• 제목/요약/키워드: Sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis

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양식넙치에서 분리된 Edwardsiella tarda의 생화학적 및 혈청학적 특성에 관한 연구 (Studies on the biochemical and serological characteristics of Edwardsiella tarda isolated from cultured flounder, Paralichthys olivaceus)

  • 방종득;전세규;박수일;최윤정
    • 한국어병학회지
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    • 제5권1호
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    • pp.29-35
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    • 1992
  • 1990년 7월부터 1991년 11월까지 우리나라에서 넙치 양식이 주로 이루어지고 있는 동해 및 남해안과 제주도 연안에 위치하고 있는 여러 넙치 양식장을 대상으로 넙치 에드와드병의 원인균인 Edwardsiella tarda를 분리하여, 이들의 생화학적 및 혈청학적 특성을 알아 보았다. 분리된 에드와드균은 131균주로서 이들의 생화학적 특성을 조사한 결과, 균주 모두 $H_2S$ 및 indole를 생성하고, glucose, maltose, mannose, galactose 및 fructose등의 당을 산화시키고 가스를 형성하나 xylose, sucrose, rhamnose등의 당은 분해를 시키지 못하는 등의 특성을 가지고 있었다. 분리된 131균주 중 지역별로 대표가 되는 10개의 균주를 선택하여, 혈청학적 특성을 비교한 결과 일본에서 분류되고 있는 E. tarda의 세가지 혈청형을 나타내는 항혈청 E-22(혈청형 a), SU-138(혈청형 b) 및 SU-100(혈청형 c)과 대표균주간에는 항체가 E-22항혈청에 대하여는 2560-5120의 응집를 보인 반면, SU-138 및 SU-100의 항혈청에서는 각각 40-80과 40 이하의 응집를 보여 대표균주는 E. tarda serotype a와 유연성이 깊은 것으로 나타났다. 또한 대표균주들을 10% acrylamide gel상에서 전기영동하여 세균단백질을 비교하여 본 결과, 대표 균주 모두가 단백질의 종류 및 양에 있어서 거의 동일한 것으로 나타났다.

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스파르가눔 항원단백질에 대한 스파르가눔증 환자 혈청의 반응 양상 (Antigenic protein fractions reacting with sera of sparganosis patients)

  • 최성호;강신영;공윤;조승열
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제26권3호
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    • pp.163-168
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    • 1988
  • 스파르가눔증을 혈청학적으로 진단하기 위하여 효소면역측정법을 실시할 경우, 그 민감도와 특이도가 높다고 이미 보고되었다. 실제로 조직기생충 감염이 의심되는 환자에 대하여 특이 IgG항체가를 일상적으로 검사하면 중추신경계 환자중에서 뇌스파르가눔증은 드물지 않게 발견할 수 있다. 그러나 혈청학적 진단에 이용되는 스파르가눔 조항원(조항원)은 조충증(조충증), 유구낭미충증이나 포충증 환자의 혈청과 비특이적인 교차반응을 일으키는 경우가 있다. 이러한 교차반응의 문제를 해결하려면 우선 스파르가눔 항원의 구성 단백질이 환차혈청과 반응하는 양상을 알아야 할 필요가 있다. 이 연구에서는 외과적으로 스파르가눔증을 확인한 환자 15명에서 얻은 혈청이 스파가눔의 생리식염수 추출액의 항원단백질중 어느 분획과 반응하는지 검토하였다. 그리고 뇌유구낭미충증 환자 24명(그중 8명은 효소면역측정법으로 교차반응이 있었음)의 혈청과 교차반응을 일으키는 단백질 분획을 관찰하였다. 스파르가눔충체의 생리식염수 추출액을 10∼15% linear gradient gel에서 SDS-폴리아크릴아마이드 전기영동을 실시하여 단백질대 30개를 구별할 수 있었다. 분리한 단백질(대)를 nitrocellulose 종이에 옮긴후 스파르가눔증 환자 혈청 및 conjugate와 차례로 반응시키고 발색반응을 일으킨 결과 (효소면역 전기영동이적법, immunoblot), 스파르가눔 항원단백질중 29kDa 및 36kDa가 가장 많이 또 가장 진하게 반응한 것이어서 민감하고 항원성이 높은 단백질 분획이라고 판단하였다. 그리고 위의 단백질 이외에도 158kDa, 130kDa, 107kDa, 78kDa, 72kDa, 52kDa, 23kDa, 21kDa, 15kDa 및 6kDa 등에도 반응이 있었다. 유구낭충증 환자 24명의 혈청중 스파르가눔 항원에 혈청학적 교차반응이 있었던 혈청은 36kDa 및 29kDa 단백질에 반응하고 있어 이 단백질이 스파르가눔의 종 특이(종특이)단백질 항원은 아닌 것으로 판단되나 그 성질에 대해서는 앞으로 더 추구할 가치가 있다고 생각한다.

