• 제목/요약/키워드: TM4

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Structural Change in Transmembrane Region of Syndecan-4 by Mutation

  • Choi, Sung-Sub;Kim, Ji-Sun;Jeong, Ji-Ho;Kim, Yongae
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제20권4호
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    • pp.129-137
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    • 2016
  • Transmembrane(TM) proteins are closely related to transport, channel formation, signaling, cell to cell interaction, so they are the crucial target of modern medicinal drugs. In order to study the structure and function of these TM proteins, it is important to prepare reasonable amounts of proteins. However, their preparation is seriously difficult and time-consuming due to insufficient yields and low solubility of TM proteins. We tried to produce large amounts of Syndecan-4 containing TM domain(SDC4-TM) that is related to the wound healing and tumor. Also, mutated SDC4-TM was studied to investigate structural change by modification of dimerization motif. We performed the structure determination by the Polarity Index at Slanted Angle (PISA) wheel pattern analysis based on $^{15}N-^1H$ 2D SAMPI-4 solid-state NMR of SDC4-TM and computational modeling using Discovery Studio 2016.

Thermotoga maritima 유래 내열성 cellulase B 융합단백질의 특성 규명 (Characterization of the recombinant cellulase B from Thermotoga maritima)

  • 김정호
    • Journal of Applied Biological Chemistry
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    • 제65권4호
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    • pp.383-386
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    • 2022
  • Thermotoga maritima cellulose B 유전자의 The open reading frame (ORF)은 825 bp이고, cellulase B는 분자량이 약 31,732 kDa인 274개의 아미노산으로 구성되어 있다 이 중 N-말단의 17개 아미노산은 signal peptide로 추정된다. Signal peptide를 제외한 ORF를 pRSET 대장균 발현벡터에 삽입하여 pRBTmCelB를 제조하였다. 6-His tag을 포함하는 TmCelB 융합단백질의 cellulose 분해활성과 생화학적 특성을 분석하기 위해 pRBTmCelB를 대장균 BL21에서 과다발현하였고 순수분리하였다. TmCelB 융합단백질은 cellulose 분해활성을 나타내었고 이 있는 것으로 분석되었다. TmCelB 융합단백질은 약 95 ℃ 부근에서 가장 높은 효소 활성을 나타내었고, 100 ℃에서 최대 활성을 80% 이상 유지하는 것을 확인하였다. 또한 TmCelB 융합단백질은 약 pH 4.5 부근에서 최대 활성을 나타내었고, pH 4.0-6.0 범위에서 최대 활성을 60% 이상 유지하였다. TmCelB 융합단백질은 100 ℃에서 180분 후에도 효소활성을 80% 이상 유지하였다.

RADARSAT과 Landsat TM자료를 이용한 벼 생육모니터링 (Monitoring of Rice Growth by RADARSAT and Landsat TM data)

  • 홍석영;임상규
    • 한국농림기상학회지
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    • 제2권1호
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    • pp.9-15
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    • 2000
  • 날씨ㆍ밤낮에 관계없이 자료를 취득할 수 있는 RADARSAT(C-밴드; 5.3GHz, HH 편광)의 후방산란계수와 태양광에 대한 반사값으로 데이터가 얻어지는 Landsat TM의 자료값(DN; Digital Numbers)을 이용하여 벼 생육과의 관계를 조사하였다. 벼 생육기간 동안 RADARSAT 3시기의 자료를 취득하여 보정 과정을 통하여 지표면의 특성이 잘 나타나는 후방산란계수 (backscatter coefcient)를 산출하였다. 연구지역에서 초장, 엽면적지수, 생체중, 건물중 등 벼의 생육변수를 조사하여 산출된 후방산란계수를 비교하였으며, Landsat TM은 논지역의 6시기 자료값을 산출하여 벼 생육과의 관계를 살펴보았다. 벼의 생육초기 담수상태일 때 논의 후방산란계수 범위는 -22dB--20dB이었고, 벼의 영양생장이 최대에 달했을 때 논의 후방산란계수는 -9dB--8dB 범위로 생육단계별로 뚜렷한 차이를 보였고 생육변수, 초장, 엽면적지수, 생체중, 건물 중 변화와 유사한 경향을 나타내었다 TM 밴드 1, 2, 3의 자료값은 생육후기로 갈수록 낮아졌다가 등숙기에 다시 높아졌고, TM 밴드 4의 자료값은 생육후기로 갈수록 높아졌다가 등숙기에 낮아지는 경향이었다. TM밴드 5와 7의 자료값은 생육기간 동안 계속 증가하여 건물중의 변화추세와 유사하였다. 시계열 RADARSAT과 Landsat TM자료를 이용한 벼 생육모리터링은 전망이 있는 것으로 보인다.

