• Title/Summary/Keyword: SPI2

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Genetic and Environmental Control of Salmonella Invasion

  • Altier, Craig
    • Journal of Microbiology
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    • v.43 no.spc1
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    • pp.85-92
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    • 2005
  • An early step in the pathogenesis of non-typhoidal Salmonella species is the ability to penetrate the intestinal epithelial monolayer. This process of cell invasion requires the production and transport of secreted effector proteins by a type III secretion apparatus encoded in Salmonella pathogenicity island I (SPI-1). The control of invasion involves a number of genetic regulators and environmental stimuli in complex relationships. SPI-1 itself encodes several transcriptional regulators (HilA, HilD, HilC, and InvF) with overlapping sets of target genes. These regulators are, in turn, controlled by both positive and regulators outside SPI-1, including the two-component regulators BarA/SirA and PhoP/Q, and the csr post-transcriptional control system. Additionally, several environmental conditions are known to regulate invasion, including pH, osmolarity, oxygen tension, bile, $Mg^{2+}$ concentration, and short chain fatty acids. This review will discuss the current understanding of invasion control, with emphasis on the interaction of environmental factors with genetic regulators that leads to productive infection.

A Study on the design and implementation of serial communication using only one pin (단일 핀을 이용한 직렬 통신 설계 및 구현에 관한 연구)

  • Park, Sang-Bong;Heo, Jeong-Hwa
    • The Journal of the Convergence on Culture Technology
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    • v.1 no.3
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    • pp.83-85
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    • 2015
  • It has been increased that communicate each other things such as consumer electronics, mobile equipments and wearable computer with serial communication protocol. The conventional method of SPI and I2C high speed serial communication is widely used with 2 pin of clock and data pin. It has been more important than the speed of data transfer to simplify the hardware structure because the IoT components is reduced the hardware complexity. In this paper, we describe the protocol and implementation of serial data transfer with only one pin. The proposed protocol is suitable for the mobile products that send and receive the small amount of data with low speed and low power consumption.

Effects of Soy Protein Isolate on the Growth of Lactobacillus acidophilus (분리대두단백(分離大豆蛋白)이 Lactobacillus acidophilus의 생육(生育)에 미치는 영향(影響))

  • Seong, Won-Hee;Lim, Sook-Ja;Ko, Young-Tae
    • Korean Journal of Food Science and Technology
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    • v.16 no.1
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    • pp.120-126
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    • 1984
  • The effects of heat treatment of soy protein and of various nutrients added to soy protein isolate (SPI)-based yogurt on the growth of Lactobacillus acidophilus were investigated. The sensory evaluation of the yogurt beverage prepared from SPI was also performed. Soy milk was prepared from SPI (4.2% as protein) and various nutrients, such as glucose, lactose, sucrose, yeast extract, peptone and tryptone. Mild $(60^{\circ}C)$ or medium $(95^{\circ}C)$ heat treatment of soy protein did not inhibit the growth of L. acidophilus and the optimum degree of heat treatment was approximately $95^{\circ}C$ for 20 min. Glucose and lactose enhanced the growth and acid production by L. acidophilus. The optimum concentration of these two sugars in the medium was approximately 3% each. Yeast extract of approximately 0.5% stimulated the acid production by L acidophilus. Concentration of soy protein did not affect the growth of L. acidophilus, whereas it affected the viscosity of SPI-based yogurt markedly.

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Utilization assessment of meteorological drought outlook information based on long-term weather forecast data (장기예보자료 기반 기상학적 가뭄전망정보의 활용성 평가)

