• 산업경영시스템학회지
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• 제25권1호
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• pp.35-41
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• 2002

XML(eXtensible Markup Language) based electronic catalog is very useful for searching target information because of its structural and contents based searching support capability. And XML document editing is easier than HTML because of XML document is divided by structure, contents and presentation. This paper is to present a prototype of XML based Electronic Catalog Management System(ECMS) whose system consists of data input, output and manipulation system for inserting, updating, editing and deletion. A proposed system could resolved the problems at virtual intermediary shopping mall invloved in the difficulty of interoperability when customer try to compare similar products at mixed shopping mall and reduced web service costs at independent shopping mall by using XML format. The proposed ECMS offers rapid response capability for product data change of electronic catalog and easy and friendly interoperability among similar products.

• Genomics & Informatics
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• 제6권3호
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• pp.157-159
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• 2008

Multiple sequence alignment (MSA) is the most important step for many of biological sequence analyses, homology search, and protein structural assignments. However, large amount of data make biologists difficult to perform MSA analyses and it requires much computational time to align many sequences. Here, we have developed a simple and fast web alignment tool for aligning, editing, and visualizing large amount of sequence data. We used a cluster server installed ClustalW-MPI using web services and message passing interface (MPI). It also enables users to edit multiple sequence alignments for manual editing and to download the input data and results such as alignments and phylogenetic tree.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
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• 한국해양정보통신학회 2003년도 춘계종합학술대회
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• pp.277-280
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• 2003

초기의 웹(Web)이 비구조적인 문서를 사용함으로써 발생하는 단점인 문서 처리와 교환 및 재사용성에 대한 해결책으로서 W3C(World Wide Web Consortium)에서 1998년 2월에 XML(extensible Markup Language)을 제정하였다. XML을 사용함으로써 기존 전자거래는 XML 기반 메시지 교환을 통한 기업간 전자거래 형태로 변화하고 있으며, 이러한 기업간 전자거래에 사용되는 XML 기반의 구조화된 전자문서를 저작 할 수 있는 솔루션에 대한 필요성이 대두되었다. 이에 본 논문에서는 XML 문서를 효율적으로 편집 및 저작 할 수 있는 사용자 중심의 XML 인스턴스 편집기와 XML 문서의 구조를 정의하는 XML 스키마 문서를 저작하기 위한 XML 스키마 편집기를 통합한 XML 문서편집 시스템에 관한 연구를 하였다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제7권3호
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• pp.513-518
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• 2003

초기의 웹(Web)이 비구조적인 문서를 사용함으로써 발생하는 단점인 문서 처리와 교환 및 재사용성에 대한 해결책으로서 W3C(World Wide Web Consortium)에서 1998년 2월에 XML(eXtensible Markup Language)을 제정하였다. XML을 사용함으로써 기존 전자거래는 XML 기반 메시지 교환을 통한 기업간 전자거래 형태로 변화하고 있으며, 이러한 기업간 전자거래에 사용되는 XML 기반의 구조화된 전자문서를 저작할 수 있는 솔루션에 대한 필요성이 대두되었다. 이에 본 논문에서는 XML 문서를 효율적으로 편집 및 저작 할 수 있는 사용자 중심의 XML 인스턴스 편집기와 XML 문서의 구조를 정의하는 XML 스키마 문서를 저작하기 위한 XML 스키마 편집기를 통합한 XML 문서편집 시스템에 관한 연구를 하였다.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제6권7호
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• pp.1106-1112
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• 2002

인터넷을 통한 디지털 컨텐츠의 활발한 유통은 디지털 컨텐츠를 보호함과 동시에 컨텐츠 대한 저작권정보를 표현하고 관리하는 데에 많은 관심을 갖게 하였다. 이에 디지털 컨텐츠에 대한 저작 권 정보의 효율 적인 표기 및 저장, 공유를 가능하게 하기 위해 XML(extensible Markup Language)의 한 어플리케이션인 XrML(extensible rights Markup Language)이 W3C를 중심으로 각 벤더들에 의해 제정되었다. 이 XrML 문서의 작성으로 디지털 컨텐츠에 대한 저작권 정보를 구조적인 언어로 표현할 수 있게 되었으며, XrML 문서를 효과적으로 작성하기 위해서는 XrML의 구조적 정보를 이용한 사용자가 효율적으로 편집할 수 있는 시스템이 필요하게 되었다. 이에 본 논문에서는 디지털 컨텐츠에 대한 저작권이나 사용 조건에 대해 기술 할 수 있는 XrML 문서를 사용자가 효율적으로 편집할 수 있도록 디지털 컨텐츠 저작권 관리를 위한 XrML 문서 편 집 시스템을 설계 및 구현하였다.