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Immunoblot technique을 이용한 폐흡충의 발육단계별 항원 특이성 분석 (Analysis of antigenic specificities of Puragonimus westeymuni developmental stages using immunoblot technique)

  • 주경환;홍성철
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제27권1호
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    • pp.1-8
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    • 1989
  • 폐흡충증의 진단은 객담검사법이 가장 확실한 진단 방법이기는 하지만 폐흡충이 폐에 기 생한 경우에도 충란 검출이 어려울 때가 있으므로 혈청학적 진단법이 이용되고 있다. 혈청학적 진단법에 사용되는 항원인 기생충 추출물, 즉 조항원은 분류학적으로 유사한 기생충과 서로 공유하고 있는 공통 항원 때문에 교차 반응을 일으키는 경우가 있다. 이 연구는 발육단계 별 폐흡충에서 만든 조항원을 SDS-PAGE(sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis)로 전기영동한 다음 EITB(enzyme-linked immunoelectrotransfer blot)를 이용하여 항원대별 항원성 및 특이성을 관찰하여 시기별로 채취한 고양이 혈청에 대한 특이 반응대를 관찰해 보고자 시행하였다. 실험에 사용한 항원은 실험적으로 고양이에 감염시켜 3, 5, 8및 12주 만에 얻은 폐흡충의 식염수 추출액 (SEPn; n=감염된 시기)이며 3∼20% linear gradient gel에서 SDS-PAGE하였다. Silver stain결과 폐흡충 조항원은 최소한 30개 이상의 band들로 구성되어 있었는데 각 발육단계 에 공통된 항원대로 203, 63, 35, 21, 19, 13 kDa band들이 관찰되었고, 단계별로 차이점도 관찰 되었다. SEPl2에서는 새로운 229 kDa band가 관찰되었다. 주요 항원대에 대하여 EITB를 한 결과 각 항원과 감염 후 5주 이상 된 혈청과 공통적으로 반응한 항원대는 203, 115, 91, 85, 67, 63, 48, 39, 35 및 25 kDa band들이었고, 8주 이상 된 혈청과의 반응에서는 19, 13및 10 kDa 항원대와 공통적으로 일관성 있게 반응하였다. SEP12는 12주 된 혈청과 229 kDa에서 특이하게 반응하였다.

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Immunoblot를 이용한 폐흡충 비항원의 특이 항원대의 증명 (Demonstration of species-specific and cross reactive components of Paragonimus tvestermani crude worm antigen by EITB)

  • 주경환;안혁;정명숙;임한종
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제27권1호
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    • pp.9-14
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    • 1989
  • 폐흡충중의 진단은 일반적으로 객담에서 충란을 검출하는 것이 가장 확실한 진단법으로 간주되고 있지만 이소기생의 경우는 물론, 본 기생충의 감염자 및 감염 강도의 감소로 인해 실제 폐에 기생한 경우에 있어서도 객담 검사의 민감도가 매우 낮아져 혈청학적 검사의 필요성이 점차 대두되고 있다. 따라서 식염수 추출액을 항원으로 하여 효소면역 측정법을 실시하는 방법으로 면역 진단을 실시하고 있으나 조항원의 단백 구성이 복잡하여 간흡충을 비롯한 몇몇 흡충류 감염자 혈청에서 교차 반응이 야기되고 있다. 그동안 정제 항원을 만들고자 하는 시도가 많았음에도 불구하고 특이 항원의 분리는 실제로 불가능하였다. 이와 같은 문제점을 보완하기 위하여 폐흡충 조항원을 SDS-PAGE로 전기영동한 다음 EITB를 이용하여 항원대별 항원성 및 특이성을 관찰하여 폐흡충 조항원의 폐흡충증 혈청에 대한 특이 반응대를 확인해 보고자 하였다. 실험에 사용된 항원은 실험적으로 개에 감염시켜 24주만에 얻은 폐흡충 성충의 식염수 추출액이며 3∼20%의 linear gradient gel에서 SDS-PAGE하였다. Silver 염색한 결과 229 kDa∼10kDa 사이에서 26개의 항원대를 구성하고 있었으며 주요 항원대에 대하여 EITB를 실시한 결과 폐흡충 감염자 혈청은 229, 91, 60, 50, 35∼31, 27, 25, 21, 17, 11 및 10kDa의 분자량을 갖는 항원대와 반응하였다. 간흡충 감염자 혈청은 35∼31, 19, 11및 17 kDa의 항원대와 반응하였고 낭미충 감염자 혈청은 229, 31∼31, 27, 25 및 17kDa의 항원대와 반응하였다. 광절열두조충 1예도 17 kDa의 항원대와 반응하였다. 따라서 91, 60, 21 및 10kDa의 항원대 중 일부가 폐흡충 조항원에 있어서 체홉충에 대한 종특이 항원대로 생각되었으며 향후 immunoblot을 이용한 폐흡충중의 면역진단에 이용될 수 있는 항원대로 간주할 수 있었다.