  • So, Jae-Min;Bae, Deg-Hyo
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2017.05a
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    • pp.40-40
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    • 2017
  • 최근 2014년 마른장마의 영향으로 중부 지방에 가뭄이 발생하였으며, 장마철 강수부족은 2015년까지 영향을 미친바 있다. 이로 인해 소양강 댐은 역대 최저수위를 기록하였으며, 일부 지역에서는 제한급수, 농업용수 부족 등의 피해가 발생하였다. 일반적으로 가뭄은 발생순서에 따라 기상학적, 농업적, 수문학적 가뭄 등으로 분류하고 있다 (Wilhite and Grantz, 1985). 기상학적 가뭄은 농업 및 수문학적 가뭄에 영향을 미치는 가뭄의 시작 단계를 의미하며, 가뭄을 판단하는데 있어 중요한 요소라 할 수 있다. 기상학적 가뭄을 정량적으로 판단하기 위해 SPI, PDSI, PN 등이 활용되고 있으며, 특히 강수량 기반의 SPI는 계산과정이 쉽고, 다양한 지속시간(3, 6, 9, 12개월 등)에 따라 가뭄을 객관적으로 판단할 수 있어 가장 활발하게 이용되고 있다(Mckee et al., 1993). 최근 기상청은 대기와 해양-해빙 모델을 접합한 GloSea5의 장기예보자료를 활용하여 월 내지 계절 가뭄전망을 위한 기상학적 가뭄지수를 현업에 활용하고 있다. 다만 국내에서는 주로 단기가뭄(1~3개월)이 빈번하게 발생함에 따라 짧은 예보선행시간을 갖는 가뭄전망에 대한 평가에 집중되어 왔다. 2014, 15년에는 이례적으로 2년 연속 가뭄이 지속된바 있으며, 장기가뭄(3개월 이상)에 대한 전망정보의 필요성이 증가하고 있다. 본 연구에서는 장기예보자료 기반의 기상학적 가뭄전망정보를 산정하고, 2015년 가뭄을 대상으로 활용성을 평가하였다. 이를 위해 ASOS 59개 지점의 관측강수량, GloSea5의 미래예측(Foreacst) 및 과거재현(Hindcast) 자료를 활용하였으며, 다양한 지속시간(3, 6, 9, 12개월)에 대한 SPI를 산정하였다. 또한 예보선행시간(1~6개월)에 따른 SPI와 관측자료 기반의 SPI 간의 통계적 분석(상관계수, 평균제곱근오차)을 수행하여 전망정보의 정확도를 평가하였다.

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Evaluation of polyherbal formulation and synthetic choline chloride on choline deficiency model in broilers: implications on zootechnical parameters, serum biochemistry and liver histopathology

  • Selvam, Ramasamy;Saravanakumar, Marimuthu;Suresh, Subramaniyam;Chandrasekeran, CV;Prashanth, D'Souza
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • v.31 no.11
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    • pp.1795-1806
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    • 2018
  • Objective: The study was designed to establish choline deficiency model (CDM) in broilers for evaluating efficacy of polyherbal formulation (PHF) in comparison with synthetic choline chloride (SCC). Methods: A total of 2,550 one-day-old Cobb 430 broiler chicks were randomly assigned to different groups in three experiments. In experiment 1, G1 and G2 served as normal controls and were fed a basal diet with 100% soybean meal (SBM) as a major protein source supplemented with and without SCC, respectively. In G3, G4, G5, and G6 groups, SBM was replaced at 25%, 50%, 75%, and 100% by soy protein isolate (SPI) to induce a graded level of choline deficiency. In experiment 2, PHF (500 and 1,000 g/ton) in comparison with SCC (1,000 g/ton) were evaluated. In experiment 3, dose-response of PHF (200, 400, and 500 g/ton) with SCC (400 g/ton) was determined. Results: Replacement of SBM by SPI produced a linear decrease in body weight gain (BWG) with a poor feed conversion ratio (FCR). 25% SBM replacement by SPI yielded an optimum negative impact on BWG and FCR; hence, it is considered for further studies. In experiment 2, PHF (500 and 1,000 g/ton) and SCC (1,000 g/ton) showed a similar performance in BWG, FCR and relative liver weight. In experiment 3, PHF produced an optimum efficacy at 400 g/ton and was comparable to SCC in the restoration of serum aspartate aminotransferase activity, abdominal fat, breast muscle lipid content and liver histopathological abnormalities. Conclusion: Replacement of SBM by SPI caused choline deficiency characterised by worsening of BWG, FCR, elevation in liver enzymes and histopathological changes indicating fatty liver. CDM was found valid for evaluating SCC and PHF. It is concluded that PHF has the potential to mimic biological activities of SCC through the restoration of negative effects caused by CDM.

