• 제목/요약/키워드: Standard swab

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CLSI M40-A2 기준에 따른 수송배지의 흡수 및 배출, 생존 효율, 회수율 평가 (Evaluation of Absorption and Release, Survival Efficiency and Recovery Rate of Transport Medium according to the CLSI M40-A2 Standard)

  • 하성일;석현수;신정섭;허웅;박강균;박연준
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제51권2호
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    • pp.164-170
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    • 2019
  • 5종류의 수송배지를 흡수 및 배출 능력, 생존 효율, 회수율을 CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) M40-A2의 Swab elution method (Quantitative) 기준으로 평가하였다. 액체배지가 반유동 배지보다 3가지 평가에서 대부분 우수한 결과값을 보여주었다. Flocked swab이 standard swab 형태보다 균의 흡수 및 배출의 능력 또한 우수하였다. 생존 효율에 대한 평가 결과는 액체배지(S4)가 가장 우수한 결과값을 보였다. 성장이 좋지 않은 S. pneumoniae는 액체배지(S4, S5)에서 생존효율과 회수율이 높았다. 균 회수율 평가 결과는 S. pyogenes는 모든 배지에서 CLSI 기준에 적합하였다. S. pneumoniae는 반유동 배지(S2, S3)에서 부적합하였고, 나머지 배지는 모두 기준에 적합하였다. H. influenzae는 반유동 배지(S1, S3)에서 부적합하였고, 반유동 배지(S2), 액체배지(S4, S5)에서 기준에 적합하였다. 호흡기 질환을 유발하는 S. pneumonia, H. influenzae의 생존 능력은 대부분의 배지에서 좋지 않았다. P. aeruginosa는 실온에서 과성장이 관찰되었다. 액체배지와 flocked swab의 조합이 3가지 평가 방법에서 가장 뛰어난 결과를 평가를 통해 확인하였다.

만성 당뇨발에서 표재조직 및 심부조직 세균배양검사의 비교 (Difference of Microbiology according to Tissue Sampling in Diabetic Ulcers)

  • 이성미;한승규;김우경
    • Archives of Plastic Surgery
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    • 제37권1호
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    • pp.1-6
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    • 2010
  • Purpose: Diabetic foot infection is one of the most common and severe complications of diabetes mellitus that delays healing of the wound. Deep tissue biopsy is considered to be the gold standard method for antibiotic selection in treating infected chronic diabetic ulcers. However, swab culture or superficial tissue biopsy is often performed for a microbiologic test since deep tissue biopsy has limitations in application. The purpose of this study is to find out whether microbiologic results of swab culture or superficial tissue biopsy could be used for selection of antibiotics in treating diabetic ulcers. Methods: This study involved 42 patients with diabetic foot ulcers with negative results in bone probing test. Tissue samples for microbiologic tests were collected from all the patients by using superficial cotton swab, superficial tissue, and deep tissue. The microbiologic results of deep tissue biopsy were compared with swab culture and superficial tissue biopsy statistically. Results: Microbiology of the deep tissue showed the same results with those of the swab culture and superficial tissue in 67% and 71%, respectively. Statistical analysis demonstrated that the microbiology of the swab culture and superficial tissue does not coincide with that of the deep tissue. Conclusion: These results suggest that the microbiology of the swab culture and superficial tissue is not concordant with that of the deep tissue in infected chronic diabetic ulcers. To select appropriate antibiotic regimen, the speci specimen for the microbiologic test should be obtained from deep tissue.

골조직 병변이 있는 당뇨발 궤양에서 표재조직 및 골조직 세균배양 검사의 비교 (Difference of Microbiology according to Tissue Sampling in Bone Involved Diabetic Ulcers)

