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다중 중합효소 연쇄반응을 이용한 DNA 바이러스의 동시검출 (Simultaneous Detection of Cytomegalovirus, Epstein-Barr Virus, Hepatitis B Virus, and Parvovirus by a Multiplex PCR)

  • 성혜란;주진영;이종길;정연복;송석길
    • 미생물학회지
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    • 제43권1호
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    • pp.1-6
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    • 2007
  • Epstein-Barr virus (EBV), cytomegalovirus (CMV), hepatitis B virus (HBV), parvovirus B19 (B19)등 4종의 바이러스는 인체에 감염을 일으키는 병원체로서 DNA를 유전물질로 함유한다. 각 바이러스 유전자의 염기서열을 분석하여 EBV CMV, HBV의 pol 유전자와 B19의 ns 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 primer를 설계 제작하고 단일 시험으로 4종의 바이러스를 동시에 검출할 수 있는 다중 중합효소 연쇄반응(Multiplex PCR)법을 확립하였다. Primer 염기서열, PCR 반응조성물의 농도, PCR 반응시간 및 온도조건을 최적화하여 민감도를 증대시킴으로써, 단일 시험으로 5-10 분자수의 유전물질까지 검출이 가능하였다. 또한 4종의 바이러스 사이에 교차반응이 일어나지 않았으며 생체시료를 이용한 시험에서도 특이성과 민감도가 유지됨을 확인하였다. 그러므로 본 연구에서 확립한 다중 중합효소 연쇄반응은 세포배양액 또는 생체 시료에 감염된 4종 DNA 바이러스진단에 효율적으로 이용할 수 있을 것이라고 판단된다.

국가수준의 과학데이터 시각화 지원체계에 관한 연구 (A Study on the Supporting System for Scientific Data Visualization at the National Level)

  • 박동진;채균식;류범종;이상태
    • 정보관리연구
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    • 제42권2호
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    • pp.85-102
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    • 2011
  • 전통적으로 과학데이터 시각화는 데이터 분석과 관련이 깊은 연구 수행과정 중의 하나로 간주되어 왔다. 그러나 최근 들어서 과학데이터 시각화의 연구영역 자체가 독립적인 학문분야로서 자리를 잡기 시작하면서 시각화의 기술 및 방법들이 점차 고도화되고 복잡해지고 있다. 그러나 과학데이터 시각화 연구가 개인 및 그룹의 연구자들 스스로의 노력으로 시각화 문제를 해결하는 데 있어서 한계가 있다. 따라서 전문집단에 의한 체계적인 지원의 필요성이 대두되고 있으며, 본 연구는 거시적 관점의 국가수준에서 어떻게 과학데이터 시각화를 체계적으로 지원할 것인가를 정책적인 시각에서 분석하였다. 구체적으로 기존 문헌의 조사를 통하여 주요 성공요인들을 파악하였으며, 집중적으로 투자해야 할 연구의 영역을 설정하였다. 다음으로 국가수준의 시각화 연구지원의 전략적인 방향과 전략적 과제를 제언하였다.

객체지향 시스템으로부터 컴포넌트를 식별하기 위한 모델 기반의 정량적 재공학 (Model-Based Quantitative Reengineering for Identifying Components from Object-Oriented Systems)

  • 이은주
    • 정보처리학회논문지D
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    • 제14D권1호
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    • pp.67-82
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    • 2007
  • 객체지향 기술은 단위가 되는 클래스가 지나지게 세밀하고 한정적이어서 재사용의 효용이 떨어진다. 컴포넌트는 객체보다 큰 단위로서 복잡도를 효율적으로 관리해주고 품질과 재사용성을 향상시킨다. 또한 MDA나 SOA와 같은 새로운 프레임워크가 등장하면서 컴포넌트 기술의 중요성은 더 커지게 되었다. 따라서 객체지향 시스템을 분석하여 새로운 환경에 적합한 컴포넌트로 재공학하는 기술이 필요하다. 본 논문에서는 객체지향 시스템으로부터 컴포넌트를 식별하기 위한 모델 기반의 정량적 재공학 방법을 제안한다. 본 방법에서는 이전 연구를 확장하여 시스템모델과 프로세스를 상세히 정의하고 정형화하였다. 객체지향 시스템으로부터 시스템 모델을 구성하고 이 모델을 사용하여 정량적 방법으로 컴포넌트들을 추출하고 정제한다. 또한 지원 도구를 개발하여 현재 존재하는 객체지향 시스템에 적용하여 유효성을 확인한다.

