• 제목/요약/키워드: Sequence Pattern

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Characterization of phenotypes and predominant skeletodental patterns in pre-adolescent patients with Pierre-Robin sequence

  • Yang, Il-Hyung;Chung, Jee Hyeok;Lee, Hyeok Joon;Cho, Il-Sik;Choi, Jin-Young;Lee, Jong-Ho;Kim, Sukwha;Baek, Seung-Hak
    • 대한치과교정학회지
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    • 제51권5호
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    • pp.337-345
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    • 2021
  • Objective: To investigate the phenotypes and predominant skeletodental pattern in pre-adolescent patients with Pierre-Robin sequence (PRS). Methods: The samples consisted of 26 Korean pre-adolescent PRS patients (11 boys and 15 girls; mean age at the investigation, 9.20 years) treated at the Department of Orthodontics, Seoul National University Dental Hospital between 1998 and 2019. Dental phenotypes, oral manifestation, cephalometric variables, and associated anomalies were investigated and statistically analyzed. Results: Congenitally missing teeth (CMT) were found in 34.6% of the patients (n = 9/26, 20 teeth, 2.22 teeth per patient) with 55.5% (n = 5/9) exhibiting bilaterally symmetric missing pattern. The mandibular incisors were the most common CMT (n = 11/20). Predominant skeletodental patterns included Class II relationship (57.7%), posteriorly positioned maxilla (76.9%) and mandible (92.3%), hyper-divergent pattern (92.3%), high gonial angle (65.4%), small mandibular body length to anterior cranial base ratio (65.4%), linguoversion of the maxillary incisors (76.9%), and linguoversion of the mandibular incisors (80.8%). Incomplete cleft palate (CP) of hard palate with complete CP of soft palate (61.5%) was the most frequently observed, followed by complete CP of hard and soft palate (19.2%) and CP of soft palate (19.2%) (p < 0.05). However, CP severity did not show a significant correlation with any cephalometric variables except incisor mandibular plane angle (p < 0.05). Five craniofacial and 15 extra-craniofacial anomalies were observed (53.8% patients); this implicated the need of routine screening. Conclusions: The results might provide primary data for individualized diagnosis and treatment planning for pre-adolescent PRS patients despite a single institution-based data.

택시 기종점 빈번 순차 패턴 분석 (Frequent Origin-Destination Sequence Pattern Analysis from Taxi Trajectories)

  • 이태영;전승배;정명훈;최연웅
    • 대한토목학회논문집
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    • 제39권3호
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    • pp.461-467
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    • 2019
  • IoT (Internet of Things) 기술과 위치기반 기술의 발전은 대용량의 이동데이터를 급속하게 생성하고 있다. 대용량 이동 데이터의 분석은 도시 이동의 흐름 및 교통 계획 등에 활용되고 있다. 본 연구에서는 불규칙한 공간적 및 시간적 해상도의 택시 승차 정보로부터 빈번 승차 패턴을 분석하였다. 택시 승차 지점을 중심으로 군집 분석을 실시한 후 군집분석에 기반한 영역을 기준으로 순차패턴 분석을 적용하여 택시 승차 지점이 빈번하게 일어나는 패턴을 분석하였다. 실험용 데이터는 서울특별시 택시 운행 정보로부터 아침 출근 시간인 7시부터 9시 사이의 승차 정보를 분석하였다. 분석 결과는 아침 출근 시간대에 가장 빈도가 높게 발생하는 승차 순차 패턴은 강남 지역 안에서 많이 발생하였으며 지역과의 연계에 있어서는 강남으로부터 서울 시청 지역으로의 이동이 많이 발생하였다. 또한 본 연구는 순차 패턴 분석을 위한 기본 단위로 행정동 경계를 기준으로 분석하였다. 하지만 행정동 경계 기반의 분석은 지역간의 이동 패턴을 찾기가 어려웠다. 본 연구 결과는 향후 택시 공차율 감소와 도시 흐름관리를 위하여 활용할 수 있을 것으로 사료된다.

유전자 및 유전체 연구 기술과 동향 (Trend and Technology of Gene and Genome Research)

  • 이진성;김기환;서동상;강석우;황재삼
    • 한국잠사곤충학회지
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    • 제42권2호
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    • pp.126-141
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    • 2000
  • A major step towards understanding of the genetic basis of an organism is the complete sequence determination of all genes in target genome. The nucleotide sequence encoded in the genome contains the information that specifies the amino acid sequence of every protein and functional RNA molecule. In principle, it will be possible to identify every protein resposible for the structure and function of the body of the target organism. The pattern of expression in different cell types will specify where and when each protein is used. The amino acid sequence of the proteins encoded by each gene will be derived from the conceptional translation of the nucleotide sequence. Comparison of these sequences with those of known proteins, whose sequences are sorted in database, will suggest an approximate function for many proteins. This mini review describes the development of new sequencing methods and the optimization of sequencing strategies for whole genome, various cDNA and genomic analysis.

