• 제목/요약/키워드: Single cell gel electrophoresis (SCGE)

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김치로부터 분리된 우세 균주들의 in vitro 항유전 독성효과 (Antigenotoxic Effect of Dominant Bacterial Isolates from Kimchi in vitro)

  • 최준원;박종흠;지승택;최옥병;신현길
    • 한국식품과학회지
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    • 제31권4호
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    • pp.1071-1076
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    • 1999
  • 본 연구에서는 김치발효에 관여하는 우세 발효균들의 집락을 분리하고, 발암원인 MNNG에 대하여 이들 분리주들이 갖는 DNA 손상 억제효과를 조사하였다. 이를 위해서 세포의 DNA 손상 및 복구를 측정하는데 이용되는 매우 신속하고 감도가 높은 Single Cell Gel Electrophoresis(SCGE 법, 또는 comet assay)를 사용하였다. 배추김치에서 분리한 3개의 분리주중에서 B-3를 제외한 B-1과 B-2는 양성 대조구와 비교하였을 때 우수한 항유전 독성효과를 나타내었으며(p<0.01), 율무김치의 3 개의 분리주(Y-1, Y-2, Y-3)와 1개의 분리주(Y-4)도 각각 항유전 독성효과를 나타내었다(p<0.05, p<0.01). 총각김치의 5 개 분리주중에서 3개의 분리주와 깍두기의 9개의 분리주중에서 2 개의 분리주들도 각각 항유전 독성효과를 나타내었다(p<0.05, p<0.01).

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방사선과 수은에 의해 유도된 Eisenia fetida 체강세포의 DNA 손상 및 수복 평가 (Evaluation of DNA Damage and Repair Kinetics in the Earthworm (Eisenia fetida) Exposed to Radiation and Mercury)

  • 류태호;모하마드닐리;안광국;김진규
    • 환경생물
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    • 제29권1호
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    • pp.68-73
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    • 2011
  • E. fetida를 방사선과 수은에 각각 노출시킨 후, 체강세포를 추출하고 단세포 겔 전기영동 기법을 이용하여 DNA의 손상정도와 시간의 경과에 따른 수복 양상을 평가해 보았다. 그 결과, 방사선 조사 후의 시간이 경과할수록 대체로 DNA 손상정도가 감소했으며, 12시간 내에 모든 실험군의 DNA가 완전히 수복되었다. 정확한 수복 완료 시간을 알아보기 위해 OTM 값을 대조군과 비교해 보면 2.5와 5Gy는 방사선 조사 후 약 2시간, 10과 20 Gy는 약 3시간, 50 Gy는 약 12시간이 지나자 DNA가 완전히 회복된다고 판단할 수 있었다. 또한 지렁이를 80과 160 mg $kg^{-1}$ 농도의 염화수은(II)에 48시간 동안 노출시킨 후, 수은에 오염되지 않은 깨끗한 배양토에서 72시간을 다시 배양했을 때 손상된 DNA가 완전히 수복되었다. 본 연구 결과는 산화적 스트레스 인자에 대한 생물의 민감도를 측정하는 자료로 제시될 수 있으며, 향후 다양한 생물을 대상으로 실험을 진행한다면 동일한 유전독성 물질에 대한 생물종 간의 감수성을 비교 분석할수 있을 것이다.

Evaluation of Oxidative DNA Damage Using an Alkaline Single Cell Gel Electrophoresis (SCGE) Comet Assay, and the Protective Effects of N-Acetylcysteine Amide on Zearalenone-induced Cytotoxicity in Chang Liver Cells