  • 이성미;한승규;김우경
    • Archives of Plastic Surgery
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    • 제37권4호
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    • pp.335-339
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    • 2010
  • Purpose: Diabetic foot ulcer with osteomyelitis is notorious with its complexity and healing difficulties. Bone biopsy is considered to be the gold standard method of guidance for antibiotic therapy. However, it is often replaced by cultures of ulcer swabs or by superficial samples because of the technical difficulties and possible adverse events. In this study, we compared microbiologic results of bone biopsy with those of superficial tissue biopsy or swab culture to investigate concordance and diagnostic value in bone involved diabetic foot ulcers. Methods: This study involved 106 patients with diabetic foot ulcers who showed positive results in bone probing test. Tissue samples for microbiologic tests were collected from all the patients by using superficial cotton swab, superficial tissue biopsy, and bone biopsy. The microbiologic results of bone biopsy were compared with swab culture and superficial tissue biopsy statistically. Results: The positive predictive value of bone probing test for underlying osteomyelitis was 82.1%. Microbiology of the bone biopsy showed same results with those of the swab culture and superficial tissue in 64% and 63%, respectively. Statistical analysis demonstrated that the microbiology of the swab culture or superficial tissue did not coincide with that of the bone biopsy. Conclusion: These results suggest that the microbiologic results of superficial tissue or swab culture do not coincide with those of bony tissue. To select appropriate antibiotic regimen for diabetic ulcer with bone involvement, the specimen for the microbiologic test should be obtained from involved bone.

초등학생의 베타용혈성 연쇄구균 보균자 검출에 있어서 인두부 중복배양(duplicate throat culture)의 유용성 (Discordant Rate of Simultaneous Duplicate Throat Swab Culture for Discovering Beta-hemolytic Streptococcal Carrier from Normal School Children)

  • 차성호;한미영;최용묵;길영철;서진태
    • Pediatric Infection and Vaccine
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    • 제3권2호
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    • pp.123-127
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    • 1996
  • Purpose : The most patients with acute streptococcal pharyngitis lack of classic clinical manifestations, therefore diagnostic laboratory test such as the throat culture or a rapid antigen detection test are frequently employed in primary practices of developed countries. We'd like to know the accuracy of the throat swab culture as gold standard for diagnosis of streptococcal infection with studying the discordant and concordant rate of duplicate culture. Methods : The study included 89 normal school children (boys:50, girls:39) who were attending Uljin primary school in Uljin, Kyong Sang Buk Do on March 1996. We obtained simultaneous 2 times of throat swab from each subject, and plating and streaking on 5-7% of sheep blood agar separately. We counted the characteristic beta-hemolytic colonies after overnight incubation. Results : 1) The carrier rate of beta-hemolytic streptococci at first culture is 25.1% and second one is 29.2%. 2) Ten out of 89(11.2%) is discordant in duplicate culture. 3) Culture containing less than 50 colonies of beta-hemolytic streptococci (+2) in first culture is 70.4%, second one is 85.7%. 4) Number of colonies is less than 50 in all ten discordant children. Conclusions : The discordant rate of duplicate throat swab cullture for beta-hemolytic streptococci is 11.2%, even if the subjects are normal school children. About 5% of individuals harboring beta-hemolytic streptococci in the pharynx may be missed by a single throat culture. If we are trying to examine the patients with pharyngitis, the discordant rate will be much lower than this results.

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Evaluation of Swab in Maintaining Survival Efficiency according to the CLSI M40-A2 Standard

  • Hyeokjin Kwon;Myeongguk Jeong;Yeeun Kim;Yunhee Chang;Myeonggi Jeong;Go-Eun Choi
    • 대한의생명과학회지
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    • 제29권4호
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    • pp.249-255
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    • 2023
  • Transporting clinical samples for microbiological testing requires a proper transport medium that guarantees the survival of microorganisms. Therefore, the aim of the study was to determine the ability of Amies Transport Medium (ATM) to maintain the viability of microorganisms in clinical specimens and its suitability as a transport medium for microbiological testing. This study evaluated the performance of swab provided by KS Co., Ltd. for three groups of bacteria comprising aerobic and facultative anaerobic bacteria, anaerobic bacteria, and fastidious bacteria, according to the Clinical and Laboratory Standard Institute (CLSI) 8.11.2. The ATM stability test was conducted by dividing the medium into two groups based on the product expiration date of use. All tested media, A and B (the date of manufacture and expiration date are different) showed ≥5 CFU, and there was no significant difference in the result values of Category A and Category B with different serial numbers for each test. The results of this experiment when cross-checked with the guidelines suggest that ATM is a suitable transport medium for microbiological testing, as it maintains the viability of microorganisms and is suitable for overgrowth trials. In addition, compared to the number of CFUs at the origin, the number of CFUs did not increase by more than 1 log after storage. These results have important implications for the development of transport media that can guarantee the survival of microorganisms in clinical specimens.