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HalcyonTM 선형가속기 6MV-FFF 에너지의 표재 선량에 대한 고찰: Phantom Study (A Study on Superficial Dose of 6MV-FFF in HalcyonTM LINAC: Phantom Study)

  • 최성훈;엄기천;유순미;박제완;송흥권;윤인하
    • 대한방사선치료학회지
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    • 제32권
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    • pp.31-39
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    • 2020
  • 목 적: 본 연구는 HalcyonTM과 TrueBeamTM에서 사용하는 6MV-FFF(Flattening Filter Free) 에너지를 이용하여 전산화치료계획시스템(Treatment Planning System, TPS)에서 계산된 선량과 광자극형광선량계(Optically Stimulated Luminescence Dosimeter, OSLD)로 측정된 표재 선량(Superficial dose)을 비교하고자 한다. 재료 및 방법: 팬텀연구를 위해 인체모형 팬텀(Human Phantom)의 CT 영상을 이용하여 치료계획시스템에서 성문암(Glottic cancer)과 유사한 치료계획용적(Planning Target Volume, PTV)과 두경부위의 등 중심점(Iso-center) 위치에 측정을 위한 Point(M), Point(R), Point(L)의 구조물을 설정하고 체표윤곽(Body contour)에 5mm Bolus를 적용하였다. 그 후 전산화치료계획은 HalcyonTM과 TrueBeamTM의 6MV-FFF 에너지를 이용하여 정적(Static) 세기변조방사선치료(Intensity Modulated Radiation Therapy, IMRT)와 용적변조회전치료(Volumetric Modulated Arc Therapy, VMAT)계획을 각각 수립하였다. 전산화치료계획과 동일하게 재현하기 위해 OSLD를 등 중심점에 위치시키고 5mm Bolus를 적용하여 선량 전달 후 오차율을 비교하였다. 결 과: 인체모형 팬텀을 사용한 실험 결과 HalcyonTM의 전산화치료계획시스템에서의 점 선량과 OSLD를 이용한 선량 측정의 오차율의 절댓값의 평균은 VMAT, IMRT 각각 1.7±1.2%, 4.0±2.8%로 확인되었으며, TrueBeamTM의 오차율의 절댓값의 평균은 VMAT, IMRT 각각 2.4±0.4%, 8.6±1.8%로 확인되었다. 결 론: 실험결과 HalcyonTM을 기준으로 TrueBeamTM에서 VMAT과 IMRT 각각 2.4배, 3.6배 더 큰 오차가 발생하는 것을 확인할 수 있었다. 따라서 본 연구의 결과를 토대로 표재 선량에 대한 정확한 선량평가가 이루어져야 하는 경우, TrueBeamTM보다 HalcyonTM에서 정확한 선량 평가가 이루어질 수 있을 것으로 사료된다.

