• 제목/요약/키워드: Soil enzyme activity

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Pseudomonas sp. J-19가 생산하는 Alkaline Lipase의 정제와 특성 (Purification and Properties of Alkaline Lipase from Pseudomonas sp. J-19)

  • 신원철;정광성;유재흥;유주현
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제19권1호
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    • pp.57-63
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    • 1991
  • 토양으로부터 분리한 알칼리 내성 및 liner alkylbenzene sulfonate 내성인 lipase 생산균주를 동정하여 Pseudomonas sp. J-19로 명명하였다. 호알칼리성 lipase는 ammonium sulfate 침전, DEAE-Sephadex와 Sephadex G-100 column chromatography로 정제하였고, 정제효소의 비활성도는 35 unit/mg protein, 수율은 17이었다. 정제효소는 polyacrylamide disc gel 전기영동에서 단일 band를 나타내었고, Sephadex G-100 gel filtration과 SDS-polyacrylamide gel 전기영동에 의하여 추정된 분자량은 36,000이었다. 정제효소의 최적 pH는 10.0 최적온도는 30'C이었다. 정제 효소의 활성은 0.1 linear alkylbenzene sulfonate 첨가에 의하여 2배 증가되었고, 0.05 Tide에 의하여 2.5배 증가되었다. 정제효소는 p8.0-10.0, 4'C이하에서 안정하였다.

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Screening and Characterization of an Esterase from a Metagenomic Library

  • KIM JEONG-NYEO;SEO MYUNG-JI;CHO EUN-AH;LEE SANG-JAE;KIM SEONG-BO;CHEIGH CHAN-ICK;PYUN YU-RYANG
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제15권5호
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    • pp.1067-1072
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    • 2005
  • A metagenomic library was constructed using a fosmid vector, and total genomic DNA was extracted directly from soil at Cisolok (hot spring area, Indonesia). This library was composed of 10,214 clones and screened for lipolytic enzyme on tributyrin agar plates. An esterase gene (estMa) was subcloned and sequenced from a positive lipolytic active clone. Esterase EstMa was encoded by a 954-bp open reading frame and showed low ($11-33\%$) amino acid similarity to known esterases. The amino acid sequence analysis demonstrated that the enzyme is a new member of lipolytic enzyme family VI. The estMa gene encodes a preprotein of 317 amino acids with a predicted molecular mass of 34,799 Da. The purified enzyme exhibited optimal activity at $50^{\circ}C$ and pH 6.5. The $K_m,\;and\;V_{max}$ values of EstMa for the hydrolysis of p-nitrophenyl valerate were $45.3\;{\mu}M$ and 4.45 U/mg, respectively.

Streptomyces corcohrussi JK-20 유래 혈전용해효소의 순수분리 및 이의 생화학적 특성 규명 (Purification and Biochemical Characteristics of Fibrinolytic Enzyme from Streptomyces corcohrussi JK-20)

  • 김유정;박정욱;서민정;김민정;이혜현;진세훈;강병원;최영현;정영기
    • 생명과학회지
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    • 제20권6호
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    • pp.838-844
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    • 2010
  • 토양에서 생육하는 Streptomyces corcohrussi의 혈전용해효소가 DEAE-Sephadex A-50 그리고 Sephadex G-50 젤 여과를 이용한 크로마토그라피 방법에 의해 순수분리 되었다. SDS-PAGE 분석결과, 분리된 효소는 단일 단백질이고, 그 분자량은 약 34 kDa 이라는 것을 알 수 있었다. 순수분리된 효소의 혈전용해활성은 plasminogen-rich fibrin plate에서 0.8 U/ml 이었으나, plasminogen-free fibrin plate 에서의 그 효소활성은 0.36 U/ml 이하이었다. 이러한 결과로, 순수 분리된 효소가 plasminogen activator 로 작용한다는 것을 알 수 있었다. 단백질 저해제인 $\varepsilon$-ACA, t-AMCHA 와 mercuric chloride의 존재시에 그 혈전용해활성은 24% 이하이었는데, 이러한 결과는 이들 plasmin 저해제 그리고(혹은) fibrinogen을 fibrin으로 전환시키는 과정과 관련된 fibrinogen 저해제에 의해 이 효소가 조절될 수 있음을 나타낼 수 있다. 한편으로, 중금속 이온인 $Zn^{2+}$은 그 활성을 58% 감소시켰다. 순수 분리된 효소의 최적 온도는 약 $50^{\circ}C$ 이었고, 그 효소활성의 92% 이상은 pH 5.0과 8.0 사이에서 유지되었다. 그러므로, 이러한 결과들은 하나의 강력한 혈전용해효소를 제공해서, S. corcohrussi 유래 새로운 혈전용해제의 개발에 기여하도록 한다.