한국산 수출용 진공포장 냉장 돈육 등심의 미생물학적 및 관능적 품질특성 (Microbiological and Sensory Characteristics of Vacuum Packed Korean Chilled Pork Loins for Export)

  • 최염순;박범영;이종문;김일석;이성기;김병철
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제44권3호
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    • pp.351-360
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    • 2002
  • 한국산 수출용 냉장 돈육의 등심 시료를 3개 수출업체(I II III)에서 채취하여 2$^{\circ}C$에서 50일간 저장하면서 5일$\sim$10일 간격으로 9회에 걸쳐 미생물 변화와 관능적 품질특성을 조사하였으며, 그 결과는 다음과 같다. 저장기간 중 총세균 수 및 대장균군 수 측정은 swab법과 조직절편법을 이용하여 측정한 결과, swab법으로 측정한 균 수가 대체적으로 높은 수준으로 나타났으며, 수출업체 시료간에는 I업체 시료가 저장 50일째까지 가식 수준을 유지한 반면, III업체 시료의 경우 총세균 수는 swab법으로 측정하였을 때 약 15일, 조직절편법으로 측정하였을 때 약 30일째 이후에는 이미 가식 수준을 넘게 나타났다. 대장균군 수도 III업체의 시료가 다른 업체와 비교하였을 때 가장 높은 수준으로 나타났는데, 이것은 수출업체간에 위생관리 상태에 따라 고기 품질 및 유통기간에 큰 차이가 있는 것으로 판단되었다. 따라서 I업체에 비해 위생도가 상대적으로 낮은 것으로 평가된 II업체 및 III업체에서는 도축과 가공 등 각 생산단계별로 더욱 세심한 위생관리체계를 구축하여야 할 필요성이 있을 것으로 판단되었다. 7점 척도묘사평가법으로 관능검사를 실시한 결과 근내지방도는 I업체 시료가 가장 낮았고, 상대적으로 II업체 및 III업체 시료가 높은 것으로 평가되었다. 신선육의 육색, 육즙 및 신선육 풍미는 세 업체 시료간에 차이가 없었으나 III업체 시료에서 전반적인 기호도가 가장 높게 나타났다. 그러나 조리육의 경우 풍미, 이상취, 다즙성, 전반적인 기호도에서 세 업체 시료간에 유의적인 차이는 없었다.

한식당 설비와 기구의 미생물 평가 (Microbiological Evaluations on the Facilities and Utilities of Korean Restaurants)

  • 정동관
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제34권10호
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    • pp.1611-1618
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    • 2005
  • 일반 음식점인 한식당의 시설과 기구의 미생물 오염도를 확인하기 위해 부산지역에서 세곳의 대형한식당을 선정하여 여름기간 중 위생평가를 실시하였다. 총 175개의 Swab 샘플이 식당의 시설과 기구의 표면에서 채취되어 총균수와 대장균군수가 측정되었다. 또한 식당내부의 공기속에 존재하는 총균, 대장균군, 포도상균 그리고 곰팡이와 효모의 오염도를 측정하기 위해 36개의 공기샘플이 채취되었다. 모든 채취된 샘플은 아이스박스에 담기어 실험실로 이송되어 분석되었다. 실험결과 대부분의 Swab된 표면들이 많은 수의미생물과 대장균군에 의해 오염된 것으로 확인되었다. 미생물의 오염정도는 샘플이 채취된 장소별로 차이가 있었다. 총균수 측정결과200$cm^{2}$의 단위면적당 검출되지 않는 것에서부터 최고 2.14$\times$$10^{9}$의 수치가 관찰되었고 대장균군인 경우에는 검출되지 않은 것에서부터 최고 8.34$\times$$10^{7}$의 수치가 검출되었다. 한식당의 공기오염도 측정결과 대부분의 측정 지역에서 일반세균, 대장균군, 포도상구균 그리고 곰광이와효모가 검출되었다. 미생물에 의해 심각하게 오염된 부분은 바닥, 트렌치, 물병내부, 플라스틱 소쿠리, 고무장갑, 선반 그리고 포장되지 않은 물수건으로 확인되었다. 이러한 장소는 위 생표준작업기준의 관리점으로 지정하여 중점적으로 관리되어야만 할 것이다. 또한 식중독사고의 발생위험을 감소시키기 위해서 육안검사와 더불어 주기적인 미생물 검사가 식당의 오염도가 높은 장소에서 수행되어져야만 할 것이다.

