We propose a method for rapid evaluation and permanent record of sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoretic runs. This method is based on the photocopy process, rather than on photography and requires no extensive or expensive investment. Comparison of a print obtained through this method and a 35mm photography indicated, on a balanced gel, equal sensitivity.
This experiment was executed to investigate the possibility of the application of taxonomic method through the isoelectric focusing with polyacrylamide gel and sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis with seeds in the identification of turfgrasses. The sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis was used to investigate the pattern of seed proteins which were extracted from 18 cultivars of cool season turfgrass and 4 cultivars of warm season turfgrass. The isoelectric focusing with polyacrylarnide gel was used to investigate the activity of the three isozymes of esterase, peroxidase and phosphoglucose isomerase which were extracted from 18 cultivars of cool season turfgrass and 4 cultivars of warm season turfgrass. The results were summarized as follows. 1. The difference of the patterns of seed proteins was observed with sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis. The identification of intra-genus was easily detected. 2. The three isozymes of esterase, peroxidase and phosphoglucose isomerase were investigated through isoelectric focusing with polyacrylamide gel. As a result, esterase was most effective among three isozymes in the identification of turfgrass cultivars 3. In the past cultivar identification was primarily based on visual morphological characters, but there was a lot of difficulty. If we should use electrophoresis, we will be able to identifvturfgrass cultivars more effectively.
SDS-PAGE를 이용한 일반적인 단백질 분리는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 방법이며 가장 보편적이고, 간단한 방법 중의 하나이다. 본 연구는 SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis)를 두 번에 걸쳐 동일한 분리 원리로 이차원으로 전개하는 방법의 전기영동을 시도하여 기존의 일차원 전기영동 분석법과 비교하였으며, 그 결과 향상된 분리능이 본 연구의 이차원 전기영동법에서 확인되었다. Gel에서 분리된 단백질들은 MALDI TOF MS를 이용하여 동정하여 서로 다른 단백질임이 확인되었으며, 이러한 duplex SDS-PAGE 분리법은 상대적으로 적은 비용으로 단백질 분리능을 용이하게 향상시킬 수 있는 경제적인 분석법으로 이용될 수 있을 것이다.
A fast and sensitive protein staining method in sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) using both an acidic dye, Coomassie Brilliant Blue R-250 (CBBR) and a basic dye, Neutral Red (NR) is described. It is based on a counter ion-dye staining technique that employs oppositely charged two dyes to form an ion-pair complex. The selective binding of the free dye molecules to proteins in an acidic solution enhances the staining effect of CBBR on protein bands, and also reduces gel background. It is a rapid staining procedure, involving fixing and staining steps with short destaining that are completed in about 1 h. As the result, it showed two to fourfold increase in sensitivity comparing with CBBR staining. The stained protein bands can be visualized at the same time of staining.
연근별로 인삼 단백질의 생화학적 특성을 체계적으로 규명하기 위하여 polyacrylamide gel 전기영동, SDS-PAGE, gel filteration 및 아미노산 자동분석기에 의한 실험결과는 다음과 같다. 인삼의 수용성 단백질을 Sephadex G-200으로 분획하여 얻은 2개의 peak 중주 단백질은 SDS-polyacrylamide gel 전기영동에 의해 분자량은 43,000으로 추정되었다. Polyacrylamide gel 전기영동 및 SDS-PAGE에 의한 band의 수는 연근에 따라 별 차이 없이 각각 8 및 $7{\sim}11$개 확인되었다. 인삼의 수용성 단백질과 그의 주 단백질을 아미노산 분석한 결과 arginine이 각각 45.17과 57.36%로 최대의 함량을 나타내었고 methionine과 cystine의 함량은 매우 낮았다.