  • Kang, Changgeun;Lee, Hyungkyoung;Yoo, Yong-San;Hah, Do-Yun;Kim, Chung Hui;Kim, Euikyung;Kim, Jong Shu
    • Toxicological Research
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    • 제29권1호
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    • pp.43-52
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    • 2013
  • Zearalenone (ZEN) is a non-steroidal estrogenic mycotoxin produced by several species of Fusarium that are found in cereals and agricultural products. ZEN has been implicated in mycotoxicosis in farm animals and in humans. The toxic effects of ZEN are well known, but the ability of an alkaline Comet assay to assess ZEN-induced oxidative DNA damage in Chang liver cells has not been established. The first aim of this study was to evaluate the Comet assay for the determination of cytotoxicity and extent of DNA damage induced by ZEN toxin, and the second aim was to investigate the ability of N-acetylcysteine amide (NACA) to protect cells from ZEN-induced toxicity. In the Comet assay, DNA damage was assessed by quantifying the tail extent moment (TEM; arbitrary unit) and tail length (TL; arbitrary unit), which are used as indicators of DNA strand breaks in SCGE. The cytotoxic effects of ZEN in Chang liver cells were mediated by inhibition of cell proliferation and induction of oxidative DNA damage. Increasing the concentration of ZEN increased the extent of DNA damage. The extent of DNA migration, and percentage of cells with tails were significantly increased in a concentration-dependent manner following treatment with ZEN toxin (p < 0.05). Treatment with a low concentration of ZEN toxin (25 ${\mu}M$) induced a relatively low level of DNA damage, compared to treatment of cells with a high concentration of ZEN toxin (250 ${\mu}M$). Oxidative DNA damage appeared to be a key determinant of ZEN-induced toxicity in Chang liver cells. Significant reductions in cytolethality and oxidative DNA damage were observed when cells were pretreated with NACA prior to exposure to any concentration of ZEN. Our data suggest that ZEN induces DNA damage in Chang liver cells, and that the antioxidant activity of NACA may contribute to the reduction of ZEN-induced DNA damage and cytotoxicity via elimination of oxidative stress.

방사선 유도 DNA 손상에 대한 인진쑥의 방어효과 (Protective Effects of a Herb, Artemisia capillaris, Against Radiation-induced DNA Damage)

  • 조성기;오헌;천의현;정우희;조남정
    • 한국식품영양과학회지
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    • 제33권1호
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    • pp.22-27
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    • 2004
  • 인진쑥의 방사선에 의한 산화적 손상에 대한 DNA 방어효과를 확인하기 위하여 마우스 림프구에서 단세포전기영동법과 CHO 세포에서 미소핵 형성 시험 그리고 마우스의 간과 흉선 조직의 DNA에서 8-OHdG의 형성정도를 관찰하였다. 그 결과 단세포전기영동법 및 미소핵 형성 시험에서는 50 $\mu\textrm{g}$/mL의 농도에서 가장 높은 DNA 손상 억제 효과를 나타내었으며, 8-OHdG 형성 정도는 간과 흉선 모두 30 mg/kg 농도 투여군에서 높은 방어효과를 나타내었다. 이상의 결과에서 인진쑥 추출물은 DNA 상해를 효과적으로 방어하였고 특히, 기존에 알려진 방사선 방호물질에 비하여 독성이 적은 천연물이라는 관점에서 방사선 방어제로 적용이 가능할 것으로 사료된다.

MUTAGENICITY AND ANTIMUTAGENICITY OF CATECHIN AND TANNINS FROM THE BARK OF HAMAMELIS VIRGINIANA L. IN HUMAN Hep G2 CELLS

  • Sundermann, Volker-Mersch;Andreas Dauer;Evelyne Lhoste;Siegfried Knasmuller
    • 한국독성학회:학술대회논문집
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    • 한국독성학회 2001년도 International Symposium on Dietary and Medicinal Antimutgens and Anticarcinogens
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    • pp.95-96
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    • 2001
  • The mutagenic and antimutagenic activities of catechin, hamamelitannin and two proanthocyanidin fractions prepared from the bark of Hamamelis virginia L. - a commonly used medicinal herb - were investigated in a human derived hepatoma (Hep G2) cell line using the single cell gel electrophoresis (SCGE, syn. Comet assay) for the detection of DNA-migration. The cells possess different phase I and phase II enzymes involved in the biotransformation of xenobiotics.(omitted)

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13-Week Oral Gavage Toxicity with Sophora Japonica Linne Seed Extract in Sd Rats

