Chung, Han Young;Lee, Kyu-Ho;Ryu, Sangryeol;Yoon, Hyunjin;Lee, Ju-Hoon;Kim, Hyeun Bum;Kim, Heebal;Jeong, Hee Gon;Choi, Sang Ho;Kim, Bong-Soo
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제26권12호
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pp.2030-2035
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2016
Bacillus cereus causes food-borne illness through contaminated foods; therefore, its pathogenicity and genome sequences have been analyzed in several studies. We sequenced and analyzed B. cereus strain FORC_021 isolated from a sashimi restaurant. The genome sequence consists of 5,373,294 bp with 35.36% GC contents, 5,350 predicted CDSs, 42 rRNA genes, and 107 tRNA genes. Based on in silico DNA-DNA hybridization values, B. cereus ATCC $14579^T$ was closest to FORC_021 among the complete genome-sequenced strains. Three major enterotoxins were detected in FORC_021. Comparative genomic analysis of FORC_021 with ATCC $14579^T$ revealed that FORC_021 harbored an additional genomic region encoding virulence factors, such as putative ADP-ribosylating toxin, spore germination protein, internalin, and sortase. Furthermore, in vitro cytotoxicity testing showed that FORC_021 exhibited a high level of cytotoxicity toward INT-407 human epithelial cells. This genomic information of FORC_021 will help us to understand its pathogenesis and assist in managing food contamination.
Cho Jun-Young;Choi Gyung-Ja;Lee Seon-Woo;Jang Kyoung-Soo;Lim He-Kyoung;Lim Chi-Hwan;Lee Sun-Og;Cho Kwang-Yun;Kim Jin-Cheol
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제16권2호
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pp.280-285
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2006
Methanol extract of the rhizomes of turmeric, Curcuma longa L., effectively controlled the development of red pepper anthracnose caused by Colletotrichum coccodes. In addition three antifungal substances were identified from the methanol extract of C. longa rhizomes as curcumin, demethoxycurcumin, and bisdemethoxycurcumin using mass and $^{1}H-NMR$ spectral analyses. The curcuminoids in a range $0.4-100\;{\mu}g/ml$ effectively inhibited the mycelial growth of three red pepper anthracnose pathogens, C. coccodes, C. gloeosporioides, and C. acutatum. The three curcuminoids inhibited mycelial growth of C. coccodes and C. gloeosporioides to an extent similar to the synthetic fungicide dithianon did, but the synthetic agent was a little more effective against C. acutatum. The curcuminoids also effectively inhibited spore germination of C. coccodes, and bisdemethoxycurcumin was the most active. Among the three curcuminoids, only demethoxycurcumin was effective in a greenhouse test in suppressing red pepper anthracnose caused by C. coccodes.
Gray mold caused by Botrytis cinerea is one of the most important postharvest fungal pathogens of cut flowers. Here, gamma irradiation, an alternative for phytosanitary purposes, and sodium dichloroisocyanurate (NaDCC) were used to control B. cinerea in a cut chrysanthemum (Chrysanthemum morifolium Ramat.) cultivar, 'Baekma', one of the cultivars susceptible to B. cinerea. Spore germination and mycelium growth of B. cinerea were inhibited by gamma irradiation in an inversely dose-dependent manner. A dose of 4 kGy completely inhibited the mycelium growth of B. cinerea. A significant change in flower quality (physical properties) on chrysanthemum was shown from gamma irradiation at over 0.2 kGy (p<0.05). Therefore, in this study, the integration of gamma ray (below 0.2 kGy) and NaDCC, an eco-friendly form of chlorine, was investigated to control the disease with low dose of gamma irradiation dose. Interestingly, the gamma irradiated flowers showed more disease severity than the non-irradiated flowers. The combined treatment of gamma irradiation and NaDCC does not affect the severity of the fungal disease, whereas only 70 ppm of NaDCC treatment showed a significantly reduced severity. These results suggest that only chlorination treatment can be applied to control B. cinerea in cut chrysanthemum flowers.