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Analog 구동 TET-LCD 의 PIAGP(Power In Auto Generated Pattern) 구현 (PIAGP Generation of A TFT-LCD Driven by Analog Signals)

  • 권순영
    • 대한전자공학회:학술대회논문집
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    • 대한전자공학회 2003년도 신호처리소사이어티 추계학술대회 논문집
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    • pp.339-342
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    • 2003
  • An PIAGP generator for TFT-LCD production has been proposed in this paper. The proposed generator was implemented using careful control of timing controller signals using a FPGA. The generator displays successfully the intended pattern sequence(REDlongrightarrowGREENlongrightarrowBLUElongrightarrowWHITElongrightarrowBLACK) and the result are demonstrated at the conference site. The advantage of the use of the proposed generator is the simplification of production equipments and the pattern generator.

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STMP/MST와 기존의 시공간 이동 패턴 탐사 기법들과의 성능 비교 (A Comparison of Performance between STMP/MST and Existing Spatio-Temporal Moving Pattern Mining Methods)

  • 이연식;김은아
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제10권5호
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    • pp.49-63
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    • 2009
  • 시공간 이동 패턴 탐사는 특성상 방대한 시공간 데이터의 분석 및 처리 방법에 따라 패턴 탐사의 성능이 좌우된다. 기존의 시공간 패턴 탐사 기법들[1-10]이 가진 패턴 탐사 수행 시간이나 패턴 탐사 시 사용되는 메모리양이 증가하는 문제를 해결하기 위해 일부 기법에서 몇 가지 방법을 제시하였으나 아직 미비한 실정하다. 이에 선행 연구로 방대한 시공간 이동 데이터 집합으로부터 순차적이고 주기적인 빈발 이동 패턴을 효과적으로 추출하기 위한 STMP/MST 탐사 기법[11]을 제안하였다. 제안된 기법은 해시 트리 기반의 이동 시퀀스 트리를 생성하여 빈발 이동 패턴을 탐사함으로써 탐사 수행 시간을 최소화하고, 상세 수준의 이력 데이터들을 실세계의 의미있는 시간 및 공간영역으로 일반화하여 탐사 시 소요되는 메모리양을 감소시킬 수 있다. 본 논문에서는 이러한 STMP/MST 탐사 기법의 효율성을 검증하기 위해서 탐사 대상 데이터양과 최소지지도를 기준으로 기존의 시공간 패턴 탐사 기법들과 탐사 수행 성능을 비교하고 분석한다.

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근사 알고리즘을 이용한 순차패턴 탐색 (Searching Sequential Patterns by Approximation Algorithm)

  • 산사볼트가람라흐차;황영섭
    • 한국컴퓨터정보학회논문지
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    • 제14권5호
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    • pp.29-36
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    • 2009
  • 서열데이터베이스에 있는 자주 발현하는 부분 서열을 패턴으로 찾아내는 순차패턴 탐색은 넓은 응용 분야를 가지는 중요한 데이터 마이닝 문제이다. DNA 서열에서 순차패턴이 모티프가 될 수 있으므로 DNA 서열에서 순차패턴을 찾는 것을 연구하였다. 대부분의 기존 마이닝 방법은 순차패턴의 정의에 따라 정확한 정합에 주력하여 노이즈가 있는 환경이나 실제 문제에서 발생하는 부정확한 데이터에 대하여 제대로 작동하지 않을 수 있다. 이러한 문제가 생물 데이터인 DNA 서열에서 자주 나타난다. 이러한 문제를 다루기 위한 근사 정합 방법을 연구하였다. 본 연구의 아이디어는 자주 발생하는 패턴을 근사 패턴이라 부르는 그룹으로 분류할 수 있다는 관찰에서 기반을 둔다. 기존의 Prefixspan 알고리즘은 주어진 긴 서열에서 순차패턴을 잘 찾을 수 있다. 본 연구는 Prefixspan 알고리즘을 개선하여 유사한 순차패턴을 찾을 수 있게 하였다. 실험 결과는 PreFixSpan보다 제안한 방법이 패턴 길이가 4일 때, 근사 순차패턴의 빈도가 5배 높아짐을 보였다.

Sequential pattern load modeling and warning-system plan in modular falsework

  • Peng, Jui-Lin;Wu, Cheng-Lung;Chan, Siu-Lai
    • Structural Engineering and Mechanics
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    • 제16권4호
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    • pp.441-468
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    • 2003
  • This paper investigates the structural behavior of modular falsework system under sequential pattern loads. Based on the studies of 25 construction sites, the pattern load sequence modeling is defined as models R (rectangle), L and U. The study focuses on the system critical loads, regions of largest reaction forces, discrepancy between the pattern load and the uniform load, and the warning-system plan. The analysis results show that the critical loads of modular falsework systems with sequential pattern loads are very close to those with the uniform load used in design. The regions of largest reaction forces are smaller than those calculated by the uniform load. However, the regions of largest reaction forces of three models under sequential pattern loads can be considered as the crucial positions of warning-system based on the measured index of loading. The positions of the sensors for the warning-system for these three different models are not identical.