  • Lee, Jae-Hyung;Kim, Il-Yong;Hyun, Chang-Kee
    • 한국독성학회:학술대회논문집
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    • 한국독성학회 2003년도 추계학술대회
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    • pp.133-133
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    • 2003
  • In recent years. attention has focused on the application of the alkaline single cell gel electrophoresis (SCGE or Comet) assay in environmental mutagenesis. To evaluate the suitability of the assay as a monitoring. technique, the DNA damages in liver cells and erythrocytes of carp (Cyprinus carpio) exposed to benzo[${\alpha}$]pyrene (B[${\alpha}$]P) were estimated comparatively with the in vivo Comet assay and the micronucleus test (MNT).(omitted)

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Galangin 및 양강추출물의 $KBrO_3$ 유도 DNA 및 염색체 손상에 대한 보호효과 (Protective Effect of the 70% Ethanolic Extract of Alpinia officinarum and Galangin Against $KBrO_3$-induced DNA and Chromosomal Damage in Mice)

  • 양혜은;허문영
    • 약학회지
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    • 제54권6호
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    • pp.423-428
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    • 2010
  • The aim of this study was to evaluate the in vivo effect of galangin and the 70% ethanolic extract of Alpinia officinarum (AO) toward $KBrO_3$-induced DNA and chromosomal damage in mice. Galangin and AO inhibited the formation of 8-hydroxy-2'-deoxyguanosine (8-OH2'dG) as an indicator of DNA oxidative damage in the liver cell. Galangin and AO showed the inhibitory effect on the formation of DNA single strand break in the splenocyte by single cell gel electrophoresis (SCGE) assay and also inhibited micronucleated reticulocyte (MNRET) formation of peripheral blood in tail blood of mice. Vit-E revealed antigenotoxic effects in DNA and chromosome levels, but galangin was more potent active compound compare to vit-E under our experimental conditions. The results suggest that the extract of Alpinia officinarum containing galangin can modify the oxidative DNA and chromosomal damage and may act as chemopreventive agent against oxidative stress in vivo.

DNA손상 및 돌연변이에 대한 명지버섯의 방어효능 (The Protective Effects of Ganoderma lucidum on the DNA Damage and Mutagenesis)

  • 이길수;공석경;최수영
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제11권2호
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    • pp.139-144
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    • 2003
  • Ganoderma lucidum is commonly known as medically potent mushroom, which has been widely used in China and other oriental countries for the treatment of various diseases, including cancer. In this report, we investigated the anti-oxidant and protective effect of Ganodema lucidum extract (GLE) against the DNA damage induced by free radical and U.V. In the assay of cell growth inhibition, the inhibitory cell growth rate induced by hydroxyl radical was dose-dependently decreased by GLE. This results support that GLE has a detoxifying activity against cytotoxicity of hydroxyl radical in E. coli cell. GLE also protected ColE1 plasmid DNA damage in the concentration of 200$\mu\textrm{g}$ per reaction on the DNA fragmentation assay. The nuclear tailing by hydrogen peroxide in single cell gel electrophoresis(SCGE) was decreased by GLE in the concentration of 50$\mu\textrm{g}$/ml. These data indicate that Ganoderma lucidum has an anti-oxidative activity to hydrogen peroxide. The mutation rate after irradiation of U.V. was reduced by 50$\mu\textrm{g}$/ml GLE and total number of Rif (Rifampicin) resistant mutants was decreased in a concentration dependent manner when added the GLE exogenously in a culture media. According to the results, it is likely that GLE has not only an anti-oxidative activity to hydroxyl radical but also an anti-mutagenic activity to U.V. mutagenesis.