Antibiotic substances were produced by Bacillus subtilis YB-70, a potential biocontrol agent found to suppress root-rot of eggplant (Solanum melonggena L) caused by Fusarium solani, in a dextrose glutamate medium and isolated by isoelectric precipitation. Partial purification was performed by column chromatography on silica gel with two solvent systems: chloroform-methanol and methanol-chloroform-water as eluting solvents, This active fraction YBS-1 s contained antifungal activity were soluble in ethanol, methanol, and water, but were not soluble in other solvents including acetone, butanol, ethyl ether, dimethylformamide, propanol, and etc. High performance liquid chromatography and thin layer chromatographic separation of YBS-1s showed that they have been composed of three biological active bands that were named YBS-1A, -1B, and -1C. The substances were stable to heat and resistant to protease. YBS-1s were active against a wide range of plant pathogenic fungi but did not inhibit the growth of bacteria and yeasts. They were not only fungicidal but also fungistatic against chlamydospores of F. solani. The $ED_{50}$ values for the chlamydospore germination and the germ-tube growth of F. solani were $O.725\mu\textrm{m}/ml\;and\;O.562\mu\textrm{m}/ml$, respectively. Microscopic observations proved the substances restricted the growth of phytopathogenic fungus F. solani by spore burst followed by dissolving of its germ-tube, and caused abnormal hyphal swelling after application to chlamydospores or growing hyphae. Cultural filtrate of B; subtilis YB-70 also suppressed the development of root-rot of eggplant in pot tests.
Background: Biological control of plant pathogens using benign or beneficial microorganisms as antagonistic agents is currently considered to be an important component of integrated pest management in agricultural crops. In this study, we evaluated the potential of Bacillus subtilis strain HK-CSM-1 as a biological control agent against Colletotrichum panacicola. Methods: The potential of B. subtilis HK-CSM-1 as a biological control agent for ginseng anthracnose was assessed. C. panacicola was inoculated to ginseng plants and the incidence and severity of disease was assessed to examine the efficacy of the bacterium as a biological control against C. panacicola. Results: Inoculation of Panax ginseng plants with B. subtilis significantly suppressed the number of disease lesions of C. panacicola and was as effective as the chemical fungicide iminoctadine tris(albesilate). The antifungal activity of B. subtilis against C. panacicola was observed on a co-culture medium. Interestingly, treatment with B. subtilis did not significantly affect the diameter of the lesions, suggesting that the mechanism of protection was through the reduction in the incidence of infection related to the initial events of the infection cycle, including penetration and infection via spore germination and appressorium formation rather than by the inhibition of invasive growth after infection. Conclusion: Our results suggest that B. subtilis HK-CSM-1 can be used as an effective and ecologically friendly biological control agent for anthracnose in P. ginseng.
1980년경부터 Botryosphaeria dothidea에 의한 사과겹무늬썩음병이 전국적으로 만연하였는데 그 동안 화학적 방제를 하였으나 병해는 감소되지 않고 현재도 그 피해손실이 극심하다. 본 병의 주요 방제제인 benomyl에 대한 본 병원균의 저항성을 조사한 결과는 다음과 같다. 1. 감수성균은 $150\;{\mu}g/ml$에서 균사생장을 할 수 없었으나, 저항성균은 $300\;{\mu}g/ml$에서 7-l3mm, $2,400\;{\mu}g/ml$에서도 균총직경 6-8mm의 균사생장을 보였다. 후자의 고농도에서 저항성균은 5-9%의 포자발아를 보였으나 감수성균은 포자발아가 없었다. 2. $20-2,400\;{\mu}g/ml$의 모든 공시농도에서 감수성균은 병자각을 형성할 수 없었는데 반하여 저항성균은 저농도에서는 많은 병자각을 형성하였으나 약제농도가 높아질수록 적게 형성하였다.