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Identification and Safety Assessment of Cucumber Mosaic Virus Coat Protein in Genetically Modified Pepper (Capsicum annuum)

  • Kim, Eunji;Noh, Hee Min;Phat, Chanvorleak;Lee, Gung Pyo;Kim, Jun Hong;Park, Tae-Sung;Lee, Chan
    • 원예과학기술지
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    • 제34권6호
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    • pp.924-939
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    • 2016
  • The great economic losses caused by Cucumber mosaic virus (CMV) infection of peppers has led to the development of genetically modified (GM) CMV-resistant peppers. We developed virus-resistant pepper plants using Agrobacterium tumefaciens -mediated transformation. The expressed recombinant protein was purified using nickel-nitrilotriacetic acid resin and immunoaffinity chromatography, and purity was assessed by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis. Immunoblot analysis revealed the purified CMV coat protein (CMV-CP) had a molecular mass of 25 kDa. After in-gel digestion and desalting, the internal peptide fragments of CMV-CP were sequenced by matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight. Most GM pepper and Escherichia coli BL21 internal peptides had identical peptide sequences and contained 137 of 183 whole peptides in CMV-CP. A quantitative enzyme-linked immunosorbent assay was performed to detect CMV-resistant GM peppers. We also provide basic information about the expressed protein in GM peppers for further safety assessment. The contents of soluble protein and CMV-CP were measured in GM and control peppers cultivated in three different areas of Korea. Statistical significance in terms of cultivation areas, harvest times, generations, and plant tissue origin were determined based on a P value of 0.05. The highest amount of CMV-CP was detected at the seedling stage from plant grown in each region. T3 and T5 showed significantly different levels of CMV-CP from T4 in leaves in the whorl stage. No statistical differences were observed among GM peppers at different stages of maturity in any cultivation area. The results from this study contribute to the safety evaluation of newly designed CMV-resistant GM peppers and provide a standard against which to compare other virus-resistant GM peppers.

Effect of Gamma Irradiation on the Structural and Physiological Properties of Silk Fibroin

  • Sung, Nak-Yun;Byun, Eui-Baek;Kwon, Sun-Kyu;Kim, Jae-Hun;Song, Beom-Seok;Choi, Jong-Il;Kim, Jin-Kyu;Yoon, Yo-Han;Byun, Myung-Woo;Kim, Mee-Ree;Yoo, Hong-Sun;Lee, Ju-Woon
    • Food Science and Biotechnology
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    • 제18권1호
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    • pp.228-233
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    • 2009
  • This study was conducted to examine the changes in the molecular structure and physiological activities of silk fibroin by gamma irradiation. The results of gel permeation chromatography and sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis showed that the molecular weight of fibroin was increased depending upon the irradiation dose. Secondary structure of fibroin determined by using circular dichroism revealed that the ratio of $\alpha$-helix was increased up to 10 kGy and then decreased depending upon the irradiation dose. Whereas, the ratio of $\beta$-sheet, $\beta$-turn, and random coil were decreased and then increased with an alteration in the $\alpha$-helix secondary conformation. The 2.2-diphenyl-1-picryl-hydrazil (DPPH) radical scavenging activity of fibroin was increased by gamma irradiation at 5 kGy, but was decreased above 10 kGy depending upon the irradiation dose. Also, the inhibition activities of tyrosinase and melanin synthesis of fibroin were increased by gamma irradiation. These results indicated that gamma irradiation could be used as an efficient method to make fibroin more suitable for the development of functional foods and cosmetics.