도심하천 생태계의 수환경 평가를 위한 생지표 바이오마커 및 바이오인디케이터 메트릭 속성 및 다변수 생태 모형 (Multiple-biometric Attributes of Biomarkers and Bioindicators for Evaluations of Aquatic Environment in an Urban Stream Ecosystem and the Multimetric Eco-Model)

  • 강한일;강남이;안광국
    • 환경영향평가
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    • 제22권6호
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    • pp.591-607
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    • 2013
  • 본 연구에서는 생물학적 바이오마커, 물리적 서식지 지표 및 화학적 수질지표를 종합하여 12-메트릭 생태평가 모형을 확립하였고, 도심하천에 적용하여 수생태계 평가를 실시하였다. 생태모형 적용을 위해 도심하천의 상류역의 대조군 지역($C_Z$), 중류의 전이대($T_Z$) 및 하류역의 오염지역(IZ)을 선정한 후, 모델값에 대한 계절별 변이특성을 분석하였다. DNA 손상도 분석은 혈액을 이용한 단세포 전기영동법(Single-cell gel electrophoresis, SCGE)인 Comet assay 지표에 의거한 생지표 메트릭으로 이용되었고, Tail moment, Tail DNA(%) 및 Tail length(${\mu}m$)값이 분석되었다. DNA의 손상은 하류역의 오염지역($I_Z$)에서 분명하게 나타났지만, 대조군($C_Z$) 지역에서는 그렇지 않았다. 개체군 지표로서 비만도 지수인 $C_F$ 값 분석, 체장빈도 분포 지표 및 개체 이상도(Abnormality) 지표가 생물지표로서 이용되었다. 물리적 서식지 지표는 QHEI 모델을 이용하였고, 4개 메트릭이 분석되었다. 화학적 수질지표는 부영양화 지표인 인(P)/질소(N), 화학적 산소요구량 및 전기전도도 지표가 이용되었다. 본 연구를 종합해보면, 12-메트릭 생태모형의 생지표 속성은 대조군($C_Z$)지역에 비해 오염지역($I_Z$)에서 화학적 스트레스 지표(부영양화 지표)에 아주 민감하게 반응 하는 것으로 나타났으며, 또한 이들은 부분적으로 서식지 평가지표에 의해 영향 받는 것으로 분석되었다.

환경재해에 관한 생물정보로서의 이온화 방사선과 살충제의 인체 위해성 비교 연구 (Comparative Study on Human Risk by Ionizing Radiation and Pesticide as Biological Information about Environmental Disaster)

  • 김진규;현성희
    • Journal of Radiation Protection and Research
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    • 제26권4호
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    • pp.385-392
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    • 2001
  • 환경독성물질이나 생물 위해 요소의 환경내 준위가 일정 수준 이상일 경우 환경재해가 유발될 수 있다. 이온화 방사선의 산업적 의료적 이용이 점차 증가하고 있으며 병해충을 막기 위한 살충제 사용의 점진적 증가로 인해 이들에 의한 재해 가능성을 배제할 수 없다. 이들 재해 요인들에 의한 인체 위해도를 비교하기 위하여 단세포 겔 전기영동법 (SCGE)을 이용하여 사람 림프구 DNA 손상에 미치는 방사선과 살충제의 영향을 각각 평가하였다. 각기 다른 농도로 살충제를 10분간 처리한 림프구에 대한 SCGE 분석을 실시하였고 또한 $0{\sim}2.0Gy$의 방사선을 조사한 림프구에 대한 SCGE 분석을 실시하여 DNA 손상도를 평가하였다. DNA 손상도는 감마선에 대해서 뚜렷한 선량-반응 관계를 나타내었을 뿐 아니라 살충제에 대해서도 명확한 농도-반응 관계를 나타내었다. 파라치온은 농업권장 사용농도인 $1mg{\ell}^{-1}$에서도 림프구에 대해 강한 유전독성을 나타내는데 이러한 유전독성은 0.1 Gy의 감마선에 의해 유발되는 DNA 손상에 상응하며 $2mg{\ell}^{-1}$의 파라치온은 임상적 증상을 야기할 가능성이 있는 전신 외부피폭 방사선량인 0.25 Gy에 상응하는 세포손상을 유발하였다. 이와 같은 연구를 통해 방사선과 살충제의 인체 위해도를 비교할 수 있는 실험적 자료와 환경재해 예방에 필요한 생물정보를 제공할 수 있다.

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