Bi-directional energy transfer process in Er3+-Tm3+-codoped fluorozirconate glasses

  • Cho, Woon-Jo;Kim, Myong-Wook;Kim, Snag-Hyuck;Jo, Jae-Cheol;Choi, Sang-Sam
    • Journal of the Optical Society of Korea
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    • 제1권1호
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    • pp.5-9
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    • 1997
  • Energy transfer direction in $Er^{3+}-Tm^{3+}$-codoped fluorozirconate glasses has been studied. For $Er^{3+}-Tm^{3+}$-codoped glasses, the dependence of the green emission intensity on the pump power (Pex) of 800 nm has ranged from (Pex)$^2$ to (Pex)$^3$. From this multistep absorption, a 1.48 $\mu m$ emission from the $^3F_4{\rightarrow}^3H_4$ transition on Tm$^{3+}$ ion has been found to transfer into $^4I_{13/2}$, $^4I_{9/2}$ and $^4S_{3/2}$ on $Er^{3+}$ ion. In case of the 1.06 $\mu m$ pumping, the emissin ratio of $^3H_4$ level in $Tm^{3+}$ to $^4I_{13/2}$ in $Er^{3+}$ showed that the amount of the energy transfer from $Tm^{3+}$ into $Er^{3+}$ increased with the increasing concentration of $Tm^{3+}$ ion. Our two kinds of pumping scheme suggest that the direction of dominant energy transfer between $Er^{3+}$ and $Tm^{3+}$ should be dependent on whether the $^3F_4$ level resonates in $Tm^{3+}$ the level or not.

Topographic Relief Mapping on Inter-tidal Mudflat in Kyongki Bay Area Using Infrared Bands of Multi-temporal Landsat TM Data

  • Lee, Kyu-Sung;Kim, Tae-Hoon
    • 대한원격탐사학회지
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    • 제20권3호
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    • pp.163-173
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    • 2004
  • The objective of this study is to develop a method to generate micro-relief digital elevation model (DEM) data of the tidal mudflats using multi-temporal Landsat Thematic Mapper (TM) data. Field spectroscopy measurements showed that reflectance of the exposed mudflat, shallow turbid water, and normal coastal water varied by TM band wavelength. Two sets of DEM data of the inter-tidal mudflat area were generated by interpolating several waterlines extracted from multi-temporal TM data acquired at different sea levels. The waterline appearing in the near-infrared band was different from the one in the middle-infrared band. It was found that the waterline in TM band 4 image was the boundary between the shallow turbid water and normal coastal water and used as a second contour line having 50cm water depth in the study area. DEM data generated by using both TM bands 4 and 5 rendered more detailed topographic relief as compared to the one made by using TM band 5 alone.

IRS-1C PAN 데이터와 Landsat TM 데이터의 IHS중합화상을 이용한 토지이용분류 정확도 분석 (An Analysis of the Landuse Classification Accuracy Using IHS Merged Images from IRS-1C PAN Data and Landsat TM Data)

  • 안기원;이효성;서두천;신석효
    • 한국측량학회지
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    • 제16권2호
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    • pp.187-194
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    • 1998
  • 본 연구에서는 높은 해상력의 IRS-1C PAN 데이터와 다양한 관측파장대를 갖고 있는 Landsat TM 데이터를 사용하여, 화상중합방법의 대표적 방법인 IHS방법으로 중합화상을 작성하고, IHS중합화상 및 원화상을 이용하여 토지이용분류를 수행하는데 있어서 어떤 칼라합성밴드가 유효한지를 밝히는데 그 목적이 있다. 분류결과를 평가하기 위해서 10개의 분류항목으로 구성된 sample data를 생성시켰으며, 생성된 sample data의 전체정확도(overall accuracy)로서 분류결과를 평가하였다. 그 결과 Landsat TM 데이터와 IRS-1C PAN데이터를 IHS방법으로 중합하여 토지이용분류를 수행할 경우, TM4, TM5 및 TM7의 적외선영역(infrared spectral region)의 밴드 중 2개 밴드를 포함시켜 분류를 수행하는 것이 좋았으며, 특히 TM 247 중합화상의 경우 분류정확도가 11.8%로 향상되어 가장 좋은 결과를 나타내었다. 또한 토지이용분류를 수행할 경우 3밴드를 중합하여 사용하는 경우보다 1% 원화상에 IRS-1C PAN화상을 추가하여 사용하는 경우의 정확도가 전체적으로 높았다.