화산회토 감귤원의 표토관리방법이 토양 미생물상에 미치는 영향 (Effect of Soil surface Soil Management Practices on Microflora in Volcanic Ash Soils of Citrus Orchard)

  • 좌재호;임한철;고상욱;현해남
    • 한국토양비료학회지
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    • 제37권3호
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    • pp.165-170
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    • 2004
  • 화산회토 노지 감글원에서 청경, 초생, 부초재배 등의 표토관리 방법이 토양의 미생물밀도, 효소활성 및 microbial biomass C에 미치는 영향을 조사하였다. 1997년에 개화기인 5월과 과실비대기인 9월에 청경재배, 초생재배, 부초재배 감귤원 각각 10개소에서 토양을 채취하여 조사한 결과는 다음과 같다. 표토관리방법에 따른 토양의 화학성 차이는 없었으며 pH는 평균 4.7로 낮았다. 유기물과 질소 함량은 평균값으로 각각 140.2 및 $6g\;kg^{-1}$이었으나 조사지점에 따라 다양하였다. 감귤원 토양에서 호기성 세균은 $26,2-47.3{\times}10^6cfu\;g^{-1}$ 수준의 분포를 나타냈으며 호기성 세균속 중에는 Pseudomoras spp., 고온성 Bacillus spp., Rhizobium spp. 등이 우점하는 경향이었다. 방선균은 $1.8-84.6{\times}10^5cfu\;g^{-1}$ 수준으로 분포를 하였고 개화기에 밀도가 높았다. 사상균은 $26.4-182.1{\times}10^5cfu\;g^{-1}$ 수준의 분포를 나타냈으며 초생재배와 부초재배에서 많았다. 과실비대기에 토양 인산효소활성은 청경재배에서 $239.6{\mu}g\;PNP\;g\;soil^{-1}\;h^{-1}$, 토양 cellulase 활성은 초생재배에서 $602.6{\mu}g\;GE\;g\;soil^{-1}$\;24\;h^{-1}$로 높았다. Microbial biomass C는 부초재배에서 $256.3mg\;C\;kg\;soil^{-1}$로 가장 높았다.

보릿짚시용(施用)이 논토양(土壤)의 생화학성(生化學性)에 미치는 영향(影響) (Effects of Barley Straw on the Biochemical Properties in the Submerged Soil)

  • 정지호;김광식
    • 한국토양비료학회지
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    • 제22권2호
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    • pp.93-99
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    • 1989
  • 보릿짚시용(施用)이 수도재배(水稻栽培) 논 토양(土壤)에 미치는 영향(影響)을 규명하기 위하여 투수(透水)를 실시하여 토양중(土壤中) 질소고정(窒素固定)에 관여하는 미생물(微生物), Acetylene 환원력(還元力), 효소활성(酵素活性), 당(糖)을 조사분석(調査分析)한 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 질소고정(窒素固定) 미생물중(微生物中) Azotobacter는 경시적(經時的)으로 증가(增加)하였고 재배구(栽培區)에서 보릿짚시용(施用)에 의해 $17.61{\times}10^4$ 으로 증가(增加)하였으며 Clostridia는 재배구(栽培區)에서 보릿짚시용(施用)에 의해 분열기에 $34.56{\times}10^4$ 으로 증가(增加)하였다가 그 후(後)에는 $0.3{\times}10^4$ 으로 감소(減少)하였다. Blue-green algae는 출수기에 $18.0{\times}10^3$ 으로 증가(增加)하였다가 그 후(後)에는 $0.46{\times}10^4$ 으로 감소(減少)하였는데 보릿짚시용(施用)에 의해 증가(增加)하는 경향(傾向)이었다. 2. Acetylene 환원력(還元力)은 출수기에 0.012nmol/hour로 감소(減少)하였다가 수확기에 0.44nmol/g/hour로 증가(增加)하였으며 보릿짚시용(施用)에 의한 뚜렷한 차이(差異)는 없었다. 3. 효소활성(酵素活性)의 변화(變化)는 ${\beta}$-glucosidase가 출수기에 $426.8{\mu}mol/g/hour$로 크게 증가(增加)하였다가 그 후(後)에는 $71.64{\mu}mol/g/hour$로 감소(減少)하였으며 Phosphatase는 무재배구(無栽培區)에서 경시적(經時的)으로 감소(減少)하였으나 재배구(栽培區)에서는 경시적(經時的)으로 증가(增加)하였다. Protease는 출수기에 $73.1{\mu}mol/g/hour$로 증가(增加)하였으며 보릿짚시용(施用)에 의해 분얼기 무재배구(無栽培區)에서 $94.71{\mu}mol/g/hour$, 출수기 재배구(栽培區)에서 $73.1{\mu}mol/g/hour$로 증가(增加)하였다. 4. 토양중(土壞中) 당(糖)의 변화(變化)는 경시적(經時的)으로 감소(減少)하였으며 보릿짚시용(施用)에 의해 분얼기 재배구(栽培區)의 hexose가 $58.73{\mu}g/g$로 크게 증가(增加)되었다. 5. 유기물(有機物)의 형태(形態)는 ligno-protein이 재배구(栽培區)와 무재배구(無栽培區)에서 보릿짚시용(施用)에 의해 각각(各各) 3840.8mg/100g dry soil, 3898.6mg/100g dry soil로 가장 높았다.