A strain of Streptomyces cavourensis subsp. cavourensis (coded as SY224) antagonistic to Colletotrichum gloeosporioides infecting pepper plants was isolated. SY224 produced lytic enzymes such as chitinase, ${\beta}$-1,3-glucanase, lipase, and protease in respective assays. To examine for antifungal activity, the treatments amended with the nonsterilized supernatant resulted in the highest growth inhibition rate of about 92.9% and 87.4% at concentrations of 30% and 10%, respectively. However, the sterilized treatments (autoclaved or chloroform treated) gave a lowered but significant inhibitory effect of about 63.4% and 62.6% for the 10% supernatant concentration, and 75.2% and 74.8% for the of 30% supernatant concentration in the PDA agar medium, respectively, indicative of the role of a non-protein, heat stable compound on the overall effect. This antifungal compound, which inhibited spore germination and altered hyphal morphology, was extracted by EtOAc and purified by ODS, silica gel, Sephadex LH-20 column, and HPLC, where an active fraction was confirmed to be 2-furancarboxaldehyde by GS-CI MS techniques. These results suggested that SY224 had a high potential in the biocontrol of anthracnose in pepper, mainly due to a combined effect of lytic enzymes and a non-protein, heat-stable antifungal compound, 2-furancarboxaldehyde.
A strain of bacterium producing antifungal antibiotic was isolated and identification of the strain was attempted. We could identify the bacterium as being a Bacillus sp., based on morphological observation, physiological characteristics, and 16S rDNA sequence analysis, thus leading us to designate the strain as Bacillus sp. AH-E-1. The strain showed potent antibiotic activity against phytopathogenic and human pathogenic fungi by inducing mycelial distortion and swelling and inhibiting spore germination. The antibiotic metabolite produced by the strain demonstrated excellent thermal and pH (2-11) stability, but was labile to autoclaving. From these results, we could find a broader antifungal activity of Bacillus genus. Isolation and characterization of the active agent produced by the strain are under progress.
In order to control postharvest spoilage of satsuma mandarin fruits, rhizobacteria were isolated from soil samples. The Pantoea agglomerans strain 59-4 (Pa 59-4) which suppresses the decay of mandarin fruit by green and blue mold, was tested for the control efficacy and its mode of action was investigated. Pa 59-4 inhibited infection by green and blue mold on wounded mandarins, which were artificially inoculated with a spore suspension of Penicillium digitatum and P. italicum with control efficacies of 85-90% and 75-80%, respectively. The biocontrol efficacy was increased by raising the concentration of cells to between $10^8$ and $10^9\;cfu/ml$, and pretreatment with the antagonist prevented subsequent infection by green mold. The population of Pa 59-4 was increased more than 10 fold during the 24 hr incubation at $20^{\circ}C$, indicating that colonization of the wound site might prevent the infection by green mold. Despite poor antifungal activity, the Pa 59-4 isolate completely inhibited the germination and growth of P. digitatum spores at $1{\times}10^8\;cfu/ml$. We argue that the control efficacy was mediated by nutrient competition. Overall, the effective rhizobacterium, Pa 59-4, was shown to be a promising biocontrol agent for the postharvest spoilage of mandarin fruits by green and blue mold.
Soil microorganisms play a major role in improving soil fertility and plant health. Symbiotic arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) form a key component of the soil microbial populations. AMF form a mutualistic association with the host plant and exert a positive influence on its growth and nutrient uptake. The establishment of mycorrhizal symbioses with the host plant can positively be influenced by plant growth promoting rhizobacteria through various mechanisms such as increased spore germination and hyphal permeability in plant roots. Though there are evidences that combined interactions between AMF and PGPR can promote the plant growth however mechanisms of these interactions are poorly understood. Better understanding of the interactions between AMF and other microorganisms is necessary for maintaining soil fertility and enhancing crop production. This paper reviews current knowledge concerning the interactions between AMF and PGPR with plants and discusses on enhanced nutrient availability, biocontrol, abiotic stress tolerance and phytoremediation in sustainable agriculture.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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