Sequencing of the RSDA Gene Encoding Raw Starch-Digesting $\alpha$-Amylase of Bacillus circulans F-2: Identification of Possible Two Domains for Raw Substrate-Adsorption and Substrate-Hydrolysis

  • Kim, Cheorl-Ho
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제2권1호
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    • pp.56-65
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    • 1992
  • The complete nucleotide sequence of the Bacillus circulans F-2 RSDA gene, coding for raw starch digesting a-amylase (RSDA), has been determined. The RSDA structure gene consists of an open reading frame of 2508 bp. Six bp upstream of the translational start codon of the RSDA is a typical gram-positive Shine-Dalgarno sequence and the RSDA encodes a preprotein of 836 amino acids with an Mr of 96, 727. The gene was expressed from its own regulatory region in E. coli and two putative consensus promoter sequences were identified upstream of a ribosome binding site and an ATG start codon. Confirmation of the nucleotide sequence was obtained and the signal peptide cleavage site was identified by comparing the predicted amino acid sequence with that derived by N-terminal analysis of the purified RSDA. The deduced N-terminal region of the RSDA conforms to the general pattern for the signal peptides of secreted prokaryotic proteins. The complete amino acid sequence was deduced and homology with other enzymes was compared. The results suggested that the Thr-Ser-rich hinge region and the non-catalytic domain are necessary for efficient adsorption onto raw substrates, and the catalytic domain (60 kDa) is necessary for the hydrolysis of substrates, as suggested in previous studies (8, 9).

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혼합분류기 기반 영상내 움직이는 객체의 혼잡도 인식에 관한 연구 (A Study on Recognition of Moving Object Crowdedness Based on Ensemble Classifiers in a Sequence)

  • 안태기;안성제;박광영;박구만
    • 한국통신학회논문지
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    • 제37권2A호
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    • pp.95-104
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    • 2012
  • 혼합분류기를 이용한 패턴인식은 약한 분류기를 결합하여 강한 분류기를 구성하는 형태이다. 본 논문에서는 고정된 카메라를 통해 입력된 영상을 이용하여 특징을 추출하고 이것들을 이용한 약한 분류기의 결합으로 강한 분류기를 만들어 낸다. 제안하는 시스템 구성은 차영상 기법을 이용해서 이진화된 전경 영상을 얻고 모폴로지 침식연산 수행으로 얻어진 혼잡도 가중치 영상을 이용해 특징을 추출하게 된다. 추출된 특징을 조합하고 혼잡도를 판단하기 위한 모델의 훈련 및 인식을 위한 혼합분류기 알고리즘으로 부스팅 방법을 사용하였다. 혼합 분류기는 약한 분류기의 조합으로 하나의 강한 분류기를 만들어 내는 분류기로서 그림자나 반사 등이 일어나는 환경에서도 잠재적인 특징들을 잘 활용할 수 있다. 제안하는 시스템의 성능실험은 "AVSS 2007"의 도로환경의 차량 영상과 철도환경내의 승강장 영상을 사용하였다. 조명변화가 심한 야외환경과 승강장과 같은 복잡한 환경에서도 시스템의 우수한 성능을 보여주었다.

Intragenic Control of Expression of a Rice MADS Box Gene OsMADS1

  • Jeon, Jong-Seong;Lee, Sichul;An, Gynheung
    • Molecules and Cells
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    • 제26권5호
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    • pp.474-480
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    • 2008
  • OsMADS1 is a rice MADS box gene necessary for floral development. To identify the key cis-regulatory regions for its expression, we utilized transgenic rice plants expressing GUS fusion constructs. Histochemical analysis revealed that the 5.7-kb OsMADS1 intragenic sequences, encompassing exon 1, intron 1, and a part of exon 2, together with the 1.9-kb 5' upstream promoter region, are required for the GUS expression pattern that coincides with flower-preferential expression of OsMADS1. In contrast, the 5' upstream promoter sequence lacking this intragenic region caused ectopic expression of the reporter gene in both vegetative and reproductive tissues. Notably, incorporation of the intragenic region into the CaMV35S promoter directed the GUS expression pattern similar to that of the endogenous spatial expression of OsMADS1 in flowers. In addition, our transient gene expression assay revealed that the large first intron following the CaMV35S minimal promoter enhances flower-preferential expression of GUS. These results suggest that the OsMADS1 intragenic sequence, largely intron 1, contains a key regulatory region(s) essential for expression.