낙각막 분해를 위한 Bacillus licheniformis로 부터 Keratinase의 정제 및 특성 (Purification and Characterization of a Keratinase from Bacillus licheniformis Strain for Degradation of Egg Shell Membrane)

  • 전태욱;박기문
    • 한국축산식품학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.259-266
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    • 2002
  • 본 연구는 토양으로부터 egg shell membrane(ESM)을 분해하는 미생물 strain 109를 분리 동정하였으며, 분리균이 생성한 keratinase를 정제하고 그 특성을 확인하였다. Strain 109는 16S rDNA 결과 99.9%의 상동성을 가지고 Bacillus licheniformis로 확인되었고, 3% ESM을 함유한 Nitrobacter 203배지에서 B. licheniformis 109를 접종하여 1주일간 배양하였을 때 ESM의 분해율은 약 15%였다. E. licheniformis 109가 생성한 keratinase를 정제하여 SDS-PA-GE로 분자량을 측정한 결과 약 65,000 Dalton이었으며 0.1% gelatin이 함유된 SDS-PAGE에 의해 효소 활력을 확인할 수 있었다. 정제한 keratinase의 PH에 따른 활성과 안정성은 pH 9.0에서 활성이 가장 높았으며 pH 9.0이상에서 안정하였다. 또한, 5$0^{\circ}C$에서 효소활성이 가장 높았으며 온도 안정성은 2$0^{\circ}C$에서 5$0^{\circ}C$까지 안정하였고, 7$0^{\circ}C$ 이상에서는 약 50%의 활력을 상실하였다. keratinase 활성에 금속 이온이 미치는 영향은 CuCl2와 ZnCl2에 의해 약 50% 정도가 저해되었으나 FeSO4에 의해서는 1mM일 때 약 11%, 10mM일 때 약 33%가 증가하였다. 그리고 PMSF에 의해 효소활성이 저해되는 것으로 나타나 B. licheniformis 109로부터 정제한 keratinase는 serine-protease로 사료된다.

능이 [Sarcodon aspratus (Berk.) S. Ito]중 단백질(蛋白質) 가수분해(加水分解) 효소(酵素)의 정제(精製) 및 성질(性質)에 관하여 (Purification and Some Characteristics of the Proteolytic Enzyme in Fruitbody of Neungee [Sarcodon aspratus (Berk.) S. Ito])

  • 이태규
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제15권3호
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    • pp.276-285
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    • 1986
  • 능이 [Sarcodon aspratus (Berk.) S. Ito]로부터 단백질가수분해(蛋白質加水分解) 효소(酵素)를 분리 정제하여 그 특성을 조사하였다. 본 효소는 Tri-acryl CM-cellulose, Ultrogel AcA 54, Hydroxy apatite column chromatography와 preparative isoelectric focusing 방법으로 순차 정제되었고, 정제된 효소는 PAGE상에서 단일 band를 나타내었으며 활성(活性)은 62.5O.D/mg.protein으로 조효소(粗酵素)보다 8.01배 증가하였다. 작용최적(作用最適) pH는 10.1로 alkaline protease였으며 작용최적(作用最適) 온도(溫度)는 $57^{\circ}C$부근이었다. $50^{\circ}C$ 이하의 온도(溫度)와 pH $4.0{\sim}10.8$ 범위에서 안정(安定)하였으나, $60^{\circ}C$에서 30분후 26%, $65^{\circ}C$에서는 65%가 실활(失活)되었다. $Mn^{++}$은 효소의 활성(活性)을 증가시켰으나 $Hg^{++}$$Cu^{++}$는 현저히 저해시켰다. SDS-PAGE에 의해 분자량(分子量)은 30,100으로 측정되었고, monomer임이 확인되었다. 등전점(等電点)은 9.80이었다.