• 정보관리학회지
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• 제19권4호
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• pp.96-111
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• 2002

현재 기관이나 조직 내에 수많은 양의 데이터가 축적되어 존재하고 있으나 대부분의 데이터는 각 기관이나 조직에 따라 정형화된 형태로 남아있는 실정이다. 정형화된 정보는 정보의 교환 및 공유에 어려움이 있다. 이러한 단점을 극복하고자 지식정보자원관리라는 새로운 개념이 도입되었으며, 축적된 데이터들을 공유 및 관리하기 위한 지식정보자원의 디지털화가 실행되고 있다. 특히 과학기술 또는 교육학술 분야에서는 지식정보자원의 교환 및 공유에 필요한 데이터를 구조적으로 처리하고자 XML을 도입하려는 움직임이 일고 있으며, 이들 분야의 전자문서 안에 사용되어지는 수많은 수학식의 표현이 이미지나 텍스트 등의 비구조적인 데이터로 처리됨에 따라 검색과 인덱싱 또는 재사용성 등의 제한사항이 발생하게 된다. 이를 극복하고자 MathML을 이용한 수학식의 처리에 관심이 집중되고, MathML을 구조적인 문서상에 쉽고 효율적으로 처리할 수 있는 솔루션이 요구되고 있는 실정이다. 이에 본 논문에서는 지식정보자원을 목적으로 하는 전자문서의 구조적인 처리를 용이하게 하고, MathML에 대한 전문적인 지식이 없어도 구조적인 문서상에 쉽게 MathML을 생성 및 표현할 수 있는 XML 문서 편집 시스템을 구현하였다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제26권12호
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• pp.2019-2029
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• 2016

Zinc finger proteins are among the most extensively applied metalloproteins in the field of biotechnology owing to their unique structural and functional aspects as transcriptional and translational regulators. The classical zinc fingers are the largest family of zinc proteins and they provide critical roles in physiological systems from prokaryotes to eukaryotes. Two cysteine and two histidine residues ($Cys_2His_2$) coordinate to the zinc ion for the structural functions to generate a ${\beta}{\beta}{\alpha}$ fold, and this secondary structure supports specific interactions with their binding partners, including DNA, RNA, lipids, proteins, and small molecules. In this account, the structural similarity and differences of well-known $Cys_2His_2$-type zinc fingers such as zinc interaction factor 268 (ZIF268), transcription factor IIIA (TFIIIA), GAGA, and Ros will be explained. These proteins perform their specific roles in species from archaea to eukaryotes and they show significant structural similarity; however, their aligned amino acids present low sequence homology. These zinc finger proteins have different numbers of domains for their structural roles to maintain biological progress through transcriptional regulations from exogenous stresses. The superimposed structures of these finger domains provide interesting details when these fingers are applied to specific gene binding and editing. The structural information in this study will aid in the selection of unique types of zinc finger applications in vivo and in vitro approaches, because biophysical backgrounds including complex structures and binding affinities aid in the protein design area.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
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• 한국해양정보통신학회 2003년도 추계종합학술대회
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• pp.500-503
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• 2003

인터넷 상에서 데이터 교환의 표준으로 광범위하게 사용되고 있는 XML(extensible Markup Language)은 HTML(HyperText Markup Language) 등의 기존의 문서 작성 언어를 대치할 기술로 주목받고 있다. 이러한 XML의 가장 큰 특징은 문서의 구조적인 내용을 표함하는 논리정보와 문서의 스타일을 표현하는 물리적인 정보가 분리되었다는 점이다. 이에 W3C(World Wide Web Consortium)에서는 XML의 스타일과 데이터 변환을 위하여 HTML과 유사한 형식의 스타일 기능을 제공하는 XSL(eXtensible Stylesheet Language)을 권고하였다. 또한 XSL의 변환(XSLT : XSL Transformation)기능은 XML 문서를 다른 데이터 형식으로 변환해주는 기능을 제공하며, 다양한 문서 형식으로의 변환을 통해 스타일 정보를 기술할 수 있다. 그러나 국내에는 XSLT 기술을 이용한 XML 문서 변환 기술이 미비한 실정이며, XSLT 문서를 효율적으로 편집할 수 있는 솔루션에 대한 필요성이 대두되고 있다. 이에 본 논문은 XML 문서를 다양한 문서 형식으로 변환 및 출력이 가능하고, WYSIWYG 환경하에서 XSLT문서를 효율적으로 편집하고 저작할 수 있는 XSLT 문서편집 시스템을 설계 및 구현하였다.

• 한국정보통신학회:학술대회논문집
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• 한국해양정보통신학회 2003년도 춘계종합학술대회
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• pp.281-284
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• 2003

인터넷의 급속한 발전은 표현의 고급화와 보편성을 제공하는 웹을 주축으로 하여 이루어져 왔으나, 웹 상에서 표현중심의 그래픽처리에는 비구조적인 방법에 따른 많은 문제점을 가지고 있다. 이러한 문제점을 보완하고자 W3C에서는 웹 상에서 벡터그래픽 표현의 효율적인 표현 및 저장, 공유를 가능하게 하기 위해 XML 어플리케이션인 SVG를 제정하였다. 이에 본 논문에서는 SVG 문서를 이용하여 그래픽 편집기 형태로 SVG의 구조적 편집 및 화면에 표현되는 그래픽 객체를 직접 편집할 수 있는 인터페이스를 통해 벡터그래픽을 편집하고 표현하기 위한 SVG 편집시스템을 설계하였다. 본 시스템은 지리정보시스템이나 서비스 환경 등에서 XML기반의 그래픽을 표현하는 효율적인 처리 등에 유용하게 사용할 수 있을 것이다.

• BMB Reports
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• 제49권4호
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• pp.201-207
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• 2016

The CRISPR-Cas system has emerged as a fascinating and important genome editing tool. It is now widely used in biology, biotechnology, and biomedical research in both academic and industrial settings. To improve the specificity and efficiency of Cas nucleases and to extend the applications of these systems for other areas of research, an understanding of their precise working mechanisms is crucial. In this review, we summarize current studies on the molecular structures and dynamic functions of type I and type II Cas nucleases, with a focus on target DNA searching and cleavage processes as revealed by single-molecule observations.