Characterization of Rhizophora SPP. particleboards with SOY protein isolate modified with NaOH/IA-PAE adhesive for use as phantom material at photon energies of 16.59-25.26 keV

  • Samson, Damilola Oluwafemi;Shukri, Ahmad;Mat Jafri, Mohd Zubir;Hashim, Rokiah;Sulaiman, Othman;Aziz, Mohd Zahri Abdul;Yusof, Mohd Fahmi Mohd
    • Nuclear Engineering and Technology
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    • v.53 no.1
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    • pp.216-233
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    • 2021
  • In this work, Rhizophora spp. particleboard phantoms were made using SPI-based adhesives, modified with sodium hydroxide and itaconic acid polyamidoamine-epichlorohydrin (0, 5, 10, and 15 wt%). An X-ray computed tomography (CT) imaging system was used to ascertain the CT numbers and density distribution profiles of the particleboards. The SPI-based/NaOH/IA-PAE/Rhizophora spp. particleboard phantoms with 15 wt% IA-PAE addition level had the highest solid content, flexural strength, flexural modulus, and internal bonding strength of 36.06 ± 1.08%, 18.61 ± 0.38 Nmm-2, 7605.76 ± 0.89 Nmm-2, and 0.463 ± 0.053 Nmm-2, respectively. The moisture content, mass density, water absorption, and dimensional stability were 6.93 ± 0.27%, 0.962 ± 0.037 gcm-3, 22.36 ± 2.47%, and 10.90 ± 0.86%, respectively. The results revealed that the mass attenuation coefficients and effective atomic number values within the 16.59-25.26 keV photon energy region, were close to the calculated XCOM values in water, with a p-value of 0.077. Moreover, the CT images showed that the dissimilarities in the discrepancy of the profile density decreased as the IA-PAE concentrations increased. Therefore, these results support the appropriateness of the SPI-based/NaOH/IA-PAE/Rhizophora spp. particleboard with 15 wt% IA-PAE adhesive as a suitable tissue-equivalent phantom material for medical health applications.

Development of Spatio-Temporal Analysis of Drought Using Mass Moment (질량모멘트를 이용한 가뭄의 시공간적 특성 분석 방법 개발)

  • Kwon, Hyun-Han;So, Byung-Jin;Yoo, Ji-Young;Kim, Tae-Woong
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2011.05a
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    • pp.434-434
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    • 2011
  • 가뭄은 홍수와는 달라서 정확한 발생시점, 지속시간, 피해반경 등을 정의하기 어렵다. 가뭄은 가뭄지수를 통해서 정의되며 정해진 지속시간에 따라서 가뭄의 특성을 평가하는 것이 일반적이다. 이러한 가뭄의 심도를 평가하기 위해서 많이 사용되는 지수로 표준강수지수(standardized precipitation index)가 있다. 본 연구에서는 6개월 지속시간에 SPI 지수를 대상으로 연구를 수행하였다. 최근 가뭄연구에서 시공간적 거동을 평가하는 연구가 중요한 연구주제로 자리 잡고 있다. 가뭄은 홍수와는 달리 공간적으로 전이되는 특성을 가지고 있어서 가뭄의 시작점과 영역반경을 평가하는 것은 가뭄을 예측하는데 있어서 기본적으로 선결되어야 한다. 그러나 상대적으로 가뭄의 시공간적 분석 연구는 많이 진행되지 않았다. 본 연구에서는 질량모멘트 개념을 도입하여 가뭄의 중심과 영역을 평가하는 기법을 개발하였다. 가뭄의 중심(centroid)은 1차모멘트를 통해서 추정되며 가뭄의 영역은 2차모멘트 즉, x방향의 공분산, y방향의 공분산, xy의 공분산을 통해서 타원(ellipse)형태로 수치적 접근이 가능하다. 다음 그림과 같이 가뭄의 중심을 1차모멘트로 추정하게 되면 +형태로 표시될 수 있으며 분산을 타원체로 표현하여 가뭄의 영역을 정의할 수 있다. 1, 2차모멘트를 추정하는데 있어서 Threshold 로 -2.0 이하의 값만을 이용하였으며 각 격자별 SPI 강도를 가중인자로 이용하였다. 그림과 같이 가뭄이 서해안에서 시작되어 시간에 따라 중동부로 퍼져나가는 것을 정량적으로 확인할 수 있다. 본 모형을 통해서 추출된 1, 2차 모멘트 정보를 활용하여 가뭄의 특성을 범주화하고 이를 기상학적 특성과 연결시키면 기상특성을 고려한 가뭄 예측모형으로의 개발도 가능할 것으로 판단된다.

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Implementation and design of fuse controller using single wire serial communication (단일 입력 직렬 통신을 이용한 퓨즈 제어 회로설계 및 구현)

  • Park, Sang-bong;Heo, Jeong-hwa
    • The Journal of the Institute of Internet, Broadcasting and Communication
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    • v.15 no.6
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    • pp.251-255
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    • 2015
  • In this paper, we propose a fuse controller which is used for storing the optimal value or the correction value for the surrounding product of the IoT applications and it is implemented serial communication circuit using a single pin. Because of the proposed single pin protocol is simpler in the hardware than the conventional $I^2C$ and SPI using two or more pins, it is suitable for the area of small amount of data transmission. The function of the one pin protocol is verified by logic simulation and the FPGA test board and it is fabricated using CMOS 0.35um technology. It is expected to use the IoT product that require the low power consumption and simple hardware.