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토양(土壤)에서 분리(分離)한 Streptomyces sp. s-45의 효소학적(酵素學的) 성질(性質)에 관한 연구(硏究) (Studies on the Enzymatical Properties of Streptomyces sp. S-45 Isolated from Soil)

  • 김영일;김용웅;김광식
    • 한국토양비료학회지
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    • 제21권2호
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    • pp.129-134
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    • 1988
  • 토양(土壤)으로부터 분리(分離)한 Streptomyces sp. S-45 균주(菌株)의 효소학적(酵素學的) 성질(性質)을 검토(檢討)한 결과(結果)는 다음과 같다. 1. 분리균(分離菌) Streptomyces sp. S-45의 Chitinase activity는 $3.01({\mu}/m{\ell})$이고 ${\beta}$-1.3-Glucanase activity는 $2.49({\mu}/m{\ell})$이었다. 2. 탄소원(炭素原)으로서 Colloidal chitin 0.7%, Glucose 0.3%, 질소원(窒素原)으로서 Asparagine 0.5%, Peptone 0.2% 존재(存在)가 효소생산(酵素生産)에 효과적(效果的)이었다. 3. 최적(最適) 효소생성(酵素生成) 조건(條件)으로 pH 7.0, $30^{\circ}C$에서 6일간(日間) 진탕배양시(培養時) 최고(最高)의 효소생성(酵素生成)을 나타내었다. 4. 효소(酵素)의 활성(活性)에 미치는 최적(最適) 작용조건(作用條件)은 pH 6.5~7.0, 온도(溫度)는 $45{\sim}50^{\circ}C$였다. 5. 본(本) 효소(酵素)는 pH6.0~7.0에서 안정성(安定性)이 가장 높았고, $80^{\circ}C$로 10분(分) 처리시(處理時) Chitinase는 10%, ${\beta}$-1.3-Glucanase는 12%로 잔존활성(殘存活性)이 감소(減少)하였다. 6. 금속(金屬)이온에 대한 효소(酵素)의 영향(影響)은 $Co^{{+}{+}}$, $Cu^{{+}{+}}$, $Mn^{{+}{+}}$, $Al^{{+}{+}{+}}$$10^{-2}M$$Sn^{{+}{+}}\;10^{-3}M$에서 활성(活性)이 증대(增大)하였고, $Ag^{{+}{+}}$, $Hg^{{+}{+}}$는 현저(顯著)한 저해작용을 하였다.

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옥수수 생 전분 당화 효소 생산 곰팡이의 분리 및 동정 (Screening and Identification of a Potent Fungus for Producing Raw Corn Meal Saccharifying Enzyme)

  • 오성훈;오평수
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제18권6호
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    • pp.547-552
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    • 1990
  • 산업적인 응용을 위한, 생 전분 분해력이 높고 액체 배양에 적용 가능한 균을 토양으로부터 분리한 결과, 옥수수 생 전분 당화 효소 생산력이 높은 곰팡이 No.55 균주를 분리하고 이 균주의 형태적, 생리적, 배양특성을 조사, 균 동정을 행한 결과 No.55 분리균은 Aspergillus niger 또는 그 유연균으로 동정되었다.

