kDa replicase, a 186.5-kDa polymerase, a 31-kDa movement protein, 17.6-kDa coat protein, and the last a 3'-terminal UTR. Furthermore, HLFPV-Ch-derived virus-derived siRNAs (vsiRNAs) ant its putative target genes, reported also for the first time, were identified and characterized from disease Hibiscus rosa-sinensis through sRNA-seq and Patmatch server to investigate the interaction in this pathogen systems. HLFPV-Ch-derived vsiRNAs demonstrated several general and specific characteristics. Gene Ontology classification revealed predicted target genes by vsiRNAs are involved in abroad range of cellular component, molecular function and biological processes. Taken together, for first time, our results certified the HLFPV infection in China and provide an insight into interaction between HLFPV and Hibiscus rosa-sinensis.

• 한국컴퓨터정보학회논문지
• /
• 제6권4호
• /
• pp.74-84
• /
• 2001

현재 인터넷에서 단-대-단 QoS 경로 제공을 위하여 자원 예약 서비스기반 통합서비스 모델, PHB에 의한 차등서비스기반 차등 서비스 모델, 그리고 이러한 2가지 모델을 목표 망의 상태에 따라 분리 적용하는 two-tire 모델에 의한 서비스 방안 등이 제안되고 있다. 그러나 이러한 인터넷의 QoS를 ATM 기반 망에 적용 시, 두 통신망간의 근본적인 상호연결방식, 이름/주소변환체계의 차이 및 단-대-단 shortcut 경로 설정에 의한 QoS 제공 등의 문제점이 제기된다. 본 논문에서는 이러한 문제점 해결을 위하여, 현재 ATM 기반 IP 통합 망에서 차세대 인터넷 이름/주소 체계의 통합 및 확장성을 보장하는 shortcut 기반 QoS 경로 설정 방안에 대하여 제안한다. 이렇게 설정된 경로에 의해 다중 서비스 클래스의 차별화 된 트래픽 처리가 설계되며, 각 단계별로 서버, ER 및 호스트 측면에서 적용 가능하도록기본기능이 구현된다. 추후 이러한 기능은 확장되어 차세대 인터넷 목표 망에 shortcut 기반QoS 보장 경로를 단-대-단 접속 구성장치 간에 제공할 수 있을 것이다.

• 한국산학기술학회논문지
• /
• 제22권4호
• /
• pp.483-492
• /
• 2021

곽향은 식욕부진, 메스꺼움 등의 치료에 사용될 뿐만 아니라 최근에는 항당뇨 효능도 알려졌다. 본 연구에서는 곽향의 항산화력과 주요 성분들을 조사한 다음, in-silico 방법론을 적용하여 타겟 단백질들을 예측하였다. 먼저 메탄올 추출물의 DPPH와 ABTS 라디칼 소거능의 EC50 값은 각각 78.6 ㎍/mL과 31.0 ㎍/mL이었다. 이것은 ascorbic acid의 값(9.9 ㎍/mL, 5.2 ㎍/mL)과 비교할 때 항산화력이 뛰어나다고 할 수 있다. HPLC-PDA-MS/MS를 이용하여 성분들을 정성 분석한 결과, 추출물의 주요 화합물로 rosmarinic acid, tilianin, agastachoside 그리고 acacetin을 확인하였다. 이들 성분들의 항당뇨 작용 타겟 단백질을 DIA-DB 서버를 사용하여 구조 유사도와 inverse doking 방법론을 적용하여 예측하였다. 본 가상 탐색 결과, 주요 타겟 단백질들은 PPAR-γ, DPP IV, glucokinase, α-glucosidase, SGLT2, aldose reductase, corticosteroid 11-beta-dehydrogenase로 예측되었다. 그리고 이들 단백질들 중 일부는 이미 실험적으로 검증된 타겟 단백질이었다. 따라서 in silico 검색 방법이 유효하다고 생각할 수 있다. 마지막으로 활성성분들의 최적의 추출 조건을 결정하기 위하여 여러 추출 용매들로 곽향을 추출하였다. 여러 유기 용매들 중에는 메탄올이 그리고 에탄올-물 혼합용매에서는 80% 에탄올이 가장 효과적인 추출 용매로 확인되었다.

• 한국콘텐츠학회논문지
• /
• 제5권4호
• /
• pp.20-27
• /
• 2005

본 논문에서는 LBS(Location-Based Services)에 기반한 모바일 전자상거래 시스템을 구현하였다. WIPI(Wireless Internet Platform for Interoperability)를 사용하여 시뮬레이터를 개발하였고 실험결과 제안 시스템이 서버의 부하를 줄이고 접속시간을 단축하고, 마케팅 및 고객관리측면에서 효율적임을 확인 하였다. 향후 유비쿼터스 환경에서 LBS기반 무선 전자상거래는 매우 다양한 분야에서 활용이 될 수 있을 것이다.

• International Journal of Naval Architecture and Ocean Engineering
• /
• 제2권3호
• /
• pp.171-176
• /
• 2010

This paper proposes the application of sensor technology to assemble ship blocks efficiently. A sensor-based monitoring system is designed and implemented to improve shipbuilding productivity by reducing the labor cost for the adjustment of adequate positioning between ship blocks during pre-erection or erection stage. For the real-time remote monitoring of relative distances between two ship blocks, sensor nodes are applied to measure the distances between corresponding target points on the blocks. Highly precise positioning data can be transferred to a monitoring server via wireless network, and analyzed to support the decision making which needs to determine the next construction process; further adjustment or seam welding between the ship blocks. The developed system is expected to put to practical use, and increase the productivity during ship blocks assembly.

• 한국공작기계학회논문집
• /
• 제15권5호
• /
• pp.37-43
• /
• 2006

The target of this study is development of web based mold discrimination system by matching vision information with CAD database. The use of 2D vision image makes possible speedy mold discrimination from many databases. The image processing such as preprocessing, cleaning is done for obtaining vivid image with object information. The web-based system is a program which runs to exchange messages between a server and a client by making of ActiveX control and the result of mold discrimination is shown on web-browser. For effective feature classification and extraction, signature method is used to make sensible information from 2D data. As a result, the possibility of proposed system is shown as matching feature information from vision image with CAD database samples.

• 로봇학회논문지
• /
• 제2권1호
• /
• pp.71-79
• /
• 2007

We propose and develop Home Security robot system based on Sensor Network (HSSN) configured by sensor nodes including radio frequency (RF), ultrasonic, temperature, light and sound sensors. Our system can acknowledge security alarm events that are acquired by sensor nodes and relayed in the hop-by-hop transmission way. There are sensor network, Home Security Mobile Robot (HSMR) and Home Server(HS) in this system. In the experimental results of this system, we presented that our system has more enhanced performance of response to emergency context and more speedy and accurate path planning to target position for arriving an alarm zone with obstacle avoidance and acquiring the context-aware information.

• 제어로봇시스템학회:학술대회논문집
• /
• 제어로봇시스템학회 2005년도 ICCAS
• /
• pp.1550-1552
• /
• 2005

In this paper, we have designed a Fingerprint Recognition System based on the Embedded LINUX. The fingerprint is captured using the AS-S2 semiconductor sensor. To extract a feature vector we transform the image of the fingerprint into a column vector. The image is row-wise filtered with the low-pass filter of the Haar wavelet. The feature vectors of the different fingerprints are compared by computing with the probabilistic neural network the distance between the target feature vector and the stored feature vectors in advance. The system implemented consists of a server PC based on the LINUX and a client based on the Embedded LINUX. The client is a Tynux box-x board using a PXA-255 CPU. The algorithm is simple and fast in computing and comparing the fingerprints.