영역 기반 영상 검색을 위한 다중클래스 피드백 알고리즘 (Multi-class Feedback Algorithm for Region-based Image Retrieval)

  • 고병철;남재열
    • 정보처리학회논문지B
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    • 제13B권4호
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    • pp.383-392
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    • 2006
  • 본 논문에서는 영역기반 영상검색의 성능 향상을 위한 피드백 알고리즘으로 다중 클래스를 갖는 확률적 신경망(Probabilistic Neural Networks)을 이용한 방법론을 제안하고 이를 영역기반 영상 검색 시스템인 FRIP(Finding Regions In the Pictures) 시스템에 적용하였다. 본 논문에서 제안하는 피드백 알고리즘은 특정 벡터가 독립적이라는 가정을 할 필요가 없으며 보다 상세한 분류를 위해 추가적인 클래스들을 추가할 수 있도록 허용하고 있다. 또한 단지 4개 층(layer)만을 가지고 있음으로 학습을 위한 계산시간이 적게 든다는 장점이 있다. 추가적으로 다음단계에서의 성능 향상을 위해 분류 단계에서 사용자의 이전 피드백 행동을 모두 히스토리(history)로 모두 기억시켜 놓고 다음 단계를 위한 가중치 학습을 위해 사용하도록 한다. 히스토리를 사용함으로써 제안하는 알고리즘은 사용자의 주관적 의도를 보다 정확하게 파악 할 수 있을 뿐만 아니라 학습을 위해 이전 단계만을 사용 했을 때 발생할 수 있는 성능 감소를 막을 수 있다. 본 논문에서는 Corel-photo CD에서 3000장의 자연 영상을 무작위로 추출하여 기존의 방법론들과 제안하는 방법론의 성능을 측정하여 본 논문에서 제안하는 방법론이 성능이 우수함을 증명하였다.

In Vivo Wound Healing Activity of Crocodile (Crocodylus siamensis) Hemoglobin and Evaluation of Antibacterial and Antioxidant Properties of Hemoglobin and Hemoglobin Hydrolysate

  • Pakdeesuwan, Anawat;Araki, Tomohiro;Daduang, Sakda;Payoungkiattikun, Wisarut;Jangpromma, Nisachon;Klaynongsruang, Sompong
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제27권1호
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    • pp.26-35
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    • 2017
  • The hydrolysis of proteins constitutes an invaluable tool, granting access to a variety of peptide fragments with potentially interesting biological properties. Therefore, a hemoglobin (Hb) hydrolysate of Crocodylus siamensis was generated by digestion under acidic conditions. The antibacterial and antioxidant activities of the Hb hydrolysate were assessed in comparison with intact Hb. A disc diffusion assay revealed that the Hb hydrolysate exhibited antibacterial activity against eight strains of gram-positive bacteria and showed a higher efficacy than intact Hb. Moreover, the antioxidant activity of intact Hb and its hydrolysate was evaluated using ABTS and DPPH radical scavenging assays. The Hb hydrolysate exhibited free radical scavenging rates of 6-32%, whereas intact Hb showed a slightly higher activity. In addition, non-toxicity to human erythrocytes was observed after treatment with quantities of Hb hydrolysate up to $10{\mu}g$. Moreover, active fragmented Hb (P3) was obtained after purifying the Hb hydrolysate by reversed-phase HPLC. Scanning electron microscopy demonstrated the induction of bacterial cell membrane abnormalities after exposure to P3. Antibacterial and antioxidant activities play crucial roles for supporting the wound healing activity. Consequently, an in vivo mice excisional skin wound healing assay was carried out to investigate the effects of intact Hb treatment on wound healing in more detail. The results clearly demonstrate that intact Hb is capable of promoting 75% wound closure within 6 days. These findings imply that intact Hb of C. siamensis and its acid hydrolysate may serve as valuable precursors for food supplementary products benefitting human health.