The peptidyl prolyl cis-trans isomerase(PPlase, EC 5.2.2.8) from Bacillus stearothermophilus SIC1 was extracted from the cells treated with by lysozyme. PPlase was purified from the cell extracts by heat treatment, ammonium sulfate precipitation, ion exchange chromatography and finally gel filtration (FPLC). The purity of purified the enzyme after Superose 12 column chromatography was examined by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE). The molecular weight of the purified PPlase was estimated as 18,000 by SDS-PAGE. The 39 amino acid residues from the N-terminus were determined by the protein sequencer. The enzyme showed the optimum pH at 8.0 and was stable at the range of pH 7.0 to 8.0. The enzyme was considerably stable after heat treatment at $60^{\circ}C$ for 30 minutes, and the enzyme was quite stable up to $65^{\circ}C$. The presence of the PPlase in the refolding solution accelerated the isomerization rate of the assay peptide.
The polygalacturonase (PG) production in rotten apples by Botryosphaeria dothidea was purified by using gel filtration and ion exchange column chromatography, and the biochemical characters of PG were investigated. The purified PG appeared as a single band on sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) with approximate molecular weight of 49 kilodalton (kDa). The molecular weight was equal to the native molecular weight estimated by gel filtration. The Km and Vmax values of PG were 0.51 mg/ml and 90.9 $\mu$M/min/ml, respectively. Optimum pH was 4.0~5.0, and the PG activity was stable from pH 5.0~10.0. Optimum temperature of the enzyme activity was 4$0^{\circ}C$. The PG activity was relatively stable at 2$0^{\circ}C$, but it was reduced 45% at 4$0^{\circ}C$ and completely inactivated at 8$0^{\circ}C$. The PG activity was considerably inhibited by Cu2+, Zn2+, SDS and EDTA, whereas it was not effected by Ca2+, K+, Mg2+ or Na+ ions.
Sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) of muscles extracted with distilled water, saline solution, SDS or Trition X-100 showed simular protein patterns between Hanwoo and Holstein meat, indicating that SDS-PAGE technique may not be useful for the identification between Hanwoo and Holstein meat. Lectine blot analysis of muscle extracted with distilled water demonstrated that Hanwoo and Holstein meat had similar affinities for concanavalin A (Con A), ricinus communis agglutinin (RCA-120), ulex europaeus agglutinin (UEA-1) or peanut agglutinin (PNA) lectins. However, approximately 32.1 kDa component of Hanwoo meat showed high affinity for dolichos biflorus agglutinin (DBA) lectin. On the contrary, high molecular weight components of Holstein meat had the specific affinity for wheat germ agglutinin (WGA) lectin. Hanwoo meat-specific components were observed by lectin staining of heat-denatured meat at 100$^{\circ}C$ for 30 sec. Also, the component of heat-denatured meat at 100$^{\circ}C$ for 30 sec, which was slightly smaller than Hanwoo meat-specific component, was concentrated specifically in Holstein meat.
네품종의 보리(올보리, 영산보리, 사천 6호, 수원 228호)로 부터 Osborne의 방법과 이것을 변형한 전보의 방법으로 단백질을 분획하여 albumin, globulin, hordein 및 glutelin 획분을 얻어 이들 각획분들을 SDS-PAGE로 분석한 결과 품종간 polypeptide 조성 차이를 관찰할 수 있었으며 특히 hordein과 hordein-I을 pH 3에서 PAGE를 수행 하였을 때 각 품종사이의 pattern에 명확한 차이를 볼 수 있었다. 한편, hordein-I의 아미노산조성은 glutamic acid와 proline 함량이 높았으나 품종간의 아미노산조성차이는 거의 볼 수 없었다.
These experiments were undertaken as a basic study to understand the role of cumulus cell on in vitro maturation and fertilization process with identifying the cumulus cell-secreted proteins. By sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis(SDS-PAGE) and fast protein liquid chromatography(FPLC), the proteins of cumulus cells were identified. The results obtained in these experiments were summarized as follows ; 1. When the proteins secreted from cultured cell for 30 hours were separated by SDS-PAGE, there were a major band (>94,000) and other minor 2 bands with molecular weight ranging 30,000∼67,000 dalton. 2. In addition, the fractionations of these proteins by FPLC were idirectly shown that three bands were hyaluronic acid, chondroitin sulfate, and heparin.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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