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Purification and Characterization of the Rat Liver CYP2D1 and Utilization of Reconstituted CYP2D1 in Caffeine Metabolism

  • Chung, Woon-Gye;Cho, Myung-Haing;Cha, Young-Nam
    • Toxicological Research
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    • 제13권1_2호
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    • pp.117-125
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    • 1997
  • In order to assess the possibility whether CYP2D is involved in caffeine metabolism, we have purified and characterized the rat liver microsomal cytochrome P4502D1 (CYP2D1), equivalent to CYP2D6 in human liver, and have utilized the reconstituted CYP2D1 in the metabolism of 4 primary caffeine (1, 3, 7-trimethylxanthine) metabolites such as paraxanthine (1, 7-dimethylxanthine), 1, 3, 7-trimethylurate, theophylline (1, 3-dimethylxanthine) and theobromine (3, 7-dimethylxanthine). Rat liver CYP 2D1 has been purified to a specific content of 8.98 nmole/mg protein (13.4fold purification, 1.5% yield) using $\omega$-aminooctylagarose, hydroxlapatite, and DE52 columns in a sequential manner. As judged from sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), the purified CYP2D1 was apparently homogeneous. Molecular weight of the purified CYP2D1 was found to be 51, 000 Da. Catalytic activity of the purified and then reconstituted CYP2D1 was confirmed by using bufuralol, a known subsFate of CYP2D1. The reconstituted CYP2D1 was found to produce to 1-hydroxylbufuralol at a rate of 1.43$\pm$0.13 nmol/min/nmol P450. The kinetic analysis of bufuralol hydroxylation indicated that Km and Vmax values were 7.32$\mu M$ and 1.64 nmol/min/nmol P450, respectively. The reconstituted CYP2D1 could catalyze the 7-demethylation of PX to 1-methylxanthine at a rate of 12.5 pmol/min/pmol, and also the 7- and 3- demethylations of 1, 3, 7-trimethylurate to 1, 3-dimethylurate and 1, 7-dimethylurate at 6.5 and 12.8 pmol/min/pmol CYP2D1, respectively. The reconstituted CYP2D1 could also 3-demethylate theophylline to 1-methylxanthine at 5 pmol/min/pmol and hydroxylate the theophylline to 1, 3-dimethylurate at 21.8 pmol/min/pmol CYP2D1. The reconstituted CYP2D1, however, did not metabolize TB at all (detection limits were 0.03 pmol/min/pmol). This study indicated that CYP2D1 is involved in 3-and 7-demethylations of paraxanthine and theophylline and suggested that CYP2D6 (equivalent to CYP2D1 in rat liver) present in human liver may be involved in the secondary metabolism of the primary metabolites of caffeine.

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개불의 체벽으로부터 i-type 라이소자임의 정제 (Isolation of an Invertebrate-type Lysozyme from the Body Wall of Spoon Worm, Urechis unicinctus)

  • 오혜영;박남규
    • 생명과학회지
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    • 제28권3호
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    • pp.300-306
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    • 2018
  • 라이소자임은 선천성 면역 물질로 개불을 포함하는 여러 무척추동물의 병원균에 대한 방어에 주요하게 작용한다. 본 논문은 개불(Urechis unicinctus)의 체벽 조직 추출물로부터 무척추형 라이소자임의 정제와 그 특성에 관한 분석을 기술하고 있다. 체벽 추출물은 우선적으로 Sep-Pak C18 cartridge를 사용하여 부분적으로 분리되었으며, 분리된 분획 중 60% 메탄올에 용출된 분획이 Bacillus subtilis KCTC 1021에서 강한 항균활성을 나타내었다. 그 후 여러 단계의 역상과 이온교환 고속액체크로마토그래피(High Performance Liquid Chromatography, HPLC)를 사용하여 항균성 물질이 정제되었으며, 분자량은 약 14 kDa이었다. 이 단백질의 일차서열은 LC-MS/MS를 통해 분석되었으며, 얻은 부분적 아미노산 서열을 NCBI BLAST를 통하여 분석해 본 결과, 이 항균성 물질은 다른 동물들로부터 동정된 무척추동물형 라이소자임(invertebrate-type lysozyme)의 서열과 유사도를 가지고 있어, 체벽으로부터 정제된 개불 라이소자임(Urechis unicinctus invertebrate-type lysozyme from body wall, Uu-iLysb)으로 명명하였다. 개불 라이소자임의 활성을 확인하기 위하여 항균활성 및 라이소자임 효소 활성실험을 진행한 결과, 개불 라이소자임이 항균활성과 라이소자임 효소활성 모두 강하게 가지고 있는 것을 확인하였다.