지속가능한 순천만을 위한 보호지역 확대와 정책적 활용을 위한 생태계 서비스 지불제(PES)의 적용 (Establishment of Additional Protected Areas and Applying Payment for Ecosystem Services(PES) for Sustainability of Suncheonman-Bay)

  • 모용원;박진한;손용훈;이동근
    • 한국환경복원기술학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.171-184
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    • 2016
  • Suncheonman-Bay and its surrounding areas play important roles as habitats for migratory birds. However, sustainable management of these areas is difficult because of the development pressure of private lands. Therefore, the areas surrounding Suncheonman-Bay must be classified as additional protected areas; for this, it is necessary to gather concrete and objective evidence and ensure protected area management. Further, compensation measures must be considered when acquiring a private property as an additional protected area. In this study, we distinguish protected areas, such as core, buffer, and transition areas, within a private area by using data from the Winter Waterbird Census of Korea and MARXAN software, a spatial conservation prioritization tool. We applied ecosystem services to apply Payment for Ecosystem services (PES) as compensation measures. Watershed conservation (supply), climate control (regulation), supporting habitats (support), and recreation (culture) etc. were evaluated by calculating the economic value of these ecosystem services. Eastern, western, and northern forests and rice fields of Suncheonman-Bay were shown to have a number of core areas for the preservation of endangered species. The ecosystem service value of the additional protected areas was estimated at 17.5 million KRW/ha/year. We believe that our study result could be used to establish protected areas to preserve major habitats, as well as include areas adjacent to such major habitats that play a vital role in endangered species conservation. In addition, through this study, we highlight the need for an objective basis to establish protected areas.

차량과 노변기지국간 전용 무선 데이터 통신을 이용한 차량위치 추적 시스템 (AVLS Using the Dedicated Wireless Communication between Vehicle and Road-Side Equipment)

  • 홍승범;이정구;나원;최은석;백중환;황병원
    • 한국항행학회논문지
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    • 제4권2호
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    • pp.171-181
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    • 2000
  • 본 논문에서는 DSRC(Dedicated Short Range Communication) 시스템을 이용하여 이동하는 차량에 탑재된 단말장치(OBE : On-Board Equipment)와 도로변에 설치된 기지국 장치 (RSE : Road-Side Equipment) 사이에 5.8GHz대 ISM대역의 주파수를 사용한 무선패킷통신방식을 통한 차량위치 추적 시스템을 제안한다. 기존의 차량 위치 추적 방식은 차량위치를 파악하여 차량위치를 센터와 사용자에게 전송하는 무선 통신방식으로 단순한 센서만 사용되었지만, 본 시스템은 차량의 위치, 통관, 차량간 통신, 교통정보 수집 및 분배 등의 다양한 업무를 수행하도록 개발되었다. 또한, 빠른 처리를 위해 통신 계층 중 물리, 데이터링크, 응용계층으로 설계하여, 기존의 무선 통신방식 및 센서를 대체할 새로운 기술로 제안한다.