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Aspergillus sp. CC-29 생성하는 Alkaline Protease의 정제 및 특성 (Purification and Biological Characteristics of Alkaline Protease from Aspergillus sp. CC-29)

  • 최청;김두기;조영제;성태수
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제19권5호
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    • pp.434-442
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    • 1990
  • Aspergillus sp. CC-29 ws selected for its strong protease activity among various stains of molds found in soil. It was found that the production of alkaline protease reached to maximum when the wheat bran medium containing glucose as carbon source had been cultured for 4 days. Alkaline proteased was purified 36.10 fold from Aspergillus sp. CC-29 The purification procedures included ammonium sulfate fractunation gel filteration on Sepha-dex G-75 G-150 and DEAE-cellulose ion-exchange chromatography, The yield of the purified enzyme was 22.40% The purified enzyme was confirmed as a single band by the polyacryla-mide. When the purified enzyme was applied to SDS-PAGE the molecular weight was estima-ted 24000. The optimum pH for the enzyme activity was 9.0 and the optimum temperature was 4$0^{\circ}C$ The reaction of this enzyme followed typical Michaelis-Menten kinetics with the Km value of 2.10$\times$10-4M with the Vmax of 29.41 $\mu$g/min. The enzyme was reactively stable in alkalic condition and unstable by heat treatment. The activity of alkaline protease was increased by the addition of Ca2+ whereas it was inhibited by Hg2+ Zn2+ at concentration of 1$\times$10-3M.

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Functional Characteristics and Diversity of a Novel Lignocelluloses Degrading Composite Microbial System with High Xylanase Activity

  • Guo, Peng;Zhu, Wanbin;Wang, Hui;Lu, Yucai;Wang, Xiaofen;Zheng, Dan;Cui, Zongjun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제20권2호
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    • pp.254-264
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    • 2010
  • To obtain an efficient natural lignocellulolytic complex enzyme, we screened an efficient lignocellulose-degrading composite microbial system (XDC-2) from composted agricultural and animal wastes amended soil following a long-term directed acclimation. Not only could the XDC-2 degrade natural lignocelluloses, but it could also secrete extracellular xylanase efficiently in liquid culture under static conditions at room temperature. The XDC-2 degraded rice straw by 60.3% after fermentation for 15 days. Hemicelluloses were decomposed effectively, whereas the extracellular xylanase activity was dominant with an activity of 8.357 U/ml on day 6 of the fermentation period. The extracellular crude enzyme noticeably hydrolyzed natural lignocelluloses. The optimum temperature and pH for the xylanase activity were $40^{\circ}C$ and 6.0. However, the xylanase was activated in a wide pH range of 3.0-10.0, and retained more than 80% of its activity at $25-35^{\circ}C$ and pH 5.0-8.0 after three days of incubation in liquid culture under static conditions. PCR-DGGE analysis of successive subcultures indicated that the XDC-2 was structurally stable over long-term restricted and directed cultivation. Analysis of the 168 rRNA gene clone library showed that the XDC-2 was mainly composed of mesophilic bacteria related to the genera Clostridium, Bacteroides, Alcaligenes, Pseudomonas, etc. Our results offer a new approach to exploring efficient lignocellulolytic enzymes by constructing a high-performance composite microbial system with synergistic complex enzymes.

Screening and Characterization of an Enzyme with ${\beta}-Glucosidase$ Activity from Environmental DNA

  • Kim, Soo-Jin;Lee, Chang-Muk;Kim, Min-Young;Yeo, Yun-Soo;Yoon, Sang-Hong;Kang, Han-Cheol;Koo, Bon-Sung
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권6호
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    • pp.905-912
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    • 2007
  • A novel ${\beta}-glucosidase$ gene, bglA, was isolated from uncultured soil bacteria and characterized. Using genomic libraries constructed from soil DNA, a gene encoding a protein that hydrolyzes a fluorogenic analog of cellulose, 4-methylumbelliferyl ${\beta}-D-cellobioside$ (MUC), was isolated using a microtiter plate assay. The gene, bglA, was sequenced using a shotgun approach, and expressed in E. coli. The deduced 55-kDa amino acid sequence for bglA showed a 56% identity with the family 1 glycosyl hydrolase Chloroflexus aurantiacus. BglA included two conserved family 1 glycosyl hydrolase regions. When using $p-nitrophenyl-{\beta}-D-glucoside$ (pNPG) as the substrate, the maximum activity of the purified ${\beta}-glucosidase$ exhibited at pH 6.5 and $55^{\circ}C$, and was enhanced in the presence of $Mn^{2+}$. The $K_m\;and\;V_{max}$ values for the purified enzyme with pNPG were 0.16 mM and $19.10{\mu}mol/min$, respectively. The purified BglA enzyme hydrolyzed both pNPG and $p-nitrophenyl-{\beta}-D-fucoside$. The enzyme also exhibited substantial glycosyl hydrolase activities with natural glycosyl substrates, such as sophorose, cellobiose, cellotriose, cellotetraose, and cellopentaose, yet low hydrolytic activities with gentiobiose, salicin, and arbutin. Moreover, BglA was able to convert the major ginsenoside $Rb_1$ into the pharmaceutically active minor ginsenoside Rd within 24 h.