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Expression, Purification and NMR Studies on MC4R-TM2 Mutant

  • Oh, Dae-Seok;Yun, Ji-Hye;Lee, Weon-Tae
    • 한국자기공명학회논문지
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    • 제16권1호
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    • pp.34-45
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    • 2012
  • Melanocortin-4 receptor (MC4R) subtype is associated with obese humans. Especially, in a patient with severe early-onset obesity, novel heterozygous mutation in the MC4R gene was detected, resulting in an exchange of aspartic acid to asparagine in $90^{th}$ amino acid residue located in the predicted second trans-membrane domain (TM2). Mutations in the melanocortin-4 receptor (MC4R) gene are the most frequent monogenic causes of severe obesity which have been described as heterozygous with loss of function. In order to compare structure difference between MC4R wild type (MC4R-TM2-wt) and mutant (MC4R-TM2-D90N), we designed both MC4R-TM2-wt and MC4R-TM2-D90N construct in pET 21b vector. In this study, we optimized high-yield purification procedure for recombinant TM2-D90N. Eluted recombinant protein was resolubilized under urea condition for thrombin cleavage reaction and we conducted the high-performance liquid chromatography (HPLC) with reverse phase column under 1% acetonitrile, 0.01% TFA buffer solution. The molecular size of purified target peptide was confirmed by Tricine-SDS page analysis. To characterize MC4R-TM2-D90N, we have performed $^{15}N$-isotope labeling of peptide using M9 media and purified labeled target peptide for hetero-nuclear NMR spectroscopy.

LANDSAT-5의 TM과 MSS 데이타의 비교에 관한 연구 -인천지역의 토지이용분류를 중심으로- (A Study on the Comparison of LANDSAT-5 TM and MSS Data -laying stress on the landuse mapping of Incheon area-)

  • 안철호;박병욱
    • 한국측량학회지
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    • 제4권2호
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    • pp.27-41
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    • 1986
  • 본 연구에서는 LANDSAT- 5호의 TM과 MSS 데이타를 비교분석함으로서 TM 데이타의 활용방안에 대한 검토를 하고자 하였다. TM과 MSS 데이타의 비교는 인천지역의 토지이용분류 결과를 중심으로 이루어졌으며, 아울러 화상강조처리의 방법에 따른 정확도의 비교도 행하였다. 연구결과, 토지이용분류에 있어서 TM 데이타가 MSS보다 약 20%의 정확도 향상을 가져왔으며, TM 화상의 강조처리에서는 평활화처리가 효과적이었음을 알 수 있었다.

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THz Filter Using the Transverse-electric (TE1) Mode of the Parallel-plate Waveguide

  • Lee, Eui-Su;Jeon, Tae-In
    • Journal of the Optical Society of Korea
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    • 제13권4호
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    • pp.423-427
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    • 2009
  • The results of the experimental and theoretical studies conducted on terahertz filtering using two parallel-plate waveguides (PPWGs) are presented herein. The first PPWG with 355 ${\mu}m$ plate separation generates 4 THz bandwidth TM modes ($TM_0,\;TM_2,\;and\;TM_4$), whereas the second PPWG with 100 ${\mu}m$ plate separation operated the THz filter for the generated TM modes with 1.5 THz cutoff frequency. The outgoing THz wave of the two PPWGs was truncated until 1.5 THz, and the system was operated using a high-pass THz filter. The absorption and dispersion of the combined TM and TE modes for the filtering system were calculated. The theoretical calculation and measurement results for the cutoff and oscillation frequency in the spectrum domain agreed well.