제주지역에서 사육중인 더러브렛 말 호흡기로부터 분리된 병원성 Streptoccus spp.의 생화학성상 및 약제감수성 양상 (Biochemical characteristics and antimicrobials susceptibility of pathogenic Streptoccus spp. isolated from respiratory tract of Thoroughbred horses in Jeju, Korea)

  • 최성균;김성국;조길재
    • 한국동물위생학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.209-216
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    • 2011
  • This study carried out to investigate the pathogenic Streptococcus spp. isolated from respiratory tract of Thoroughbred in Jeju province. The specimens were collected from nasal mucosa using a culture swab from 113 Thoroughbred horses. Suspected colonies were selected onto blood and MacConkey agar plate, and identified by standard biochemical properties using Vitek 2 system and PCR method. In this study, we isolated S. equi (n=6), S. zooepidemicus (n=31), S. equisimilis (n=5), S. dysgalactiae (n=2), S. agalctiae (n=1), non identified ${\beta}$-hemolytic Streptococcus spp. (n=1) from Thoroughbred horses. In antimicrobial susceptibility test, it showed a high sensibility in the most of antimicrobial except for neomycin, streptomycin, spectinomycin, erythromycin and clindamycin. These results will provide the basic information to establish control measures for the treatment and prevention of respiratory disease by pathogenic Streptococcus spp. in Thoroughbred horses in Korea.

Nucleic acid-based molecular diagnostic testing of SARS-CoV-2 using self-collected saliva specimens

  • Hwang, Eurim C.;Kim, Jeong Hee
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제46권1호
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    • pp.1-6
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    • 2021
  • Since the outbreak of coronavirus disease 2019 (COVID-2019), the infection has spread worldwide due to the highly contagious nature of severe acute syndrome coronavirus (SARS-CoV-2). To manage SARS-CoV-2, the development of diagnostic assays that can quickly and accurately identify the disease in patients is necessary. Currently, nucleic acid-based testing and serology-based testing are two widely used approaches. Of these, nucleic acid-based testing with quantitative reverse transcription-PCR (RT-qPCR) using nasopharyngeal (NP) and/or oropharyngeal (OP) swabs is considered to be the gold standard. Recently, the use of saliva samples has been considered as an alternative method of sample collection. Compared to the NP and OP swab methods, saliva specimens have several advantages. Saliva specimens are easier to collect. Self-collection of saliva specimens can reduce the risk of infection to healthcare providers and reduce sample collection time and cost. Until recently, the sensitivity and accuracy of the data obtained using saliva specimens for SARS-CoV-2 detection was controversial. However, recent clinical research has found that sensitive and reliable data can be obtained from saliva specimens using RT-qPCR, with approximately 81% to 95% correspondence with the data obtained from NP and OP swabs. These data suggest that self-collected saliva is an alternative option for the diagnosis of COVID-19.

방사선비상시 비강스메어 시료의 전알파 분석 및 내부피폭선량평가 절차 (Gross Alpha Analysis of Nasal Smear Samples and Internal Dose Assessment Procedure in Radiation Emergency)

  • 윤석원;하위호;김미령;이승숙
    • Journal of Radiation Protection and Research
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    • 제37권4호
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    • pp.226-230
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    • 2012
  • 방사선 사고시 피폭환자로부터 채취된 스메어 시료의 전알파 방사능 측정법을 수립하였으며 이를 바탕으로 피폭환자의 후속조치 절차를 확립하였다. 국내방사선사고 대응기관에서 사용중인 스메어용 면봉을 이용하여 계측 절차를 검증하였다. 액체섬광계수기를 이용하여 표준선원을 점적한 시료의 계측 결과 20% 이내에서 인증값과 잘 일치하였으며, 채취 조건은 세정제 등을 이용하는 것이 더 높은 스메어 효율을 보였다. 액체섬광계수법 특성상 소광현상의 영향을 배제하기 위해 건조 등의 최소한의 전처리가 필요 할 것으로 판단되었다. 계측결과를 바탕으로 방사선비상시 피폭환자에 대한 의료적 처치 기준 및 선량평가 절차를 수립하였다.