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e-Science 서비스 통합 워크벤치를 위한 그리드 미들웨어 지원 (Grid Middleware Support for e-Science Service Integration Workbench)

  • 서영균;김병상;남덕윤;이준학;황순욱
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2007년도 추계 종합학술대회 논문집
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    • pp.574-577
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    • 2007
  • e-Science 서비스 통합 워크벤치는 IT를 기반으로 하는 계산 및 공학 연구자의 연구 활동을 반자동화함로써, 데이터 공유를 통한 협업 연구를 가능하게 하는 핵심 도구이다. 워크벤치는 연구자가 필요로 하는 서비스 -웹 서비스 또는 그리드 서비스로 포장된 응용코드- 를 언제든지 찾고, 등록하고, 구성하고, 실행할 수 있는 환경을 구축함으로써 이러한 연구자들의 연구 플로우를 지원한다. 즉 연구자들은 워크벤치를 통해 그들의 연구 플로우를 구성하여, 그리드나 수퍼컴퓨팅과 같은 계산 자원에 자신들이 실행하기 원하는 작업을 제출하거나 실험을 요청함으로써, 최종 결과를 돌려받거나 공유할 수 있게 된다. 본 논문은 그리드 미들웨어의 서비스를 지원하기 위한 워크벤치의 구현 아키텍처를 제안한다.

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온톨로지 구축 지원을 위한 과학기술 문헌으로부터의 인력정보 구축 (Construction of Human Resources from Science & Technology Publications for Supporting of Ontology Construction)

  • 정한민;이승우;강인수;성원경
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2006년도 춘계 종합학술대회 논문집
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    • pp.223-226
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    • 2006
  • 시멘틱 웹의 발전은 정보의 규격화, 의미화를 통한 지식을 기본으로 요구하며, 온톨로지는 이러한 지식 표현을 위해 필수적으로 사용되는 도구이다. 온톨로지 상에서 Individual들은 식별체계인 URI(Universal Resource Identifier)를 이용하여 유일하게 지칭될 수 있어야 한다. 그렇지만, 현실에서 식별체계를 사용하는 경우를 발견하기가 힘들며, 특히 논문과 같은 과학기술 문헌은 그 적용 대상에서 제외되어 왔다. 이러한 이유로 인해 과학기술 문헌상의 인력정보를 식별체계 기반으로 구축하고자 하는 시도가 미약한 실정이었다. 이에 본 논문은 과학기술 문헌을 포함한 국가 과학기술 R&D 기반정보 온톨로지 구축에서 중심이 되는 인력정보를 URI 기반으로 구축하는 방법을 기술한다. 공저자 관계, 이메일, 출판 연도, 소속기관 등을 이용하여 동명이인 문제를 해소하고, 각 저자 그룹 별 URI 부여를 위해 국가과학기술인력 종합정보시스템을 활용한 사례를 소개한다. 이러한 과정을 통해 7,175건의 논문들로부터 획득한 인력정보는 연구자 네트워크 분석, 성과 통계 등 다양한 시멘틱 웹 응용 분야들에 기초적으로 활용될 것으로 기대한다.

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TRIZ를 활용한 사례 기반 서비스 개선 방법론 개발 (Development of Case-based Service Improvement Methodology By Utilizing TRIZ Concept)

  • 홍정완;최재호;전영호
    • 한국전자거래학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.107-127
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    • 2013
  • 서비스 산업은 21세기 새로운 비즈니스 핵심으로 부각되고 있다. 현대 산업에서 서비스 산업은 제조업을 지원하는 산업에서 탈피하여 제조업의 성장을 리드하는 산업으로 급부상하였다. 기업들은 기존 서비스의 개선을 통해 고객들의 다양한 요구사항을 충족시켜 주고자 하였으나, 서비스 개발자의 직관적인 판단에 근거한 서비스의 개선은 높은 실패율을 보이고 있다. 따라서 본 논문에서는 서비스 개발자의 개선 방향성을 지원하기 위해 서비스 개선방법론을 개발하였다. 이 방법론은 120개의 수집된 사례를 바탕으로 TRIZ 모델의 개념을 활용하여 개발되었다. 그 결과 사례 기반 서비스 개선 방법론(Case-based Service Improvement Methodolog; CSIM)이 개발되었고, 이는 서비스 개발자의 창의적인 문제해결을 지원하는 도구로 활용될 수 있을 것이다.