Chromophorylation of a Novel Cyanobacteriochrome GAF Domain from Spirulina and Its Response to Copper Ions

  • Jiang, Su-Dan;sheng, Yi;Wu, Xian-Jun;Zhu, Yong-Li;Li, Ping-Ping
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • v.31 no.2
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    • pp.233-239
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    • 2021
  • Cyanobacteriochromes (CBCRs) are phytochrome-related photoreceptor proteins in cyanobacteria and cover a wide spectral range from ultraviolet to far-red. A single GAF domain that they contain can bind bilin(s) autocatalytically via heterologous recombination and then fluoresce, with potential applications as biomarkers and biosensors. Here, we report that a novel red/green CBCR GAF domain, SPI1085g2 from Spirulina subsalsa, covalently binds both phycocyanobilin (PCB) and phycoerythrobilin (PEB). The PCB-binding GAF domain exhibited canonical red/green photoconversion with weak fluorescence emission. However, the PEB-binding GAF domain, SPI1085g2-PEB, exhibited an intense orange fluorescence (λabs.max = 520 nm, λfluor.max = 555 nm), with a fluorescence quantum yield close to 1.0. The fluorescence of SPI1085g2-PEB was selectively and instantaneously quenched by copper ions in a concentration-dependent manner and exhibited reversibility upon treatment with the metal chelator EDTA. This study identified a novel PEB-binding cyanobacteriochrome-based fluorescent protein with the highest quantum yield reported to date and suggests its potential as a biosensor for the rapid detection of copper ions.

Analysis of Calssification Method for Drought in Jeju Island by Standard Precipitation Index (표준강수지수를 이용한 제주도 가뭄의 공간적 분석)

  • Lee, Jun Ho;Yang, Sung Kee;Yang, Won Seok;Kang, Myung Su;Kim, Min Chul
    • Proceedings of the Korea Water Resources Association Conference
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    • 2017.05a
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    • pp.367-367
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    • 2017
  • 지국온난화에 의한 기후변화는 전 세계적으로 강수의 편중이나 이상기온 등의 현상들이 빈번하게 발생하여 가뭄 및 홍수로 인한 피해가 점차 늘어나고 있다. 제주도는 수자원의 98% 이상을 지하수에 의존하고 있기 때문에 기후변화에 따른 수자원 영향에 대한 지속적인 관심과 연구가 필요한 지역이다. 본 연구에서는 표준강수지수를 활용한 제주도 가뭄의 공간적 특성을 분석하기 위하여 가뭄 속성 인자들 간의 상관관계가 높은 변수인 가뭄지속시간과 가뭄 심도를 변수로 선택하여 각 지역의 가뭄특성과 지역 분류를 수행하였다. 제주도의 4개 기상대(제주, 서귀포, 성산, 고산)의 관측소별 표준강수지수(SPI 3, 6, 9, 12)를 산정한 결과 SPI 12가 SPI6에 비해 비교적 단순한 경향을 가지고 있는 것으로 확인 되었으며 단기간 일수록 변동성이 심하고 장기간 표준강수지수는 비교적 극심한 가뭄을 판단하기 위한 자료로 활용이 가능한 것을 확인하였다. 지역별 가뭄의 특성을 고려하기 위한 지역을 구분하기 위하여 한가지 요소로만 구분할 수 없어 가뭄 속성 인자들의 동질성을 구분하였으며 가뭄 속성인자의 변량을 71.8%를 설명해 주는 2개의 요인을 주요인으로 산정하였다. 인자분석의 결과로 추출된 2개의 변수로 비계측적 군집방법 중 하나인 K-means 기법을 이용하여 군집분석을 실시하여 7번의 반복계산에 걸쳐 군집이 종료 되었으며 최종적으로 2개의 군집이 형성 되었다. 기후변화는 전 세계와 제주도 수자원에 지속적인 영향을 미칠 것으로 전망되어 수자원 정책 평가 및 관리에 매우 신중한 대비책을 요구하고 있다. 향후 다양한 입력자료를 활용하고 가뭄 산정기법과 가뭄 분류 등을 통하여 활발한 후속 연구가 필요하다.

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